Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v4059050.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v4059050.1 CUFF.31832.1
(2093 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC80442 similar to UniRef100_A7PTG7 Cluster: Chromosome... 1818 0.0
gnl|LJGI|TC75526 similar to UniRef100_A7PTG7 Cluster: Chromosome... 1695 0.0
gnl|LJGI|BW596975 similar to UniRef100_A7PTG7 Cluster: Chromosom... 950 0.0
>gnl|LJGI|TC80442 similar to UniRef100_A7PTG7 Cluster: Chromosome chr8 scaffold_29,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr8 scaffold_29, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (36%)
Length = 1301
Score = 1818 bits (917), Expect = 0.0
Identities = 922/924 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1170 caaatacaaattagtcagattgcctgggcagccccaagcatacatgatatggaaatccat 1229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 caaatacaaattagtcagattgcctgggcagccccaagcatacatgatatggaaatccat 61
Query: 1230 tctacaatggactgataagtctgcttcaagagtgggggttatattgcccgaccttacgtc 1289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tctacaatggactgataagtctgcttcaagagtgggggttatattgcccgaccttacgtc 121
Query: 1290 tggggctgaaaagttacctgtttgtcttgtgaatgatgttgacaacgagaagggccctgc 1349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 tggggctgaaaagttacctgtttgtcttgtgaatgatgttgacaacgagaagggccctgc 181
Query: 1350 atatttcacttacagccctactctcaagaatctgaatcgattagctcctgtggagtcttc 1409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 atatttcacttacagccctactctcaagaatctgaatcgattagctcctgtggagtcttc 241
Query: 1410 tgagggatgcacttgtaatggtggatgtcaacctggcagtcataaatgtggttgcactca 1469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 tgagggatgcacttgtaatggtggatgtcaacctggcagtcataaatgtggttgcactca 301
Query: 1470 aaagaatggaggttatctcccatattctgcagctgggttgcttgcggatttaaaatccgt 1529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 aaagaatggaggttatctcccatattctgcagctgggttgcttgcggatttaaaatccgt 361
Query: 1530 ggtatatgagtgcggtccttcctgtcattgccctcctagttgccgaaatcgtgtttccca 1589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 ggtatatgagtgcggtccttcctgtcattgccctcctagttgccgaaatcgtgtttccca 421
Query: 1590 aggtggcttgaaacttcgtctggaggtgtttagaacaaaaggtaaaggttggggtctaag 1649
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 aggtggcttgaaacttcgtctggaggngtttagaacaaaaggtaaaggttggggtctaag 481
Query: 1650 gtcatgggaccctattcgtgctggaacgttcatatgtgagtatgcaggggaagtcataga 1709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 gtcatgggaccctattcgtgctggaacgttcatatgtgagtatgcaggggaagtcataga 541
Query: 1710 taatgctagagtggaggagctcagcggtgagaatgaagatgactacatctttgattctac 1769
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 taatgctagagtggaggagctcggcggtgagaatgaagatgactacatctttgattctac 601
Query: 1770 ccgcatttatcagcaactggaagttttttccagtgacgttgaagctccgaagatcccatc 1829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 ccgcatttatcagcaactggaagttttttccagtgacgttgaagctccgaagatcccatc 661
Query: 1830 tcccctttacataacagcaaggaatgaagggaacgttgctcggtttatgaatcacagctg 1889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 tcccctttacataacagcaaggaatgaagggaacgttgctcggtttatgaatcacagctg 721
Query: 1890 cactccaaatgtgttatggcgtccagtcgtacgtgaaaacaagaatgaagcagacctcca 1949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 cactccaaatgtgttatggcgtccagtcgtacgtgaaaacaagaatgaagcagacctcca 781
Query: 1950 tgttgctttctatgcaatcagacatatccctccgatgatggaattaacttatgattatgg 2009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 tgttgctttctatgcaatcagacatatccctccgatgatggaattaacttatgattatgg 841
Query: 2010 gatagttcttcctctcaaagtaggtcagaagaaaaagaaatgcttgtgtggatctgtcaa 2069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 gatagttcttcctctcaaagtaggtcagaagaaaaagaaatgcttgtgtggatctgtcaa 901
Query: 2070 atgcaggggttacttttgctaaat 2093
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 atgcaggggttacttttgctaaat 925
>gnl|LJGI|TC75526 similar to UniRef100_A7PTG7 Cluster: Chromosome chr8 scaffold_29,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr8 scaffold_29, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (17%)
Length = 1135
Score = 1695 bits (855), Expect = 0.0
Identities = 864/866 (99%), Gaps = 1/866 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggatcacaatttaggtcaagaccctgcacctgcagctgggtcctttgataagtctagg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 267 atggatcacaatttaggtcaagaccctgcacctgcagctgggtcctttgataagtctagg 326
Query: 61 gttttaaatgttaagccattgagaactcttgtccctgtgtttccttcaccatccaatccc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327 gttttaaatgttaagccattgagaactcttgtccctgtgtttccttcaccatccaatccc 386
Query: 121 tcttcatctgcaaccccacaaggtggtgctccttttgtttgtgtttctccttctggtcct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 387 tcttcatctgcaaccccacaaggtggtgctccttttgtttgtgtttctccttctggtcct 446
Query: 181 ttcccctctggggttgcgccgttttaccctttcttcgtctccccggagtcccagagactc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 447 ttcccctctggggttgcgccgttttaccctttcttcgtctccccggagtcccagagactc 506
Query: 241 tctgaacaaaatgcacaaaccccaactgctcaacgtgctgccccaatatctgctgcagtt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 507 tctgaacaaaatgcacaaaccccaactgctcaacgtgctgccccaatatctgctgcagtt 566
Query: 301 ccaattaattcattcaggacaccaactggggctacaaatggagatgtgggttcctcgcgg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 567 ccaattaattcattcaggacaccaactggggctacaaatggagatgtgggttcctcgcgg 626
Query: 361 aggaaaagtcgtggccagttaccagaggatgataactttgttgatctgagtgaagttgat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 627 aggaaaagtcgtggccagttaccagaggatgataactttgttgatctgagtgaagttgat 686
Query: 421 ggagaaggtggaactggagatgggaagaggcgcaagccacagaagaggataagggaaaag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 687 ggagaaggtggaactggagatgggaagaggcgcaagccacagaagaggataagggaaaag 746
Query: 481 cgctgctcttctgatgttgatccagatgcagtggctaatgaaattctgaaaacaattaac 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 747 cgctgctcttctgatgttgatccagatgcagtggctaatgaaattctgaaaacaattaac 806
Query: 541 cctggggtttttgaaatactgaatcaacctgatggtagcagggacgccgttgcttatacg 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 807 nctggggtttttgaaatactgaatcaacctgatggtagcagggacgccgttgcttatacg 866
Query: 601 cttatgatatatgaagtgatgaggaggaagcttggacaaattgacgagaaagcaaaggga 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 867 cttatgatatatgaagtgatgaggaggaagcttggacaaattgacgagaaagcaaaggga 926
Query: 661 tcccattctggagcaaagcgccctgatctaaaggctggtacacttatgaataccaaaggg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 927 tcccattctggagcaaagcgccctgatctaaaggctggtacacttatgaataccaaaggg 986
Query: 721 attcgggctaacagcaggaagagaattggagttgttcctggtgtcgaggttggggatatt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 987 attcgggctaacagcaggaagagaattggagttgttcctggtgtcgaggttggggatatt 1046
Query: 781 ttcttcttccgatttgagttgtgcttggtggggttgcatgctccttctatggctggaatt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1047 ttcttcttccgatttgagttgtgcttggtggggttgcatgctccttctatggctggaatt 1106
Query: 841 gattacttgggcaccaaagtcagtca 866
||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1107 gattacttgggcacc-aagtcagtca 1131
>gnl|LJGI|BW596975 similar to UniRef100_A7PTG7 Cluster: Chromosome chr8 scaffold_29,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr8 scaffold_29, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (19%)
Length = 483
Score = 950 bits (479), Expect = 0.0
Identities = 479/479 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 936 tgtgctgatttacagtggacaaggtgggactagccgtgaaaagggagcaagtgatcaaaa 995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5 tgtgctgatttacagtggacaaggtgggactagccgtgaaaagggagcaagtgatcaaaa 64
Query: 996 gcttgaaaggggtaatcttgctttggagaggagcctgcacagaggtaatgatgtgagagt 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 65 gcttgaaaggggtaatcttgctttggagaggagcctgcacagaggtaatgatgtgagagt 124
Query: 1056 aattaggggtatgagggatgaagcacatccaactgggaaggtatatgtctatgatggtct 1115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 125 aattaggggtatgagggatgaagcacatccaactgggaaggtatatgtctatgatggtct 184
Query: 1116 ttacaagattcagaattcatgggtggagaaagcgaaatctggtttcaatgtgttcaaata 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 ttacaagattcagaattcatgggtggagaaagcgaaatctggtttcaatgtgttcaaata 244
Query: 1176 caaattagtcagattgcctgggcagccccaagcatacatgatatggaaatccattctaca 1235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 245 caaattagtcagattgcctgggcagccccaagcatacatgatatggaaatccattctaca 304
Query: 1236 atggactgataagtctgcttcaagagtgggggttatattgcccgaccttacgtctggggc 1295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 305 atggactgataagtctgcttcaagagtgggggttatattgcccgaccttacgtctggggc 364
Query: 1296 tgaaaagttacctgtttgtcttgtgaatgatgttgacaacgagaagggccctgcatattt 1355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 tgaaaagttacctgtttgtcttgtgaatgatgttgacaacgagaagggccctgcatattt 424
Query: 1356 cacttacagccctactctcaagaatctgaatcgattagctcctgtggagtcttctgagg 1414
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 425 cacttacagccctactctcaagaatctgaatcgattagctcctgtggagtcttctgagg 483