Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v4048440.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v4048440.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1N8J5|I1N8J5_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.6733 PE=,86.17,0,no
description,NULL; AIG1,AIG1; 3a0901s02IAP34: GTP-binding
protein,Chloroplast protein import compo,CUFF.31805.1
(954 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC63084 similar to UniRef100_Q41009 Cluster: Translocas... 1859 0.0
gnl|LJGI|BW596895 homologue to UniRef100_Q41009 Cluster: Translo... 654 0.0
>gnl|LJGI|TC63084 similar to UniRef100_Q41009 Cluster: Translocase of chloroplast 34;
n=1; Pisum sativum|Rep: Translocase of chloroplast 34 -
Pisum sativum (Garden pea), partial (98%)
Length = 1443
Score = 1859 bits (938), Expect = 0.0
Identities = 950/954 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgtcccaagttgtccgtgagtggtcaggaatcaacacatttgcacctgctacccag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 132 atggcgtcccaagttgtccgtgagtggtcaggaatcaacacatttgcacctgctacccag 191
Query: 61 aacaagttgtttgagcttttggggcaacttaaacaagagaatgtgaactccttgactata 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 192 aacaagttgtttgagcttttggggcaacttaaacaagagaatgtgaactccttgactata 251
Query: 121 cttgttatggggaaaggtggtgttggcaagtcttcaactgtcaactctatcattggggaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 252 cttgttatggggaaaggtggtgttggcaagtcttcaactgtcaactctatcattggggaa 311
Query: 181 agagttgtttcaatcagtccttttcagtcggaagggcctaggcctgtgatggtatcgcga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 312 agagttgtttcaatcagtccttttcagtcggaagggcctaggcctgtgatggtatcgcga 371
Query: 241 tcaagggcaggttttacattgaacatcattgacactcctggtctcattgaagggggatat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 372 tcaagggcaggttttacattgaacatcattgacactcctggtctcattgaagggggatat 431
Query: 301 atcaatgatatggcacttaatttgataaaatgtttccttctgaacaagaccatagatgtt 360
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 432 atcaatgatatggcacttaatttgataaaacgtttccttctgaacaagaccatagatgtt 491
Query: 361 ttgctttatgtggaccgcttggatgcatatagagtggacaacttggacaagttagttgct 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 492 ttgctttatgtggaccgcttggatgcatatagagtggacaacttggacaagttagttgct 551
Query: 421 aaggctataactgatagttttgggaaagcaatatggaacagggctatagttgcactcaca 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 552 aaggctataactgatagttttgggaaagcaatatggaacagggctatagttgcactcaca 611
Query: 481 catgcccagttctctccacctgatggattgccttatgaggaattcttctcaaaaagatct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 612 catgcccagttctctccacctgatggattgccttatgaggaattcttctcaaaaagatct 671
Query: 541 gaggctctcttgaaagttgttagatcaggtgcccggattaagaaagatgcctcccaggct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 672 gaggctctcttgaaagttgttagatcaggtgcccggattaagaaagatgcctcccaggct 731
Query: 601 tctgcgattcccgttgttttgatcgagaacagtgggagatgcaacaaaaatgatagtgat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 732 tctgcgattcccgttgttttgatcgagaacagtgggagatgcaacaaaaatgatagtgat 791
Query: 661 gaaaaggttcttccaaatgggattgcatggatttctaatctagtccaaaaaatcacagaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 792 gaaaaggttcttccaaatgggattgcatggatttctaatctagtccaaaaaatcacagaa 851
Query: 721 gttgcattgaacaaaagtgagtctattcatgttgataagaatttgattgaagggccaaat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 852 gttgcattgaacaaaagtgagtctattcatgttgataagaatttgattgaagggccaaat 911
Query: 781 ccaaatcagactggaaaattatggattcctctcctgtatgcattacaatatttctttgtg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 912 ccaaatcagactggaaaattatggattcctctcctgtatgcattacaatatttctttgtg 971
Query: 841 ataaagccgatagaaggactgatccagcaggacatttcaagtgagagtaggccttcatgg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 972 ataaagccgatagaaggactgatccagcaggacatttcaagtgagagtaggccttcatgg 1031
Query: 901 gaggtgcgagatgcaggtttacgcgaaagagatcaaagggatctctgttagctg 954
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 1032 gagatgcgagatgcaggtttacgcaaaagagatcaaagggatctctattagctg 1085
>gnl|LJGI|BW596895 homologue to UniRef100_Q41009 Cluster: Translocase of chloroplast
34; n=1; Pisum sativum|Rep: Translocase of chloroplast
34 - Pisum sativum (Garden pea), partial (35%)
Length = 476
Score = 654 bits (330), Expect = 0.0
Identities = 330/330 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgtcccaagttgtccgtgagtggtcaggaatcaacacatttgcacctgctacccag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 91 atggcgtcccaagttgtccgtgagtggtcaggaatcaacacatttgcacctgctacccag 150
Query: 61 aacaagttgtttgagcttttggggcaacttaaacaagagaatgtgaactccttgactata 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 151 aacaagttgtttgagcttttggggcaacttaaacaagagaatgtgaactccttgactata 210
Query: 121 cttgttatggggaaaggtggtgttggcaagtcttcaactgtcaactctatcattggggaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 211 cttgttatggggaaaggtggtgttggcaagtcttcaactgtcaactctatcattggggaa 270
Query: 181 agagttgtttcaatcagtccttttcagtcggaagggcctaggcctgtgatggtatcgcga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 271 agagttgtttcaatcagtccttttcagtcggaagggcctaggcctgtgatggtatcgcga 330
Query: 241 tcaagggcaggttttacattgaacatcattgacactcctggtctcattgaagggggatat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 331 tcaagggcaggttttacattgaacatcattgacactcctggtctcattgaagggggatat 390
Query: 301 atcaatgatatggcacttaatttgataaaa 330
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 391 atcaatgatatggcacttaatttgataaaa 420