Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v4012860.2
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v4012860.2 tr|Q5PY86|Q5PY86_VERFO NADH:cytochrome b5
reductase OS=Vernicia fordii GN=CBR1A PE=2
SV=1,84.89,0,CYTB5RDTASE,NADH:cytochrome b5 reductase (CBR);
FPNCR,Flavoprotein pyridine nucleotide cytochrome re,CUFF.31823.2
(840 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC59126 similar to UniRef100_Q5PY86 Cluster: NADH:cytoc... 1665 0.0
gnl|LJGI|TC70591 similar to UniRef100_Q5PY86 Cluster: NADH:cytoc... 1292 0.0
gnl|LJGI|GO022762 homologue to UniRef100_Q5PY86 Cluster: NADH:cy... 1025 0.0
gnl|LJGI|GO019187 similar to UniRef100_Q5PY86 Cluster: NADH:cyto... 494 e-139
gnl|LJGI|TC58568 similar to UniRef100_Q5PY86 Cluster: NADH:cytoc... 58 9e-08
>gnl|LJGI|TC59126 similar to UniRef100_Q5PY86 Cluster: NADH:cytochrome b5 reductase;
n=1; Vernicia fordii|Rep: NADH:cytochrome b5 reductase -
Vernicia fordii (Tung) (Aleurites fordii), complete
Length = 1247
Score = 1665 bits (840), Expect = 0.0
Identities = 840/840 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggattttttgcagataccagaaaatcagataattgtgggtgttgctgtggctattgta 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 173 atggattttttgcagataccagaaaatcagataattgtgggtgttgctgtggctattgta 232
Query: 61 gctgttggggttggtgcttactacctctattcatctaagaagcccaaaggtaacttggac 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 233 gctgttggggttggtgcttactacctctattcatctaagaagcccaaaggtaacttggac 292
Query: 121 ccagataatttcaaggagtttaaacttgtgaagaaagcacagctgagccataatgttgca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 293 ccagataatttcaaggagtttaaacttgtgaagaaagcacagctgagccataatgttgca 352
Query: 181 aagttcacatttgcactcccaacacctacttctgttttgggtcttccaattggccaacac 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 353 aagttcacatttgcactcccaacacctacttctgttttgggtcttccaattggccaacac 412
Query: 241 ataagttgcaagggtaaggatcctcaaggggatgaggttatcaaaccgtatacccctaca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 413 ataagttgcaagggtaaggatcctcaaggggatgaggttatcaaaccgtatacccctaca 472
Query: 301 actttggattccgatgttggacacttcgagctagttatcaagatgtacccgcaaggaagg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 473 actttggattccgatgttggacacttcgagctagttatcaagatgtacccgcaaggaagg 532
Query: 361 atgtcacatcatttccgtgagatgcgtgttggtgactatcttgctgttaaaggacccaag 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 533 atgtcacatcatttccgtgagatgcgtgttggtgactatcttgctgttaaaggacccaag 592
Query: 421 ggacgtttcaagtaccaacctaatgatgttagagcattcgggatgcttgctggagggtca 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 593 ggacgtttcaagtaccaacctaatgatgttagagcattcgggatgcttgctggagggtca 652
Query: 481 ggaatcactccaatgttccaagttgctagagctatattagaaaacccaaatgacaggacc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 653 ggaatcactccaatgttccaagttgctagagctatattagaaaacccaaatgacaggacc 712
Query: 541 aaggtgcatcttatctatgccaatgttacatatgaggacattcttttgaaggaagagctt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 713 aaggtgcatcttatctatgccaatgttacatatgaggacattcttttgaaggaagagctt 772
Query: 601 gatggtcttgctactaactaccctgatagctttaaaatatactatgtattgaatcagcct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 773 gatggtcttgctactaactaccctgatagctttaaaatatactatgtattgaatcagcct 832
Query: 661 ccggaagtatgggatggtggtgttggatttgtatcaaaggagatgattgaagcccatttg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 833 ccggaagtatgggatggtggtgttggatttgtatcaaaggagatgattgaagcccatttg 892
Query: 721 cctgctccagcacatgatgttaagatattgcgatgcggcccgccaccgatgaacaaggcc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 893 cctgctccagcacatgatgttaagatattgcgatgcggcccgccaccgatgaacaaggcc 952
Query: 781 atggctgctcacctggaagccctcgaatatgctcctgagatgcagttccagttctgatcg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 953 atggctgctcacctggaagccctcgaatatgctcctgagatgcagttccagttctgatcg 1012
>gnl|LJGI|TC70591 similar to UniRef100_Q5PY86 Cluster: NADH:cytochrome b5 reductase;
n=1; Vernicia fordii|Rep: NADH:cytochrome b5 reductase -
Vernicia fordii (Tung) (Aleurites fordii), partial (80%)
Length = 898
Score = 1292 bits (652), Expect = 0.0
Identities = 684/693 (98%), Gaps = 2/693 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggattttttgcagataccagaaaatcagataattgtgggtgttgctgtggctattgta 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 204 atggattttttgcagataccagaaaatcagataattgtgggtgttgctgtggctattgta 263
Query: 61 gctgttggggttggtgcttactacctctattcatctaagaagcccaaaggtaacttggac 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264 gctgttggggttggtgcttactacctctattcatctaagaagcccaaaggtaacttggac 323
Query: 121 ccagataatttcaaggagtttaaacttgtgaagaaagcacagctgagccataatgttgca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 324 ccagataatttcaaggagtttaaacttgtgaagaaagcacagctgagccataatgttgca 383
Query: 181 aagttcacatttgcactcccaacacctacttctgttttgggtcttccaattggccaacac 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 384 aagttcacatttgcactcccaacacctacttctgttttgggtcttccaattggccaacac 443
Query: 241 ataagttgcaagggtaaggatcctcaaggggatgaggttatcaaaccgtatacccctaca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 444 ataagttgcaagggtaaggatcctcaaggggatgaggttatcaaaccgtatacccctaca 503
Query: 301 actttggattccgatgttggacacttcgagctagttatcaagatgtacccgcaaggaagg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 504 actttggattccgatgttggacacttcgagctagttatcaagatgtacccgcaaggaagg 563
Query: 361 atgtcacatcatttccgtgagatgcgtgttggtgactatcttgctgttaaaggacccaag 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 564 atgtcacatcatttccgtgagatgcgtgttggtgactatcttgctgttaaaggacccaag 623
Query: 421 ggacgtttcaagtaccaacctaatgatgttagagcattcgggatgcttgctggagggtca 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 624 ggacgtttcaagtaccaacctaatgatgttagagcattcgggatgcttgctggagggtca 683
Query: 481 ggaatcactccaatgttccaagttgctagagctatattagaaaacccaaatgacaggacc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 684 ggaatcactccaatgttccaagttgctagagctatattagaaaacccaaatgacaggacc 743
Query: 541 aaggtgcatcttatctatgccaatgttacatatgaggacattcttttgaaggaagagctt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 744 aaggtgcatcttatctatgccaatgttacatatgaagacattcttttgaangaaga-ctt 802
Query: 601 gatggtcttgctactaactaccctgatagctttaaaatatactatgtattgaatcagcct 660
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct: 803 gatggtcttgctactaactaccctgatanctttaaaatatactatgtattnaatccccct 862
Query: 661 ccggaagtatgggatggtggtg-ttggatttgt 692
|||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 863 ccggaaatatgggatggtggtgtttggatttgt 895
>gnl|LJGI|GO022762 homologue to UniRef100_Q5PY86 Cluster: NADH:cytochrome b5
reductase; n=1; Vernicia fordii|Rep: NADH:cytochrome b5
reductase - Vernicia fordii (Tung) (Aleurites fordii),
partial (60%)
Length = 683
Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0
Identities = 517/517 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 149 tgaagaaagcacagctgagccataatgttgcaaagttcacatttgcactcccaacaccta 208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 160 tgaagaaagcacagctgagccataatgttgcaaagttcacatttgcactcccaacaccta 219
Query: 209 cttctgttttgggtcttccaattggccaacacataagttgcaagggtaaggatcctcaag 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 220 cttctgttttgggtcttccaattggccaacacataagttgcaagggtaaggatcctcaag 279
Query: 269 gggatgaggttatcaaaccgtatacccctacaactttggattccgatgttggacacttcg 328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280 gggatgaggttatcaaaccgtatacccctacaactttggattccgatgttggacacttcg 339
Query: 329 agctagttatcaagatgtacccgcaaggaaggatgtcacatcatttccgtgagatgcgtg 388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 340 agctagttatcaagatgtacccgcaaggaaggatgtcacatcatttccgtgagatgcgtg 399
Query: 389 ttggtgactatcttgctgttaaaggacccaagggacgtttcaagtaccaacctaatgatg 448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 400 ttggtgactatcttgctgttaaaggacccaagggacgtttcaagtaccaacctaatgatg 459
Query: 449 ttagagcattcgggatgcttgctggagggtcaggaatcactccaatgttccaagttgcta 508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 460 ttagagcattcgggatgcttgctggagggtcaggaatcactccaatgttccaagttgcta 519
Query: 509 gagctatattagaaaacccaaatgacaggaccaaggtgcatcttatctatgccaatgtta 568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 520 gagctatattagaaaacccaaatgacaggaccaaggtgcatcttatctatgccaatgtta 579
Query: 569 catatgaggacattcttttgaaggaagagcttgatggtcttgctactaactaccctgata 628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 580 catatgaggacattcttttgaaggaagagcttgatggtcttgctactaactaccctgata 639
Query: 629 gctttaaaatatactatgtattgaatcagcctccgga 665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 640 gctttaaaatatactatgtattgaatcagcctccgga 676
>gnl|LJGI|GO019187 similar to UniRef100_Q5PY86 Cluster: NADH:cytochrome b5 reductase;
n=1; Vernicia fordii|Rep: NADH:cytochrome b5 reductase -
Vernicia fordii (Tung) (Aleurites fordii), partial (29%)
Length = 523
Score = 494 bits (249), Expect = e-139
Identities = 249/249 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 592 gaagagcttgatggtcttgctactaactaccctgatagctttaaaatatactatgtattg 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 43 gaagagcttgatggtcttgctactaactaccctgatagctttaaaatatactatgtattg 102
Query: 652 aatcagcctccggaagtatgggatggtggtgttggatttgtatcaaaggagatgattgaa 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 103 aatcagcctccggaagtatgggatggtggtgttggatttgtatcaaaggagatgattgaa 162
Query: 712 gcccatttgcctgctccagcacatgatgttaagatattgcgatgcggcccgccaccgatg 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 163 gcccatttgcctgctccagcacatgatgttaagatattgcgatgcggcccgccaccgatg 222
Query: 772 aacaaggccatggctgctcacctggaagccctcgaatatgctcctgagatgcagttccag 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 223 aacaaggccatggctgctcacctggaagccctcgaatatgctcctgagatgcagttccag 282
Query: 832 ttctgatcg 840
|||||||||
Sbjct: 283 ttctgatcg 291
>gnl|LJGI|TC58568 similar to UniRef100_Q5PY86 Cluster: NADH:cytochrome b5 reductase;
n=1; Vernicia fordii|Rep: NADH:cytochrome b5 reductase -
Vernicia fordii (Tung) (Aleurites fordii), partial (84%)
Length = 1057
Score = 58.0 bits (29), Expect = 9e-08
Identities = 62/73 (84%)
Strand = Plus / Plus
Query: 97 aagaagcccaaaggtaacttggacccagataatttcaaggagtttaaacttgtgaagaaa 156
||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct: 199 aagaatcccaaaggtagcttggacccccaaaatttcaaagaattcaaacttgtgaagaag 258
Query: 157 gcacagctgagcc 169
| ||||||||||
Sbjct: 259 acccagctgagcc 271