Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v3975960.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v3975960.1 CUFF.31706.1
(1040 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC82508 similar to UniRef100_A7QAV0 Cluster: Chromosome... 2030 0.0
>gnl|LJGI|TC82508 similar to UniRef100_A7QAV0 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_72,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_72, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (87%)
Length = 1489
Score = 2030 bits (1024), Expect = 0.0
Identities = 1036/1040 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcaagcttttcctggtgaaggtggaagtgctttgtcagttgtcggtccaaggcctatg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 180 atgcaagcttttcctggtgaaggtggaagtgctttgtcagttgtcggtccaaggcctatg 239
Query: 61 gaatggtctactgttccatatagtggtcctcagggtcctgggtcaaatggaaagcagcgg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 gaatggtctactgttccatatagtggtcctcagggtcctgggtcaaatggaaagcagcgg 299
Query: 121 acctcaagtttggaatcgccaatcatgttgctgacaggtcaccagagtgttatatatacc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 300 acctcaagtttggaatcgccaatcatgttgctgacaggtcaccagagcgttatatatacc 359
Query: 181 atgaagttcaacccagcaggaacagtcattgcatctggatcgcatgacagagaaattttc 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 atgaagttcaacccagcaggaacagtcattgcatctggttcgcatgacagagaaattttc 419
Query: 241 ctctggaatgtgcatggggaatgcaagaacttcatggttctaaaaggtcacaagaatgca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 ctctggaatgtgcatggggaatgcaagaacttcatggttctaaaaggtcacaagaatgca 479
Query: 301 gttttagatcttcactggactacagatgggacacagatagtctctgccagccctgataaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 gttttagatcttcactggactacagatgggacacagatagtctctgccagccctgataaa 539
Query: 361 acagtgagggtatgggatgtggaaacaggaaaacaagtcaagaagatggtagagcatctc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 acagtgagggtatgggatgtggaaacaggaaaacaagtcaagaagatggtagagcatctc 599
Query: 421 tcatacgtgaattcttgttgtccttccaggagggggccacctcttgttgtcagcggctct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 tcatacgtgaattcttgttgtccttccaggagggggccacctcttgttgtcagcggctct 659
Query: 481 gatgatggaactgcaaaattgtgggacatgcgtcaaaggggttccatccaaacattccca 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 gatgatggaactgcaaaattgtgggacatgcgtcaaaggggttccatccaaacattccca 719
Query: 541 gataaataccagattacggctgtcggcttcgctgatgcttcagataagatcttcaccggt 600
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 gataaataccagatcacggctgtcggcttcgctgatgcttcagataagatcttcaccggt 779
Query: 601 ggtattgataatgatgtcaaagtatgggatttgcgtaaaggtgaggttatcatgacactt 660
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 ggtattgataatgatgtcaaggtatgggatttgcgtaaaggtgaggttatcatgacactt 839
Query: 661 caaggtcaccaagacatgatcaccggaatgcaactgagtcctgatggttcctatcttcta 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 caaggtcaccaagacatgatcaccggaatgcaactgagtcctgatggttcctatcttcta 899
Query: 721 acaaacgctatggactgcaagctttgcatttgggatatgcgcccatatgctccccagaat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 900 acaaacgctatggactgcaagctttgcatttgggatatgcgcccatatgctccccagaat 959
Query: 781 cgctgtgtgaaggtgtttgaagggcaccaacacaattttgaaaagaacttgttgaaatgt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 cgctgtgtgaaggtgtttgaagggcaccaacacaattttgaaaagaacttgttgaaatgt 1019
Query: 841 agctggtcacctgatggaagcaaggtcacagctggtagtgctgatagaatggtttacatc 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 agctggtcacctgatggaagcaaggtcacagctggtagtgctgatagaatggtttacatc 1079
Query: 901 tgggacaccacttctcggcgcatcttgtataagctccctgggcataatggatctgttaat 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 tgggacaccacttctcggcgcatcttgtataagctccctgggcataatggatctgttaat 1139
Query: 961 gaatgtgtttttcatcccaatgaacctattgttggatcttgcagtagtgacaagcagatt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 gaatgtgtttttcatcccaatgaacctattgttggatcttgcagtagtgacaagcagatt 1199
Query: 1021 tatctgggggagatatgaag 1040
||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 tatctgggggagatatgaag 1219