Miyakogusa Predicted Gene

Lj1g3v3975960.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj1g3v3975960.1 CUFF.31706.1
         (1040 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC82508 similar to UniRef100_A7QAV0 Cluster: Chromosome...  2030   0.0  

>gnl|LJGI|TC82508 similar to UniRef100_A7QAV0 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_72,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr5 scaffold_72, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (87%)
          Length = 1489

 Score = 2030 bits (1024), Expect = 0.0
 Identities = 1036/1040 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgcaagcttttcctggtgaaggtggaagtgctttgtcagttgtcggtccaaggcctatg 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 180  atgcaagcttttcctggtgaaggtggaagtgctttgtcagttgtcggtccaaggcctatg 239

                                                                        
Query: 61   gaatggtctactgttccatatagtggtcctcagggtcctgggtcaaatggaaagcagcgg 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240  gaatggtctactgttccatatagtggtcctcagggtcctgggtcaaatggaaagcagcgg 299

                                                                        
Query: 121  acctcaagtttggaatcgccaatcatgttgctgacaggtcaccagagtgttatatatacc 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 300  acctcaagtttggaatcgccaatcatgttgctgacaggtcaccagagcgttatatatacc 359

                                                                        
Query: 181  atgaagttcaacccagcaggaacagtcattgcatctggatcgcatgacagagaaattttc 240
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 360  atgaagttcaacccagcaggaacagtcattgcatctggttcgcatgacagagaaattttc 419

                                                                        
Query: 241  ctctggaatgtgcatggggaatgcaagaacttcatggttctaaaaggtcacaagaatgca 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420  ctctggaatgtgcatggggaatgcaagaacttcatggttctaaaaggtcacaagaatgca 479

                                                                        
Query: 301  gttttagatcttcactggactacagatgggacacagatagtctctgccagccctgataaa 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480  gttttagatcttcactggactacagatgggacacagatagtctctgccagccctgataaa 539

                                                                        
Query: 361  acagtgagggtatgggatgtggaaacaggaaaacaagtcaagaagatggtagagcatctc 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540  acagtgagggtatgggatgtggaaacaggaaaacaagtcaagaagatggtagagcatctc 599

                                                                        
Query: 421  tcatacgtgaattcttgttgtccttccaggagggggccacctcttgttgtcagcggctct 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600  tcatacgtgaattcttgttgtccttccaggagggggccacctcttgttgtcagcggctct 659

                                                                        
Query: 481  gatgatggaactgcaaaattgtgggacatgcgtcaaaggggttccatccaaacattccca 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660  gatgatggaactgcaaaattgtgggacatgcgtcaaaggggttccatccaaacattccca 719

                                                                        
Query: 541  gataaataccagattacggctgtcggcttcgctgatgcttcagataagatcttcaccggt 600
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720  gataaataccagatcacggctgtcggcttcgctgatgcttcagataagatcttcaccggt 779

                                                                        
Query: 601  ggtattgataatgatgtcaaagtatgggatttgcgtaaaggtgaggttatcatgacactt 660
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780  ggtattgataatgatgtcaaggtatgggatttgcgtaaaggtgaggttatcatgacactt 839

                                                                        
Query: 661  caaggtcaccaagacatgatcaccggaatgcaactgagtcctgatggttcctatcttcta 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840  caaggtcaccaagacatgatcaccggaatgcaactgagtcctgatggttcctatcttcta 899

                                                                        
Query: 721  acaaacgctatggactgcaagctttgcatttgggatatgcgcccatatgctccccagaat 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 900  acaaacgctatggactgcaagctttgcatttgggatatgcgcccatatgctccccagaat 959

                                                                        
Query: 781  cgctgtgtgaaggtgtttgaagggcaccaacacaattttgaaaagaacttgttgaaatgt 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960  cgctgtgtgaaggtgtttgaagggcaccaacacaattttgaaaagaacttgttgaaatgt 1019

                                                                        
Query: 841  agctggtcacctgatggaagcaaggtcacagctggtagtgctgatagaatggtttacatc 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 agctggtcacctgatggaagcaaggtcacagctggtagtgctgatagaatggtttacatc 1079

                                                                        
Query: 901  tgggacaccacttctcggcgcatcttgtataagctccctgggcataatggatctgttaat 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 tgggacaccacttctcggcgcatcttgtataagctccctgggcataatggatctgttaat 1139

                                                                        
Query: 961  gaatgtgtttttcatcccaatgaacctattgttggatcttgcagtagtgacaagcagatt 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 gaatgtgtttttcatcccaatgaacctattgttggatcttgcagtagtgacaagcagatt 1199

                                
Query: 1021 tatctgggggagatatgaag 1040
            ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 tatctgggggagatatgaag 1219