Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v3278880.2
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v3278880.2 Non Chatacterized Hit- tr|F6HSQ4|F6HSQ4_VITVI
Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera
GN=,72.69,0,HEAT_REPEAT,HEAT, type 2; LISH,LisH dimerisation motif;
ARM repeat,Armadillo-type fold; Lissencephal,CUFF.30304.2
(3279 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC81379 similar to UniRef100_A7PAV4 Cluster: Chromosome... 3017 0.0
gnl|LJGI|TC60865 similar to UniRef100_A7PAV4 Cluster: Chromosome... 1814 0.0
>gnl|LJGI|TC81379 similar to UniRef100_A7PAV4 Cluster: Chromosome chr14 scaffold_9,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr14 scaffold_9, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (56%)
Length = 2679
Score = 3017 bits (1522), Expect = 0.0
Identities = 1528/1530 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1750 gtggaggagttgatgttccagttggcatgtgacccatcaggagtggtggtggaaactact 1809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 617 gtggaggagttgatgttccagttggcatgtgacccatcaggagtggtggtggaaactact 676
Query: 1810 ctcaaggaattggttcctgcagttataaagtggggaaacaaattggatcatgctttgaga 1869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 677 ctcaaggaattggttcctgcagttataaagtggggaaacaaattggatcatgctttgaga 736
Query: 1870 gttttactttctcatgttttaagctccgctatgcgttgtccgcctctttctggggttgaa 1929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 737 gttttactttctcatgttttaagctccgctatgcgttgtccgcctctttctggggttgaa 796
Query: 1930 gggtctttagagtcacatctccgcgtcttgggtgaaagagagcggtggaatatagatgct 1989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 797 gggtctttagagtcacatctccgcgtcttgggtgaaagagagcggtggaatatagatgct 856
Query: 1990 ctgttgagaatgatggtggaattactgtctttggtgcaccagaaagcaattgagacatgc 2049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 857 ctgttgagaatgatggtggaattactgtctttggtgcaccagaaagcaattgagacatgc 916
Query: 2050 cccttctcatgcacctcagaatctgcccaaattgtgctatctaccccattgcttgaattg 2109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 917 cccttctcatgcacctcagaatctgcccaaattgtgctatctaccccattgcttgaattg 976
Query: 2110 tatgctaggggacaagttgaatgggaagcatttgaatggatgcatgttgagtgctttcct 2169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 977 tatgctaggggacaagttgaatgggaagcatttgaatggatgcatgttgagtgctttcct 1036
Query: 2170 agtttgatacagctgtcttgcttattaccacagaaagaagataatttacggagccgaatt 2229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1037 agtttgatacagctgtcttgcttattaccacagaaagaagataatttacggagccgaatt 1096
Query: 2230 tctaagtttctgttatctgtttctgaatcgtttggggattcctatgtgacatgcatcatg 2289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1097 tctaagtttctgttatctgtttctgaatcgtttggggattcctatgtgacatgcatcatg 1156
Query: 2290 ctaccgatatttttaattgccgttggggatagtgccgatttgacattttttccaactgcc 2349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1157 ctaccgatatttttaattgccgttggggatagtgccgatttgacattttttccaactgcc 1216
Query: 2350 atccattcaagaattaaaggcttgaggccaagatctgctgttgctgatagactctctaca 2409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1217 atccattcaagaattaaaggcttgaggccaagatctgctgttgctgatagactctctaca 1276
Query: 2410 atgtgtgtcctaccacttctattggctggtgttttaagtgctcctggaaaacatgaacag 2469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1277 atgtgtgtcctaccacttctattggctggtgttttaagtgctcctggaaaacatgaacag 1336
Query: 2470 ttagtagaatatttgaggaagctgctactagaagacaaatccatggagaaccgatcaacc 2529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1337 ttagtagaatatttgaggaagctgctactagaagacaaatccatggagaaccgatcaacc 1396
Query: 2530 aaacacattcctgagattattaatgctatccgctttatatgcatatatgaacaaaatcat 2589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1397 aaacacattcctgagattattaatgctatccgctttatatgcatatatgaacaaaatcat 1456
Query: 2590 ggtatgatatttaatatactatgggaaatggttgtcagctctaacatgaccatgaaaatt 2649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1457 ggtatgatatttaatatactatgggaaatggttgtcagctctaacatgaccatgaaaatt 1516
Query: 2650 aatgccgctcaactgctgaaagttattgtgtcatatattgatgcaaaggttgcttcaact 2709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1517 aatgccgctcaactgctgaaagttattgtgtcatatattgatgcaaaggttgcttcaact 1576
Query: 2710 catgttttgcctgccctaattactctgggatctgaccaaaacctgaatgtgaagtatgcc 2769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1577 catgttttgcctgccctaattactctgggatctgaccaaaacctgaatgtgaagtatgcc 1636
Query: 2770 agcatagatgcatttggggctgtagctcaacattttaaaaacgagatgattgttgacaag 2829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1637 agcatagatgcatttggggctgtagctcaacattttaaaaacgagatgattgttgacaag 1696
Query: 2830 atacgtgtgcaaatggatgcttttcttgaagatggttcccatgaagctactattgctgtt 2889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1697 atacgtgtgcaaatggatgcttttcttgaagatggttcccatgaagctactattgctgtt 1756
Query: 2890 attcgtgcgttggtgattgcagtaccacatacaatagaaagacttagagattatctttta 2949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1757 attcgtgcgttggtgattgcagtaccacatacaatagaaagacttagagattatctttta 1816
Query: 2950 tccaagattttccagcttacagctatgccgaatgtaacaaatgatttaatgcgtcgacga 3009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1817 tccaagattttccagcttacagctatgccgaatgtaacaaatgatttaatgcgtcgacga 1876
Query: 3010 gagagagcagatgctttttgtgaggcaatccgtgctctggatgctacagatcttcctgca 3069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1877 gagagagcagatgctttttgtgaggcaatccgtgctctggatgctacagatcttcctgca 1936
Query: 3070 aatagtgtccgcgacttcttcctgcctgctatacagaacctgtttaaagacatggatgca 3129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1937 aatagtgtccgcgacttcttcctgcctgctatacagaacctgtttaaagacatggatgca 1996
Query: 3130 ctggatccagcacacaaagaagcccttgaaattattttgaaggaaagatcagggggaact 3189
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1997 ttggatccagcacacaaagaagcccttgaaattattttgaaggaaagatcagggggaact 2056
Query: 3190 tttgacaatattagcaaggtgatgggcgcccatctcgggcttccatcatcagtcagcaac 3249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2057 tttgacaatattagcaaggtgatgggcgcccatctcgagcttccatcatcagtcagcaac 2116
Query: 3250 ttgtttggtgagggcgggttgctaggaaag 3279
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2117 ttgtttggtgagggcgggttgctaggaaag 2146
Score = 829 bits (418), Expect = 0.0
Identities = 418/418 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1334 aggagctccttcctctaataatgtgtgctattgagcgccacccagatagcagcactcgag 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 aggagctccttcctctaataatgtgtgctattgagcgccacccagatagcagcactcgag 192
Query: 1394 attctttgactcacacattgtttaatttaatcaagcgtcctgatgagcaacagagacaaa 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 attctttgactcacacattgtttaatttaatcaagcgtcctgatgagcaacagagacaaa 252
Query: 1454 taataatggatgcatgtgtcaaccttgcaaagaatgttggagagatgagaacagaaacag 1513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253 taataatggatgcatgtgtcaaccttgcaaagaatgttggagagatgagaacagaaacag 312
Query: 1514 aactgcttccacagtgctgggaacaaatcagtcacatgtacgaggaacgtagactgcttg 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 313 aactgcttccacagtgctgggaacaaatcagtcacatgtacgaggaacgtagactgcttg 372
Query: 1574 ttgctcaatcatgtggagagcttgcagaatttgtgcggcctgagattcgtgattctctta 1633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373 ttgctcaatcatgtggagagcttgcagaatttgtgcggcctgagattcgtgattctctta 432
Query: 1634 ttttatctattgttcagcaactagtagaagattctgccactattgttcgagaggctgccg 1693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 433 ttttatctattgttcagcaactagtagaagattctgccactattgttcgagaggctgccg 492
Query: 1694 ctcgtaatctggctatgctgcttccactattcccaaacgtggataagtatttcaaggt 1751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 493 ctcgtaatctggctatgctgcttccactattcccaaacgtggataagtatttcaaggt 550
Score = 125 bits (63), Expect = 2e-27
Identities = 63/63 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1274 ttcagatacttgcagaggctttgcctaaaattgttccatatgtcttgatcaaccatcgtg 1333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttcagatacttgcagaggctttgcctaaaattgttccatatgtcttgatcaaccatcgtg 60
Query: 1334 agg 1336
|||
Sbjct: 61 agg 63
>gnl|LJGI|TC60865 similar to UniRef100_A7PAV4 Cluster: Chromosome chr14 scaffold_9,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr14 scaffold_9, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (23%)
Length = 1249
Score = 1814 bits (915), Expect = 0.0
Identities = 921/923 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 90 agtggctgatcctcaaactttactggaagagaaagaagcagcagtagaaaagttagctat 149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 327 agtggctgatcctcaaactttactggaagagaaagaagcagcagtagaaaagttagctat 386
Query: 150 tagtgactatgaactgcggttggctcaagaagacatcttaaaattcaaggatgaattgca 209
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 387 tagtgactatgatctgcggttggctcaagaagacatcttaaaattcaaggatgaattgca 446
Query: 210 gaagaagacagaaagtcttaatgaaccaaatgttgcacgcttaagtggagatattttggt 269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 447 gaagaagacagaaagtcttaatgaaccaaatgttgcacgcttaagtggagatattttggt 506
Query: 270 gaatgaagggcaacaaattccactacaaaagagtacttccttcaccgatttgggtccatt 329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 507 gaatgaagggcaacaaattccactacaaaagagtacttccttcaccgatttgggtccatt 566
Query: 330 aaaggatactgaacgtcgagatcttaattgtgctgtaaaggaatacttgcttatggctgg 389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 567 aaaggatactgaacgtcgagatcttaattgtgctgtaaaggaatacttgcttatggctgg 626
Query: 390 ttaccgtcttactgcaatgacattttatgaagaggttacagaccagaacttggacatttg 449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 627 ttaccgtcttactgcaatgacattttatgaagaggttacagaccagaacttggacatttg 686
Query: 450 gcacaacacacctgcatctgtaccagatgccttgcgtcattattattatcagtatctttc 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 687 gcacaacacacctgcatctgtaccagatgccttgcgtcattattattatcagtatctttc 746
Query: 510 atcaacttcagaggctgctgaggaaaaattctccctgcttcgggagaacgaaacattact 569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 747 atcaacttcagaggctgctgaggaaaaattctccctgcttcgggagaacgaaacattact 806
Query: 570 taaagctaataaggtgctgaatcaagaaaaggaggccttgttgaagaacagagatttggc 629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 807 taaagctaataaggtgctgaatcaagaaaaggaggccttgttgaagaacagagatttggc 866
Query: 630 agatgctcaaataggagcattaactaaatccttggaggcaatgcacaaagatgttaagga 689
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 867 agatgctcaaataagagcattaactaaatccttggaggcaatgcacaaagatgttaagga 926
Query: 690 caaagagaacttggtgcaagatttaaaacagtccttggaacatcaaagaaaggtgatcaa 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 927 caaagagaacttggtgcaagatttaaaacagtccttggaacatcaaagaaaggtgatcaa 986
Query: 750 tgattgccgagctgagatcacttcactgaaaatgcatattgaagggtctcacttgggaaa 809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 987 tgattgccgagctgagatcacttcactgaaaatgcatattgaagggtctcacttgggaaa 1046
Query: 810 gaatctggttgttagtgatgttaatactgttcaatctcaatcttcagagaagtatgagga 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1047 gaatctggttgttagtgatgttaatactgttcaatctcaatcttcagagaagtatgagga 1106
Query: 870 agaaattaagaaactgcagatggaaatcgaattgctgaaggaaaataatatcagagctcc 929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1107 agaaattaagaaactgcagatggaaatcgaattgctgaaggaaaataatatcagagctcc 1166
Query: 930 tgaacctggaaattttgttggttctgaaagtgaaaattttcagacggatgataaagtgat 989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1167 tgaacctggaaattttgttggttctgaaagtgaaaattttcagacggatgataaagtgat 1226
Query: 990 tgagattcatgaagatcgggctg 1012
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1227 tgagattcatgaagatcgggctg 1249