Miyakogusa Predicted Gene

Lj1g3v2738190.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj1g3v2738190.1 tr|Q2HUD4|Q2HUD4_MEDTR ATP binding , related
OS=Medicago truncatula GN=MTR_7g078220 PE=4 SV=1,71.18,0,seg,NULL;
Malectin_like,Malectin-like carbohydrate-binding domain,CUFF.29459.1
         (1578 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC67672 similar to UniRef100_Q2HUD4 Cluster: ATP bindin...  2111   0.0  

>gnl|LJGI|TC67672 similar to UniRef100_Q2HUD4 Cluster: ATP binding , related; n=1;
            Medicago truncatula|Rep: ATP binding , related - Medicago
            truncatula (Barrel medic), partial (73%)
          Length = 1454

 Score = 2111 bits (1065), Expect = 0.0
 Identities = 1065/1065 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 514  gatctgggtcgcgctcaatttcacgtcttggttgatgggcatgtcgttttgagcaatttt 573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2    gatctgggtcgcgctcaatttcacgtcttggttgatgggcatgtcgttttgagcaatttt 61

                                                                        
Query: 574  acccgtttgatgaagactggcggtgatggaaaccctagggttgttgagtatctgatctgg 633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62   acccgtttgatgaagactggcggtgatggaaaccctagggttgttgagtatctgatctgg 121

                                                                        
Query: 634  gtcgattcgaaaaagcttgtgatcgtgtttgtgccgagtaaggattcgaaattggcgttt 693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122  gtcgattcgaaaaagcttgtgatcgtgtttgtgccgagtaaggattcgaaattggcgttt 181

                                                                        
Query: 694  gtgaatgccattgaggtgatttctgcacccaaagaccttgttcctgttaaagcacagtat 753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182  gtgaatgccattgaggtgatttctgcacccaaagaccttgttcctgttaaagcacagtat 241

                                                                        
Query: 754  ttgaatttaggaaatttagagagttttgatggtttgaacatgcaagcacttgaagttgtg 813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242  ttgaatttaggaaatttagagagttttgatggtttgaacatgcaagcacttgaagttgtg 301

                                                                        
Query: 814  tatagagtcactgttgggggtcctaaagttaccccttttaatgattcattgtggaggact 873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302  tatagagtcactgttgggggtcctaaagttaccccttttaatgattcattgtggaggact 361

                                                                        
Query: 874  tgggttactgatgatgagtttttcaaatcaagtgttgggtctgaaagaattgtctttggt 933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362  tgggttactgatgatgagtttttcaaatcaagtgttgggtctgaaagaattgtctttggt 421

                                                                        
Query: 934  ggtaggatcaagtatcaagttggcggtgctagtcgcgaagttggaccggataatgtgtat 993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422  ggtaggatcaagtatcaagttggcggtgctagtcgcgaagttggaccggataatgtgtat 481

                                                                        
Query: 994  aatagtgcaaggttgatcaggagtaagaatgattctgttcctaatgtgaatatgacttgg 1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482  aatagtgcaaggttgatcaggagtaagaatgattctgttcctaatgtgaatatgacttgg 541

                                                                        
Query: 1054 gtgttttcaattgttggaggatacaagtacctggttaggttgcatttctgtgatgttgct 1113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542  gtgttttcaattgttggaggatacaagtacctggttaggttgcatttctgtgatgttgct 601

                                                                        
Query: 1114 agcatttcgcttggtttgctatatttcaatgtttatgtcaatggctatttagcttctgaa 1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602  agcatttcgcttggtttgctatatttcaatgtttatgtcaatggctatttagcttctgaa 661

                                                                        
Query: 1174 gacttggatctctcttacatgacaaattcactggcttccccttattatgctgactttgtt 1233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662  gacttggatctctcttacatgacaaattcactggcttccccttattatgctgactttgtt 721

                                                                        
Query: 1234 gttgatggagatagcagcacagggacaggggcactgagtgttagtattggtccttctaaa 1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722  gttgatggagatagcagcacagggacaggggcactgagtgttagtattggtccttctaaa 781

                                                                        
Query: 1294 aacagcattcctcatgtcattgatggtatattgaatggagttgaggttatgaagatgaat 1353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782  aacagcattcctcatgtcattgatggtatattgaatggagttgaggttatgaagatgaat 841

                                                                        
Query: 1354 aactcgcgtaatagtcttgatggagatgtttgtgctggttttgttatgcagagctggtca 1413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842  aactcgcgtaatagtcttgatggagatgtttgtgctggttttgttatgcagagctggtca 901

                                                                        
Query: 1414 agtggaaattcaggtattgtgctaactttcatggctgctgtttgcattgtgttaagctta 1473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902  agtggaaattcaggtattgtgctaactttcatggctgctgtttgcattgtgttaagctta 961

                                                                        
Query: 1474 gccatagtgattcgtaggaggatggttgagtctagggaatctgtatcatggtcaaggttg 1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962  gccatagtgattcgtaggaggatggttgagtctagggaatctgtatcatggtcaaggttg 1021

                                                         
Query: 1534 cctgtgaatttatcggatgataatgttaaaaccagcaatatatag 1578
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 cctgtgaatttatcggatgataatgttaaaaccagcaatatatag 1066