Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v2432910.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v2432910.1 tr|B9IGN9|B9IGN9_POPTR Predicted protein
OS=Populus trichocarpa GN=POPTRDRAFT_778006 PE=4
SV=1,45.99,1e-17,seg,NULL,CUFF.29032.1
(1099 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC79955 weakly similar to UniRef100_A7QFJ3 Cluster: Chr... 1162 0.0
gnl|LJGI|DC598655 similar to UniRef100_A7QFJ3 Cluster: Chromosom... 1007 0.0
>gnl|LJGI|TC79955 weakly similar to UniRef100_A7QFJ3 Cluster: Chromosome chr8
scaffold_88, whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis
vinifera|Rep: Chromosome chr8 scaffold_88, whole genome
shotgun sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (15%)
Length = 826
Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0
Identities = 592/594 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 506 aacaaatgcaacttcataatgaaccccaaccattgcagtatcagccccagccacatttac 565
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Sbjct: 2 aacaaatgcaacttcataatgaaccccaaccattgcagtatcagccccagccacatttac 61
Query: 566 agcaccagcctcaacatcatccgcattttcagcctcacccccaaccacagctacagtctc 625
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Sbjct: 62 agcatcagcctcaacatcatccgcattttcagcctcacccccaaccacagctacagtctc 121
Query: 626 agccccaaccccaacacattcagcaatctcaaccacaacctcagtcccaaccccaacaca 685
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Sbjct: 122 agccccaaccccaacacattcagcaatctcaaccacaacctcagtcccaaccccaacaca 181
Query: 686 ttcagcaacctcaaccacaacctcagctccaacacattcaacaatctcaaccacaaccgc 745
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Sbjct: 182 ttcagcaacctcaaccacaacctcagctccaacacattcagcaatctcaaccacaaccgc 241
Query: 746 aatttcagaatcaacattttcagtaccctggaacatatcctcccccaccatgggctgcta 805
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Sbjct: 242 aatttcagaatcaacattttcagtaccctggaacatatcctcccccaccatgggctgcta 301
Query: 806 ctcccggatatcccaattatcaaaaccacttatcttcaacaaatgcgttgtcaactcctc 865
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Sbjct: 302 ctcccggatatcccaattatcaaaaccacttatcttcaacaaatgcgttgtcaactcctc 361
Query: 866 aagccaacacaccttacacatctgctgttagaggagatcctgtggcgagttctggacaga 925
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Sbjct: 362 aagccaacacaccttacacatctgctgttagaggagatcctgtggcgagttctggacaga 421
Query: 926 gtaaccctcccaatgcaaccggacaaaggccctttgttccgtcttaccggttatttgaag 985
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Sbjct: 422 gtaaccctcccaatgcaaccggacaaaggccctttgttccgtcttaccggttatttgaag 481
Query: 986 atttgaatgtttttggaaacactgatggaagggcaaaggtgactggaagtggcacatcat 1045
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Sbjct: 482 atttgaatgtttttggaaacactgatggaagggcaaaggtgactggaagtggcacatcat 541
Query: 1046 cttccagcatgtcagggacaatgggacctggtatggtcgggggaagaaagtgaa 1099
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Sbjct: 542 cttccagcatgtcagggacaatgggacctggtatggtcgggggaagaaagtgaa 595
>gnl|LJGI|DC598655 similar to UniRef100_A7QFJ3 Cluster: Chromosome chr8 scaffold_88,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr8 scaffold_88, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (5%)
Length = 569
Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0
Identities = 517/520 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 19 ccctcgaatgcattagctcttcccgccccacctgcaccagttagtacttcaaaagatcag 78
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Sbjct: 50 ccctcgaatgcattagctcttcccgacccacctgcaccagttagtacttcaaaagatcag 109
Query: 79 gacattattgacttactgagtctcactttgtccctggcaccgtcttctccgcagcagaca 138
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Sbjct: 110 gacattattgacttactgagtctcactttgtccctggcaccgtcttctccgcagcagaca 169
Query: 139 acttacacgccatcagcctctagccaaggcatgcatcagatacctgctccatccggaacc 198
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Sbjct: 170 acttacacgccatcagcctctagccaaggcatgcatcagatacctgctccatccggaacc 229
Query: 199 ggaacagaaggttattcttatgctccccaaacatatcctggaagtttgccattcgacagt 258
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Sbjct: 230 ggaacagaaggttattcttatgctccccaaacatatcctggaagtttgccattcgacagt 289
Query: 259 tacgttgtcccatgggcccaaccccaacctcaatctcaatcccaacccgcaaccccaccc 318
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Sbjct: 290 tacgttgtcccatgggcccaaccccaacctcaatctcaatcccaacccgcaaccccaccc 349
Query: 319 tcacatcaacatttgcatacaccttttgaatctgaacaagctttgcaacatcaacaaacc 378
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Sbjct: 350 tcacatcaacatttgcatacaccttttgaatctgaacaagctttgcatcatcaacaaacc 409
Query: 379 caaccgtcacaggctcagcaccagtcacagctattacaatcacagcaccaaccacaatcc 438
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Sbjct: 410 caaccgtcacagtctcagcaccagtcacagctattacaatcacagcaccaaccacaatcc 469
Query: 439 cctcaagcattgcaaccacagcctcattcacaatttcagaatcagcatattcagtataac 498
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Sbjct: 470 cctcaagcattgcaaccacagcctcattcacaatttcagaatcagcatattcagtataac 529
Query: 499 cctcctcaacaaatgcaacttcataatgaaccccaaccat 538
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Sbjct: 530 cctcctcaacaaatgcaacttcataatgaaccccaaccat 569