Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v2295200.4
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v2295200.4 tr|Q7X9C1|Q7X9C1_LOTJA NIN-like protein 1
OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,94.02,0,seg,NULL; RWP-RK,Plant regulator
RWP-RK; RWP_RK,Plant regulator RWP-RK; SUBFAMILY NOT NAMED,NULL;
FA,CUFF.28829.4
(1749 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC63894 UniRef100_Q7X9C1 Cluster: NIN-like protein 1; n... 3374 0.0
gnl|LJGI|TC74887 UniRef100_Q9S7B1 Cluster: Nodule inception prot... 74 3e-12
>gnl|LJGI|TC63894 UniRef100_Q7X9C1 Cluster: NIN-like protein 1; n=1; Lotus
japonicus|Rep: NIN-like protein 1 - Lotus japonicus,
complete
Length = 3498
Score = 3374 bits (1702), Expect = 0.0
Identities = 1716/1720 (99%), Gaps = 3/1720 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 33 agaggaggactccaaggagttggtgccgggattgccgggtcgagttttccgggacaaggt 92
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 agaggaggactccaaggagttggtgccgggattgccgggtcgagttttccgggacaaggt 1321
Query: 93 tcctgagtggactcctgatgtgaggttcttcaggagtgatgagtacccgcgtgtcgaaca 152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1322 tcctgagtggactcctgatgtgaggttcttcaggagtgatgagtacccgcgtgtcgaaca 1381
Query: 153 tgctcgagagtttgacatatgtggaacattagcagtgccaatctttgagcaaggtagcag 212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1382 tgctcgagagtttgacatatgtggaacattagcagtgccaatctttgagcaaggtagcag 1441
Query: 213 gacttgcttgggtgttattgaggttgtgatgactacacagcagatcaattatgtccctca 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1442 gacttgcttgggtgttattgaggttgtgatgactacacagcagatcaattatgtccctca 1501
Query: 273 acttgagagtgtttgcaaggcacttgaggttgttgatcttacaagcttgaaacattcaag 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1502 acttgagagtgtttgcaaggcacttgaggttgttgatcttacaagcttgaaacattcaag 1561
Query: 333 tattcagaatgcaaag---gcacgtgacaagtcgtatgaagctgcactacccgagattca 389
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1562 tattcagaatgcaaagcaggcacgtgacaagtcgtatgaagctgcactacccgagattca 1621
Query: 390 agaggtgctgagatctgcatgtcatatgcacaaattacctttagctcaaacttgggtctc 449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1622 agaggtgctgagatctgcatgtcatatgcacaaattacctttagctcaaacttgggtctc 1681
Query: 450 gtgctttcaacaaggcaaagatgggtgccggcattctgaagataattacttacactgcat 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1682 gtgctttcaacaaggcaaagatgggtgccggcattctgaagataattacttacactgcat 1741
Query: 510 atctcctgtggagcaagcttgctatgttggtgatccctctgttaggttctttcatgaggc 569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1742 atctcctgtggagcaagcttgctatgttggtgatccctctgttaggttctttcatgaggc 1801
Query: 570 ttgcatggagcatcacttgttaaaaggtcaaggtgttgctgggaaagctttcatgataaa 629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1802 ttgcatggagcatcacttgttaaaaggtcaaggtgttgctgggaaagctttcatgataaa 1861
Query: 630 tcaaccattcttctcaaccgacataactatgttaagcaagacagactatccactgtctca 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1862 tcaaccattcttctcaaccgacataactatgttaagcaagacagactatccactgtctca 1921
Query: 690 tcatgccagattgttcggattgcgcgctgcagttgccatacgcctccgaagcatctatag 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1922 tcatgccagattgttcggattgcgcgctgcagttgccatacgcctccgaagcatctatag 1981
Query: 750 tagtgcagatgactatgttctagagttcttcttgcctgtgaattgcaatgacagtgaaga 809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1982 tagtgcagatgactatgttctagagttcttcttgcctgtgaattgcaatgacagtgaaga 2041
Query: 810 acagaaaaacatgcttatatcattgtccataattatacaaaggtgttgccgcagcttgcg 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2042 acagaaaaacatgcttatatcattgtccataattatacaaaggtgttgccgcagcttgcg 2101
Query: 870 ggttataacagataaggaattggagagaactagctcatcagttgaagtgatggcccttga 929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2102 ggttataacagataaggaattggagagaactagctcatcagttgaagtgatggcccttga 2161
Query: 930 agatagtggatttgctaggactgtgaaatggtcagaaccccaacacataacaagtgttgc 989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2162 agatagtggatttgctaggactgtgaaatggtcagaaccccaacacataacaagtgttgc 2221
Query: 990 ctcattggaacctgaagaaaaatcaagtgaaacagtgggtggaaaattctctgatctaag 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2222 ctcattggaacctgaagaaaaatcaagtgaaacagtgggtggaaaattctctgatctaag 2281
Query: 1050 ggaacatcaagaagattctattttaaaaggaaacattgagtgtgatagggagtgttctcc 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2282 ggaacatcaagaagattctattttaaaaggaaacattgagtgtgatagggagtgttctcc 2341
Query: 1110 ttttgttgaaggtaacttatcaagtgtgggaataagtaaaaccggagagaaaaggcgagc 1169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2342 ttttgttgaaggtaacttatcaagtgtgggaataagtaaaaccggagagaaaaggcgagc 2401
Query: 1170 caaagcagataaaactatcactctggaagttcttaggcaatattttcctggaagcctaaa 1229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2402 caaagcagataaaactatcactctggaagttcttaggcaatattttcctggaagcctaaa 2461
Query: 1230 agatgctgcaaagaatattggtgtttgtactacaactttgaaaagggtatgccgacaaca 1289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2462 agatgctgcaaagaatattggtgtttgtactacaactttgaaaagggtatgccgacaaca 2521
Query: 1290 tgggataaagcgttggccttctagaaagatcaagaaggttggtcactccttacagaaact 1349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2522 tgggataaagcgttggccttctagaaagatcaagaaggttggtcactccttacagaaact 2581
Query: 1350 ccaacttgtcattgactcagttcaaggtgcctctggtgcatcatttaaaattgattcctt 1409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2582 ccaacttgtcattgactcagttcaaggtgcctctggtgcatcatttaaaattgattcctt 2641
Query: 1410 ctattcgaacttcccggatctagcttctccaaatttatcaggagccagcctggtctcagc 1469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2642 ctattcgaacttcccggatctagcttctccaaatttatcaggagccagcctggtctcagc 2701
Query: 1470 tctgaatcaaagtgaaaatccaaactcattaagcatacaacctgatcttggcccgttgag 1529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2702 tctgaatcaaagtgaaaatccaaactcattaagcatacaacctgatcttggcccgttgag 2761
Query: 1530 cccagaaggtgcaaccaaatcactctcttcctcatgcagccagggttccctttcaagcca 1589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2762 cccagaaggtgcaaccaaatcactctcttcctcatgcagccagggttccctttcaagcca 2821
Query: 1590 ttcctgttccagcatgccagagcaacaacctcacacaagtgatgttgcttgtaacaaaga 1649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2822 ttcctgttccagcatgccagagcaacaacctcacacaagtgatgttgcttgtaacaaaga 2881
Query: 1650 tcctgtggttggtaaagactctgctgatgttgtgttgaagaggatcagaagtgaagcaga 1709
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2882 tcctgtggttggtaaagactctgctgatgttgcgttgaagaggatcagaagtgaagcaga 2941
Query: 1710 gcttaaaagccacagtgaaaataaagcaaaactcttcccc 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2942 gcttaaaagccacagtgaaaataaagcaaaactcttcccc 2981
Score = 67.9 bits (34), Expect = 2e-10
Identities = 34/34 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgctcatacaaatttgggtgccagttcctcgag 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1122 atgctcatacaaatttgggtgccagttcctcgag 1155
>gnl|LJGI|TC74887 UniRef100_Q9S7B1 Cluster: Nodule inception protein; n=1; Lotus
japonicus|Rep: Nodule inception protein - Lotus
japonicus, complete
Length = 3000
Score = 73.8 bits (37), Expect = 3e-12
Identities = 94/113 (83%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1219 ggaagcctaaaagatgctgcaaagaatattggtgtttgtactacaactttgaaaagggta 1278
||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||| ||
Sbjct: 1866 ggaagcctaaaagatgcagcaaagagcattggtgtatgtcccacaactctgaaaaggata 1925
Query: 1279 tgccgacaacatgggataaagcgttggccttctagaaagatcaagaaggttgg 1331
||| |||| ||||| || | | |||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct: 1926 tgcagacagcatggcatcaccaggtggccttcaaggaaaatcaagaaggttgg 1978