Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v2155490.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v2155490.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1JCI9|I1JCI9_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=4 SV=1,49.5,2e-17,seg,NULL;
ZF_C3H1,Zinc finger, CCCH-type,CUFF.28643.1
(1260 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC78341 similar to UniRef100_A7NSY8 Cluster: Chromosome... 2456 0.0
>gnl|LJGI|TC78341 similar to UniRef100_A7NSY8 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_1,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_1, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (53%)
Length = 1549
Score = 2456 bits (1239), Expect = 0.0
Identities = 1253/1260 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgcgtggatcgcatagacgagtttcatgggcttctgattttaatctttgtcaggttagg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 159 atgcgtggatcgcatagacgagtttcatgggcttctgattttaatctttgtcaggttagg 218
Query: 61 ttattcttatcagatgaatctccttcacaagttgggttaaattctcaagatcacctccaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 219 ttattcttatcagatgaatctccttcacaagttgggttaaattctcaagatcacctccaa 278
Query: 121 gcaaagacatcattgctgttgcatccaggtggagctggttctgatgactctctgcctcct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 279 gcaaagacatcattgctgttgcatccaggtggagctggttctgatgactctctgcctcct 338
Query: 181 ggatttgagggaactcatgcttcaagtcagtttgagattaatctgtcccaaataccagtt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 339 ggatttgagggaactcatgcttcaagtcagtttgagattaatctgtcccaaataccagtt 398
Query: 241 attagttggactagacctccaaagattgtgctaaatctcacatggcaagtggtggctgga 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 399 attagttggactagacctccaaagattgtgctaaatctcacatggcaagtggtggctgga 458
Query: 301 gaagagagcaaagaggtggaggatcaacataaaagggagctgagagtacttgaagctatt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 459 gaagagagcaaagaggtggaggatcaacataaaagggagctgagagtacttgaagctatt 518
Query: 361 tatcctcgcatttcgtccattccttcaaaccctgctgtttcagtggatgtggaaaattcc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 519 tatcctcgcatttcgtccattccttcaaaccctgctgtttcagtggatgtggaaaattcc 578
Query: 421 catcacattgatggtcaaattcctttgataccaattactcctattgaagacgatgatgcg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 579 catcacattgatggtcaaattcctttgataccaattactcctattgaagacgatgatgcg 638
Query: 481 gttgccgatacagtatctaatgtttcacagtctcttgaacaacctactggtatattgaag 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 639 gttgccgatacagtatctaatgtttcacagtctcttgaacaacctactggtatattgaag 698
Query: 541 gtttcgagctctgctacaaatatgcacttagctggtggtctagggtctgatgtagctgct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 699 gtttcgagctctgctacaaatatgcacttagctggtggtctagggtctgatgtagctgct 758
Query: 601 gcagctgctgctttaaccaacatagtcaagagcaatgaacgtggaaatttgattgaccat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 759 gcagctgctgctttaaccaacatagtcaagagcaatgaacgtggaaatttgattgaccat 818
Query: 661 gaattacttaagaatattctcaggagtccagaagtgattgagaagttggttagagattat 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 819 gaattacttaagaatattctcaggagtccagaagtgattgagaagttggttagagattat 878
Query: 721 ggagttactaataattcacagtatgtacataatgtgggaccatcttcagcagctttttca 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 879 ggagttactaataattcacagtatgtacataatgtgggaccatcttcagcagctttttca 938
Query: 781 cgtcctcctattgctactaatcaaggagaaaatgctttgctctcatcggttacttcttcc 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 939 cgtcctcctattgctactaatcaaggagaaaatgctttgctctcatcggttacttcttcc 998
Query: 841 tatattcacccaactggaggccaggcagcaagcgtttctacccagtgggttcctaggcct 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 999 tatattcacccaactggaggccaggcagcaagcgtttctacccagtgggttcctaggcct 1058
Query: 901 gtagtgaattcagttagtgttgcttcccctgttgaggtcccttcnnnnnnngatgcaaac 960
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1059 gtagtgaattcagttagtgttgcttcccctgttgaggtcccttcaaaaaaagatgcaaac 1118
Query: 961 tactataagagcttaattcaacaacatggaggagacaaacaagaaacatttccatactct 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1119 tactataagagcttaattcaacaacatggaggagacaaacaagaaacatttccatactct 1178
Query: 1021 agcagtaatcagatccagcagccagtaaaccaatatgagacagcatacaatcctagagcg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1179 agcagtaatcagatccagcagccagtaaaccaatatgagacagcatacaatcctagagcg 1238
Query: 1081 aaagcgttgagaccaaagataatgaagccttgtatcttctttaacagttctagagggtgt 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1239 aaagcgttgagaccaaagataatgaagccttgtatcttctttaacagttctagagggtgt 1298
Query: 1141 aggaatggagctaactgctcataccagcatgatgcatcattccagcaacgagggagtact 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1299 aggaatggagctaactgctcataccagcatgatgcatcattccagcaacgagggagtact 1358
Query: 1201 gtgtccgggatacaaagctcaaagagaatgaaactggataatgagattagcagttaatta 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1359 gtgtccgggatacaaagctcaaagagaatgaaactggataatgagattagcagttaatta 1418