Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v2110490.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v2110490.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3SIC1|I3SIC1_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,99.38,0,no
description,Nucleic acid-binding, OB-fold; no description,Translation
initiation factor 2, alpha ,CUFF.28550.1
(960 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC73164 similar to UniRef100_A7Q3N2 Cluster: Chromosome... 1903 0.0
gnl|LJGI|TC59267 similar to UniRef100_A7Q3N2 Cluster: Chromosome... 1895 0.0
>gnl|LJGI|TC73164 similar to UniRef100_A7Q3N2 Cluster: Chromosome chr13 scaffold_48,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr13 scaffold_48, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (97%)
Length = 1404
Score = 1903 bits (960), Expect = 0.0
Identities = 960/960 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctccgaatctcgagtgtcgcatgtacgaaaccaagtacccggaggtagacatggcg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 177 atggctccgaatctcgagtgtcgcatgtacgaaaccaagtacccggaggtagacatggcg 236
Query: 61 gtgatgattcaggtcaagaacatcgccgatatgggtgcatacgtctccctgttagagtac 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 237 gtgatgattcaggtcaagaacatcgccgatatgggtgcatacgtctccctgttagagtac 296
Query: 121 aacaacatcgaagggatgatcctgttctcggagctctcccgccgtcggattcggagtgtc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 297 aacaacatcgaagggatgatcctgttctcggagctctcccgccgtcggattcggagtgtc 356
Query: 181 agcagtctcatcaaggtgggtcgcattgagccggtgatggtcctccgtgttgacaaggag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 357 agcagtctcatcaaggtgggtcgcattgagccggtgatggtcctccgtgttgacaaggag 416
Query: 241 aagggttacatcgatctcagtaagcgtagggtttctgaagaagatattcagacttgtgag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 417 aagggttacatcgatctcagtaagcgtagggtttctgaagaagatattcagacttgtgag 476
Query: 301 gagaggtacaacaagagcaagctcgttcactccatcatgcgccatgttgctgaaacccta 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 477 gagaggtacaacaagagcaagctcgttcactccatcatgcgccatgttgctgaaacccta 536
Query: 361 aacattgatttagaggagctgtatgttcacattggatggcctttatatcgcaaatacggt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 537 aacattgatttagaggagctgtatgttcacattggatggcctttatatcgcaaatacggt 596
Query: 421 catgcttttgaggcattcaaaatagttgtgactgatcctgattctgttttgaatcttcta 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 597 catgcttttgaggcattcaaaatagttgtgactgatcctgattctgttttgaatcttcta 656
Query: 481 actcgtgaggttaaggaagttggccctgatgggcaagaggtgaccaaggtggtacctgct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 657 actcgtgaggttaaggaagttggccctgatgggcaagaggtgaccaaggtggtacctgct 716
Query: 541 gtatctgaagaagtgaaggattctcttgtgaagaatatcagaaggcggatgactccccaa 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 717 gtatctgaagaagtgaaggattctcttgtgaagaatatcagaaggcggatgactccccaa 776
Query: 601 cctttgaaaattagggcggatattgaaatgaaatgtttccaatttgatggagttcttcac 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 777 cctttgaaaattagggcggatattgaaatgaaatgtttccaatttgatggagttcttcac 836
Query: 661 atcaaggaggctatgcgtaaggctgaagctgctggaaatgatgactgccctgtgaacatt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 837 atcaaggaggctatgcgtaaggctgaagctgctggaaatgatgactgccctgtgaacatt 896
Query: 721 aaacttgttgcgcccccactttacgttcttaccacacagacccttgacaaggagcaagga 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 897 aaacttgttgcgcccccactttacgttcttaccacacagacccttgacaaggagcaagga 956
Query: 781 atattggttctcaacaatgccattgtttcttgcactgaatcaatagagaaacacaagggt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 957 atattggttctcaacaatgccattgtttcttgcactgaatcaatagagaaacacaagggt 1016
Query: 841 aaacttgtggtgaaggaggcagccagagcggtgagtgagcgtgatgataaagtgattgcg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1017 aaacttgtggtgaaggaggcagccagagcggtgagtgagcgtgatgataaagtgattgcg 1076
Query: 901 gagtacatggctaagctacgccaagagaatgaggaggtgagcggcgatgaagatagcgag 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1077 gagtacatggctaagctacgccaagagaatgaggaggtgagcggcgatgaagatagcgag 1136
>gnl|LJGI|TC59267 similar to UniRef100_A7Q3N2 Cluster: Chromosome chr13 scaffold_48,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr13 scaffold_48, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (97%)
Length = 1209
Score = 1895 bits (956), Expect = 0.0
Identities = 959/960 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctccgaatctcgagtgtcgcatgtacgaaaccaagtacccggaggtagacatggcg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 96 atggctccgaatctcgagtgtcgcatgtacgaaaccaagtacccggaggtagacatggcg 155
Query: 61 gtgatgattcaggtcaagaacatcgccgatatgggtgcatacgtctccctgttagagtac 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 156 gtgatgattcaggtcaagaacatcgccgatatgggtgcatacgtctccctgttagagtac 215
Query: 121 aacaacatcgaagggatgatcctgttctcggagctctcccgccgtcggattcggagtgtc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 216 aacaacatcgaagggatgatcctgttctcggagctctcccgccgtcggattcggagtgtc 275
Query: 181 agcagtctcatcaaggtgggtcgcattgagccggtgatggtcctccgtgttgacaaggag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276 agcagtctcatcaaggtgggtcgcattgagccggtgatggtcctccgtgttgacaaggag 335
Query: 241 aagggttacatcgatctcagtaagcgtagggtttctgaagaagatattcagacttgtgag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 336 aagggttacatcgatctcagtaagcgtagggtttctgaagaagatattcagacttgtgag 395
Query: 301 gagaggtacaacaagagcaagctcgttcactccatcatgcgccatgttgctgaaacccta 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 396 gagaggtacaacaagagcaagctcgttcactccatcatgcgccatgttgctgaaacccta 455
Query: 361 aacattgatttagaggagctgtatgttcacattggatggcctttatatcgcaaatacggt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 456 aacattgatttagaggagctgtatgttcacattggatggcctttatatcgcaaatacggt 515
Query: 421 catgcttttgaggcattcaaaatagttgtgactgatcctgattctgttttgaatcttcta 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 516 catgcttttgaggcattcaaaatagttgtgactgatcctgattctgttttgaatcttcta 575
Query: 481 actcgtgaggttaaggaagttggccctgatgggcaagaggtgaccaaggtggtacctgct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 576 actcgtgaggttaaggaagttggccctgatgggcaagaggtgaccaaggtggtacctgct 635
Query: 541 gtatctgaagaagtgaaggattctcttgtgaagaatatcagaaggcggatgactccccaa 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 636 gtatctgaagaagtgaaggattctcttgtgaagaatatcagaaggcggatgactccccaa 695
Query: 601 cctttgaaaattagggcggatattgaaatgaaatgtttccaatttgatggagttcttcac 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 696 cctttgaaaattagggcggatattgaaatgaaatgtttccaatttgatggagttcttcac 755
Query: 661 atcaaggaggctatgcgtaaggctgaagctgctggaaatgatgactgccctgtgaacatt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 756 atcaaggaggctatgcgtaaggctgaagctgctggaaatgatgactgccctgtgaacatt 815
Query: 721 aaacttgttgcgcccccactttacgttcttaccacacagacccttgacaaggagcaagga 780
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 816 aaacttgttgcgcccccactctacgttcttaccacacagacccttgacaaggagcaagga 875
Query: 781 atattggttctcaacaatgccattgtttcttgcactgaatcaatagagaaacacaagggt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 876 atattggttctcaacaatgccattgtttcttgcactgaatcaatagagaaacacaagggt 935
Query: 841 aaacttgtggtgaaggaggcagccagagcggtgagtgagcgtgatgataaagtgattgcg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 936 aaacttgtggtgaaggaggcagccagagcggtgagtgagcgtgatgataaagtgattgcg 995
Query: 901 gagtacatggctaagctacgccaagagaatgaggaggtgagcggcgatgaagatagcgag 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 996 gagtacatggctaagctacgccaagagaatgaggaggtgagcggcgatgaagatagcgag 1055