Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v2035090.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v2035090.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3S4X3|I3S4X3_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,99.05,0,PCI/PINT
associated module,PCI/PINT associated module; motif in proteasome
subunits, Int-6, Nip-1 a,,CUFF.28283.1
(1271 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC60588 2512 0.0
gnl|LJGI|TC69092 644 0.0
gnl|LJGI|TC79310 404 e-112
gnl|LJGI|BP072325 54 2e-06
>gnl|LJGI|TC60588
Length = 1665
Score = 2512 bits (1267), Expect = 0.0
Identities = 1270/1271 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtcttcatcttatcttcctgccacaacagaatcagttgctttggcattggaggccaaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 162 atgtcttcatcttatcttcctgccacaacagaatcagttgctttggcattggaggccaaa 221
Query: 61 gacccatctgagggcatttccattctttaccgtgtgcttgaagatccttcttcttcaccc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 222 gacccatctgagggcatttccattctttaccgtgtgcttgaagatccttcttcttcaccc 281
Query: 121 gaagccttgcgtatgaaagagcaagccatcacaaacctcactgatcttctcaggcaagag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 282 gaagccttgcgtatgaaagagcaagccatcacaaacctcactgatcttctcaggcaagag 341
Query: 181 aataggggagaggatctgcgcagccttctcactcaattgaggccctttttctccttgatt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 342 aataggggagaggatctgcgcagccttctcactcaattgaggccctttttctccttgatt 401
Query: 241 cctaaggccaaaactgcaaagattgttaggggaataattgactctgttgctaaaatacca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 402 cctaaggccaaaactgcaaagattgttaggggaataattgactctgttgctaaaatacca 461
Query: 301 gggtcatctgatctacaaattgcactctgcaaagaaatggtgcagtggacccgtgctgaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 462 gggtcatctgatctacaaattgcactctgcaaagaaatggtgcagtggacccgtgctgaa 521
Query: 361 aagcgtacctttttgaggcagcgagttgaggcaaggcttgcagcacttctgatggaaact 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 522 aagcgtacctttttgaggcagcgagttgaggcaaggcttgcagcacttctgatggaaact 581
Query: 421 aaggagtattcagaagctttgactcttctttctgggttggtcaaagaggttcggagacta 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 582 aaggagtattcagaagctttgactcttctttctgggttggtcaaagaggttcggagacta 641
Query: 481 gatgacaagctgcttcttgtagacatagacttgctggaaagcaagctacacttctcatta 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 642 gatgacaagctgcttcttgtagacatagacttgctggaaagcaagctacacttctcatta 701
Query: 541 agaaaccttccgaaggcaaaagctgctctcactgctgcaagaacagctgcaaatgctatt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 702 agaaaccttccgaaggcaaaagctgctctcactgctgcaagaacagctgcaaatgctatt 761
Query: 601 tatgtgcctccagctcaacaaggtgcaattgatctccagagtggaatacttcatgctgag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 762 tatgtgcctccagctcaacaaggtgcaattgatctccagagtggaatacttcatgctgag 821
Query: 661 gagaaggattacaaaacagcatacagttatttctttgaagcttttgagtccttcaacgct 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 822 gagaaggattacaaaacagcatacagttatttctttgaagcttttgagtccttcaacgct 881
Query: 721 cttgaagaccccaaggctgtttttagcttaaaatacatgttgctgtgtaagatcatggtg 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 882 cttgaagaccccaaggctgtttttagcttaaaatacatgttgctgtgtaagatcatggtg 941
Query: 781 aatcaagctgacgatgtgggcggaattatttcatcgaaagcaggcctgcaatatgttgga 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 942 aatcaagctgacgatgtgggcggaattatttcatcgaaagcaggcctgcaatatgttgga 1001
Query: 841 cctgatttggatgcgatgaaagctgttgctgatgctcattccaagcgatccctcaagtta 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1002 cctgatttggatgcgatgaaagctgttgctgatgctcattccaagcgatccctcaagtta 1061
Query: 901 ttcgaaaccgctttgcgtaactacaaggcgcagttggaggaagatccaattgttcacagg 960
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1062 ttcgaaaccgctttgcgtgactacaaggcgcagttggaggaagatccaattgttcacagg 1121
Query: 961 cacctgcagtccctttatggtacccttatggaacagaatctttgcagattgattgagcca 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1122 cacctgcagtccctttatggtacccttatggaacagaatctttgcagattgattgagcca 1181
Query: 1021 ttctcaagggttgagattgcacacattgctgagcttattgaacttcccattgatcatgtg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1182 ttctcaagggttgagattgcacacattgctgagcttattgaacttcccattgatcatgtg 1241
Query: 1081 gagaggaagttgtctcagatgattctggacaagaagtttgctggaacattggatcaaggt 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1242 gagaggaagttgtctcagatgattctggacaagaagtttgctggaacattggatcaaggt 1301
Query: 1141 gctggatgcctcatcatatttgatgatcccaagactgatgctatatatcctgcaactttg 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1302 gctggatgcctcatcatatttgatgatcccaagactgatgctatatatcctgcaactttg 1361
Query: 1201 gagaccatttcaaatattgggaaggtcgtggacagtctttatgttaggtctgccaagata 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1362 gagaccatttcaaatattgggaaggtcgtggacagtctttatgttaggtctgccaagata 1421
Query: 1261 atggcatgagc 1271
|||||||||||
Sbjct: 1422 atggcatgagc 1432
>gnl|LJGI|TC69092
Length = 607
Score = 644 bits (325), Expect = 0.0
Identities = 370/385 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 887 gatccctcaagttattcgaaaccgctttgcgtaactacaaggcgcagttggaggaagatc 946
|||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1 gatccctcaagttatttgaaactgctttgcgtgactacaaggcgcagttggaggaagacc 60
Query: 947 caattgttcacaggcacctgcagtccctttatggtacccttatggaacagaatctttgca 1006
|||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct: 61 caatagttcacaggcacctgcaatctctgtatggtacccttatggagcagaatctttgta 120
Query: 1007 gattgattgagccattctcaagggttgagattgcacacattgctgagcttattgaacttc 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gattgattgagccattctcaagggttgagattgcacacattgctgagcttattgaacttc 180
Query: 1067 ccattgatcatgtggagaggaagttgtctcagatgattctggacaagaagtttgctggaa 1126
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 181 ccattgaacatgtggagaggaagttgtctcagatgattctggacaagaagtttgctggga 240
Query: 1127 cattggatcaaggtgctggatgcctcatcatatttgatgatcccaagactgatgctatat 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cattggatcaaggtgctggatgcctcatcatatttgatgatcccaagactgatgctatat 300
Query: 1187 atcctgcaactttggagaccatttcaaatattgggaaggtcgtggacagtctttatgtta 1246
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atcctgcaactttggagaccatttccaatattggcaaggtcgtggacagtctttatgtta 360
Query: 1247 ggtctgccaagataatggcatgagc 1271
||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 361 ggtctgccaagataatggcctgagc 385
>gnl|LJGI|TC79310
Length = 450
Score = 404 bits (204), Expect = e-112
Identities = 282/308 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7 tcatcttatcttcctgccacaacagaatcagttgctttggcattggaggccaaagaccca 66
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 141 tcatcttatcttcctgccaccacagaatcagttgctctggcattggaggccaaagaccca 200
Query: 67 tctgagggcatttccattctttaccgtgtgcttgaagatccttcttcttcacccgaagcc 126
||||| | ||||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| |||||
Sbjct: 201 tctgatgccatttccattctttatcgcgtcctcgacgatccgtcttcttcaccggaagct 260
Query: 127 ttgcgtatgaaagagcaagccatcacaaacctcactgatcttctcaggcaagagaatagg 186
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 261 ctgcgtatgaaggagcaggccatcacaaacctcactgatcttctcaggcaagagaatcgg 320
Query: 187 ggagaggatctgcgcagccttctcactcaattgaggccctttttctccttgattcctaag 246
||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 321 ggagaggatctgcgcggtcttctcactcaattgagaccttttttctccttgattccgaag 380
Query: 247 gccaaaactgcaaagattgttaggggaataattgactctgttgctaaaataccagggtca 306
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct: 381 gccaaaactgcaaagattgttaggggaataatcgactccgttgctaaaataccgggctcg 440
Query: 307 tctgatct 314
||||||||
Sbjct: 441 tctgatct 448
>gnl|LJGI|BP072325
Length = 153
Score = 54.0 bits (27), Expect = 2e-06
Identities = 30/31 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1230 ggacagtctttatgttaggtctgccaagata 1260
||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 153 ggacagtctctatgttaggtctgccaagata 123