Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v1785860.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v1785860.1 Non Chatacterized Hit- tr|G1RFD5|G1RFD5_NOMLE
Uncharacterized protein OS=Nomascus leucogenys
GN=FUBP,36.93,3e-18,seg,NULL; KH_1,K Homology domain, type 1; KH
DOMAIN-CONTAINING PROTEIN,NULL; KH DOMAIN CONTAINING RN,CUFF.27848.1
(1791 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC77869 similar to UniRef100_A7P4I3 Cluster: Chromosome... 2401 0.0
gnl|LJGI|TC70698 weakly similar to UniRef100_Q29AF0 Cluster: GA1... 775 0.0
gnl|LJGI|TC57564 similar to UniRef100_A7P4I3 Cluster: Chromosome... 359 4e-98
gnl|LJGI|DC593634 weakly similar to UniRef100_A8EH71 Cluster: Ch... 339 4e-92
>gnl|LJGI|TC77869 similar to UniRef100_A7P4I3 Cluster: Chromosome chr4 scaffold_6,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr4 scaffold_6, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (40%)
Length = 1269
Score = 2401 bits (1211), Expect = 0.0
Identities = 1211/1211 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcagaggaagcgcactatgcagcaccggcatcggaatccctcaaacggaagtacgat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 59 atggcagaggaagcgcactatgcagcaccggcatcggaatccctcaaacggaagtacgat 118
Query: 61 gagccacccacccaccgccccaccggcttctcctcccctcattccaccgtctccgacatc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 119 gagccacccacccaccgccccaccggcttctcctcccctcattccaccgtctccgacatc 178
Query: 121 gagctcgccaagcagaaagctcaagaagtcgctgctcgtctcttcagcggtgctcctcct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 179 gagctcgccaagcagaaagctcaagaagtcgctgctcgtctcttcagcggtgctcctcct 238
Query: 181 cccccaatcgacctcaaacgccctaaacctgataacgctgctcctccttcctccttcgat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 239 cccccaatcgacctcaaacgccctaaacctgataacgctgctcctccttcctccttcgat 298
Query: 241 tccatcgatttgaaggctcaataccctgtgtctacttatcaaacttcgagcaagaagata 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 tccatcgatttgaaggctcaataccctgtgtctacttatcaaacttcgagcaagaagata 358
Query: 301 gatatacccagtggtagagttggtgtgattattggtaaaggtggggaaaccatcaagtct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 gatatacccagtggtagagttggtgtgattattggtaaaggtggggaaaccatcaagtct 418
Query: 361 cttcagttgcggtctggtgccaaaatccaagttacccgtgatatggatgctgaccccaat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 419 cttcagttgcggtctggtgccaaaatccaagttacccgtgatatggatgctgaccccaat 478
Query: 421 tccccgaataggttggttgagcttatgggtagtcctgaggctattgccgatgctgagaaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 479 tccccgaataggttggttgagcttatgggtagtcctgaggctattgccgatgctgagaaa 538
Query: 481 ctcatcaatgaagttcttgctgaggctgagtctgggggttctggcatgattggtcgacgg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539 ctcatcaatgaagttcttgctgaggctgagtctgggggttctggcatgattggtcgacgg 598
Query: 541 ctgactggacaatctgggtcggctgatgagttttcgatgcaaatcccgaataataaggtt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 ctgactggacaatctgggtcggctgatgagttttcgatgcaaatcccgaataataaggtt 658
Query: 601 ggccttataattggcaagggaggagaaactataaagagtatgcaagctgagtctggagca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 ggccttataattggcaagggaggagaaactataaagagtatgcaagctgagtctggagca 718
Query: 661 cgaattcaggtgatacctttgcatcttcccccaggtgacccatcaacagaaagaacatta 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719 cgaattcaggtgatacctttgcatcttcccccaggtgacccatcaacagaaagaacatta 778
Query: 721 aaaattgatggttctcctgagcaaattgagtcagcaaagcaattggttaatcaaatcatc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 aaaattgatggttctcctgagcaaattgagtcagcaaagcaattggttaatcaaatcatc 838
Query: 781 aatggcgagaaccgtcccagaaattcaggtggttattctcagcagggttaccaatcccga 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 aatggcgagaaccgtcccagaaattcaggtggttattctcagcagggttaccaatcccga 898
Query: 841 ccaccatctagctgggctccccctgctcctcctatgcagcaacctggttatggctatatg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 899 ccaccatctagctgggctccccctgctcctcctatgcagcaacctggttatggctatatg 958
Query: 901 cagcctggagcatactctggtcaagcaccccaatacaacatgcctcaggcccaataccct 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 cagcctggagcatactctggtcaagcaccccaatacaacatgcctcaggcccaataccct 1018
Query: 961 ggctatcctccccagcaagctggcggatattccaccaattgggaccagtccaccgctcca 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 ggctatcctccccagcaagctggcggatattccaccaattgggaccagtccaccgctcca 1078
Query: 1021 cctaaccagccgacagctggtggctatgattactacagtcaacagccacagcagcagcaa 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 cctaaccagccgacagctggtggctatgattactacagtcaacagccacagcagcagcaa 1138
Query: 1081 aatcctgggggttctgcagcttctgctgatgggtccacatacaattacagtcaaccacct 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 aatcctgggggttctgcagcttctgctgatgggtccacatacaattacagtcaaccacct 1198
Query: 1141 tcctctggttataaccatccaggacaaggttatggtcaggacggctatagtgcttataat 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1199 tcctctggttataaccatccaggacaaggttatggtcaggacggctatagtgcttataat 1258
Query: 1201 gcgccaccaca 1211
|||||||||||
Sbjct: 1259 gcgccaccaca 1269
>gnl|LJGI|TC70698 weakly similar to UniRef100_Q29AF0 Cluster: GA14643-PA; n=1;
Drosophila pseudoobscura|Rep: GA14643-PA - Drosophila
pseudoobscura (Fruit fly), partial (5%)
Length = 695
Score = 775 bits (391), Expect = 0.0
Identities = 394/395 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1397 aaccaaactccaccagtcagcaaggttatggagccccacccccaacctcccaagcagctt 1456
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 aaccaaattccaccagtcagcaaggttatggagccccacccccaacctcccaagcagctt 60
Query: 1457 atggcaatcaacaacagtctggttatggttatggaccccctcaacctgtgaagccaagtg 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 atggcaatcaacaacagtctggttatggttatggaccccctcaacctgtgaagccaagtg 120
Query: 1517 gcactccacctgtttatggacaatcacagtcgcccagcacagcaggaggctatggtcagt 1576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gcactccacctgtttatggacaatcacagtcgcccagcacagcaggaggctatggtcagt 180
Query: 1577 cagcatatcctcctgcacaaccctcacctgccgggtatgctcaaccagaccaaaaagcgc 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 cagcatatcctcctgcacaaccctcacctgccgggtatgctcaaccagaccaaaaagcgc 240
Query: 1637 ccgcatctggttatggtgttgcagcgcaaccagggtatggtcctcaatcatatggtgctc 1696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ccgcatctggttatggtgttgcagcgcaaccagggtatggtcctcaatcatatggtgctc 300
Query: 1697 ctcagggtagttatggtcaggcaccgccatcatacggcaacagttcttatggtgctggtt 1756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ctcagggtagttatggtcaggcaccgccatcatacggcaacagttcttatggtgctggtt 360
Query: 1757 atgctcagacacctgcttatgctagtgatggtact 1791
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 atgctcagacacctgcttatgctagtgatggtact 395
>gnl|LJGI|TC57564 similar to UniRef100_A7P4I3 Cluster: Chromosome chr4 scaffold_6,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr4 scaffold_6, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (48%)
Length = 2229
Score = 359 bits (181), Expect = 4e-98
Identities = 783/984 (79%), Gaps = 21/984 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 288 gagcaagaagatagatatacccagtggtagagttggtgtgattattggtaaaggtgggga 347
|||||||||||| |||||||| | ||| || || ||||| || ||||| ||| |||| ||
Sbjct: 419 gagcaagaagattgatataccgaatgggagggtgggtgttatcattgggaaaagtggaga 478
Query: 348 aaccatcaagtctcttcagttgcggtctggtgccaaaatccaagttacccgtgatatgga 407
||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || || || |||||
Sbjct: 479 aaccatcaagtaccttcagacgcagtctggtgccaaaatccaagtcactcgcgacatgga 538
Query: 408 tgctgaccccaattccccgaataggttggttgagcttatgggtagtcctgaggctattgc 467
|||||| || ||||| | | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 539 tgctgatccgaattcttcaactagggctgttgagcttatgggtactcctgaggctattgc 598
Query: 468 cgatgctgagaaactcatcaatgaagttcttgctgaggctgagtctgggggttctggcat 527
| |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct: 599 ccatgctgagaagctcattaatgaagttctcaccgaggctgaatctggaggttctggcat 658
Query: 528 gattggtcgacggctgactggacaatctgggtcggctgatgagttttcgatgcaaatccc 587
|| | || | | |||||||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||
Sbjct: 659 tgttactagaagaatccctggacaagctgg---ggctgatgagtttgtgatgaaggtccc 715
Query: 588 gaataataaggttggccttataattggcaagggaggagaaactataaagagtatgcaagc 647
|||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 716 gaataacaaggttggccttgttattggtaaaggaggagaaacaattaagagtatgcaaca 775
Query: 648 tgagtctggagcacgaattcaggtgatacctttgcatcttcccccaggtgacccatcaac 707
| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| || |||||| |||| ||
Sbjct: 776 gtcgactggagcaagaattcaggtgattcctcttcatcttccaccgggtgacacatccac 835
Query: 708 agaaagaacattaaaaattgatggttctcctgagcaaattgagtcagcaaagcaattggt 767
|||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 836 ggaaagaacattaaaaattgaagggaactctgaacaaattgagtctgcaaaacaattggt 895
Query: 768 taatcaaatcatcaatggcgagaaccgtcccagaaat---------tcaggtggttattc 818
|||| | ||||||| || || || || | || ||| || |||||||||||
Sbjct: 896 taattcagtcatcaacggtgataatcgccttaggaatccatccatgtctggtggttattc 955
Query: 819 tcagcagggttaccaatcccgaccaccatctagctgggctccccctgctcctcctatgca 878
|||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||
Sbjct: 956 tcagcaaggttaccaagctcggacaccttctagctgggctcctcctgcagctccgactca 1015
Query: 879 gcaacctggttatggctatatgcagcctggagcatactctggtcaagcaccccaatacaa 938
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| || || ||
Sbjct: 1016 acaacctggttatggctatgtgcagcctggagcgtactctggtccatcacctcagtataa 1075
Query: 939 catgcctcaggcccaataccctggctatcctccccagcaagctggcggatattccaccaa 998
||||||||| | ||| | ||||| ||| | ||| | || |||||| |||||||
Sbjct: 1076 catgcctcaacaaccatatgcaggctacccttctcag---tccggtggatatcccaccaa 1132
Query: 999 ttgggaccagtccaccgctccacctaaccagccgacagctggtggctatgattactacag 1058
||||||||| ||||| || || || | ||| | || || ||| ||||||||||| |
Sbjct: 1133 ttgggaccactccactgcacctccccagcagtctactcatgctgggtatgattactatgg 1192
Query: 1059 tcaacagccacagcagcagcaaaatcctgggggttctgcagcttctgctgatgggtccac 1118
||| |||||| |||||||||||||| | | ||||| || | |||||||| | |
Sbjct: 1193 tca------acagcaacagcaaaatcctggtgctcctgcacctccagctgatggaactgc 1246
Query: 1119 atacaattacagtcaaccaccttcctctggttataaccatccaggacaaggttatggtca 1178
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||| |||
Sbjct: 1247 ttacaattacagtcaaccaccttcctctggttatagccaacctggacagggctatgctca 1306
Query: 1179 ggacggctatagtgcttataatgcgccaccacaatcggggtacggtcagccgccaacata 1238
|| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||
Sbjct: 1307 agatggctatggtgcatatcaagcgccaccacattcagggtatggtcaaccaccatcata 1366
Query: 1239 tgaccagcagcaaggttatggctc 1262
||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct: 1367 tgatcagcagcaaggttatagctc 1390
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-17
Identities = 125/152 (82%), Gaps = 12/152 (7%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1435 cccccaacctcccaagcagcttatggcaatcaaca------acagtctggttatggt--- 1485
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct: 1572 cccccaacctcccaagcagcttatggcaatccacctcaagtacagtctggttatggagct 1631
Query: 1486 ---tatggaccccctcaacctgtgaagccaagtggcactccacctgtttatggacaatca 1542
|||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || || |||||||||
Sbjct: 1632 ggatatggaccccctcaggctcagaagccaagtggtactccaccggtatacggacaatca 1691
Query: 1543 cagtcgcccagcacagcaggaggctatggtca 1574
||||| || | |||| ||||||||||||||||
Sbjct: 1692 cagtcacctaacacaacaggaggctatggtca 1723
Score = 75.8 bits (38), Expect = 8e-13
Identities = 62/70 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 110 tctccgacatcgagctcgccaagcagaaagctcaagaagtcgctgctcgtctcttcagcg 169
|||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||
Sbjct: 226 tctccgacttcgaactcgccaaacagaaagcccaagaagtcgccgctcgcctcctcggcg 285
Query: 170 gtgctcctcc 179
||||||||||
Sbjct: 286 gtgctcctcc 295
>gnl|LJGI|DC593634 weakly similar to UniRef100_A8EH71 Cluster: Chloride transporter,
chloride channel (ClC) family; n=1; Burkholderia
pseudomallei 406e|Rep: Chloride transporter, chloride
channel (ClC) family - Burkholderia pseudomallei 406e,
partial (4%)
Length = 471
Score = 339 bits (171), Expect = 4e-92
Identities = 171/171 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1621 ccagaccaaaaagcgcccgcatctggttatggtgttgcagcgcaaccagggtatggtcct 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 471 ccagaccaaaaagcgcccgcatctggttatggtgttgcagcgcaaccagggtatggtcct 412
Query: 1681 caatcatatggtgctcctcagggtagttatggtcaggcaccgccatcatacggcaacagt 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 411 caatcatatggtgctcctcagggtagttatggtcaggcaccgccatcatacggcaacagt 352
Query: 1741 tcttatggtgctggttatgctcagacacctgcttatgctagtgatggtact 1791
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 351 tcttatggtgctggttatgctcagacacctgcttatgctagtgatggtact 301