Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v1754610.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v1754610.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1K885|I1K885_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.39243 PE,82.52,0,no
description,Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type; no
description,Armadillo-like helical; WDSAM1 PROTEI,CUFF.27753.1
(1342 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC57938 similar to UniRef100_A7NUB3 Cluster: Chromosome... 2660 0.0
gnl|LJGI|FS318156 similar to UniRef100_A7QZC7 Cluster: Chromosom... 1233 0.0
gnl|LJGI|GO023027 similar to UniRef100_A7NUB3 Cluster: Chromosom... 1070 0.0
>gnl|LJGI|TC57938 similar to UniRef100_A7NUB3 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_1,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_1, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (84%)
Length = 1527
Score = 2660 bits (1342), Expect = 0.0
Identities = 1342/1342 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtattttcatcaaacagttggtgggcatgcaactatgcctctgtatcaggcatcaaag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 38 atgtattttcatcaaacagttggtgggcatgcaactatgcctctgtatcaggcatcaaag 97
Query: 61 gatagaaaagatgagggtttgaagattgttgatgttctgggtcttgaatccaccatgaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 98 gatagaaaagatgagggtttgaagattgttgatgttctgggtcttgaatccaccatgaaa 157
Query: 121 ggggttgagattttggatctgaaggtgatgattgaggagatggaatcaattgatgttcca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 158 ggggttgagattttggatctgaaggtgatgattgaggagatggaatcaattgatgttcca 217
Query: 181 tctgttttcatctgtccaatctctcttgagccaatgcaggaccctgtgaccctttgcact 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 218 tctgttttcatctgtccaatctctcttgagccaatgcaggaccctgtgaccctttgcact 277
Query: 241 ggccaaacctatgacagatccaacatcctcaaatggttctcacttggtcacaaaacttgt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 278 ggccaaacctatgacagatccaacatcctcaaatggttctcacttggtcacaaaacttgt 337
Query: 301 cccacaacaatgcaagagctttgggatgattctgtcacacccaacaagacactcacccac 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 338 cccacaacaatgcaagagctttgggatgattctgtcacacccaacaagacactcacccac 397
Query: 361 ttgatcctcacatggttctctcacaagtacttggccatgaagaagaagcttgaggatgtt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 398 ttgatcctcacatggttctctcacaagtacttggccatgaagaagaagcttgaggatgtt 457
Query: 421 cagggaagagtcttggacctcttggatatgctcaagaaggtgaagggtcaagccagggtt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 458 cagggaagagtcttggacctcttggatatgctcaagaaggtgaagggtcaagccagggtt 517
Query: 481 aaagctcttaaggatctgaggcaacttgttgcagctaatgtgtttgctagaaggactgtg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 518 aaagctcttaaggatctgaggcaacttgttgcagctaatgtgtttgctagaaggactgtg 577
Query: 541 tcagaaaatggtgggcttgctttggtttgttctttgttaggtcctttcacttcacatgct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 578 tcagaaaatggtgggcttgctttggtttgttctttgttaggtcctttcacttcacatgct 637
Query: 601 gtaggctctgaagcaattgggatcattgtgaatttggatttggtatctgagctgaagagg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 638 gtaggctctgaagcaattgggatcattgtgaatttggatttggtatctgagctgaagagg 697
Query: 661 aatttgatgcatcctgcaaaggtttcattattggtggatatcatgaatgagggaaccatt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 698 aatttgatgcatcctgcaaaggtttcattattggtggatatcatgaatgagggaaccatt 757
Query: 721 gagacaaagatgaactgtgctaaattgattgagatgttgttgattgaagggagtgggaat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 758 gagacaaagatgaactgtgctaaattgattgagatgttgttgattgaagggagtgggaat 817
Query: 781 gggaatgaaacagagattgtctcaagcttgagtcttttggttgggttgttgaggttagtg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 818 gggaatgaaacagagattgtctcaagcttgagtcttttggttgggttgttgaggttagtg 877
Query: 841 agggataagaaacacccaactggggtcttaactggtctcattttactcaaagctatatgt 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 878 agggataagaaacacccaactggggtcttaactggtctcattttactcaaagctatatgt 937
Query: 901 tcttcccatgaatctgttagaagctctgtgataagcataggggcagttcctcaattgatt 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 938 tcttcccatgaatctgttagaagctctgtgataagcataggggcagttcctcaattgatt 997
Query: 961 gagcttttgcctagtttgaacaaggagtgcttagaggtagcactttatattctagaggtt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 998 gagcttttgcctagtttgaacaaggagtgcttagaggtagcactttatattctagaggtt 1057
Query: 1021 ttgtcaactcttccagagggaagaatggccttgaaagagtgtccaaacatcattcctaat 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1058 ttgtcaactcttccagagggaagaatggccttgaaagagtgtccaaacatcattcctaat 1117
Query: 1081 gtggtgaagttgctgatgagagtctcagagaggtgcactcaatttgcattgtcaatattg 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1118 gtggtgaagttgctgatgagagtctcagagaggtgcactcaatttgcattgtcaatattg 1177
Query: 1141 tgggctatctacaagcttgcacctgaagaatgtgcctcaaaggcagtggaagctgggtta 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1178 tgggctatctacaagcttgcacctgaagaatgtgcctcaaaggcagtggaagctgggtta 1237
Query: 1201 gcagctaagttgttgttagtaattcagagtggttgcaacccagttttgaagcaaatgtct 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1238 gcagctaagttgttgttagtaattcagagtggttgcaacccagttttgaagcaaatgtct 1297
Query: 1261 tctgagttcttgaaaatgtgcagtgtgaattactctactagtattttgatttccaagtgt 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1298 tctgagttcttgaaaatgtgcagtgtgaattactctactagtattttgatttccaagtgt 1357
Query: 1321 atgctcagcacaatacaatgaa 1342
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1358 atgctcagcacaatacaatgaa 1379
>gnl|LJGI|FS318156 similar to UniRef100_A7QZC7 Cluster: Chromosome chr7 scaffold_270,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr7 scaffold_270, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (37%)
Length = 783
Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0
Identities = 633/636 (99%), Gaps = 3/636 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtattttcatcaaacagttggtgggcatgcaactatgcctctgtatcaggcatcaaag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 148 atgtattttcatcaaacagttggtgggcatgcaactatgcctctgtatcaggcatcaaag 207
Query: 61 gatagaaaagatgagggtttgaagattgttgatgttctgggtcttgaatccaccatgaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 208 gatagaaaagatgagggtttgaagattgttgatgttctgggtcttgaatccaccatgaaa 267
Query: 121 ggggttgagattttggatctgaaggtgatgattgaggagatggaatcaattgatgttcca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 268 ggggttgagattttggatctgaaggtgatgattgaggagatggaatcaattgatgttcca 327
Query: 181 tctgttttcatctgtccaatctctcttgagccaatgcaggaccctgtgaccctttgcact 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 328 tctgttttcatctgtccaatctctcttgagccaatgcaggaccctgtgaccctttgcact 387
Query: 241 ggccaaacctatgacagatccaacatcctcaaatggttctcacttggtcacaaaacttgt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 388 ggccaaacctatgacagatccaacatcctcaaatggttctcacttggtcacaaaacttgt 447
Query: 301 cccacaacaatgcaagagctttgggatgattctgtcacacccaacaagacactcacccac 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 448 cccacaacaatgcaagagctttgggatgattctgtcacacccaacaagacactcacccac 507
Query: 361 ttgatcctcacatggttctctca---caagtacttggccatgaagaagaagcttgaggat 417
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 508 ttgatcctcacatggttctctcactgcaagtacttggccatgaagaagaagcttgaggat 567
Query: 418 gttcagggaagagtcttggacctcttggatatgctcaagaaggtgaagggtcaagccagg 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 568 gttcagggaagagtcttggacctcttggatatgctcaagaaggtgaagggtcaagccagg 627
Query: 478 gttaaagctcttaaggatctgaggcaacttgttgcagctaatgtgtttgctagaaggact 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 628 gttaaagctcttaaggatctgaggcaacttgttgcagctaatgtgtttgctagaaggact 687
Query: 538 gtgtcagaaaatggtgggcttgctttggtttgttctttgttaggtcctttcacttcacat 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 688 gtgtcagaaaatggtgggcttgctttggtttgttctttgttaggtcctttcacttcacat 747
Query: 598 gctgtaggctctgaagcaattgggatcattgtgaat 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 748 gctgtaggctctgaagcaattgggatcattgtgaat 783
>gnl|LJGI|GO023027 similar to UniRef100_A7NUB3 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_1,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_1, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (32%)
Length = 668
Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0
Identities = 552/556 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 18 agttggtgggcatgcaactatgcctctgtatcaggcatcaaaggatagaaaagatgaggg 77
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 113 agttggtgggcatgcaactatgcctctgtatcaggcatcaaaggatagaaaagatgaggg 172
Query: 78 tttgaagattgttgatgttctgggtcttgaatccaccatgaaaggggttgagattttgga 137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 173 tttgaagattgttgatgttctgggtcttgaatccaccatgaaaggggttgagattttgga 232
Query: 138 tctgaaggtgatgattgaggagatggaatcaattgatgttccatctgttttcatctgtcc 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 233 tctgaaggtgatgattgaggagatggaatcaattgatgttccatctgttttcatctgtcc 292
Query: 198 aatctctcttgagccaatgcaggaccctgtgaccctttgcactggccaaacctatgacag 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 293 aatctctcttgagccaatgcaggaccctgtgaccctttgcactggccaaacctatgacag 352
Query: 258 atccaacatcctcaaatggttctcacttggtcacaaaacttgtcccacaacaatgcaaga 317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 353 atccaacatcctcaaatggttctcacttggtcacaaaacttgtcccacaacaatgcaaga 412
Query: 318 gctttgggatgattctgtcacacccaacaagacactcacccacttgatcctcacatggtt 377
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 413 gttttgggatgattctgtcacacccaacaagacactcacccacttgatcctcacatggtt 472
Query: 378 ctctcacaagtacttggccatgaagaagaagcttgaggatgttcagggaagagtcttgga 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 473 ctctcacaagtacttggccatgaagaagaagcttgaggatgttcagggaagagtcttgga 532
Query: 438 cctcttggatatgctcaagaaggtgaagggtcaagccagggttaaagctcttaaggatct 497
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 533 ccccttggatatgctcaagaaggtgaagggtcaagccagggttaaagctcttaaagatct 592
Query: 498 gaggcaacttgttgcagctaatgtgtttgctagaaggactgtgtcagaaaatggtgggct 557
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 593 gaggcaacttgttgcagctaatgtgtttgctagaaagactgtgtcagaaaatggtgggct 652
Query: 558 tgctttggtttgttct 573
||||||||||||||||
Sbjct: 653 tgctttggtttgttct 668