Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v1091050.3
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v1091050.3 Non Chatacterized Hit- tr|I1KB28|I1KB28_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.42212
PE,47.8,0,seg,NULL; coiled-coil,NULL,CUFF.26838.3
(3516 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC78464 2204 0.0
gnl|LJGI|TC61197 1312 0.0
gnl|LJGI|AV777110 similar to UniRef100_Q967U1 Cluster: Proteasom... 745 0.0
gnl|LJGI|AV779967 458 e-127
gnl|LJGI|DC594519 UniRef100_UPI0000E87B73 Cluster: serine O-acet... 178 2e-43
>gnl|LJGI|TC78464
Length = 1121
Score = 2204 bits (1112), Expect = 0.0
Identities = 1119/1120 (99%), Gaps = 1/1120 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2143 gttcaactgctggttgatacattgcaaaatatgtcagaattgcttctttatcattgttca 2202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gttcaactgctggttgatacattgcaaaatatgtcagaattgcttctttatcattgttca 61
Query: 2203 tatgatggctgtgaattgaaagagcgagattgcaatatccttaaaaaagtgattgg-taa 2261
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 62 tatgatggctgtgaattgaaagagcgagattgcaatatccttaaaaaagtgattgggtaa 121
Query: 2262 tctcagtacatgtgctttaaagaatgctgaagaaattaccacagctccagaatgcctctt 2321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 tctcagtacatgtgctttaaagaatgctgaagaaattaccacagctccagaatgcctctt 181
Query: 2322 ccatcagccagaaaattctagatgtactggagggccatgtgagcttcaacagaatacaag 2381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ccatcagccagaaaattctagatgtactggagggccatgtgagcttcaacagaatacaag 241
Query: 2382 tttcaagaggccccaattaaccaagattgagcaagagatctctgaaatcaagcttgagaa 2441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 tttcaagaggccccaattaaccaagattgagcaagagatctctgaaatcaagcttgagaa 301
Query: 2442 tcagtttgaagaggcaaaccagcatttcagttctgaaagaccacattggaagcttccagt 2501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tcagtttgaagaggcaaaccagcatttcagttctgaaagaccacattggaagcttccagt 361
Query: 2502 ttgcatgtcccctaggtttgatgctgaaacaacaaaggcagatagcatgactaaggatct 2561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 ttgcatgtcccctaggtttgatgctgaaacaacaaaggcagatagcatgactaaggatct 421
Query: 2562 aaagaggattcttagtgagaatttccatgatgaagaagaagactctcaaactgacttata 2621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 aaagaggattcttagtgagaatttccatgatgaagaagaagactctcaaactgacttata 481
Query: 2622 taagaatctatggctcgaagctgaagctgcactatgttctgtgtcttacagagctcgcta 2681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 taagaatctatggctcgaagctgaagctgcactatgttctgtgtcttacagagctcgcta 541
Query: 2682 taatcaaatgaagattgaaatggagaaacggtcatacaaccaaagagacatggaggagca 2741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 taatcaaatgaagattgaaatggagaaacggtcatacaaccaaagagacatggaggagca 601
Query: 2742 atcaaaagctgaggttatacctagttcaagcaaaagtcagagttctgcaaccgaagtgca 2801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 atcaaaagctgaggttatacctagttcaagcaaaagtcagagttctgcaaccgaagtgca 661
Query: 2802 caattatccaaaccctggttctcctgcccaggatttgcctgtcttacatgataccaatcc 2861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 caattatccaaaccctggttctcctgcccaggatttgcctgtcttacatgataccaatcc 721
Query: 2862 aaaggaattatctcctttgaaaatttctaaagatatgaacaaggatactactccattgac 2921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 aaaggaattatctcctttgaaaatttctaaagatatgaacaaggatactactccattgac 781
Query: 2922 acctgatggaacgggtagtgaagacctgattagtttcatccagaattatatttccggaac 2981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 acctgatggaacgggtagtgaagacctgattagtttcatccagaattatatttccggaac 841
Query: 2982 aaacaacgtggctgaaaatgaagagtcttctgttatggccagatactatgtgctcaaagc 3041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 aaacaacgtggctgaaaatgaagagtcttctgttatggccagatactatgtgctcaaagc 901
Query: 3042 ccgggctgacaatccatgcgtggatactgccaatctggaggaaccatcagactcagcagg 3101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 ccgggctgacaatccatgcgtggatactgccaatctggaggaaccatcagactcagcagg 961
Query: 3102 caagttgtcacctgaaggaggagataatcaaaaccaagtcaattgcgggactttctgtca 3161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 caagttgtcacctgaaggaggagataatcaaaaccaagtcaattgcgggactttctgtca 1021
Query: 3162 ggactctcctgttcctgcagaaaacaaggctgatgattacgaggcatctgttgtggctag 3221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 ggactctcctgttcctgcagaaaacaaggctgatgattacgaggcatctgttgtggctag 1081
Query: 3222 gttccacattctcaagtcccgggcggaagattcaagctct 3261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 gttccacattctcaagtcccgggcggaagattcaagctct 1121
>gnl|LJGI|TC61197
Length = 867
Score = 1312 bits (662), Expect = 0.0
Identities = 665/666 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2851 gataccaatccaaaggaattatctcctttgaaaatttctaaagatatgaacaaggatact 2910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gataccaatccaaaggaattatctcctttgaaaatttctaaagatatgaacaaggatact 61
Query: 2911 actccattgacacctgatggaacgggtagtgaagacctgattagtttcatccagaattat 2970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 actccattgacacctgatggaacgggtagtgaagacctgattagtttcatccagaattat 121
Query: 2971 atttccggaacaaacaacgtggctgaaaatgaagagtcttctgttatggccagatactat 3030
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 atttccggaacaaacaacgtggctgaaaatgaggagtcttctgttatggccagatactat 181
Query: 3031 gtgctcaaagcccgggctgacaatccatgcgtggatactgccaatctggaggaaccatca 3090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 gtgctcaaagcccgggctgacaatccatgcgtggatactgccaatctggaggaaccatca 241
Query: 3091 gactcagcaggcaagttgtcacctgaaggaggagataatcaaaaccaagtcaattgcggg 3150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 gactcagcaggcaagttgtcacctgaaggaggagataatcaaaaccaagtcaattgcggg 301
Query: 3151 actttctgtcaggactctcctgttcctgcagaaaacaaggctgatgattacgaggcatct 3210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 actttctgtcaggactctcctgttcctgcagaaaacaaggctgatgattacgaggcatct 361
Query: 3211 gttgtggctaggttccacattctcaagtcccgggcggaagattcaagctctgtatcttca 3270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 gttgtggctaggttccacattctcaagtcccgggcggaagattcaagctctgtatcttca 421
Query: 3271 caagagaaattgtcagatggtgttggattttctggcaaaagaatgtatgactcatcaatt 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 caagagaaattgtcagatggtgttggattttctggcaaaagaatgtatgactcatcaatt 481
Query: 3331 tcagaaaatgcttcagagggtaagaggatgaatgttgatctcaacagttcctacgctgct 3390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 tcagaaaatgcttcagagggtaagaggatgaatgttgatctcaacagttcctacgctgct 541
Query: 3391 gtggacaagtcaatctcgaacgagtttcatgtggacctggaggacaatgatgaagttcag 3450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 gtggacaagtcaatctcgaacgagtttcatgtggacctggaggacaatgatgaagttcag 601
Query: 3451 ccccgcgagcttcaggttcctacttattactcggatggattagcatcggattgggaacat 3510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 ccccgcgagcttcaggttcctacttattactcggatggattagcatcggattgggaacat 661
Query: 3511 gtgtag 3516
||||||
Sbjct: 662 gtgtag 667
>gnl|LJGI|AV777110 similar to UniRef100_Q967U1 Cluster: Proteasome regulator PA28; n=1;
Dictyostelium discoideum|Rep: Proteasome regulator PA28 -
Dictyostelium discoideum (Slime mold), partial (6%)
Length = 383
Score = 745 bits (376), Expect = 0.0
Identities = 383/384 (99%), Gaps = 1/384 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1573 cattatgaatcctgtgaggttctgcctccagaacaagtccacaaaaaggagaagcctctg 1632
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 383 cattatgaatcctgt-aggttctgcctccagaacaagtccacaaaaaggagaagcctctg 325
Query: 1633 aattttccgcttgatacagaaagtggtgtgaaaaggtcacctgaacattcaaatagctat 1692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 324 aattttccgcttgatacagaaagtggtgtgaaaaggtcacctgaacattcaaatagctat 265
Query: 1693 cagatgtactctgaaaatgttaatctggaaacaagatcatcaggttctccgttgaaatgt 1752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264 cagatgtactctgaaaatgttaatctggaaacaagatcatcaggttctccgttgaaatgt 205
Query: 1753 tcattgacaaagtttgcatccaaagattgcaagtcagatggtgcagtgagtgctggacct 1812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 204 tcattgacaaagtttgcatccaaagattgcaagtcagatggtgcagtgagtgctggacct 145
Query: 1813 tttctgtctgagccaagctgtaattgtaggcttcaatatcttgatgatattacccaaacg 1872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 144 tttctgtctgagccaagctgtaattgtaggcttcaatatcttgatgatattacccaaacg 85
Query: 1873 aaggaaaatggaatcccaccaatcaagccaactggctgtgagtcaggatcttctttcact 1932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 84 aaggaaaatggaatcccaccaatcaagccaactggctgtgagtcaggatcttctttcact 25
Query: 1933 gagcatcaagtttttgtgaacgac 1956
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 24 gagcatcaagtttttgtgaacgac 1
>gnl|LJGI|AV779967
Length = 486
Score = 458 bits (231), Expect = e-127
Identities = 260/267 (97%), Gaps = 2/267 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 924 ggaatcagttgcaggtaatgatgtggcccacatgattgatggggagaaacacggtatgcc 983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggaatcagttgcaggtaatgatgtggcccacatgattgatggggagaaacacggtatgcc 60
Query: 984 tataaatgcagatcagtcagttgataaatcttgcccttgg-ggaactatcaa-acggcca 1041
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 61 tataaatgcagatcagtcagtagataaatcttgcccttggtggaactatcaagacggcca 120
Query: 1042 gttcaagtttcagatgcatctactatgcagtcccctctggtgcctctggcaattcatgtt 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 121 gttcaagtttcagatgcatctactatgcagtcccctctggtgcctctggcaatgcatgtg 180
Query: 1102 ccggctccttcaaaatcatttgcagatacaggggcacatcacttgtcatatactggtcca 1161
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ccggctccttcaaaatcatttgcagatacaggcgcatatcacttgtcatatactggtcca 240
Query: 1162 tatgacaagcgcccaagcccgcaaggt 1188
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatgacaagcgcccaagcccgcaaggt 267
Score = 315 bits (159), Expect = 1e-84
Identities = 207/223 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1296 aggtcatctcggcatgcatctggagacaattgaaccttcctcatcaaacaatgccttgat 1355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264 aggtcatctcggcatgcatctggagacaattgaaccttcctcatcaaacaatgccttgat 323
Query: 1356 ttcagacaaaaatgtttcaagggatgttaaggattatgatatatttaaaggaaggcgtga 1415
|||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct: 324 aacagacaaaaatgttccaagggatgttacggatcatgatatatctaacggaaggcgtga 383
Query: 1416 atttcaaaatccttatctaagtctagataatttatgctcgagacttagtgctgttgagga 1475
|| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 384 atctccaaatccttatctaaatctagataattcatgctcgagacttactgctgttgagga 443
Query: 1476 tgtcaattctggtgagaaatcttttgagggtggtgatcaatgt 1518
|||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 444 tgtcgattcgggtgacaaatctattgagggtggtgatcaatgt 486
Score = 119 bits (60), Expect = 1e-25
Identities = 148/174 (85%), Gaps = 5/174 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 754 aatggtgtggcccacatggttgatggggagaaacacgggacgcctataaatgcagatcac 813
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct: 17 aatgatgtggcccacatgattgatggggagaaacacggtatgcctataaatgcagatcag 76
Query: 814 tcagttgataaatc-tcccctgtggggaactatcaa-acggcc---tcaaatttcaggta 868
||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||| |
Sbjct: 77 tcagtagataaatcttgcccttggtggaactatcaagacggccagttcaagtttcagatg 136
Query: 869 catctgttaagcagtcccctcttgttcctctggaaattcatgttccggctcctt 922
||||| || |||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||
Sbjct: 137 catctactatgcagtcccctctggtgcctctggcaatgcatgtgccggctcctt 190
>gnl|LJGI|DC594519 UniRef100_UPI0000E87B73 Cluster: serine O-acetyltransferase; n=1;
Methylophilales bacterium HTCC2181|Rep: serine
O-acetyltransferase - Methylophilales bacterium
HTCC2181, partial (5%)
Length = 220
Score = 178 bits (90), Expect = 2e-43
Identities = 90/90 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaaggtgctgggtcctataacgattgggggtattactcaccaccacaaccccattca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 131 atggaaggtgctgggtcctataacgattgggggtattactcaccaccacaaccccattca 190
Query: 61 acgctatcgccgtatgcggcggcgtttagc 90
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 acgctatcgccgtatgcggcggcgtttagc 220