Miyakogusa Predicted Gene

Lj1g3v0813950.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj1g3v0813950.1 tr|G7J2Z9|G7J2Z9_MEDTR Solute carrier family 35
member E3 OS=Medicago truncatula GN=MTR_3g072380 PE=,89.8,0,Multidrug
resistance efflux transporter EmrE,NULL; seg,NULL; TPT,Domain of
unknown function DUF250; ,CUFF.26364.1
         (1038 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC65744                                                     2058   0.0  
gnl|LJGI|TC62142                                                      930   0.0  

>gnl|LJGI|TC65744 
          Length = 1407

 Score = 2058 bits (1038), Expect = 0.0
 Identities = 1038/1038 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atggaagaaagcgttgttttcaacttgagcgctctcagatctctcttgtgcatccttcaa 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 231  atggaagaaagcgttgttttcaacttgagcgctctcagatctctcttgtgcatccttcaa 290

                                                                        
Query: 61   tggtgggctttcaatgtcactgtcatcatcgtcaacaaatggatcttccagaaattggat 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291  tggtgggctttcaatgtcactgtcatcatcgtcaacaaatggatcttccagaaattggat 350

                                                                        
Query: 121  ttcaagtttcccctatcagtgtcctgtgtccactttatctgctcatccattggagcgtat 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 351  ttcaagtttcccctatcagtgtcctgtgtccactttatctgctcatccattggagcgtat 410

                                                                        
Query: 181  gtggtaattaaagtgctgaaaattaaaccactgataactgttgaccctgaggaccgctgg 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 411  gtggtaattaaagtgctgaaaattaaaccactgataactgttgaccctgaggaccgctgg 470

                                                                        
Query: 241  aaaagaatcttcccaatgtcatttgtgttctgtattaacatagtgctggggaatgtgagc 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 471  aaaagaatcttcccaatgtcatttgtgttctgtattaacatagtgctggggaatgtgagc 530

                                                                        
Query: 301  cttagatacattccagtgtcttttatgcagacaataaagtcattcacgcctgcaactaca 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531  cttagatacattccagtgtcttttatgcagacaataaagtcattcacgcctgcaactaca 590

                                                                        
Query: 361  gtgttattgcagtggctagtttggaggaaaagttttgactctcgtatttgggcttctctt 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 591  gtgttattgcagtggctagtttggaggaaaagttttgactctcgtatttgggcttctctt 650

                                                                        
Query: 421  atacccattgttggagggattcttctcacatctatgacagagcttagctttaatatgttt 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 651  atacccattgttggagggattcttctcacatctatgacagagcttagctttaatatgttt 710

                                                                        
Query: 481  ggattttgtgccgccttagttggctgtttggctacatctacaaagactatcctggctgaa 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 711  ggattttgtgccgccttagttggctgtttggctacatctacaaagactatcctggctgaa 770

                                                                        
Query: 541  tctcttctgcacggctacaaatttgacagcataaacacagtctattacatggcacctttt 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 771  tctcttctgcacggctacaaatttgacagcataaacacagtctattacatggcacctttt 830

                                                                        
Query: 601  gcaactatgatcttggcacttcctgccttattacttgaaggcaatggagttattgaatgg 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 831  gcaactatgatcttggcacttcctgccttattacttgaaggcaatggagttattgaatgg 890

                                                                        
Query: 661  ctaaacactcatccatatccttggtcggccctcactattatttttagctctggggtgttg 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 891  ctaaacactcatccatatccttggtcggccctcactattatttttagctctggggtgttg 950

                                                                        
Query: 721  gctttctgccttaacttctccattttctatgtgattcactccaccactgctgtcacgttt 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 951  gctttctgccttaacttctccattttctatgtgattcactccaccactgctgtcacgttt 1010

                                                                        
Query: 781  aatgttgccggaaaccttaaggttgcagttgctgtccttgtttcttggctgatattcagg 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1011 aatgttgccggaaaccttaaggttgcagttgctgtccttgtttcttggctgatattcagg 1070

                                                                        
Query: 841  aacccaatttcatatttaaatgccgttggatgtggtataactcttgtgggatgtacattc 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1071 aacccaatttcatatttaaatgccgttggatgtggtataactcttgtgggatgtacattc 1130

                                                                        
Query: 901  tatggttatgtcaggcacatgctctcccaacaacaaccaattccaggaactcctagaaca 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1131 tatggttatgtcaggcacatgctctcccaacaacaaccaattccaggaactcctagaaca 1190

                                                                        
Query: 961  cccagaactcctcgcacccctgggagtaagatggagctgcttcctcttgtaaatgataaa 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1191 cccagaactcctcgcacccctgggagtaagatggagctgcttcctcttgtaaatgataaa 1250

                              
Query: 1021 ttagaaaacaaggtctaa 1038
            ||||||||||||||||||
Sbjct: 1251 ttagaaaacaaggtctaa 1268


>gnl|LJGI|TC62142 
          Length = 1495

 Score =  930 bits (469), Expect = 0.0
 Identities = 867/1001 (86%), Gaps = 9/1001 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 38   gatctctcttgtgcatccttcaatggtgggctttcaatgtcactgtcatcatcgtcaaca 97
            |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct: 233  gatctctcttggcaatccttcaatggtgggctttcaatgtcactgttatcatcatcaaca 292

                                                                        
Query: 98   aatggatcttccagaaattggatttcaagtttcccctatcagtgtcctgtgtccacttta 157
            | ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || |||||| |||||||||
Sbjct: 293  agtggatcttccagaaattggatttcaagttcccgttatcggtatcctgtatccacttta 352

                                                                        
Query: 158  tctgctcatccattggagcgtatgtggtaattaaagtgctgaaaattaaaccactgataa 217
            | |||||| |||||||||  |||||||| |||   ||||| ||  |||||||||||||| 
Sbjct: 353  tttgctcagccattggaggatatgtggtgattcgggtgcttaagcttaaaccactgatag 412

                                                                        
Query: 218  ctgttgaccctgaggaccgctggaaaagaatcttcccaatgtcatttgtgttctgtatta 277
            ||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||  |||
Sbjct: 413  ctgttgaacctgaagatcgctggagaagaatatttcctatgtcatttgtgttctgcgtta 472

                                                                        
Query: 278  acatagtgctggggaatgtgagccttagatacattccagtgtcttttatgcagacaataa 337
            |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 473  acattgtgctggggaatgtgagcctacgatacataccagtttcttttatgcagacaataa 532

                                                                        
Query: 338  agtcattcacgcctgcaactacagtgttattgcagtggctagtttggaggaaaagttttg 397
            |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||  |||||
Sbjct: 533  agtcattcactcctgcaactacagtttttttgcaatggctggtatggaggaaatattttg 592

                                                                        
Query: 398  actctcgtatttgggcttctcttatacccattgttggagggattcttctcacatctatga 457
            | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |
Sbjct: 593  attggcgtatttgggcttctcttatacccattgttggagggattcttgtgacatctgtta 652

                                                                        
Query: 458  cagagcttagctttaatatgtttggattttgtgccgccttagttggctgtttggctacat 517
            |||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 653  cagagcttagttttaatatgtttggttttcttgctgccttatttggctgtttggctacat 712

                                                                        
Query: 518  ctacaaagactatcctggctgaatctcttctgcacggctacaaatttgacagcataaaca 577
            ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 713  ctacaaagactattcttgctgagtctctgctgcatggatacaaatttgacagcatcaaca 772

                                                                        
Query: 578  cagtctattacatggcaccttttgcaactatgatcttggcacttcctgccttattacttg 637
            |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| || |||||||
Sbjct: 773  cagtttattacatggcaccttttgcaactatgatcctggcggtacctgctttgttacttg 832

                                                                        
Query: 638  aaggcaatggagttattgaatggctaaacactcatccatatccttggtcggccctcacta 697
            ||||||||||| |  |||| |||||||  | ||||||||||||||||   ||||| |  |
Sbjct: 833  aaggcaatggaatccttgagtggctaagtattcatccatatccttggatagccctgatca 892

                                                                        
Query: 698  ttatttttagctctggggtgttggctttctgccttaacttctccattttctatgtgattc 757
            | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 893  tcattttcagctctggggtcttggcgttctgcctcaacttctccattttttatgtgattc 952

                                                                        
Query: 758  actccaccactgctgtcacgtttaatgttgccggaaaccttaaggttgcagttgctgtcc 817
            |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |
Sbjct: 953  actccaccactgctgtaacatttaatgttgctggaaacctaaaggttgcggttgctgttc 1012

                                                                        
Query: 818  ttgtttcttggctgatattcaggaacccaatttcatatttaaatgccgttggatgtggta 877
            ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |  |||||||||  |
Sbjct: 1013 ttgtttcttggctgatatttaggaacccaatttcatatatgaattctattggatgtgcca 1072

                                                                        
Query: 878  taactcttgtgggatgtacattctatggttatgtcaggcacatgctctcccaacaacaac 937
            |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | | 
Sbjct: 1073 taactcttattggatgtacattctatggttatgttagacatatgctctcacaacagccag 1132

                                                                        
Query: 938  caattccaggaactcctagaacacccagaactcctcgcacccctgggagtaagatggagc 997
            || |||| ||||||||| | |||||||         | |||||| |||||||||||||| 
Sbjct: 1133 cagttccgggaactcctcggacaccca---------ggacccctaggagtaagatggagt 1183

                                                     
Query: 998  tgcttcctcttgtaaatgataaattagaaaacaaggtctaa 1038
            ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||
Sbjct: 1184 tgcttcctcttgtaaatgataaattagatgataaggtctaa 1224