Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v0318200.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v0318200.1 tr|A2A1E8|A2A1E8_LOTJA Nucleoporin OS=Lotus
japonicus GN=NUP85 PE=2 SV=1,99.86,0,SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; FROUNT
PROTEIN-RELATED,NULL; Nucleopor_Nup85,Nucleoporin Nup85-like;
seg,N,CUFF.25538.1
(2139 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC62744 UniRef100_A2A1E8 Cluster: Nucleoporin; n=1; Lot... 4240 0.0
gnl|LJGI|TC58967 homologue to UniRef100_A2A1E8 Cluster: Nucleopo... 795 0.0
gnl|LJGI|FS348619 homologue to UniRef100_A2A1E8 Cluster: Nucleop... 585 e-166
>gnl|LJGI|TC62744 UniRef100_A2A1E8 Cluster: Nucleoporin; n=1; Lotus japonicus|Rep:
Nucleoporin - Lotus japonicus, complete
Length = 2469
Score = 4240 bits (2139), Expect = 0.0
Identities = 2139/2139 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgccctccgacacagtcggcaatggcgtcctggtcccattctccggcgagggcagtgac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 24 atgccctccgacacagtcggcaatggcgtcctggtcccattctccggcgagggcagtgac 83
Query: 61 tccgtcgcggtttaccctctcaaccatggcctctcccttccaatttctcgcgtcgccatc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 84 tccgtcgcggtttaccctctcaaccatggcctctcccttccaatttctcgcgtcgccatc 143
Query: 121 tcctggtcccgcggcaactccctccgcgtctcccttttcgccgaaccttctgcaaccagt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 144 tcctggtcccgcggcaactccctccgcgtctcccttttcgccgaaccttctgcaaccagt 203
Query: 181 cccgactcccaagcatccggcgccaaggtcgtcgaagttaaactcagcggcgaagatccg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 204 cccgactcccaagcatccggcgccaaggtcgtcgaagttaaactcagcggcgaagatccg 263
Query: 241 gagatctccgactctaattggcggcgaatcgcctacggctccgtcacgcccttcgcgctg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264 gagatctccgactctaattggcggcgaatcgcctacggctccgtcacgcccttcgcgctg 323
Query: 301 cttcagagtcgccggagctctcttgccgctttgtcaaagtctccctcgccgtatcatgta 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 324 cttcagagtcgccggagctctcttgccgctttgtcaaagtctccctcgccgtatcatgta 383
Query: 361 gattggtgggagcatgtgcttgagtatagtaaggatatagcttcacttcttggggggcca 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 384 gattggtgggagcatgtgcttgagtatagtaaggatatagcttcacttcttggggggcca 443
Query: 421 aagttatctcccggtccgataatcgaagaccccaacgcaattgccacgaaatgtgaggag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 444 aagttatctcccggtccgataatcgaagaccccaacgcaattgccacgaaatgtgaggag 503
Query: 481 ccgacatgcttgaaagctgcatgggagttgctggaaatgttttatgtggacaagcgatct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 504 ccgacatgcttgaaagctgcatgggagttgctggaaatgttttatgtggacaagcgatct 563
Query: 541 caagcatggctacctgaaaggcttgttgattggttagctgatttcgacagcctctttact 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 564 caagcatggctacctgaaaggcttgttgattggttagctgatttcgacagcctctttact 623
Query: 601 agtacacatgaaaccattcatggcaaacttgtcaattttcagaaagagcttgtcaatata 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 624 agtacacatgaaaccattcatggcaaacttgtcaattttcagaaagagcttgtcaatata 683
Query: 661 caggtgattgaggatgatcctagatattgggaagtgatgtcatctgcattgtcagttggt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 684 caggtgattgaggatgatcctagatattgggaagtgatgtcatctgcattgtcagttggt 743
Query: 721 tggcttgatattgtggtgaaaatgctgcgcttgcatggatcttatcaattagatcaactc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 744 tggcttgatattgtggtgaaaatgctgcgcttgcatggatcttatcaattagatcaactc 803
Query: 781 agcagccgcgagcgagagaatggacttgtggaggtagttgctgttcttatttcgaaaatg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 804 agcagccgcgagcgagagaatggacttgtggaggtagttgctgttcttatttcgaaaatg 863
Query: 841 ccccgcttgcgtcctgagtctgctgtagaaaatcttggagaatgctttaaatcaaaacct 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 864 ccccgcttgcgtcctgagtctgctgtagaaaatcttggagaatgctttaaatcaaaacct 923
Query: 901 gactttatcaaggcctgggaaaaatggaggtctcaaattacgaaactagactgcagtcca 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 924 gactttatcaaggcctgggaaaaatggaggtctcaaattacgaaactagactgcagtcca 983
Query: 961 ttctggattcaatgtgataatcaacagacatgtgatggtttgagaaacttgctgcaaatt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 984 ttctggattcaatgtgataatcaacagacatgtgatggtttgagaaacttgctgcaaatt 1043
Query: 1021 atgctgggtaacactgagagtctctgcactgctacatgtcattggattgagttgtatgtt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1044 atgctgggtaacactgagagtctctgcactgctacatgtcattggattgagttgtatgtt 1103
Query: 1081 tctcattttctgtacatcaggccattcacaacaggaatagaaagcatgtataatttggcc 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1104 tctcattttctgtacatcaggccattcacaacaggaatagaaagcatgtataatttggcc 1163
Query: 1141 caaaaatgcatgcaattgaaaccaccatccagtatccataagttgacaggacttatgatt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1164 caaaaatgcatgcaattgaaaccaccatccagtatccataagttgacaggacttatgatt 1223
Query: 1201 ggcattcttggagaaaacactgaggtagttttagcagaatgttccagagaatttggtcct 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1224 ggcattcttggagaaaacactgaggtagttttagcagaatgttccagagaatttggtcct 1283
Query: 1261 tggatggttgcacacgctgtagaattgttgactgcagggagtgagcaagcagaggttctt 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1284 tggatggttgcacacgctgtagaattgttgactgcagggagtgagcaagcagaggttctt 1343
Query: 1321 ctacatgatgagcattataacttggggggtatcagtatagtggaactgcatcggcttgca 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1344 ctacatgatgagcattataacttggggggtatcagtatagtggaactgcatcggcttgca 1403
Query: 1381 tatgctcaagttctatcatcacatgcattgacctggcaaatagctccaatatatttaact 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1404 tatgctcaagttctatcatcacatgcattgacctggcaaatagctccaatatatttaact 1463
Query: 1441 tcgtgcatgaagcaaggaatgggcttgttagagaatttattatatcgacaatctgtccaa 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1464 tcgtgcatgaagcaaggaatgggcttgttagagaatttattatatcgacaatctgtccaa 1523
Query: 1501 cacaatgacacgctgcttaagaacattgagatttgccgtttgtacgagcttgatcatatc 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1524 cacaatgacacgctgcttaagaacattgagatttgccgtttgtacgagcttgatcatatc 1583
Query: 1561 agttcaaagatcatgaaggttgctggagtatttcactggaagcatggtcgtaaaggtgca 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1584 agttcaaagatcatgaaggttgctggagtatttcactggaagcatggtcgtaaaggtgca 1643
Query: 1621 ggagtattttggcttcaacaagcccaagatgcaagttgtctcggtaggattgccctgcag 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1644 ggagtattttggcttcaacaagcccaagatgcaagttgtctcggtaggattgccctgcag 1703
Query: 1681 ttatttgatgctgttggaaagtcaatttctgatgaaagcttcaagcaatgggaaggcata 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1704 ttatttgatgctgttggaaagtcaatttctgatgaaagcttcaagcaatgggaaggcata 1763
Query: 1741 attgaattattgggttctgaatctaagcctgcagggggtcttgaatttttacacaagtac 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1764 attgaattattgggttctgaatctaagcctgcagggggtcttgaatttttacacaagtac 1823
Query: 1801 agggatttcaaaaaatcccttcagcaggtatctggtggaaaatctactgaggctgccaga 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1824 agggatttcaaaaaatcccttcagcaggtatctggtggaaaatctactgaggctgccaga 1883
Query: 1861 caagctgtaggctccctcatactgcttatgaaaaacccatcgaccccgccgcgcttttgg 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1884 caagctgtaggctccctcatactgcttatgaaaaacccatcgaccccgccgcgcttttgg 1943
Query: 1921 ctgccacttctttatgactcgttgaagctgctcaattggaaagattgttctcttctcacc 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1944 ctgccacttctttatgactcgttgaagctgctcaattggaaagattgttctcttctcacc 2003
Query: 1981 gagtctgagaccaatcttctgctgaacaaacttcaagagttatctttggcgaggttgcgc 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2004 gagtctgagaccaatcttctgctgaacaaacttcaagagttatctttggcgaggttgcgc 2063
Query: 2041 ccacatttcactgagccaagcttaccccctgaagcactaagctctgtcaggctggctcta 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2064 ccacatttcactgagccaagcttaccccctgaagcactaagctctgtcaggctggctcta 2123
Query: 2101 gctacaaatcttggtcgtgctatacttgatgaataggct 2139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2124 gctacaaatcttggtcgtgctatacttgatgaataggct 2162
>gnl|LJGI|TC58967 homologue to UniRef100_A2A1E8 Cluster: Nucleoporin; n=1; Lotus
japonicus|Rep: Nucleoporin - Lotus japonicus, partial
(23%)
Length = 1122
Score = 795 bits (401), Expect = 0.0
Identities = 422/429 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1297 gggagtgagcaagcagaggttcttctacatgatgagcattataacttggggggtatcagt 1356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346 gggagtgagcaagcagaggttcttctacatgatgagcattataacttggggggtatcagt 405
Query: 1357 atagtggaactgcatcggcttgcatatgctcaagttctatcatcacatgcattgacctgg 1416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 406 atagtggaactgcatcggcttgcatatgctcaagttctatcatcacatgcattgacctgg 465
Query: 1417 caaatagctccaatatatttaacttcgtgcatgaagcaaggaatgggcttgttagagaat 1476
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 466 caaatagatccaatatatttaacttcgtgcatgaagcaaggaatgagcttgttagagaat 525
Query: 1477 ttattatatcgacaatctgtccaacacaatgacacgctgcttaagaacattgagatttgc 1536
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 526 ttattatatcgacaatctgttcaacacaatgacacattgcttaagaacattgagatttgc 585
Query: 1537 cgtttgtacgagcttgatcatatcagttcaaagatcatgaaggttgctggagtatttcac 1596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 586 cgtttgtacgagcttgatcatatcagttcaaagatcatgaaggttgctggagtatttcac 645
Query: 1597 tggaagcatggtcgtaaaggtgcaggagtattttggcttcaacaagcccaagatgcaagt 1656
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 646 tggaagcatggtcctaaaggtgcaggagtattttggcttcaacaagcccaagatgcaagt 705
Query: 1657 tgtctcggtaggattgccctgcagttatttgatgctgttggaaagtcaatttctgatgaa 1716
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 706 tgtctcggtaggattgccctgcagttatttgatgctgttggaaagttaatttctgatgaa 765
Query: 1717 agcttcaag 1725
|||||||||
Sbjct: 766 agcttcaag 774
Score = 81.8 bits (41), Expect = 2e-14
Identities = 41/41 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1223 aggtagttttagcagaatgttccagagaatttggtccttgg 1263
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 307 aggtagttttagcagaatgttccagagaatttggtccttgg 347
>gnl|LJGI|FS348619 homologue to UniRef100_A2A1E8 Cluster: Nucleoporin; n=1; Lotus
japonicus|Rep: Nucleoporin - Lotus japonicus, partial
(15%)
Length = 637
Score = 585 bits (295), Expect = e-166
Identities = 319/327 (97%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1399 tcacatgcattgacctggcaaatagctccaatatatttaacttcgtgcatgaagcaagga 1458
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 637 tcacatgcattgacctggcaaatagatccaatatatttaacttcgtgcatgaagcaagga 578
Query: 1459 atgggcttgttagagaatttattatatcgacaatctgtccaacacaatgacacgctgctt 1518
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct: 577 atgagcttgttagagaatttattatatcgacaatctgttcaacacaatgacacattgctt 518
Query: 1519 aagaacattgagatttgccgtttgtacgagcttgatcatatcagttcaaagatcatgaag 1578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 517 aagaacattgagatttgccgtttgtacgagcttgatcatatcagttcaaagatcatgaag 458
Query: 1579 gttgctggagtatttcactggaagcatggtcgtaaaggtgcaggagtattttggcttcaa 1638
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 457 gttgctggagtatttcactggaagcatggtcctaaaggtgcaggagtattttggcttcaa 398
Query: 1639 caagcccaagatgcaagttgtctcggtaggattgccctgcagttatttgatgctgttgga 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 397 caagcccaagatgcaagttgtctcggtaggattgccctgcagttatttgatgctgttgga 338
Query: 1699 aagtcaatttctgatgaaagcttcaag 1725
|||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 337 aagttaatttttgatgaaagcttcaag 311