Miyakogusa Predicted Gene
- Lj1g3v0203200.3
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj1g3v0203200.3 Non Chatacterized Hit- tr|I1JGY6|I1JGY6_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.51039
PE,86.17,0,SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; FAMILY NOT NAMED,NULL;
seg,NULL,CUFF.25381.3
(3684 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC71136 similar to UniRef100_A7NUP1 Cluster: Chromosome... 2091 0.0
gnl|LJGI|TC59428 similar to UniRef100_A7NUP1 Cluster: Chromosome... 1528 0.0
gnl|LJGI|TC64918 1114 0.0
>gnl|LJGI|TC71136 similar to UniRef100_A7NUP1 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_1,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_1, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (37%)
Length = 1378
Score = 2091 bits (1055), Expect = 0.0
Identities = 1058/1059 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2626 tttcaaagagatctttcaagctggaaaattagtcctataaaaggtggagtggatgcaaaa 2685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tttcaaagagatctttcaagctggaaaattagtcctataaaaggtggagtggatgcaaaa 60
Query: 2686 gagttgttccatttgtatattcttgtgtggatccaagataaacgtctatctttactcgaa 2745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagttgttccatttgtatattcttgtgtggatccaagataaacgtctatctttactcgaa 120
Query: 2746 tcatgcaaattagataaggtgaaatggtctggagttagaacacagcattcaactactcct 2805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tcatgcaaattagataaggtgaaatggtctggagttagaacacagcattcaactactcct 180
Query: 2806 tttgttgatgacatgtatgaacgtctgaaggagacattgacagactacgaggtcatcatt 2865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tttgttgatgacatgtatgaacgtctgaaggagacattgacagactacgaggtcatcatt 240
Query: 2866 tgccgctggccagaatataccctggttttagaaaatgccattgctgatattgagaaggcc 2925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tgccgctggccagaatataccctggttttagaaaatgccattgctgatattgagaaggcc 300
Query: 2926 attgtggaagctttagacaaacaatatgcagatgttttatctcctctcaaagaaagcatg 2985
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 attgtggacgctttagacaaacaatatgcagatgttttatctcctctcaaagaaagcatg 360
Query: 2986 actcctaagaagtttgggcttaaatatgtccagaaacttgccaaacgctctacatgtgcc 3045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 actcctaagaagtttgggcttaaatatgtccagaaacttgccaaacgctctacatgtgcc 420
Query: 3046 tatgtggttcctgatgagctcggaattctattgaattctttaaagagaatgcttgacatc 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tatgtggttcctgatgagctcggaattctattgaattctttaaagagaatgcttgacatc 480
Query: 3106 ttgcgtcccagggtagaatcacagttcaagtcatggggatcgtgcttgccacatgctgga 3165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ttgcgtcccagggtagaatcacagttcaagtcatggggatcgtgcttgccacatgctgga 540
Query: 3166 aacacagcacctggtgagagacttagtgaagtgacagtgatgctgagagctaagttcagg 3225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aacacagcacctggtgagagacttagtgaagtgacagtgatgctgagagctaagttcagg 600
Query: 3226 aactaccttcaggctattgtggagaaacttgtggaaaatactaagttgcataacaccacc 3285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aactaccttcaggctattgtggagaaacttgtggaaaatactaagttgcataacaccacc 660
Query: 3286 aaattaaaaaagattctccaagagtccaaggaaactgtggtagagtctgatttaagaagt 3345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 aaattaaaaaagattctccaagagtccaaggaaactgtggtagagtctgatttaagaagt 720
Query: 3346 agaatgcagccactgaaagagaagttggttgataccataagtcaccttcacagtgtcttt 3405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 agaatgcagccactgaaagagaagttggttgataccataagtcaccttcacagtgtcttt 780
Query: 3406 gagactcatgtttttattgcaatatgtcgaggttattgggatcgtatggggcaggaaatt 3465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gagactcatgtttttattgcaatatgtcgaggttattgggatcgtatggggcaggaaatt 840
Query: 3466 ttaagtttcttggagaacagaaaagagaatagatcgtggtacaagggttcaagggtggct 3525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 ttaagtttcttggagaacagaaaagagaatagatcgtggtacaagggttcaagggtggct 900
Query: 3526 gtttctgttctggatgatacatttgcctcacaaatgcaacagcttctaggaaattcatta 3585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 gtttctgttctggatgatacatttgcctcacaaatgcaacagcttctaggaaattcatta 960
Query: 3586 caagaaaaagacctggatcctcctagatgcatcatggaagttcgttccatgctttgcaag 3645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 caagaaaaagacctggatcctcctagatgcatcatggaagttcgttccatgctttgcaag 1020
Query: 3646 gatgctgccaaccacaaggataatagtttttacttttag 3684
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 gatgctgccaaccacaaggataatagtttttacttttag 1059
>gnl|LJGI|TC59428 similar to UniRef100_A7NUP1 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_1,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_1, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (27%)
Length = 771
Score = 1528 bits (771), Expect = 0.0
Identities = 771/771 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 900 tccatcatttcatgcaagtgctcttgggccatggtatggagtgattgcatatgatgcttg 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tccatcatttcatgcaagtgctcttgggccatggtatggagtgattgcatatgatgcttg 60
Query: 960 tgtgcgtctttgccttcatgcttgggcaatgcaaaacatggaggcacctatgtttttgga 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tgtgcgtctttgccttcatgcttgggcaatgcaaaacatggaggcacctatgtttttgga 120
Query: 1020 gaacgaatgctctttactcagggatgcatttggattgcgacaggtgctattacaatcaga 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaacgaatgctctttactcagggatgcatttggattgcgacaggtgctattacaatcaga 180
Query: 1080 agaggaactaatggtgaagtgcaatatagagccttcaagtgagggtgttgctccaaaacc 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 agaggaactaatggtgaagtgcaatatagagccttcaagtgagggtgttgctccaaaacc 240
Query: 1140 caaaaaacttattgggaaaatgaaggtgcaagtacgtaaaattaaagttggcttggagcc 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 caaaaaacttattgggaaaatgaaggtgcaagtacgtaaaattaaagttggcttggagcc 300
Query: 1200 tcctactggctgtagcgtgtcatcgttgatgacacataaaattaaaatggaatctgtgcg 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tcctactggctgtagcgtgtcatcgttgatgacacataaaattaaaatggaatctgtgcg 360
Query: 1260 ataccacctctccaatatgcagtcaacactatcttctggatggcaagctctcaagaaagt 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ataccacctctccaatatgcagtcaacactatcttctggatggcaagctctcaagaaagt 420
Query: 1320 tcgatttgcaccacgtttgcatgcaaatggttccctggcacgacaaagcttggcatatgt 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tcgatttgcaccacgtttgcatgcaaatggttccctggcacgacaaagcttggcatatgt 480
Query: 1380 gcatgctagcactcgctacatacaacaagtgtctggactccttaaggctggtgttacaac 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcatgctagcactcgctacatacaacaagtgtctggactccttaaggctggtgttacaac 540
Query: 1440 atctcttcgcagcagttcatcgtcctatgaagttgtgcaagagacgtacgcgtgttattt 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 atctcttcgcagcagttcatcgtcctatgaagttgtgcaagagacgtacgcgtgttattt 600
Query: 1500 aagactgaaaagctcagttgaagaggacgctgttaggttgcagcctggatctagtgaagt 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aagactgaaaagctcagttgaagaggacgctgttaggttgcagcctggatctagtgaagt 660
Query: 1560 ccatgtgttttttccagatagccttggagatgatttgatcgttgaagttcaagattccaa 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 ccatgtgttttttccagatagccttggagatgatttgatcgttgaagttcaagattccaa 720
Query: 1620 ggggaagcattttggccgtgttcttgtccaagtggctactataactgagga 1670
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 ggggaagcattttggccgtgttcttgtccaagtggctactataactgagga 771
>gnl|LJGI|TC64918
Length = 830
Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0
Identities = 565/566 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgttcacacaaggccttgacaaaaacgctcttcgctgggttggagagaaggatgttcca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 265 atgttcacacaaggccttgacaaaaacgctcttcgctgggttggagagaaggatgttcca 324
Query: 61 ttctcaagcacaacattgagatctcgcaacgatcccattggtgcgatgaagagtggtact 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 325 ttctcaagcacaacattgagatctcgcaacgatcccatcggtgcgatgaagagtggtact 384
Query: 121 ggaagagggtttgggctgccgccgccagcgaaattcagaagtgggcatcttcctgcgaat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 385 ggaagagggtttgggctgccgccgccagcgaaattcagaagtgggcatcttcctgcgaat 444
Query: 181 gcgattcctgtgtcgacggttgagactggcgatagctgttcgaattctgataatgatgac 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 445 gcgattcctgtgtcgacggttgagactggcgatagctgttcgaattctgataatgatgac 504
Query: 241 agcattggttctgaggaagaagtttatggtagcagatattcattggattcgtcacctcaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 505 agcattggttctgaggaagaagtttatggtagcagatattcattggattcgtcacctcaa 564
Query: 301 gatcatagagcccccaacggtgctgctaggaaatatgagaacctcactcaaagggcgtcc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 565 gatcatagagcccccaacggtgctgctaggaaatatgagaacctcactcaaagggcgtcc 624
Query: 361 cggtatgggagtgagtatacatactccgaggtcagttcttccagggaaaccctggctggc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 625 cggtatgggagtgagtatacatactccgaggtcagttcttccagggaaaccctggctggc 684
Query: 421 agacctggtgctgtgcgggaagtgttgatgaggggggcttcaaatggaaggcaaagtggt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 685 agacctggtgctgtgcgggaagtgttgatgaggggggcttcaaatggaaggcaaagtggt 744
Query: 481 ttcacagaagatgattcatcggattctgcagctagctcggaattctcttctacacaagta 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 745 ttcacagaagatgattcatcggattctgcagctagctcggaattctcttctacacaagta 804
Query: 541 ggaagtatcaatggcacactgccaag 566
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 805 ggaagtatcaatggcacactgccaag 830