Miyakogusa Predicted Gene

Lj1g3v0074750.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj1g3v0074750.1 tr|B9IJB1|B9IJB1_POPTR Predicted protein
OS=Populus trichocarpa GN=POPTRDRAFT_825475 PE=4
SV=1,28.76,6e-18,seg,NULL,CUFF.25180.1
         (1145 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC59739                                                     2254   0.0  

>gnl|LJGI|TC59739 
          Length = 2898

 Score = 2254 bits (1137), Expect = 0.0
 Identities = 1143/1145 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atggtgggagaagattgtggaacctggttgccccaggtgcaatttgatttgcaatcatcc 60
            |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 870  atggtgggtgaagattgtggaacctggatgccccaggtgcaatttgatttgcaatcatcc 929

                                                                        
Query: 61   aatttgaattcatttggtgctccccttcatgtggggaagcaaaatgctacatatgcagct 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 930  aatttgaattcatttggtgctccccttcatgtggggaagcaaaatgctacatatgcagct 989

                                                                        
Query: 121  gtgaacccgggtgtgaatgtggtcacaagaaatgagggtgtgaatgtggtcacaagtaat 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 990  gtgaacccgggtgtgaatgtggtcacaagaaatgagggtgtgaatgtggtcacaagtaat 1049

                                                                        
Query: 181  gagacggtgtcaccctctgcactacctcccttgcaactaggaagtgctaatgaacctcat 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1050 gagacggtgtcaccctctgcactacctcccttgcaactaggaagtgctaatgaacctcat 1109

                                                                        
Query: 241  ggttggttttattgtttgcctcgcttccgacagggatttacgcctgctccgagctccact 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1110 ggttggttttattgtttgcctcgcttccgacagggatttacgcctgctccgagctccact 1169

                                                                        
Query: 301  gctgaggttaaaccccctgctagccatgggaaaagtttaagggatgaaagtgtaccaaat 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1170 gctgaggttaaaccccctgctagccatgggaaaagtttaagggatgaaagtgtaccaaat 1229

                                                                        
Query: 361  agggatgaaagtttgcctcagaagcggttcctggtcattgaccaaacaggtgatcaaaca 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1230 agggatgaaagtttgcctcagaagcggttcctggtcattgaccaaacaggtgatcaaaca 1289

                                                                        
Query: 421  actctcatatacagttccaggtttgggagtcctgttgagtgccttgcttcctgggactca 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1290 actctcatatacagttccaggtttgggagtcctgttgagtgccttgcttcctgggactca 1349

                                                                        
Query: 481  aaactgcatggtcccaacaatttgaatacgcacaatgaacctcctttgagaggagacgtg 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1350 aaactgcatggtcccaacaatttgaatacgcacaatgaacctcctttgagaggagacgtg 1409

                                                                        
Query: 541  aataatgtggttggagttggaccagctttagacgataaagttgatgaaaatcagggaact 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1410 aataatgtggttggagttggaccagctttagacgataaagttgatgaaaatcagggaact 1469

                                                                        
Query: 601  gacactgaaagcgagatgcatgaagatacagaggagataaatgcattgctttactctgac 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1470 gacactgaaagcgagatgcatgaagatacagaggagataaatgcattgctttactctgac 1529

                                                                        
Query: 661  agtgatggttattcatctgaggaggatgaagttactagcacagggcattcgcctagtacc 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1530 agtgatggttattcatctgaggaggatgaagttactagcacagggcattcgcctagtacc 1589

                                                                        
Query: 721  atgaccactcatgataacccggcacccttgttaggagccgaggaagaagttgccagctct 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1590 atgaccactcatgataacccggcacccttgttaggagccgaggaagaagttgccagctct 1649

                                                                        
Query: 781  cgtgctggagaagcaaagaagcggaagcgagccgatggggatgcttatggtgatcatatg 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1650 cgtgctggagaagcaaagaagcggaagcgagccgatggggatgcttatggtgatcatatg 1709

                                                                        
Query: 841  cagttcatggacactgccaattctctgaatccgaaccggcccatcgacattgaagatgat 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1710 cagttcatggacactgccaattctctgaatccgaaccggcccatcgacattgaagatgat 1769

                                                                        
Query: 901  gatgcagaatcaagatgctctagcgacaatttcagtcaaggtgaaatgggttccttaaca 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1770 gatgcagaatcaagatgctctagcgacaatttcagtcaaggtgaaatgggttccttaaca 1829

                                                                        
Query: 961  ggcaataagaagatgagaaaggagaagatacaagatgttttaagcgttttgcaacacatt 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1830 ggcaataagaagatgagaaaggagaagatacaagatgttttaagcgttttgcaacacatt 1889

                                                                        
Query: 1021 gttcctggtgggaaggacaaggacccaatccagctccttgatgaagccatacgttgcttg 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1890 gttcctggtgggaaggacaaggacccaatccagctccttgatgaagccatacgttgcttg 1949

                                                                        
Query: 1081 aaatccttgaaagtcaaggctagagcacttggactcgatgccttgcaagatggagaattc 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1950 aaatccttgaaagtcaaggctagagcacttggactcgatgccttgcaagatggagaattc 2009

                 
Query: 1141 taagc 1145
            |||||
Sbjct: 2010 taagc 2014