Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0347359.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0347359.1 tr|B9GIS5|B9GIS5_POPTR Predicted protein
OS=Populus trichocarpa GN=POPTRDRAFT_550441 PE=4
SV=1,53.85,0.0000000000002, ,CUFF.23843.1
(1263 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC59829 similar to UniRef100_Q9FN40 Cluster: Genomic DN... 2482 0.0
>gnl|LJGI|TC59829 similar to UniRef100_Q9FN40 Cluster: Genomic DNA, chromosome 5, TAC
clone: K19P17; n=1; Arabidopsis thaliana|Rep: Genomic
DNA, chromosome 5, TAC clone: K19P17 - Arabidopsis
thaliana (Mouse-ear cress), partial (81%)
Length = 1632
Score = 2482 bits (1252), Expect = 0.0
Identities = 1262/1264 (99%), Gaps = 1/1264 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtccagagagcgtttggtgaaggcagtgaagcgctttgtggaggttcgatacaaggtc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 66 atgtccagagagcgtttggtgaaggcagtgaagcgctttgtggaggttcgatacaaggtc 125
Query: 61 ttctctactcgttatggccaaaacgttatcgatatcttggacttcccaatcaagctcgtc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 126 ttctctactcgttatggccaaaacgttatcgatatcttggacttcccaatcaagctcgtc 185
Query: 121 ttgtctcccttcactttggccttcgacattgctggttctgctcctcgtggcttcggtgtc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 186 ttgtctcccttcactttggccttcgacattgctggttctgctcctcgtggcttcggtgtc 245
Query: 181 cctgagcttatctctaagctctctgctgcttccgtcttcgctattgctactttggggact 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 246 cctgagcttatctctaagctctctgctgcttccgtcttcgctattgctactttggggact 305
Query: 241 tatgacattgcattagagctggggaagaaggtgatatgtcaaaggaattgtcggacatgt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 306 tatgacattgcattagagctggggaagaaggtgatatgtcaaaggaattgtcggacatgt 365
Query: 301 aatggatggcaggccttgcggtgtaccatgtgccgagggagtggaagggtgcactatcaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 366 aatggatggcaggccttgcggtgtaccatgtgccgagggagtggaagggtgcactatcaa 425
Query: 361 gtgaagagttgcaccttgaagaggggagagaaagcaactgctgaatctgtagcagatgcc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426 gtgaagagttgcaccttgaagaggggagagaaagcaactgctgaatctgtagcagatgcc 485
Query: 421 attgttgacaaccgggctgagttagtgcatataccttcctccttggattttcagaaacca 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 486 attgttgacaaccgggctgagttagtgcatataccttcctccttggattttcagaaacca 545
Query: 481 ttgccattgaaagactgtccaacttgtgatggaacgggtgtaatgggctgtactgaatgc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 546 ttgccattgaaagactgtccaacttgtgatggaacgggtgtaatgggctgtactgaatgc 605
Query: 541 aagcacaaattacaagttaggatctcagcagacgatattatggagcccccatggcaagct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 606 aagcacaaattacaagttaggatctcagcagacgatattatggagcccccatggcaagct 665
Query: 601 tataatgtgttggaaaagatggattatccatatgagcacataaggcacagcatgaaagat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 666 tataatgtgttggaaaagatggattatccatatgagcacataaggcacagcatgaaagat 725
Query: 661 cctggtattgctgcattttggctgattaccttacctcagattatggggggatttacctat 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 726 cctggtattgctgcattttggctgattaccttacctcagattatggggggatttacctat 785
Query: 721 gatgatgatgtgaagcagaatatatggtcgcagtacaaggaatccatgcgttatgatcaa 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 786 gatgatgatgtgaagcagaatatatggtcgcagtacaaggaatccatgcgttatgatcaa 845
Query: 781 ctccgagatgtggtggccaagaggaaaccagggtgggagtatctgcaggatgccttgata 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 846 ctccgagatgtggtggccaagaggaaaccagggtgggagtatctgcaggatgccttgata 905
Query: 841 tctatagatccttcccgtgcaagggatgatcctgtcattgtgaaaaatgtcccttacttt 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 906 tctatagatccttcccgtgcaagggatgatcctgtcattgtgaaaaatgtcccttacttt 965
Query: 901 aaggctaagaaggctctgg-aggcagaggttatgaagcttgatccaccaccgagaccacc 959
||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 966 aaggctaagaaggctctggaaggcagacgttatgaagcttgatccaccaccgagaccacc 1025
Query: 960 aacttggggtgagctggaccttccattaagtgcatcatcttggagtgagcaggatctcaa 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1026 aacttggggtgagctggaccttccattaagtgcatcatcttggagtgagcaggatctcaa 1085
Query: 1020 agatccagacaagttctatgagatgactgttcttcttaatgcccaaagagagatctctga 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1086 agatccagacaagttctatgagatgactgttcttcttaatgcccaaagagagatctctga 1145
Query: 1080 taagatcttggatgcacaatgggaaactaaatggcgtcaagagaagttgaataagatggt 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1146 taagatcttggatgcacaatgggaaactaaatggcgtcaagagaagttgaataagatggt 1205
Query: 1140 ggaggaaaagctgcagccatacattcagaatacagacagtgcagttctttctgagactat 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1206 ggaggaaaagctgcagccatacattcagaatacagacagtgcagttctttctgagactat 1265
Query: 1200 attactaaaaccacaaaatcaggataacaagagacctcgccgacgaaggtggttcttctt 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1266 attactaaaaccacaaaatcaggataacaagagacctcgccgacgaaggtggttcttctt 1325
Query: 1260 ttga 1263
||||
Sbjct: 1326 ttga 1329