Miyakogusa Predicted Gene

Lj0g3v0323329.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj0g3v0323329.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1NCY8|I1NCY8_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=3
SV=1,86.92,0,Mito_carr,Mitochondrial substrate/solute carrier;
seg,NULL; Mitochondrial carrier,Mitochondrial carr,CUFF.21966.1
         (1107 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC69964                                                     2187   0.0  
gnl|LJGI|TC68364                                                      579   e-164

>gnl|LJGI|TC69964 
          Length = 1319

 Score = 2187 bits (1103), Expect = 0.0
 Identities = 1106/1107 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgtcagagtcaaacgcaattgcaaatggtttggctggtgcaggtggtggaattatcgct 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 24   atgtcagagtcaaacgcaattgcaaatggtttggctggtgcaggtggtggaattatcgct 83

                                                                        
Query: 61   caaatcataacttatcctcttcaagcggtaaacacgcgccagcaaactgagagaacactc 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 84   caaatcataacttatcctcttcaagcggtaaacacgcgccagcaaactgagagaacactc 143

                                                                        
Query: 121  aagaggaacaagcaaaacttaaacacaagtgccactgctcctgcttctgctccaggcact 180
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 144  aagaggaacaagcaaaactttaacacaagtgccactgctcctgcttctgctccaggcact 203

                                                                        
Query: 181  ctttttcagatatttcaggtcattggaaatgagggcttgggtggactctacagtggcctc 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 204  ctttttcagatatttcaggtcattggaaatgagggcttgggtggactctacagtggcctc 263

                                                                        
Query: 241  aagccttctcttcttggaactgctgcttctcagggcatttactactacttctatcaagtt 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264  aagccttctcttcttggaactgctgcttctcagggcatttactactacttctatcaagtt 323

                                                                        
Query: 301  ttcaagaacaaagcggtggccattgctgctgctcggaaagtcaaagggcatggagatggc 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 324  ttcaagaacaaagcggtggccattgctgctgctcggaaagtcaaagggcatggagatggc 383

                                                                        
Query: 361  actgttggaatgtttggctggcttgttgtggctgcaattgctgggtccttgaatgtattg 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 384  actgttggaatgtttggctggcttgttgtggctgcaattgctgggtccttgaatgtattg 443

                                                                        
Query: 421  tgtacaaacccaatatgggttctagtgactcgtatgcagacacacactcaagcagaaaga 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 444  tgtacaaacccaatatgggttctagtgactcgtatgcagacacacactcaagcagaaaga 503

                                                                        
Query: 481  aaaatcatggagcaaaagaaagaagcattgaggagggatgcttcagaaagcagtttagca 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 504  aaaatcatggagcaaaagaaagaagcattgaggagggatgcttcagaaagcagtttagca 563

                                                                        
Query: 541  ggttcaacattagaagaccaattggctgaactcaattctataaaaccccgaccatatgga 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 564  ggttcaacattagaagaccaattggctgaactcaattctataaaaccccgaccatatgga 623

                                                                        
Query: 601  actatacatgcagctaatgaagtatataatgaagcgggtattgttggattttggaagggt 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 624  actatacatgcagctaatgaagtatataatgaagcgggtattgttggattttggaagggt 683

                                                                        
Query: 661  gtcttccctgcccttattatggtttgcaatccatcaatccagtttatgatctatgagagt 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 684  gtcttccctgcccttattatggtttgcaatccatcaatccagtttatgatctatgagagt 743

                                                                        
Query: 721  tcattaaagcgtctaagagaaaaacgtgcggctaagaagcaggggagtagtagtgtaacc 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 744  tcattaaagcgtctaagagaaaaacgtgcggctaagaagcaggggagtagtagtgtaacc 803

                                                                        
Query: 781  gctttggaggtctttttggtgggagcaatagcaaaacttggagcgactgtcacaacatat 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 804  gctttggaggtctttttggtgggagcaatagcaaaacttggagcgactgtcacaacatat 863

                                                                        
Query: 841  cccttgctagttgtcaagtcaaggcttcaagcaaaacaggagattggtggaagtaacaca 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 864  cccttgctagttgtcaagtcaaggcttcaagcaaaacaggagattggtggaagtaacaca 923

                                                                        
Query: 901  ttaagatacacaggtacttttgatgcaatacttaaaatcatccgttatgaaggatttcct 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 924  ttaagatacacaggtacttttgatgcaatacttaaaatcatccgttatgaaggatttcct 983

                                                                        
Query: 961  ggtttttacaaggggatgagcacaaagatagtgcagagtgtttttgcagcttctgtttta 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 984  ggtttttacaaggggatgagcacaaagatagtgcagagtgtttttgcagcttctgtttta 1043

                                                                        
Query: 1021 ttcatgattaaggaggagcttgttaaggcttttatggtgctaactgataagagcaagaaa 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1044 ttcatgattaaggaggagcttgttaaggcttttatggtgctaactgataagagcaagaaa 1103

                                       
Query: 1081 gttgtattaaatttgggtagttgactt 1107
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1104 gttgtattaaatttgggtagttgactt 1130


>gnl|LJGI|TC68364 
          Length = 577

 Score =  579 bits (292), Expect = e-164
 Identities = 313/320 (97%), Gaps = 5/320 (1%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 788  aggtctttttggtgggagcaatagcaaaacttggagcgactgtcacaacatatcccttgc 847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 150  aggtctttttggtgggagcaatagcaaaacttggagcgactgtcacaacatatcccttgc 209

                                                                        
Query: 848  tagttgtcaagtcaaggcttcaagcaaaacaggagattggtggaagtaacacattaagat 907
            ||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 210  tagttgtcagg-----gcttcaagcaaaacaggagattggtggaagtaacacattaagat 264

                                                                        
Query: 908  acacaggtacttttgatgcaatacttaaaatcatccgttatgaaggatttcctggttttt 967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 265  acacaggtacttttgatgcaatacttaaaatcatccgttatgaaggatttcctggttttt 324

                                                                        
Query: 968  acaaggggatgagcacaaagatagtgcagagtgtttttgcagcttctgttttattcatga 1027
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 325  acaaggggatgagcacaaagatagtgcagagtgtctttgcagcttctgttttattcatga 384

                                                                        
Query: 1028 ttaaggaggagcttgttaaggcttttatggtgctaactgataagagcaagaaagttgtat 1087
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 385  ttaaggaggagcttgttaaggcttttatggtgctaactgataagagcaagaaagttgtat 444

                                
Query: 1088 taaatttgggtagttgactt 1107
            ||||||||||||||||||||
Sbjct: 445  taaatttgggtagttgactt 464



 Score =  246 bits (124), Expect = 2e-64
 Identities = 124/124 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 666 ccctgcccttattatggtttgcaatccatcaatccagtttatgatctatgagagttcatt 725
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2   ccctgcccttattatggtttgcaatccatcaatccagtttatgatctatgagagttcatt 61

                                                                       
Query: 726 aaagcgtctaagagaaaaacgtgcggctaagaagcaggggagtagtagtgtaaccgcttt 785
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62  aaagcgtctaagagaaaaacgtgcggctaagaagcaggggagtagtagtgtaaccgcttt 121

               
Query: 786 ggag 789
           ||||
Sbjct: 122 ggag 125