Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0312759.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0312759.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1LXJ6|I1LXJ6_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=3 SV=1,90.11,0,seg,NULL;
ATPases associated with a variety of cellula,AAA+ ATPase domain;
ABC_tran,ABC transporter-,CUFF.21199.1
(1857 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC78821 homologue to UniRef100_A7QU38 Cluster: Chromoso... 2379 0.0
gnl|LJGI|TC72257 similar to UniRef100_Q8W1S2 Cluster: ABC transp... 967 0.0
>gnl|LJGI|TC78821 homologue to UniRef100_A7QU38 Cluster: Chromosome chr2 scaffold_176,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr2 scaffold_176, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (56%)
Length = 1429
Score = 2379 bits (1200), Expect = 0.0
Identities = 1203/1204 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 654 ggagtcacgagcagcatctatacttgctggtttgagtttcactcctgaaatgcagaacaa 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggagtcacgagcagcatctatacttgctggtttgagtttcactcctgaaatgcagaacaa 60
Query: 714 ggcaacaaaaacgttctctggaggatggcggatgcgaatagcacttgctcgtgcactgtt 773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ggcaacaaaaacgttctctggaggatggcggatgcgaatagcacttgctcgtgcactgtt 120
Query: 774 tatagagcctgatatattgcttcttgatgagcctacgaaccatcttgatcttcatgctgt 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tatagagcctgatatattgcttcttgatgagcctacgaaccatcttgatcttcatgctgt 180
Query: 834 cttatggcttgaatcgtacttggttaagtggccaaaaacagttattgttgtttctcatgc 893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 cttatggcttgaatcgtacttggttaagtggccaaaaacagttattgttgtttctcatgc 240
Query: 894 tagagaatttttaaacacggtggttacagatataattcacttacaaaaccaaaagctgac 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tagagaatttttaaacacggtggttacagatataattcacttacaaaaccaaaagctgac 300
Query: 954 tacttataaaggggattatgataattttgagaagacacgagaagaacaaatcaaaaacca 1013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tacttataaaggggattatgataattttgagaagacacgagaagaacaaatcaaaaacca 360
Query: 1014 gcaaaaagcattggaggcaaatgaacgttccagagctcacatgcagactttcattgacaa 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gcaaaaagcattggaggcaaatgaacgttccagagctcacatgcagactttcattgacaa 420
Query: 1074 gtttcgctttaatgcaaagagggcgtcacttgttcaatcaagaatcaaggctctggatcg 1133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gtttcgctttaatgcaaagagggcgtcacttgttcaatcaagaatcaaggctctggatcg 480
Query: 1134 gctgggctttgtagatcaaattgttaatgatcctgactacaagtttgagttccccactcc 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gctgggctttgtagatcaaattgttaatgatcctgactacaagtttgagttccccactcc 540
Query: 1194 agatgatagaccaggcgcaccaataataagtttcagtgatgcatcatttgggtatcctgg 1253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 agatgatagaccaggcgcaccaataataagtttcagtgatgcatcatttgggtatcctgg 600
Query: 1254 agggcccattctatttaagaatttgaactttgggattgatcttgacagccgtattgcaat 1313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 agggcccattctatttaagaatttgaactttgggattgatcttgacagccgtattgcaat 660
Query: 1314 ggttggaccaaatggcattggcaaatctactatacttaagttaattgctggggatttaca 1373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 ggttggaccaaatggcattggcaaatctactatacttaagttaattgctggggatttaca 720
Query: 1374 accaacttctgggaccgtcttccgttctgctaaggttcgaatagcagttttcagtcagca 1433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 721 accaacttctgggaccgtcttccgttctgctaaggttcgaatagcagttttaagtcagca 780
Query: 1434 ccacgttgatggactcgacttatcctcaaatcctcttctgtatatgatgcgctgctatcc 1493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 ccacgttgatggactcgacttatcctcaaatcctcttctgtatatgatgcgctgctatcc 840
Query: 1494 tggagttccagaacagaagcttcgagctcacttaggttcttttggtgtaactggaaatct 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 tggagttccagaacagaagcttcgagctcacttaggttcttttggtgtaactggaaatct 900
Query: 1554 tgcacttcagcccatgtatactttgtcaggtggtcagaaaagtagggttgccttcgcaaa 1613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 tgcacttcagcccatgtatactttgtcaggtggtcagaaaagtagggttgccttcgcaaa 960
Query: 1614 gattacttttaagaagccacacataatattgcttgatgagccatccaatcatctggactt 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 gattacttttaagaagccacacataatattgcttgatgagccatccaatcatctggactt 1020
Query: 1674 ggatgctgttgaggcgctaattcaaggtcttgtgatgttccaaggaggaattctcatggt 1733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 ggatgctgttgaggcgctaattcaaggtcttgtgatgttccaaggaggaattctcatggt 1080
Query: 1734 gagtcacgatgagcatctcatctctggaagcgtagatgagttatgggttgtatcccaagg 1793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 gagtcacgatgagcatctcatctctggaagcgtagatgagttatgggttgtatcccaagg 1140
Query: 1794 aacagcaacaccattccatggctccttccaagattacaagaagatactccagtcatctta 1853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 aacagcaacaccattccatggctccttccaagattacaagaagatactccagtcatctta 1200
Query: 1854 ggga 1857
||||
Sbjct: 1201 ggga 1204
>gnl|LJGI|TC72257 similar to UniRef100_Q8W1S2 Cluster: ABC transporter-like protein;
n=1; Glycine max|Rep: ABC transporter-like protein -
Glycine max (Soybean), partial (41%)
Length = 808
Score = 967 bits (488), Expect = 0.0
Identities = 488/488 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgaacgagggattggacgacggtgtagctcctaagaagaagcctgagccagtggatggt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 321 atgaacgagggattggacgacggtgtagctcctaagaagaagcctgagccagtggatggt 380
Query: 61 cctctcttgactgaacgcgacaaattgaagctcgaaaggaggaagaggaaggatgaacga 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 381 cctctcttgactgaacgcgacaaattgaagctcgaaaggaggaagaggaaggatgaacga 440
Query: 121 cagagagaggcacaataccaaattcatttgcaagagatggaagcggtgcgggcagggatg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 441 cagagagaggcacaataccaaattcatttgcaagagatggaagcggtgcgggcagggatg 500
Query: 181 cctgtggtttgcgtaaggcatgagaacatgggcggtccgaatgtgaaggacattcacatg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 501 cctgtggtttgcgtaaggcatgagaacatgggcggtccgaatgtgaaggacattcacatg 560
Query: 241 gagaatttcaatatctctgttggtggccgcgatctcattctcgatggttccatcactctc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 561 gagaatttcaatatctctgttggtggccgcgatctcattctcgatggttccatcactctc 620
Query: 301 tcttttggaaggcattatgggcttgttggaagaaatggtacaggcaaaacaacttttctc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 621 tcttttggaaggcattatgggcttgttggaagaaatggtacaggcaaaacaacttttctc 680
Query: 361 aggcacatggctatgcatgccgttgatggcattcccaggaattgtcagatattgcatgtg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 681 aggcacatggctatgcatgccgttgatggcattcccaggaattgtcagatattgcatgtg 740
Query: 421 gagcaagaggttgtgggtgacaatatatctgcactgcagtgtgttctcaattctgacatc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 741 gagcaagaggttgtgggtgacaatatatctgcactgcagtgtgttctcaattctgacatc 800
Query: 481 gagagaac 488
||||||||
Sbjct: 801 gagagaac 808