Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0306429.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0306429.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1MYL7|I1MYL7_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max PE=3
SV=1,94.39,0,TCOMPLEXTCP1,Chaperone, tailless complex polypeptide 1;
GroEL equatorial domain-like,Chaperonin Cpn6,CUFF.20700.1
(1608 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC62538 homologue to UniRef100_A7P458 Cluster: Chromoso... 3188 0.0
gnl|LJGI|FS338399 similar to UniRef100_Q17KD5 Cluster: Chaperoni... 68 2e-10
>gnl|LJGI|TC62538 homologue to UniRef100_A7P458 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_5,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_5, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), complete
Length = 1940
Score = 3188 bits (1608), Expect = 0.0
Identities = 1608/1608 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgctggctttcgacgagtacggaaggccgttcctcatcctgaaggagcaggagcag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155 atggcgctggctttcgacgagtacggaaggccgttcctcatcctgaaggagcaggagcag 214
Query: 61 aagagcagattgagaggtctcgatgctcagaaggccaacatctccgccggtaaagccgtc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 215 aagagcagattgagaggtctcgatgctcagaaggccaacatctccgccggtaaagccgtc 274
Query: 121 gctcgcatcctccgaacctctctcggccccaaaggcatggacaagatgcttcaaagcccc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 275 gctcgcatcctccgaacctctctcggccccaaaggcatggacaagatgcttcaaagcccc 334
Query: 181 gacggcgacgtcaccatcacaaatgatggagcgacaatcttggagcagatggatgttgac 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 335 gacggcgacgtcaccatcacaaatgatggagcgacaatcttggagcagatggatgttgac 394
Query: 241 aaccagattgcgaagctgatggtggagctgtcgaggagtcaggattatgagattggtgat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 395 aaccagattgcgaagctgatggtggagctgtcgaggagtcaggattatgagattggtgat 454
Query: 301 gggaccactggtgttgttgtgttggctggagctcttcttgagcaagcggaacggctcttg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 455 gggaccactggtgttgttgtgttggctggagctcttcttgagcaagcggaacggctcttg 514
Query: 361 gaaaggggaattcacccgattaggattgctgagggctatgaaatggcatccaggatctct 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 515 gaaaggggaattcacccgattaggattgctgagggctatgaaatggcatccaggatctct 574
Query: 421 gttgagcatctggagcggatcgcaaacaagtttgaattcggagaatcaaatttggagcct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 575 gttgagcatctggagcggatcgcaaacaagtttgaattcggagaatcaaatttggagcct 634
Query: 481 ctcattcaaacttgtatgactaccttgtcctctaaaattgtgaatcgatgtaagcgtagc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 635 ctcattcaaacttgtatgactaccttgtcctctaaaattgtgaatcgatgtaagcgtagc 694
Query: 541 ttggctgagattgctgtcaatgctgttgttgctgttgctgatttggagagaaaggatgtt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 695 ttggctgagattgctgtcaatgctgttgttgctgttgctgatttggagagaaaggatgtt 754
Query: 601 aacttggatctaattaaagtagaaggaaaggttggtgggaagttggaagataccgagttg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 755 aacttggatctaattaaagtagaaggaaaggttggtgggaagttggaagataccgagttg 814
Query: 661 atatatggaatcgttgttgacaaagacatgagccatccacaaatgccaaagcaaattgaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 815 atatatggaatcgttgttgacaaagacatgagccatccacaaatgccaaagcaaattgaa 874
Query: 721 gatgctaaaattgctatcctgacttgcccctttgagcctcctaagccaaagactaaacat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 875 gatgctaaaattgctatcctgacttgcccctttgagcctcctaagccaaagactaaacat 934
Query: 781 aaggttgatatcgatacagtggagaagttccagacgttaaggaaacaagaagtgaaatat 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 935 aaggttgatatcgatacagtggagaagttccagacgttaaggaaacaagaagtgaaatat 994
Query: 841 tttgatgacatggttcaacaatgcaaggatgcgggcgcaacccttgttatctgtcaatgg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 995 tttgatgacatggttcaacaatgcaaggatgcgggcgcaacccttgttatctgtcaatgg 1054
Query: 901 ggttttgatgatgaagcaaatcatctgttaatgcataggaacttgccagcggttagatgg 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1055 ggttttgatgatgaagcaaatcatctgttaatgcataggaacttgccagcggttagatgg 1114
Query: 961 gttggtggtgtagagttggaattgatagctatagcgacaggtggaagaattgttcctagg 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1115 gttggtggtgtagagttggaattgatagctatagcgacaggtggaagaattgttcctagg 1174
Query: 1021 ttccaggagctaactccagaaaagttgggaaaggctggtctggttcgagaaaaagccttt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1175 ttccaggagctaactccagaaaagttgggaaaggctggtctggttcgagaaaaagccttt 1234
Query: 1081 ggcacaacgaaagaccgaatgctttacattgagcattgtgcaaactcaagggctgtaact 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1235 ggcacaacgaaagaccgaatgctttacattgagcattgtgcaaactcaagggctgtaact 1294
Query: 1141 atattcattcgtggaggtaacaaaatgattatagaggagacaaagcgcagccttcatgat 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1295 atattcattcgtggaggtaacaaaatgattatagaggagacaaagcgcagccttcatgat 1354
Query: 1201 gccttgtgtgtggctaggaatcttatccgtaacaattctattgtatatggtggtggttca 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1355 gccttgtgtgtggctaggaatcttatccgtaacaattctattgtatatggtggtggttca 1414
Query: 1261 gctgagatttcctgctctgtagcagttgaggctgctgctgacagattccctggagttgaa 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1415 gctgagatttcctgctctgtagcagttgaggctgctgctgacagattccctggagttgaa 1474
Query: 1321 cagtatgctatcagagcttttgcggatgctttggagtatgtcccgatggcccttgctgaa 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1475 cagtatgctatcagagcttttgcggatgctttggagtatgtcccgatggcccttgctgaa 1534
Query: 1381 aatagtggtctccaaccaattgaaacgttatctgccgttaagtctcagcaaataaaggat 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1535 aatagtggtctccaaccaattgaaacgttatctgccgttaagtctcagcaaataaaggat 1594
Query: 1441 aataatccccattatggcattgattgcaatgacgtgggcactaatgacatgcgtgagcag 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1595 aataatccccattatggcattgattgcaatgacgtgggcactaatgacatgcgtgagcag 1654
Query: 1501 aatgtctttgaaactttgattggaaagcagcaacagatcttactcgctacccaagttgtc 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1655 aatgtctttgaaactttgattggaaagcagcaacagatcttactcgctacccaagttgtc 1714
Query: 1561 aagatgatattgaaaattgacgatgttatttccccatttgattactga 1608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1715 aagatgatattgaaaattgacgatgttatttccccatttgattactga 1762
>gnl|LJGI|FS338399 similar to UniRef100_Q17KD5 Cluster: Chaperonin; n=1; Aedes
aegypti|Rep: Chaperonin - Aedes aegypti (Yellowfever
mosquito), partial (40%)
Length = 734
Score = 67.9 bits (34), Expect = 2e-10
Identities = 88/106 (83%)
Strand = Plus / Plus
Query: 287 atgagattggtgatgggaccactggtgttgttgtgttggctggagctcttcttgagcaag 346
|||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct: 374 atgaaattggtgatggaacgactggggttgttgtgctggctggagcccttctggagcagg 433
Query: 347 cggaacggctcttggaaaggggaattcacccgattaggattgctga 392
| |||| ||| ||||| | ||| ||||| || ||| | ||||||||
Sbjct: 434 ccgaacagctgttggacaagggcattcatcccattcgcattgctga 479