Miyakogusa Predicted Gene

Lj0g3v0306399.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj0g3v0306399.1 Non Chatacterized Hit- tr|I3T6Q6|I3T6Q6_LOTJA
Uncharacterized protein OS=Lotus japonicus PE=2
SV=1,99.49,0,NADH-UBIQUINONE OXIDOREDUCTASE 39 KDA SUBUNIT,NULL;
NADH-UBIQUINONE OXIDOREDUCTASE 39 KDA SUBUNIT-RE,CUFF.20970.1
         (1194 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC74822 similar to UniRef100_A7Q1K0 Cluster: Chromosome...  2367   0.0  

>gnl|LJGI|TC74822 similar to UniRef100_A7Q1K0 Cluster: Chromosome chr7 scaffold_44,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr7 scaffold_44, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (95%)
          Length = 1696

 Score = 2367 bits (1194), Expect = 0.0
 Identities = 1194/1194 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgcaggccatggcgaggcgcgtagtgcaccaatcgctcaaaccctcaacttcgctcaag 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78   atgcaggccatggcgaggcgcgtagtgcaccaatcgctcaaaccctcaacttcgctcaag 137

                                                                        
Query: 61   tcaatttacccaatttccgatcaccattatggagcggatcatgaacgtttcgtgtccacc 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 138  tcaatttacccaatttccgatcaccattatggagcggatcatgaacgtttcgtgtccacc 197

                                                                        
Query: 121  atcgctaccaagggcgtgggtcacctcgtccgcaagggtactggtggacgatcatctgtc 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 198  atcgctaccaagggcgtgggtcacctcgtccgcaagggtactggtggacgatcatctgtc 257

                                                                        
Query: 181  agtggcattgttgctacagtatttggggcgactggattccttggtcgttatgttgtccaa 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 258  agtggcattgttgctacagtatttggggcgactggattccttggtcgttatgttgtccaa 317

                                                                        
Query: 241  catcttgctaaaatgggatctcaagtcctagttcctttccgaggttctgaagattgtcac 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 318  catcttgctaaaatgggatctcaagtcctagttcctttccgaggttctgaagattgtcac 377

                                                                        
Query: 301  cgtcatctcaaactgatgggggatttaggacaggttgtacccatgaaatacaatccaaga 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 378  cgtcatctcaaactgatgggggatttaggacaggttgtacccatgaaatacaatccaaga 437

                                                                        
Query: 361  gatgaaagttcggtaaaagctgtgatggctaaggccaatgttgttatcaatcttattgga 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 438  gatgaaagttcggtaaaagctgtgatggctaaggccaatgttgttatcaatcttattgga 497

                                                                        
Query: 421  agggattttgagacaagaaactacagctatgagcaagtgcattatcatatggctgaccaa 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 498  agggattttgagacaagaaactacagctatgagcaagtgcattatcatatggctgaccaa 557

                                                                        
Query: 481  cttgctaggatttccaaagagcatggtggtatcatgagatttattcaagtttcttgttta 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 558  cttgctaggatttccaaagagcatggtggtatcatgagatttattcaagtttcttgttta 617

                                                                        
Query: 541  ggtgcatctccttcctctccttccaggatgctaagagctaaagcagcggcagaggaagca 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 618  ggtgcatctccttcctctccttccaggatgctaagagctaaagcagcggcagaggaagca 677

                                                                        
Query: 601  attttaagggaattacccgaggccacaatcttgaaacctgctacaatgattggtacagag 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 678  attttaagggaattacccgaggccacaatcttgaaacctgctacaatgattggtacagag 737

                                                                        
Query: 661  gatcggattttaaaccgatgggctcattttgccaaaaagtatagctttcttccattgttt 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738  gatcggattttaaaccgatgggctcattttgccaaaaagtatagctttcttccattgttt 797

                                                                        
Query: 721  ggggatggcagcacaaaaatccagcctgtatatgttgttgatgtcgccaatgcacttact 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 798  ggggatggcagcacaaaaatccagcctgtatatgttgttgatgtcgccaatgcacttact 857

                                                                        
Query: 781  gcagccttgaaggatgatggcactagcatgggaaaggtttatgaattggggggtcctgag 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 858  gcagccttgaaggatgatggcactagcatgggaaaggtttatgaattggggggtcctgag 917

                                                                        
Query: 841  gtctatactatgcatgaattggcagagcttatgtatgaggtcattcgagaatggcctcga 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 918  gtctatactatgcatgaattggcagagcttatgtatgaggtcattcgagaatggcctcga 977

                                                                        
Query: 901  tatgtgaaggttccttttcccattgctaaggcattggcatcaccgagagaattattaatt 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 978  tatgtgaaggttccttttcccattgctaaggcattggcatcaccgagagaattattaatt 1037

                                                                        
Query: 961  aataagctcccctttccactccccactcctaacatattcaatctggatcagatccgtgct 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1038 aataagctcccctttccactccccactcctaacatattcaatctggatcagatccgtgct 1097

                                                                        
Query: 1021 ttgactacagatactgttgtttcagaaaatgcattgactttcaatgatcttggaattaat 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1098 ttgactacagatactgttgtttcagaaaatgcattgactttcaatgatcttggaattaat 1157

                                                                        
Query: 1081 cctcagaagctgaagggataccctactgagtttcttatttcatataggaaagggggccca 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1158 cctcagaagctgaagggataccctactgagtttcttatttcatataggaaagggggccca 1217

                                                                  
Query: 1141 caatttggttctacaatcagtgaacgggtctctccagatgcttggccgtgataa 1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1218 caatttggttctacaatcagtgaacgggtctctccagatgcttggccgtgataa 1271