Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0303019.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0303019.1 Non Chatacterized Hit- tr|H2T5U0|H2T5U0_TAKRU
Uncharacterized protein (Fragment) OS=Takifugu
rubripe,28.09,1e-17,SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; ZINC FINGER, CCHC DOMAIN
CONTAINING 8,NULL; proline-rich domain in spliceo,CUFF.20371.1
(1506 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC69591 similar to UniRef100_A7PAL0 Cluster: Chromosome... 2962 0.0
>gnl|LJGI|TC69591 similar to UniRef100_A7PAL0 Cluster: Chromosome chr14 scaffold_9,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr14 scaffold_9, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (38%)
Length = 1836
Score = 2962 bits (1494), Expect = 0.0
Identities = 1503/1506 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggatgttgagcatttgaacgaggttcttccttctgtggaagtggaacattctggttct 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 131 atggatgttgagcatttgaacgaggttcttccttctgtggaagtggaacattctggttct 190
Query: 61 gaagctgcaaaccagcactgtggcactgagaaggaggagtatgccaattcctcgcaagaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 gaagctgcaaaccagcactgtggcactgagaaggaggagtatgccaattcctcgcaagaa 250
Query: 121 aagggtttgcatgtgggatccgagctgagtgacacggtggtggtctcggaggaagtgcgt 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 251 aagggtttgcatgtgggatccgagctgagtgacacggtgggggtctcggaggaagtgcgt 310
Query: 181 cctgacatcgatggaagaggtgctaaaagagccaggattactgttgaagagcatcaacct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 311 cctgacatcgatggaagaggtgctaaaagagccaggattactgttgaagagcatcaacct 370
Query: 241 tcagttcatttcatttataattcactaacaagagctagtagacagaagcttgaggagctt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 371 tcagttcatttcatttataattcactaacaagagctagtagacagaagcttgaggagctt 430
Query: 301 ctacaacaatggtctgaatggcaggctaaacatgttcccaaatcagatgatcttagtgaa 360
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 431 ctacagcaatggtctgaatggcaggctaaacatgttcccaaatcagatgatcttagtgaa 490
Query: 361 gtgttggagtctggtgagaagacattttttcctgcactatgtgttggacttgaaaagacc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 491 gtgttggagtctggtgagaagacattttttcctgcactatgtgttggacttgaaaagacc 550
Query: 421 tcttccgtgtcattctggatggagaaccagacaagtattgataaaaacaaagatttcatt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 551 tcttccgtgtcattctggatggagaaccagacaagtattgataaaaacaaagatttcatt 610
Query: 481 ctagatggtgattctgtgcccctatatgatcgtggatatgctttgggattgacttcagct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 611 ctagatggtgattctgtgcccctatatgatcgtggatatgctttgggattgacttcagct 670
Query: 541 gatggttcaagtaatttagatggtggactggaaatcattgaagatgctagccgatgcttt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 671 gatggttcaagtaatttagatggtggactggaaatcattgaagatgctagccgatgcttt 730
Query: 601 aactgtggttcttacaatcactctctgagagaatgttcaaggcctcgtgacaatgttgct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 731 aactgtggttcttacaatcactctctgagagaatgttcaaggcctcgtgacaatgttgct 790
Query: 661 gtcaatagtgctcgcaaacaacggaagtcccggcggaaccaaaatgtttcttcccgcaat 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 791 gtcaatagtgctcgcaaacaacggaagtcccggcggaaccaaaatgtttcttcccgcaat 850
Query: 721 ccaactcgatactatcagaattctccagctggaaaatatgatggtttgaggccaggtgct 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 851 ccaactcgatactatcagaattctccagctggaaaatatgatggtttgaggccaggtgct 910
Query: 781 cttgataatgtaacccgtcgactcttgggcttgggggagcttgatccacctccatggctt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 911 cttgataatgtaacccgtcgactcttgggcttgggggagcttgatccacctccatggctt 970
Query: 841 aacagaatgcgagaaataggataccctcctggatatcttgatgtggatgctgaggatcag 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 971 aacagaatgcgagaaataggataccctcctggatgtcttgatgtggatgctgaggatcag 1030
Query: 901 ccttctggtattacaatatacacagatgcggagattgcagaacaggaggatggggaaatt 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1031 ccttctggtattacaatatacacagatgcggagattgcagaacaggaggatggggaaatt 1090
Query: 961 atggaagcaaatcattcaaaaccaaagcggaaaatgactgttggatttccaggaataaat 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1091 atggaagcaaatcattcaaaaccaaagcggaaaatgactgttggatttccaggaataaat 1150
Query: 1021 gctcctattccagaaaatgctgatgaaagattgtgggctgctggggctggaccctctagt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1151 gctcctattccagaaaatgctgatgaaagattgtgggctgctggggctggaccctctagt 1210
Query: 1081 tcagatgtttcaagaaacttgccacagcacaggtcaaatcataataccgatcatggcagc 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1211 tcagatgtttcaagaaacttgccacagcacaggtcaaatcataataccgatcatggcagc 1270
Query: 1141 agaggtcattatcgcgagcagagattaggggatttaagggatgatggtcctcctggggat 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1271 agaggtcattatcgcgagcagagattaggggatttaagggatgatggtcctcctggggat 1330
Query: 1201 ccaggacacagttcattacaatatagttttcatcccaggtttggtggccatgaatctata 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1331 ccaggacacagttcattacaatatagttttcatcccaggtttggtggccatgaatctata 1390
Query: 1261 ccaagaagttcttcggcgggaaggtcccaggacaggaacagaagtcccttgcatgatgca 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1391 ccaagaagttcttcggcgggaaggtcccaggacaggaacagaagtcccttgcatgatgca 1450
Query: 1321 gagtccccgaggccattttccttccattctcttcattatacgtcatcagggaggctttcg 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1451 gagtccccgaggccattttccttccattctcttcattatacgtcatcagggaggctttcg 1510
Query: 1381 cccatggaccgggattctggcaggcttgaaaactggacccctgaaagcctatatgataga 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1511 cccatggaccgggattctggcaggcttgaaaactggacccctgaaagcctatatgataga 1570
Query: 1441 gaccgtaatcttccatctcgatttgtggacaggccagacgactatcaccatcgcaggtgg 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1571 gaccgtaatcttccatctcgatttgtggacaggccagacgactatcaccatcgcaggtgg 1630
Query: 1501 aggtga 1506
||||||
Sbjct: 1631 aggtga 1636