Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0276339.2
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0276339.2 Non Chatacterized Hit- tr|J3NCI5|J3NCI5_ORYBR
Uncharacterized protein OS=Oryza brachyantha
GN=OB12G1,48.42,6e-18,RNase_P_p30,RNase P subunit p30; seg,NULL; PHP
domain-like,Polymerase/histidinol phosphatase-like; n,CUFF.18343.2
(1776 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC81836 similar to UniRef100_A8TZE3 Cluster: Enoyl-CoA ... 2456 0.0
>gnl|LJGI|TC81836 similar to UniRef100_A8TZE3 Cluster: Enoyl-CoA hydratase/isomerase;
n=1; alpha proteobacterium BAL199|Rep: Enoyl-CoA
hydratase/isomerase - alpha proteobacterium BAL199,
partial (5%)
Length = 1391
Score = 2456 bits (1239), Expect = 0.0
Identities = 1269/1280 (99%), Gaps = 1/1280 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 497 tacttaacaatgtaactgagcagcccaacaggcttgatatttgtcctgagcaacatgaaa 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 tacttaacaatgtaactgagcagcccaacaggcttgatatttgtcctgagcaacatgaaa 61
Query: 557 gctcattatctgttgatataacaacacgtcgcgtgagctgtgacactttttctgagaaaa 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 gctcattatctgttgatataacaacacgtcgcgtgagctgtgacactttttctgagaaaa 121
Query: 617 atttacaatgtgaaactactgaagctttcaattctaaggaggagacagacactgagacaa 676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 atttacaatgtgaaactactgaagctttcaattctaaggaggagacagacactgagacaa 181
Query: 677 atgccactaagttagaggagagacttattgattctgatgtcccgatggatgacatggaaa 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 atgccactaagttagaggagagacttattgattctgatgtcccgatggatgacatggaaa 241
Query: 737 aatctttttcaacctcatgcgaaacatcgaaaactgcagaagacattgactttgtttcag 796
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 aatctttttcaacctcatgcgaaacatcgaaagctgcagaagacattgactttgtttcag 301
Query: 797 tggacaacagccttccatctcatgattttcgaaccatggatttcttacccgcaaactatg 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tggacaacagccttccatctcatgattttcgaaccatggatttcttacccgcaaactatg 361
Query: 857 tttaccctatcttgccatgtaataagggaagcttacttcctgtttctggtaaggtaaatc 916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 tttaccctatcttgccatgtaataagggaagcttacttcctgtttctggtaaggtaaatc 421
Query: 917 agtcatcacctgtatctgacaactcaactgagctacccaacaagcatgatgtttgtcctc 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 agtcatcacctgtatctgacaactcaactgagctacccaacaagcatgatgtttgtcctc 481
Query: 977 agcaagacgaaaggtcattatatgacaagaaagatttgcatagtggaacaattgaagctt 1036
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 agcaagacaaaaggtcattatatgacaagaaagatttgcatagtggaacaattgaagctt 541
Query: 1037 tcaattctaagaaggagatagacactcagacaaatgctacaaagttagaaaaactaaatt 1096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 tcaattctaagaaggagatagacactcagacaaatgctacaaagttagaaaaactaaatt 601
Query: 1097 ttattgattcagatgtcaatgtaaaagcacttgattcacaatcagacttgtgcatctcaa 1156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 ttattgattcagatgtcaatgtaaaagcacttgattcacaatcagacttgtgcatctcaa 661
Query: 1157 gtgatggtgtcttggatactgtaaaatcacatgagaatgggaaactggtcagatcatcag 1216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 gtgatggtgtcttggatactgtaaaatcacatgagaatgggaaactggtcagatcatcag 721
Query: 1217 atgaccccaaactaggttctgcaagtaatgatcatacagaagaaatttttaccccaccca 1276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 atgaccccaaactaggttctgcaagtaatgatcatacagaagaaatttttaccccaccca 781
Query: 1277 ccaacattaaatttccagccctggtacttgataagcataataatgagaaaagctctgatg 1336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 ccaacattaaatttccagccctggtacttgataagcataataatgagaaaagctctgatg 841
Query: 1337 tcaatctaaatgcgaaaattgtcaagatacaggaaatcttgcccagtgaagattctgaag 1396
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 tc-atctaaatgcgaaaattgtcaagatacaggaaatcttgcccagtgaagattctgaag 900
Query: 1397 ttgcagaaaacatggttttggagataaagacatctactcatgaaacttcagtggaggatg 1456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ttgcagaaaacatggttttggagataaagacatctactcatgaaacttcagtggaggatg 960
Query: 1457 cgttatttgacaaacgggaaactgatgctgttgaacttgatgagatgccacagcaaacac 1516
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 ctttatttgacaaacgggaaactgatgctgttgaacttgatgagatgccacagcaaacac 1020
Query: 1517 cttttgatgagatgcaaacggaaggtgatgacactgttccaacaatgcatttattaccag 1576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 cttttgatgagatgcaaacggaaggtgatgacactgttccaacaatgcatttattaccag 1080
Query: 1577 tcacaatggaagataataataagcttggtgaaatgagcactgattctcaatttgccgcag 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 tcacaatggaagataataataagcttggtgaaatgagcactgattctcaatttgccgcag 1140
Query: 1637 gtcaggcattgtcaggtcgattgagagttaagcgaaggacatctcgtggaccacttttgt 1696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 gtcaggcattgtcaggtcgattgagagttaagcgaaggacatctcgtggaccacttttgt 1200
Query: 1697 tccccttgaagcgattgttgaatcaaatgccttttaagaagaaaggtnnnnnnnttaaga 1756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1201 tccccttgaagcgattgttgaatcaaatgccttttaagaagaaaggtaaaaaaattaaga 1260
Query: 1757 acaggattaaactaaagtaa 1776
||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 acaggattaaactaaagtaa 1280