Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0258519.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0258519.1 tr|G7KS10|G7KS10_MEDTR Pentatricopeptide
repeat-containing protein OS=Medicago truncatula
GN=MTR_7g0,66.74,0,Small MutS-related domain,Smr protein/MutS2
C-terminal; PPR_2,Pentatricopeptide repeat; PPR,Pentatri,CUFF.17004.1
(2667 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC78780 similar to UniRef100_A7Q0P9 Cluster: Chromosome... 1756 0.0
gnl|LJGI|TC78618 similar to UniRef100_A7Q0P9 Cluster: Chromosome... 827 0.0
>gnl|LJGI|TC78780 similar to UniRef100_A7Q0P9 Cluster: Chromosome chr7 scaffold_42,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr7 scaffold_42, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (29%)
Length = 886
Score = 1756 bits (886), Expect = 0.0
Identities = 886/886 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1248 ggtcggttttgacagggtgtcttataataccatggtggggatttatgctaagctgggttt 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggtcggttttgacagggtgtcttataataccatggtggggatttatgctaagctgggttt 60
Query: 1308 gctggaggaggcaatctatgtatgtaaagagatggagagctgtggaataaaaaatgatgt 1367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gctggaggaggcaatctatgtatgtaaagagatggagagctgtggaataaaaaatgatgt 120
Query: 1368 ggtaacttataatgcacttttgggtgggtttgggaagcatggcaaatatgatgatgttag 1427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggtaacttataatgcacttttgggtgggtttgggaagcatggcaaatatgatgatgttag 180
Query: 1428 taggatttttgctgagatgaaagcccgaaatatacatccaaatacattaacttactcaac 1487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 taggatttttgctgagatgaaagcccgaaatatacatccaaatacattaacttactcaac 240
Query: 1488 aatgattgatgtgtacacaaaaggtggaatgtatagggaagcaatggatgcttatagaga 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aatgattgatgtgtacacaaaaggtggaatgtatagggaagcaatggatgcttatagaga 300
Query: 1548 gttcaagcaggaaaggttggaggctgatgttgttttctatagtgcactaattgatgccct 1607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gttcaagcaggaaaggttggaggctgatgttgttttctatagtgcactaattgatgccct 360
Query: 1608 ttgcaagaatggtttagtggagtcttctatggtgttgcttgatgcaatgatagagaaagg 1667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttgcaagaatggtttagtggagtcttctatggtgttgcttgatgcaatgatagagaaagg 420
Query: 1668 aattaggcccaatgttgtcacttacaactccataattgatgcatttggtcagctgtcagc 1727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 aattaggcccaatgttgtcacttacaactccataattgatgcatttggtcagctgtcagc 480
Query: 1728 tttggaatgtggggttgatacttctgttcaagccaatgagcatcgagttgtaccttcatc 1787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tttggaatgtggggttgatacttctgttcaagccaatgagcatcgagttgtaccttcatc 540
Query: 1788 ttctatgcttattgatggtgccctccaaaatctagctataggtaaggaggatgaccggat 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 ttctatgcttattgatggtgccctccaaaatctagctataggtaaggaggatgaccggat 600
Query: 1848 catgaagatgtttgagcaacttgctgctgaaaaatcaggtcaaataaagaaggacatgag 1907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 catgaagatgtttgagcaacttgctgctgaaaaatcaggtcaaataaagaaggacatgag 660
Query: 1908 gggcagtcaggacaagttctgcatcttgtggctctttcggaaaatgcatgagatggaaat 1967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gggcagtcaggacaagttctgcatcttgtggctctttcggaaaatgcatgagatggaaat 720
Query: 1968 caaacctaatgttgtcacattttctgccattttgaatgcttgcagcaattgcaagtcctt 2027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 caaacctaatgttgtcacattttctgccattttgaatgcttgcagcaattgcaagtcctt 780
Query: 2028 tgaagatgcttcaaagctgttagatgagcttcgcctgtttgacaaccaggtgtatggggt 2087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 tgaagatgcttcaaagctgttagatgagcttcgcctgtttgacaaccaggtgtatggggt 840
Query: 2088 agcccatgggctactcttgggttacagggaacagatatggcttcag 2133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 agcccatgggctactcttgggttacagggaacagatatggcttcag 886
>gnl|LJGI|TC78618 similar to UniRef100_A7Q0P9 Cluster: Chromosome chr7 scaffold_42,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr7 scaffold_42, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (14%)
Length = 556
Score = 827 bits (417), Expect = 0.0
Identities = 420/421 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2247 ggtcgtgcttgaagggaaacgccgcgaagtgtggaatggtgactggtctgaatcttgttt 2306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 ggtcgtgcttgaagggaaacgccgcgaagtgtggaatggtgactggtctgaatcttgttt 61
Query: 2307 ggatctgcacatgatgtcttgtggtgctgctagtgctatggttcatgcatggttgctcaa 2366
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 ggatctgcacaggatgtcttgtggtgctgctagtgctatggttcatgcatggttgctcaa 121
Query: 2367 gatacgttctgtagtgtttgaaggctgtgaactgcccaagatattgaacattttaactgg 2426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 gatacgttctgtagtgtttgaaggctgtgaactgcccaagatattgaacattttaactgg 181
Query: 2427 ctggggtaagcacagcaaggttgttggtgacggcactctaagaaaggctattgaggcact 2486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ctggggtaagcacagcaaggttgttggtgacggcactctaagaaaggctattgaggcact 241
Query: 2487 cctgaatggcatgggttcaccctttaagattgctgaatgtaacttaggaagatttatttc 2546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 cctgaatggcatgggttcaccctttaagattgctgaatgtaacttaggaagatttatttc 301
Query: 2547 tccagggtacttggtagctgcctggttgaaacaatccagcacactgaatgtgcttgtttt 2606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tccagggtacttggtagctgcctggttgaaacaatccagcacactgaatgtgcttgtttt 361
Query: 2607 gcatgatctaaaaaattctgaacctgctgctgagcataagttgccagcactttgcattta 2666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 gcatgatctaaaaaattctgaacctgctgctgagcataagttgccagcactttgcattta 421
Query: 2667 g 2667
|
Sbjct: 422 g 422