Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0253199.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0253199.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1MMM9|I1MMM9_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.21024 PE,82.66,0,no
description,UAS; Ubiquitin-like,NULL; UBA-like,UBA-like; UBX,UBX; no
description,NULL; Thioredoxi,CUFF.16627.1
(1362 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC57825 similar to UniRef100_A7QBX2 Cluster: Chromosome... 2700 0.0
gnl|LJGI|TC61953 similar to UniRef100_A7QBX2 Cluster: Chromosome... 1423 0.0
gnl|LJGI|FS345983 similar to UniRef100_A7QBX2 Cluster: Chromosom... 848 0.0
>gnl|LJGI|TC57825 similar to UniRef100_A7QBX2 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_75,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_75, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (85%)
Length = 1823
Score = 2700 bits (1362), Expect = 0.0
Identities = 1362/1362 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggagggagtgttatccgccattgagcaacagagcatggtctcttccttcctcgaggtc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 118 atggagggagtgttatccgccattgagcaacagagcatggtctcttccttcctcgaggtc 177
Query: 61 gctcagggtcagaccgccgacaccgccagacaattcctccaggccacgagttggaaactt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 178 gctcagggtcagaccgccgacaccgccagacaattcctccaggccacgagttggaaactt 237
Query: 121 gaggaagctcttcagctgttcttgattggtaatgaagctggggcagtgccgccgccttcg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 238 gaggaagctcttcagctgttcttgattggtaatgaagctggggcagtgccgccgccttcg 297
Query: 181 tcacacactccgcctttagaaaatgctgattcctggactgatcatcaaacttcaagtgaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 tcacacactccgcctttagaaaatgctgattcctggactgatcatcaaacttcaagtgaa 357
Query: 241 ccaaggaaggatgctgcaaatgaaagtagtggccataatgatggagaagatgtacgtcct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 358 ccaaggaaggatgctgcaaatgaaagtagtggccataatgatggagaagatgtacgtcct 417
Query: 301 cccttacctgtgataagggaaactctttatgacgatgcaatgctgtttggagcatcaagg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 418 cccttacctgtgataagggaaactctttatgacgatgcaatgctgtttggagcatcaagg 477
Query: 361 tttggacagcgtccacaggaaccaaacgccctagttgcatttcgtaactttgaagaggaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 478 tttggacagcgtccacaggaaccaaacgccctagttgcatttcgtaactttgaagaggaa 537
Query: 421 atgagacgtccaggggtttgggaatcagatcaaggtgctgcctcaacacctgagagttct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 538 atgagacgtccaggggtttgggaatcagatcaaggtgctgcctcaacacctgagagttct 597
Query: 481 cgtgataatcttgcttcactttatcgccctccttttcatctgatgttcaatggttctttt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 598 cgtgataatcttgcttcactttatcgccctccttttcatctgatgttcaatggttctttt 657
Query: 541 gacaaggcaaaaggtgctgcttccttgcaggacaaatggttattggtgaacatacaatct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 658 gacaaggcaaaaggtgctgcttccttgcaggacaaatggttattggtgaacatacaatct 717
Query: 601 aacaaggaattcagctcacatatgcttaatcgggatacatgggccaatgaagctgtttct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 718 aacaaggaattcagctcacatatgcttaatcgggatacatgggccaatgaagctgtttct 777
Query: 661 cagaccatcagtacgaacttcatattctggcaggtgtatgatgatacaactgaaggcaaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 778 cagaccatcagtacgaacttcatattctggcaggtgtatgatgatacaactgaaggcaaa 837
Query: 721 aaggtttgtacttattacagactggattctattcctgttgtgcttattatcgatcccatc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 838 aaggtttgtacttattacagactggattctattcctgttgtgcttattatcgatcccatc 897
Query: 781 actggccaaaagatgcgttcctggtctggaatggttcaacctgaaagcttgttggaaggt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 898 actggccaaaagatgcgttcctggtctggaatggttcaacctgaaagcttgttggaaggt 957
Query: 841 ttactaggattccttgatgctggccctaaggatcatcacactaccttatctcacaagcgt 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 958 ttactaggattccttgatgctggccctaaggatcatcacactaccttatctcacaagcgt 1017
Query: 901 cctagaggaagtactagcccaccaaaagctaaagtcatagtagatgagagtaaagaggag 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1018 cctagaggaagtactagcccaccaaaagctaaagtcatagtagatgagagtaaagaggag 1077
Query: 961 gatgaggaagttcaaagagctctggcagcttcattggaaggcatgactggaggagataat 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1078 gatgaggaagttcaaagagctctggcagcttcattggaaggcatgactggaggagataat 1137
Query: 1021 atagatgttgatgttgctgtcaatcagcaagaagcagccttgccaaagaggcccacgtat 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1138 atagatgttgatgttgctgtcaatcagcaagaagcagccttgccaaagaggcccacgtat 1197
Query: 1081 ccaaccttgcctgaagaacctaaggttgaaagaaatctcctttgcagagttggtgtccga 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1198 ccaaccttgcctgaagaacctaaggttgaaagaaatctcctttgcagagttggtgtccga 1257
Query: 1141 cttccagatggacgccgggttcagcgtaacttcttacgctctgatcctattcagctgctg 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1258 cttccagatggacgccgggttcagcgtaacttcttacgctctgatcctattcagctgctg 1317
Query: 1201 tggtcattcatttctgctcagctaggggaagacgagacaaagctgtttagattaacacaa 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1318 tggtcattcatttctgctcagctaggggaagacgagacaaagctgtttagattaacacaa 1377
Query: 1261 gcaattcctggagcatctaagaatctggactatgaaagcaattcaaccttcgaggaatca 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1378 gcaattcctggagcatctaagaatctggactatgaaagcaattcaaccttcgaggaatca 1437
Query: 1321 ggccttgctaactccatgatttcagtgacttgggactgagtt 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1438 ggccttgctaactccatgatttcagtgacttgggactgagtt 1479
>gnl|LJGI|TC61953 similar to UniRef100_A7QBX2 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_75,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_75, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (58%)
Length = 1148
Score = 1423 bits (718), Expect = 0.0
Identities = 718/718 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggagggagtgttatccgccattgagcaacagagcatggtctcttccttcctcgaggtc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 166 atggagggagtgttatccgccattgagcaacagagcatggtctcttccttcctcgaggtc 225
Query: 61 gctcagggtcagaccgccgacaccgccagacaattcctccaggccacgagttggaaactt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 226 gctcagggtcagaccgccgacaccgccagacaattcctccaggccacgagttggaaactt 285
Query: 121 gaggaagctcttcagctgttcttgattggtaatgaagctggggcagtgccgccgccttcg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 286 gaggaagctcttcagctgttcttgattggtaatgaagctggggcagtgccgccgccttcg 345
Query: 181 tcacacactccgcctttagaaaatgctgattcctggactgatcatcaaacttcaagtgaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346 tcacacactccgcctttagaaaatgctgattcctggactgatcatcaaacttcaagtgaa 405
Query: 241 ccaaggaaggatgctgcaaatgaaagtagtggccataatgatggagaagatgtacgtcct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 406 ccaaggaaggatgctgcaaatgaaagtagtggccataatgatggagaagatgtacgtcct 465
Query: 301 cccttacctgtgataagggaaactctttatgacgatgcaatgctgtttggagcatcaagg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 466 cccttacctgtgataagggaaactctttatgacgatgcaatgctgtttggagcatcaagg 525
Query: 361 tttggacagcgtccacaggaaccaaacgccctagttgcatttcgtaactttgaagaggaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 526 tttggacagcgtccacaggaaccaaacgccctagttgcatttcgtaactttgaagaggaa 585
Query: 421 atgagacgtccaggggtttgggaatcagatcaaggtgctgcctcaacacctgagagttct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 586 atgagacgtccaggggtttgggaatcagatcaaggtgctgcctcaacacctgagagttct 645
Query: 481 cgtgataatcttgcttcactttatcgccctccttttcatctgatgttcaatggttctttt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 646 cgtgataatcttgcttcactttatcgccctccttttcatctgatgttcaatggttctttt 705
Query: 541 gacaaggcaaaaggtgctgcttccttgcaggacaaatggttattggtgaacatacaatct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 706 gacaaggcaaaaggtgctgcttccttgcaggacaaatggttattggtgaacatacaatct 765
Query: 601 aacaaggaattcagctcacatatgcttaatcgggatacatgggccaatgaagctgtttct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 766 aacaaggaattcagctcacatatgcttaatcgggatacatgggccaatgaagctgtttct 825
Query: 661 cagaccatcagtacgaacttcatattctggcaggtgtatgatgatacaactgaaggca 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 826 cagaccatcagtacgaacttcatattctggcaggtgtatgatgatacaactgaaggca 883
Score = 539 bits (272), Expect = e-152
Identities = 272/272 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 997 gaaggcatgactggaggagataatatagatgttgatgttgctgtcaatcagcaagaagca 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 877 gaaggcatgactggaggagataatatagatgttgatgttgctgtcaatcagcaagaagca 936
Query: 1057 gccttgccaaagaggcccacgtatccaaccttgcctgaagaacctaaggttgaaagaaat 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 937 gccttgccaaagaggcccacgtatccaaccttgcctgaagaacctaaggttgaaagaaat 996
Query: 1117 ctcctttgcagagttggtgtccgacttccagatggacgccgggttcagcgtaacttctta 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 997 ctcctttgcagagttggtgtccgacttccagatggacgccgggttcagcgtaacttctta 1056
Query: 1177 cgctctgatcctattcagctgctgtggtcattcatttctgctcagctaggggaagacgag 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1057 cgctctgatcctattcagctgctgtggtcattcatttctgctcagctaggggaagacgag 1116
Query: 1237 acaaagctgtttagattaacacaagcaattcc 1268
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1117 acaaagctgtttagattaacacaagcaattcc 1148
>gnl|LJGI|FS345983 similar to UniRef100_A7QBX2 Cluster: Chromosome chr1 scaffold_75,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr1 scaffold_75, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (26%)
Length = 789
Score = 848 bits (428), Expect = 0.0
Identities = 431/432 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 931 aaagtcatagtagatgagagtaaagaggaggatgaggaagttcaaagagctctggcagct 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 496 aaagtcatagtagatgagagtaaagaggaggatgaggaagttcaaagagctctggcagct 437
Query: 991 tcattggaaggcatgactggaggagataatatagatgttgatgttgctgtcaatcagcaa 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 436 tcattggaaggcatgactggaggagataatatagatgttgatgttgctgtcaatcagcaa 377
Query: 1051 gaagcagccttgccaaagaggcccacgtatccaaccttgcctgaagaacctaaggttgaa 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 gaagcagccttgccaaagaggcccacgtatccaaccttgcctgaagaacctaaggttgaa 317
Query: 1111 agaaatctcctttgcagagttggtgtccgacttccagatggacgccgggttcagcgtaac 1170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 316 agaaatctcctttgcagagttggtgtccgacttccagatggacaccgggttcagcgtaac 257
Query: 1171 ttcttacgctctgatcctattcagctgctgtggtcattcatttctgctcagctaggggaa 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 ttcttacgctctgatcctattcagctgctgtggtcattcatttctgctcagctaggggaa 197
Query: 1231 gacgagacaaagctgtttagattaacacaagcaattcctggagcatctaagaatctggac 1290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 gacgagacaaagctgtttagattaacacaagcaattcctggagcatctaagaatctggac 137
Query: 1291 tatgaaagcaattcaaccttcgaggaatcaggccttgctaactccatgatttcagtgact 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 tatgaaagcaattcaaccttcgaggaatcaggccttgctaactccatgatttcagtgact 77
Query: 1351 tgggactgagtt 1362
||||||||||||
Sbjct: 76 tgggactgagtt 65