Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0237819.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0237819.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1LT94|I1LT94_SOYBN
Uncharacterized protein (Fragment) OS=Glycine max
PE=4,73.88,0,PPR,Pentatricopeptide repeat; HCP-like,NULL;
TPR-like,NULL; PPR_2,Pentatricopeptide repeat; PPR_1,Pe,CUFF.15665.1
(2278 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC57479 similar to UniRef100_Q6E438 Cluster: ACT11D09.4... 1445 0.0
gnl|LJGI|TC65337 1019 0.0
gnl|LJGI|BI418759 similar to UniRef100_Q6E438 Cluster: ACT11D09.... 963 0.0
gnl|LJGI|TC77477 957 0.0
>gnl|LJGI|TC57479 similar to UniRef100_Q6E438 Cluster: ACT11D09.4; n=1; Cucumis
melo|Rep: ACT11D09.4 - Cucumis melo (Muskmelon), partial
(25%)
Length = 826
Score = 1445 bits (729), Expect = 0.0
Identities = 729/729 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtcactttggcgcctactcgtcctccgctccctccgccgtcctcccgccgtccaaccc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 98 atgtcactttggcgcctactcgtcctccgctccctccgccgtcctcccgccgtccaaccc 157
Query: 61 atctcggttaccgtccgctcctttgcattttcctccgccgaagaagccgctgctgagcgc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 158 atctcggttaccgtccgctcctttgcattttcctccgccgaagaagccgctgctgagcgc 217
Query: 121 cgtcgacggaagcgccgtctgcgcatcgagcctcccctgaatgcgattcgtcctcccctg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 218 cgtcgacggaagcgccgtctgcgcatcgagcctcccctgaatgcgattcgtcctcccctg 277
Query: 181 cagcactctccttcccgtgacccgaacgctcctcgtcttcctgactccacttcagcgctg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 278 cagcactctccttcccgtgacccgaacgctcctcgtcttcctgactccacttcagcgctg 337
Query: 241 gtgggacctcgcctcaacctccacaaccgcgtccaatcccttatacgtgccggcgaccta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 338 gtgggacctcgcctcaacctccacaaccgcgtccaatcccttatacgtgccggcgaccta 397
Query: 301 gatgccgcctcttccgtcgcccgccactccaccttctcctcgactcgtcccaccgtgttc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 398 gatgccgcctcttccgtcgcccgccactccaccttctcctcgactcgtcccaccgtgttc 457
Query: 361 acctgcaacgccatcatcgctgccatgtaccgtgccaagaggtacaacgaggctattgct 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 458 acctgcaacgccatcatcgctgccatgtaccgtgccaagaggtacaacgaggctattgct 517
Query: 421 ctctttcacttcttcttcacccagtcaaacatcgttcccaatattgtctcttacaacaat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 518 ctctttcacttcttcttcacccagtcaaacatcgttcccaatattgtctcttacaacaat 577
Query: 481 gtcatcaatacccattgcgatgagggtcgtgttgatgttgctcttgagctttatcgccat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 578 gtcatcaatacccattgcgatgagggtcgtgttgatgttgctcttgagctttatcgccat 637
Query: 541 atcattgccactgcccctttcggcccttctgcggttacctatcgccatctcaccaagggt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 638 atcattgccactgcccctttcggcccttctgcggttacctatcgccatctcaccaagggt 697
Query: 601 tttatcagcgccggtcgcattgttgaagcccttgatctcttgcgtgagatgttgaataaa 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 698 tttatcagcgccggtcgcattgttgaagcccttgatctcttgcgtgagatgttgaataaa 757
Query: 661 ggtcacggtgccgattccttggtttataacaacctaatttcaggttttctcgaactgggc 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 758 ggtcacggtgccgattccttggtttataacaacctaatttcaggttttctcgaactgggc 817
Query: 721 aatctggac 729
|||||||||
Sbjct: 818 aatctggac 826
>gnl|LJGI|TC65337
Length = 698
Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0
Identities = 514/514 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1765 gtggcagcccaggagcacccaccactgccacctcaaaatactggaatgcatcaaccttca 1824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gtggcagcccaggagcacccaccactgccacctcaaaatactggaatgcatcaaccttca 61
Query: 1825 tggggagtatctcctccaatgactgggcctcaaatgccagcagctggaccttcacctcat 1884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tggggagtatctcctccaatgactgggcctcaaatgccagcagctggaccttcacctcat 121
Query: 1885 acctcgggactgccttactcccctccatctgaatttcaaactcacatgaaaggggtggcc 1944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 acctcgggactgccttactcccctccatctgaatttcaaactcacatgaaaggggtggcc 181
Query: 1945 cctcaaatgtcagctaaccattatacaccatctgcaccttcacctcaaatggcaggacat 2004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 cctcaaatgtcagctaaccattatacaccatctgcaccttcacctcaaatggcaggacat 241
Query: 2005 caaccttatggaacaccgagcgggccccaacaatatccaccatcaggattgactcctcca 2064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 caaccttatggaacaccgagcgggccccaacaatatccaccatcaggattgactcctcca 301
Query: 2065 tggggagggcagcatcatccacagtcatggtcgtctattccctcccatggaacatctgct 2124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tggggagggcagcatcatccacagtcatggtcgtctattccctcccatggaacatctgct 361
Query: 2125 aaaatgtcagcactgtgtaatacagccccaggaccatcttctcagatgacaggaccatat 2184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 aaaatgtcagcactgtgtaatacagccccaggaccatcttctcagatgacaggaccatat 421
Query: 2185 aacccagcatcaggaatccctcctcacattcaggaaccacatcaacagcaatcagaagtc 2244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 aacccagcatcaggaatccctcctcacattcaggaaccacatcaacagcaatcagaagtc 481
Query: 2245 cctgaacaggtagcagcatggaattcgagttaat 2278
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 cctgaacaggtagcagcatggaattcgagttaat 515
>gnl|LJGI|BI418759 similar to UniRef100_Q6E438 Cluster: ACT11D09.4; n=1; Cucumis
melo|Rep: ACT11D09.4 - Cucumis melo (Muskmelon), partial
(19%)
Length = 507
Score = 963 bits (486), Expect = 0.0
Identities = 500/507 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 810 gttctttaacaatggcagggacaaggaggccatggactcgtacaagtctttgatggacag 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gttctttaacaatggcagggacaaggaggccatggactcgtacaagtctttgatggacag 60
Query: 870 acagtttaagatgacccctgtcacttgcaatgtcttgttggaggtcttgcttaaacacgg 929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 acagtttaagatgacccctgtcacttgcaatgtcttgttggaggtcttgcttaaacacgg 120
Query: 930 cnnnnnnncacaggcttgggctctgtttgatcagatgttagataaccacaccccacctaa 989
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 caaaaaaacacaggcttgggctctgtttgatcagatgttagataaccacaccccacctaa 180
Query: 990 ttttcaagctgtaaactctgataccttcaacataatggttaatgagtgctttaatctggg 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttttcaagctgtaaactctgataccttcaacataatggttaatgagtgctttaatctggg 240
Query: 1050 caagttccatgaagcactggcaacttttaggaaggctggaactaagtcaaattctaaggc 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 caagttccatgaagcactggcaacttttaggaaggctggaactaagtcaaattctaaggc 300
Query: 1110 ttttgcaatggatgttgcgggctacaataatatcatctccaggttttgtgagaatgggtt 1169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttttgcaatggatgttgcgggctacaataatatcatctccaggttttgtgagaatgggtt 360
Query: 1170 gctgtccgaagcagagacactgtttgaagaactgtgctcaaaatctttgagcccagatgt 1229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gctgtccgaagcagagacactgtttgaagaactgtgctcaaaatctttgagcccagatgt 420
Query: 1230 gcccactcacaggactttgattgatgcctacatgaaaatggaaaggatcgatgatgcttt 1289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gcccactcacaggactttgattgatgcctacatgaaaatggaaaggatcgatgatgcttt 480
Query: 1290 gaaggtattccacagaatggtggatgc 1316
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gaaggtattccacagaatggtggatgc 507
>gnl|LJGI|TC77477
Length = 846
Score = 957 bits (483), Expect = 0.0
Identities = 483/483 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1796 ctcaaaatactggaatgcatcaaccttcatggggagtatctcctccaatgactgggcctc 1855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 ctcaaaatactggaatgcatcaaccttcatggggagtatctcctccaatgactgggcctc 61
Query: 1856 aaatgccagcagctggaccttcacctcatacctcgggactgccttactcccctccatctg 1915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 aaatgccagcagctggaccttcacctcatacctcgggactgccttactcccctccatctg 121
Query: 1916 aatttcaaactcacatgaaaggggtggcccctcaaatgtcagctaaccattatacaccat 1975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 aatttcaaactcacatgaaaggggtggcccctcaaatgtcagctaaccattatacaccat 181
Query: 1976 ctgcaccttcacctcaaatggcaggacatcaaccttatggaacaccgagcgggccccaac 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ctgcaccttcacctcaaatggcaggacatcaaccttatggaacaccgagcgggccccaac 241
Query: 2036 aatatccaccatcaggattgactcctccatggggagggcagcatcatccacagtcatggt 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 aatatccaccatcaggattgactcctccatggggagggcagcatcatccacagtcatggt 301
Query: 2096 cgtctattccctcccatggaacatctgctaaaatgtcagcactgtgtaatacagccccag 2155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 cgtctattccctcccatggaacatctgctaaaatgtcagcactgtgtaatacagccccag 361
Query: 2156 gaccatcttctcagatgacaggaccatataacccagcatcaggaatccctcctcacattc 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 gaccatcttctcagatgacaggaccatataacccagcatcaggaatccctcctcacattc 421
Query: 2216 aggaaccacatcaacagcaatcagaagtccctgaacaggtagcagcatggaattcgagtt 2275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 aggaaccacatcaacagcaatcagaagtccctgaacaggtagcagcatggaattcgagtt 481
Query: 2276 aat 2278
|||
Sbjct: 482 aat 484