Miyakogusa Predicted Gene

Lj0g3v0208159.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj0g3v0208159.1 Non Chatacterized Hit- tr|E1IGV4|E1IGV4_9CHLR
Putative uncharacterized protein OS=Oscillochloris tri,26.56,3.7,
,CUFF.13367.1
         (1138 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|FS328896                                                    1489   0.0  
gnl|LJGI|TC76445                                                      248   6e-65

>gnl|LJGI|FS328896 
          Length = 762

 Score = 1489 bits (751), Expect = 0.0
 Identities = 761/763 (99%), Gaps = 1/763 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 283  gagaattcggttggtgctattcaggctagtgatgctgcagttaatttatatattcctctg 342
            |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    gagaattcggttggtgctattccggctagtgatgct-cagttaatttatatattcctctg 59

                                                                        
Query: 343  gttttcacatctcctttatctaataatgatattggtattgaccaactttctgatgaaaga 402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60   gttttcacatctcctttatctaataatgatattggtattgaccaactttctgatgaaaga 119

                                                                        
Query: 403  aatgctgtaacacgcacaaatagtggcatttataattttgatggtcaggatagaaataca 462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120  aatgctgtaacacgcacaaatagtggcatttataattttgatggtcaggatagaaataca 179

                                                                        
Query: 463  gtatcctatgaaactgttccatgtggaaaggatcaagcacattttgacaactgttccaca 522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 180  gtatcctatgaaactgttccatgtggaaaggatcaagcacattttgacaactgttccaca 239

                                                                        
Query: 523  gtcatgacacagacgtccatgctgaaggactctgctgtgggaagtttgtttgataattat 582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240  gtcatgacacagacgtccatgctgaaggactctgctgtgggaagtttgtttgataattat 299

                                                                        
Query: 583  tttcctagtggtggtgtcccagatgcatccgggtctggtggagttgattttattcctggc 642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300  tttcctagtggtggtgtcccagatgcatccgggtctggtggagttgattttattcctggc 359

                                                                        
Query: 643  cttaaagtaggtaaggatgttaatgataatcatgtttatccaaatgaggaagttgtgaca 702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360  cttaaagtaggtaaggatgttaatgataatcatgtttatccaaatgaggaagttgtgaca 419

                                                                        
Query: 703  agctatttacagaaaaggagttcctcagatgatcaaatgttcacaatggacaatttgttg 762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420  agctatttacagaaaaggagttcctcagatgatcaaatgttcacaatggacaatttgttg 479

                                                                        
Query: 763  ggtggaagttttgaaggtaacttatttcctctggccaataatcatcacccttctgctttt 822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480  ggtggaagttttgaaggtaacttatttcctctggccaataatcatcacccttctgctttt 539

                                                                        
Query: 823  caagataatatgaatatcactgctggaacttttgacgtgctcaaatctgtggatgctggt 882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540  caagataatatgaatatcactgctggaacttttgacgtgctcaaatctgtggatgctggt 599

                                                                        
Query: 883  tgtgtggagcctcagttaggcattatttcttctagcaatgttgttgcagcagacgcatgt 942
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600  tgtgtggagcctcagttaggcattatttcttctagcaatgttgttgcagcagacgcatgt 659

                                                                        
Query: 943  acatctgcaagagttatgcagggaacttctgaaggacgtgtatctgttcctcttggtgga 1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660  acatctgcaagagttatgcagggaacttctgaaggacgtgtatctgttcctcttggtgga 719

                                                       
Query: 1003 agtatgtcaaactgttttgacaagcaatgcgatgatgatgtta 1045
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720  agtatgtcaaactgttttgacaagcaatgcgatgatgatgtta 762


>gnl|LJGI|TC76445 
          Length = 679

 Score =  248 bits (125), Expect = 6e-65
 Identities = 125/125 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1014 ctgttttgacaagcaatgcgatgatgatgttaataaagaaaagaaatcttgcttatctga 1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    ctgttttgacaagcaatgcgatgatgatgttaataaagaaaagaaatcttgcttatctga 60

                                                                        
Query: 1074 gaaggctaagagtgaagttgaaatgttccaaaacgactctatgggtatgtccaaattcca 1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   gaaggctaagagtgaagttgaaatgttccaaaacgactctatgggtatgtccaaattcca 120

                 
Query: 1134 gtagc 1138
            |||||
Sbjct: 121  gtagc 125