Miyakogusa Predicted Gene

Lj0g3v0169769.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj0g3v0169769.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1J6W9|I1J6W9_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.55164
PE,85.2,0,HAD-like,HAD-like domain; Pyr-5-nucltdase: pyrimidine
5'-nucleotidase,Pyrimidine 5-nucleotidase; HAD,CUFF.10948.1
         (918 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC78159                                                     1820   0.0  
gnl|LJGI|BP077389                                                     452   e-126
gnl|LJGI|GO024680                                                     381   e-105
gnl|LJGI|BP080739                                                     323   1e-87
gnl|LJGI|TC58341                                                       64   2e-09

>gnl|LJGI|TC78159 
          Length = 1187

 Score = 1820 bits (918), Expect = 0.0
 Identities = 918/918 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atggagtacgagtatgagaaccgcttcagacaacaggctgagagatcaaaatatgattgc 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 119  atggagtacgagtatgagaaccgcttcagacaacaggctgagagatcaaaatatgattgc 178

                                                                        
Query: 61   cttctctttgatttggatgatactttgtatcccctcagatctggtcttgcaaacggagtt 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 179  cttctctttgatttggatgatactttgtatcccctcagatctggtcttgcaaacggagtt 238

                                                                        
Query: 121  ctccataacatcaaaggttacatggtggagaagcttggcatagaaccaagcaaaattgat 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 239  ctccataacatcaaaggttacatggtggagaagcttggcatagaaccaagcaaaattgat 298

                                                                        
Query: 181  gacttgtgcaacctgctttacaagaattatggaactaccatggctggaatgagggcaatt 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299  gacttgtgcaacctgctttacaagaattatggaactaccatggctggaatgagggcaatt 358

                                                                        
Query: 241  gggtatgactttgactatgatgaatatcacagttatgttcatgggagattaccttatgag 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359  gggtatgactttgactatgatgaatatcacagttatgttcatgggagattaccttatgag 418

                                                                        
Query: 301  aacttgaaacctgatccagttctgaggaacctgttgctgagcctgccctataggaaactt 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 419  aacttgaaacctgatccagttctgaggaacctgttgctgagcctgccctataggaaactt 478

                                                                        
Query: 361  atcttcacaaatggagacaaagttcatgctgttaaggtacttagcaggcttggattagag 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 479  atcttcacaaatggagacaaagttcatgctgttaaggtacttagcaggcttggattagag 538

                                                                        
Query: 421  gactgctttgaaggaatcatctgctttgagacactgaatccaatccacaagagcagtgtt 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539  gactgctttgaaggaatcatctgctttgagacactgaatccaatccacaagagcagtgtt 598

                                                                        
Query: 481  tctgatgatgaagatgacattgagttttttggttcaaggagcactaatccaactactact 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599  tctgatgatgaagatgacattgagttttttggttcaaggagcactaatccaactactact 658

                                                                        
Query: 541  acaagcagctctgaaatctttgacatcatagggcattttgctcagcctaaccccactgct 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659  acaagcagctctgaaatctttgacatcatagggcattttgctcagcctaaccccactgct 718

                                                                        
Query: 601  gtgttgccaaagacaccaattatctgcaaaccacaagaacatgccattgaattggctctc 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719  gtgttgccaaagacaccaattatctgcaaaccacaagaacatgccattgaattggctctc 778

                                                                        
Query: 661  aagatagccaaccttaacccacaaagaactttgttctttgaggacagtgtccgcaacata 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779  aagatagccaaccttaacccacaaagaactttgttctttgaggacagtgtccgcaacata 838

                                                                        
Query: 721  caagctgggaaacgtgtgggtcttcacacagtgctggttggcacatcacagagagtgaaa 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839  caagctgggaaacgtgtgggtcttcacacagtgctggttggcacatcacagagagtgaaa 898

                                                                        
Query: 781  ggtgctgattatgcattggaaagcattcacaaccttagggaagcagtgcctgaactgtgg 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 899  ggtgctgattatgcattggaaagcattcacaaccttagggaagcagtgcctgaactgtgg 958

                                                                        
Query: 841  gaagatcatgacattaaaaaatctgaagttgcataccctgctgggaagatagctgtggaa 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959  gaagatcatgacattaaaaaatctgaagttgcataccctgctgggaagatagctgtggaa 1018

                              
Query: 901  acaccagtcacagcttga 918
            ||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 acaccagtcacagcttga 1036


>gnl|LJGI|BP077389 
          Length = 407

 Score =  452 bits (228), Expect = e-126
 Identities = 228/228 (100%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 691 ttgttctttgaggacagtgtccgcaacatacaagctgggaaacgtgtgggtcttcacaca 750
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 258 ttgttctttgaggacagtgtccgcaacatacaagctgggaaacgtgtgggtcttcacaca 199

                                                                       
Query: 751 gtgctggttggcacatcacagagagtgaaaggtgctgattatgcattggaaagcattcac 810
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 198 gtgctggttggcacatcacagagagtgaaaggtgctgattatgcattggaaagcattcac 139

                                                                       
Query: 811 aaccttagggaagcagtgcctgaactgtgggaagatcatgacattaaaaaatctgaagtt 870
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 138 aaccttagggaagcagtgcctgaactgtgggaagatcatgacattaaaaaatctgaagtt 79

                                                           
Query: 871 gcataccctgctgggaagatagctgtggaaacaccagtcacagcttga 918
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78  gcataccctgctgggaagatagctgtggaaacaccagtcacagcttga 31


>gnl|LJGI|GO024680 
          Length = 607

 Score =  381 bits (192), Expect = e-105
 Identities = 333/380 (87%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 10  gagtatgagaaccgcttcagacaacaggctgagagatcaaaatatgattgccttctcttt 69
           ||||||||  || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 227 gagtatgatgactgcttcaaacaacaggctaagagaacaaaatatgattgccttcttttt 286

                                                                       
Query: 70  gatttggatgatactttgtatcccctcagatctggtcttgcaaacggagttctccataac 129
           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  || ||| || 
Sbjct: 287 gatttagatgatactttgtatcccctcagttctggtcttgcaaaagcatgtcaccaaaat 346

                                                                       
Query: 130 atcaaaggttacatggtggagaagcttggcatagaaccaagcaaaattgatgacttgtgc 189
           || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||  |
Sbjct: 347 attaaagattacatggtggagaagcttggcatagaaccaaagaaaactgatgaattgacc 406

                                                                       
Query: 190 aacctgctttacaagaattatggaactaccatggctggaatgagggcaattgggtatgac 249
           ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||||||
Sbjct: 407 aacctcctttacaataactatggaactactattgctggcctaagggcaattggatatgac 466

                                                                       
Query: 250 tttgactatgatgaatatcacagttatgttcatgggagattaccttatgagaacttgaaa 309
           ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 467 tttgactatgatgaatatcacagttttattcatgggaaattaccttatgagaatttgaaa 526

                                                                       
Query: 310 cctgatccagttctgaggaacctgttgctgagcctgccctataggaaacttatcttcaca 369
           || || |  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 527 ccagacctggttctgaggaacttgttgctaagcctcccctataggaaacatatcttcaca 586

                               
Query: 370 aatggagacaaagttcatgc 389
           |||| ||||||||| |||||
Sbjct: 587 aatgcagacaaagtccatgc 606


>gnl|LJGI|BP080739 
          Length = 359

 Score =  323 bits (163), Expect = 1e-87
 Identities = 163/163 (100%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 756 ggttggcacatcacagagagtgaaaggtgctgattatgcattggaaagcattcacaacct 815
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 ggttggcacatcacagagagtgaaaggtgctgattatgcattggaaagcattcacaacct 134

                                                                       
Query: 816 tagggaagcagtgcctgaactgtgggaagatcatgacattaaaaaatctgaagttgcata 875
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 tagggaagcagtgcctgaactgtgggaagatcatgacattaaaaaatctgaagttgcata 74

                                                      
Query: 876 ccctgctgggaagatagctgtggaaacaccagtcacagcttga 918
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73  ccctgctgggaagatagctgtggaaacaccagtcacagcttga 31



 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11
 Identities = 35/35 (100%)
 Strand = Plus / Minus

                                              
Query: 724 gctgggaaacgtgtgggtcttcacacagtgctggt 758
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 gctgggaaacgtgtgggtcttcacacagtgctggt 325


>gnl|LJGI|TC58341 
          Length = 1169

 Score = 63.9 bits (32), Expect = 2e-09
 Identities = 50/56 (89%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                   
Query: 232 agggcaattgggtatgactttgactatgatgaatatcacagttatgttcatgggag 287
           ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||
Sbjct: 308 agggcaattggttatgacattgactatgatgactttcatagttctgttcatgggag 363