Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0153869.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0153869.1 CUFF.9551.1
(1668 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC67721 similar to UniRef100_A7PZP8 Cluster: Chromosome... 1966 0.0
>gnl|LJGI|TC67721 similar to UniRef100_A7PZP8 Cluster: Chromosome chr15 scaffold_40,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr15 scaffold_40, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (37%)
Length = 1488
Score = 1966 bits (992), Expect = 0.0
Identities = 1001/1004 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 488 ctgataggttgaagaacgatttgcatgaaagggatgaaggtgagcttgagcggactggac 547
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 1 ctgataggttgaagaacgatttgcatgaaagggatgaaggtgagcttgagcggagtggac 60
Query: 548 aaccactatgcatttatgaaccgtacattggggaaggatcttggccttttcttcatcata 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaccactatgcatttatgaaccgtacattggggaaggatcttggccttttcttcatcata 120
Query: 608 agcctctttatcgtggagtttccctatccagtaaaggtcgaaggccagggagagatgatt 667
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agccgctttatcgtggagtttccctatccagtaaaggtcgaaggccagggagagatgatt 180
Query: 668 tcgatgcaccttctcgtcttccactgcttaacagtgcttactatcgggacatacttggtg 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcgatgcaccttctcgtcttccactgcttaacagtgcttactatcgggacatacttggtg 240
Query: 728 aatatggagctttctttgccatcgcgaacagggttgatcgtttacacaaaaatgcttgga 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aatatggagctttctttgccatcgcgaacagggttgatcgtttacacaaaaatgcttgga 300
Query: 788 ttggatttcagtcttggagagcaacagcacaaaaggcgtctttgtccagaactgctgaaa 847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttggatttcagtcttggagagcaacagcacaaaaggcgtctttgtccagaactgctgaaa 360
Query: 848 atgcattattagatgccatccaaaccaaaaggcatggagatgcactatatttctgggtgc 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 atgcattattagatgccatccaaaccaaaaggcatggagatgcactatatttctgggtgc 420
Query: 908 gcatggatatggatcagcgaaacccttcgcagatgaacttttggtcattttgcgatgcca 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gcatggatatggatcagcgaaacccttcgcagatgaacttttggtcattttgcgatgcca 480
Query: 968 taaacgcaggaggttgccagtttgctttctccgaagcgatgaagaaaatgtatggattga 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 taaacgcaggaggttgccagtttgctttctccgaagcgatgaagaaaatgtatggattga 540
Query: 1028 aaaatgatacggtttcttttccgcccatgcctatagatggagacacttggtctgtcatgc 1087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aaaatgatacggtttcttttccgcccatgcctatagatggagacacttggtctgtcatgc 600
Query: 1088 tgagctgggctcttcctacaagatctttcttagagtttgtgatgttttccagaatgtttg 1147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 tgagctgggctcttcctacaagatctttcttagagtttgtgatgttttccagaatgtttg 660
Query: 1148 tagatgcattggatgcgcagatgtacaatgaacaccattcaactggacggtgccctttga 1207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tagatgcattggatgcgcagatgtacaatgaacaccattcaactggacggtgccctttga 720
Query: 1208 gtttgtcaacggataagcattgctattcgcgggttctcgagcttcttgtaaatgtatggg 1267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gtttgtcaacggataagcattgctattcgcgggttctcgagcttcttgtaaatgtatggg 780
Query: 1268 cgtaccacagcgcaaggagaatggtgtttgtgaacccggaaaccggtctaatgcaggaac 1327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 tgtaccacagcgcaaggagaatggtgtttgtgaacccggaaaccggtctaatgcaggaac 840
Query: 1328 aacacaagttcaagagccgtagaggtcaaatgtggatccaatggttctcatacaacacac 1387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 aacacaagttcaagagccgtagaggtcaaatgtggatccaatggttctcatacaacacac 900
Query: 1388 ttaagagcatggatgaggacttggcagagctatcagattcagaagatcctaacaggcatt 1447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ttaagagcatggatgaggacttggcagagctatcagattcagaagatcctaacaggcatt 960
Query: 1448 ggttgtggccatcaaccggtgaagtcttctggcaaggtttgtat 1491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 ggttgtggccatcaaccggtgaagtcttctggcaaggtttgtat 1004
Score = 218 bits (110), Expect = 9e-56
Identities = 110/110 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1559 atagaatgaggaaacgtcatcgccagcaagttatagggaaatatgttaagccccctccag 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1072 atagaatgaggaaacgtcatcgccagcaagttatagggaaatatgttaagccccctccag 1131
Query: 1619 aagaggaaagctctaactcatcttcacttgcagtaaatgcatcatgacga 1668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1132 aagaggaaagctctaactcatcttcacttgcagtaaatgcatcatgacga 1181