Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0141609.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0141609.1 tr|I3STF0|I3STF0_LOTJA Proteasome subunit beta
type OS=Lotus japonicus PE=2 SV=1,98.16,0,Proteasome,Proteasome,
subunit alpha/beta; PROTEASOME SUBUNIT BETA TYPE 7,10,NULL; PROTEASOME
SUBUNI,CUFF.8707.1
(819 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC58228 homologue to UniRef100_A2Q2I3 Cluster: Proteaso... 1624 0.0
gnl|LJGI|TC61100 homologue to UniRef100_A2Q2I3 Cluster: Proteaso... 1243 0.0
gnl|LJGI|TC63843 homologue to UniRef100_A2Q2I3 Cluster: Proteaso... 1172 0.0
>gnl|LJGI|TC58228 homologue to UniRef100_A2Q2I3 Cluster: Proteasome subunit beta
type; n=1; Medicago truncatula|Rep: Proteasome subunit
beta type - Medicago truncatula (Barrel medic), partial
(98%)
Length = 1004
Score = 1624 bits (819), Expect = 0.0
Identities = 819/819 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtctaagactgtggatcttcctcctaagggtggcttcagttttgataactgcagaaga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 atgtctaagactgtggatcttcctcctaagggtggcttcagttttgataactgcagaaga 121
Query: 61 aatgcgatgcttcaaaagaatggccttaagggaccgtcgtttttgaagactgggacgact 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 aatgcgatgcttcaaaagaatggccttaagggaccgtcgtttttgaagactgggacgact 181
Query: 121 attgttggtttagtatttcaggatggtgtaattctaggagcagatactagagcaactgaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 attgttggtttagtatttcaggatggtgtaattctaggagcagatactagagcaactgaa 241
Query: 181 ggacccatagttgctgataaaaactgtgagaaaattcactatatggcacccaacatatat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 ggacccatagttgctgataaaaactgtgagaaaattcactatatggcacccaacatatat 301
Query: 241 tgttgtggtgcaggaactgctgctgatacagaggctgtaacagatatggttagctcacaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tgttgtggtgcaggaactgctgctgatacagaggctgtaacagatatggttagctcacaa 361
Query: 301 ctgcaacttcatcgctaccatactggtcgagaatcaagagttgttacagcactgaccctt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 ctgcaacttcatcgctaccatactggtcgagaatcaagagttgttacagcactgaccctt 421
Query: 361 cttaagagacacctcttcaactaccaaggtcatgtctcagctgccttagttcttggtgga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 cttaagagacacctcttcaactaccaaggtcatgtctcagctgccttagttcttggtgga 481
Query: 421 gttgatattactggccctcatttgcatactatttatccacatggttcaactgacactctc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 gttgatattactggccctcatttgcatactatttatccacatggttcaactgacactctc 541
Query: 481 ccgtttgccaccatgggttccggttcacttgctgcaatgtctgtatttgagtctaaatac 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 ccgtttgccaccatgggttccggttcacttgctgcaatgtctgtatttgagtctaaatac 601
Query: 541 aaggaaagcttgactagggatgaaggagtaaaaatagttgtcgaggcaatatgtgctggt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 aaggaaagcttgactagggatgaaggagtaaaaatagttgtcgaggcaatatgtgctggt 661
Query: 601 gtgtttaatgacttgggaagtggaagtaatgttgatgtttgtgtgataacgaagggacat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 gtgtttaatgacttgggaagtggaagtaatgttgatgtttgtgtgataacgaagggacat 721
Query: 661 aaggaatatctcaggaatcacctcacgccaaatcctcgtacatatgtcaatccaaaaggc 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 aaggaatatctcaggaatcacctcacgccaaatcctcgtacatatgtcaatccaaaaggc 781
Query: 721 tttactttcagcaaaaagactgaggttctcttaacaaagattaccccgttgaaggagaag 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 tttactttcagcaaaaagactgaggttctcttaacaaagattaccccgttgaaggagaag 841
Query: 781 gtggaagtgattgaaggaggagatgccatggaagagtag 819
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 gtggaagtgattgaaggaggagatgccatggaagagtag 880
>gnl|LJGI|TC61100 homologue to UniRef100_A2Q2I3 Cluster: Proteasome subunit beta
type; n=1; Medicago truncatula|Rep: Proteasome subunit
beta type - Medicago truncatula (Barrel medic), partial
(77%)
Length = 762
Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0
Identities = 646/650 (99%), Gaps = 3/650 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtctaagactgtggatcttcctcctaagggtggcttcagttttgataactgcagaaga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 116 atgtctaagactgtggatcttcctcctaagggtggcttcagttttgataactgcagaaga 175
Query: 61 aatgcgatgcttcaaaagaatggccttaagggaccgtcgtttttgaagactgggacgact 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 176 aatgcgatgcttcaaaagaatggccttaagggaccgtcgtttttgaagactgggacgact 235
Query: 121 attgttggtttagtatttcaggatggtgtaattctaggagcagatactagagcaactgaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 236 attgttggtttagtatttcaggatggtgtaattctaggagcagatactagagcaactgaa 295
Query: 181 ggacccatagttgctgataaaaactgtgagaaaattcactatatggcacccaacatatat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 296 ggacccatagttgctgataaaaactgtgagaaaattcactatatggcacccaacatatat 355
Query: 241 tgttgtggtgcaggaactgctgctgatacagaggctgtaacagatatggttagctcacaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 356 tgttgtggtgcaggaactgctgctgatacagaggctgtaacagatatggttagctcacaa 415
Query: 301 ctgcaacttcatcgctaccatactggtcgagaatcaagagttgttacagcactgaccctt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 416 ctgcaacttcatcgctaccatactggtcgagaatcaagagttgttacagcactgaccctt 475
Query: 361 cttaagagacacctcttcaactaccaaggtcatgtctcagctgccttagttcttggtgga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 476 cttaagagacacctcttcaactaccaaggtcatgtctcagctgccttagttcttggtgga 535
Query: 421 gttgatattactggccctcatttgcatactatttatccacatggttcaactgacactctc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 536 gttgatattactggccctcatttgcatactatttatccacatggttcaactgacactctc 595
Query: 481 ccgtttgccaccatgggttccggttcacttgctgcaatgtctgtatttgagtctaaatac 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 596 ccgtttgccaccatgggttccggttcacttgctgcaatgtctgtatttgagtctaaatac 655
Query: 541 aaggaaagcttgactagggatgaaggagtaaaaatagttgtcgaggcaatatgtgctggt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 656 aaggaaagcttgactagggatgaaggagtaaaaatagttgtcgag--catatgtgctggt 713
Query: 601 gtgtttaatgacttgggaagtggaagtaatgttgatgtttgtgtgataac 650
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 714 gtgttt-atgacttgggaagtggaagtaatgttgatgtttgtgtgataac 762
>gnl|LJGI|TC63843 homologue to UniRef100_A2Q2I3 Cluster: Proteasome subunit beta
type; n=1; Medicago truncatula|Rep: Proteasome subunit
beta type - Medicago truncatula (Barrel medic), partial
(98%)
Length = 1279
Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0
Identities = 759/815 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 ctaagactgtggatcttcctcctaagggtggcttcagttttgataactgcagaagaaatg 64
||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 100 ctaagacggtggatcttcctcccaagggcggcttcagttttgatctctgcagaagaaatg 159
Query: 65 cgatgcttcaaaagaatggccttaagggaccgtcgtttttgaagactgggacgactattg 124
| |||||| || |||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 160 caatgcttgaacagaagggccttaagggcccatcctttctgaagactgggacgactattg 219
Query: 125 ttggtttagtatttcaggatggtgtaattctaggagcagatactagagcaactgaaggac 184
|||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct: 220 ttggtttagttttccaagatggtgtcattctaggagcagatactagggcaacttcaggat 279
Query: 185 ccatagttgctgataaaaactgtgagaaaattcactatatggcacccaacatatattgtt 244
||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 280 ccacagttgctgataaaaactgtgagaaaattcattatatggcacccaacatatattgct 339
Query: 245 gtggtgcaggaactgctgctgatacagaggctgtaacagatatggttagctcacaactgc 304
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
Sbjct: 340 gtggagcaggaactgctgctgacacagaggctgtaacagacatggttagctcccaactcc 399
Query: 305 aacttcatcgctaccatactggtcgagaatcaagagttgttacagcactgacccttctta 364
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 400 aactacatcgctaccatactggtcgagaatcgagaattgttacagcactaacccttctta 459
Query: 365 agagacacctcttcaactaccaaggtcatgtctcagctgccttagttcttggtggagttg 424
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 460 agagacacctcttcaattaccaaggtcaggtctcggctgccttagttcttggtggagttg 519
Query: 425 atattactggccctcatttgcatactatttatccacatggttcaactgacactctcccgt 484
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct: 520 atgcaactggccctcatttgcatactatttatccacatggttcaactgacacactcccat 579
Query: 485 ttgccaccatgggttccggttcacttgctgcaatgtctgtatttgagtctaaatacaagg 544
|||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 580 ttgctaccatgggatcaggttcacttgctgcaatgtctgtatttgagtctaaatacaagg 639
Query: 545 aaagcttgactagggatgaaggagtaaaaatagttgtcgaggcaatatgtgctggtgtgt 604
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct: 640 aaagcttgactagggatgaaggaataaaaatagttgttgaggcaatatgtgctggtgttt 699
Query: 605 ttaatgacttgggaagtggaagtaatgttgatgtttgtgtgataacgaagggacataagg 664
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct: 700 ttaatgacttgggaagtggaagtaatgttgatgtttgtgtcataaccaagggacataagg 759
Query: 665 aatatctcaggaatcacctcacgccaaatcctcgtacatatgtcaatccaaaaggcttta 724
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 760 aatatctcaggaattacctcacaccaaatcctcgcacatatgtcaatccaaaaggcttta 819
Query: 725 ctttcagcaaaaagactgaggttctcttaacaaagattaccccgttgaaggagaaggtgg 784
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 820 ctttttccaaaaagactgaggttctcttaacaaagattacccccttgaaggagaaggtgg 879
Query: 785 aagtgattgaaggaggagatgccatggaagagtag 819
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 880 aagtgattgaaggaggagatgccatggaagagtag 914