Miyakogusa Predicted Gene

Lj0g3v0139249.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj0g3v0139249.1 tr|I1MZ35|I1MZ35_SOYBN Arginyl-tRNA--protein
transferase 1 OS=Glycine max PE=3
SV=1,76.98,0,ATE_C,Arginine-tRNA-protein transferase, C-terminal;
seg,NULL; SUBFAMILY NOT NAMED,NULL; ARGININE-TR,CUFF.8469.1
         (1668 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC57693 similar to UniRef100_A7Q3F3 Cluster: Chromosome...  3259   0.0  

>gnl|LJGI|TC57693 similar to UniRef100_A7Q3F3 Cluster: Chromosome chr13 scaffold_48,
            whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
            Chromosome chr13 scaffold_48, whole genome shotgun
            sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (65%)
          Length = 2376

 Score = 3259 bits (1644), Expect = 0.0
 Identities = 1660/1668 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atggaaaggacatgttgcccatcttatacaattcgcttgaaagcaagtgattttattcct 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 343  atggaaaggacatgttgcccatcttatacaattcgcttgaaagcaagtgattttattcct 402

                                                                        
Query: 61   tctaaggagcaacttcgtgtgtctagacgaatgcaaaggtttttagatggaacattggat 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 403  tctaaggagcaacttcgtgtgtctagacgaatgcaaaggtttttagatggaacattggat 462

                                                                        
Query: 121  gttaaaagagctgatctcatggaggactctagtacttcaaagaagtcagaaagctctgtc 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 463  gttaaaagagctgatctcatggaggactctagtacttcaaagaagtcagaaagctctgtc 522

                                                                        
Query: 181  catcataacttctcaagacccatgtcagaagaatctcctggcaaccaaaaggtcaatgag 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 523  catcataacttctcaagacccatgtcagaagaatctcctggcaaccaaaaggtcaatgag 582

                                                                        
Query: 241  gttgaaaaatcattggagcatttatcagatcaaattgataatgtagtacacatgttcaat 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 583  gttgaaaaatcattggagcatttatcagatcaaattgataatgtagtacacatgttcaat 642

                                                                        
Query: 301  gaaaaaggggaatttccctctggtactaatttgccaaaagcttcagtcagaaaggtttca 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 643  gaaaaaggggaatttccctctggtactaatttgccaaaagcttcagtcagaaaggtttca 702

                                                                        
Query: 361  cagggtnnnnnnnngttactggtcaatggatcagaagatctcttatatagtagcaatata 420
            ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 703  cagggtaaaaaaaagttactggtcaatggatcagaagatctcttatatagtagcaatata 762

                                                                        
Query: 421  gcctttcaattagcagcatccataaacagagcacgagcaagtgacaaggatggaaatgat 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 763  gcctttcaattagcagcatccataaacagagcacgagcaagtgacaaggatggaaatgat 822

                                                                        
Query: 481  tccaagccatccagagatcgtgaaaaggacaatgcatcgtctcataaagttattgcagaa 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 823  tccaagccatccagagatcgtgaaaaggacaatgcatcgtctcataaagttattgcagaa 882

                                                                        
Query: 541  aagctggtagcatctttaattccattcttagaagattctggtctgtctatcagggcttgc 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 883  aagctggtagcatctttaattccattcttagaagattctggtctgtctatcagggcttgc 942

                                                                        
Query: 601  aatggacatgtcaatttttatgcttcaagtaaaaacgtttccctgaatggaagtgtccaa 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 943  aatggacatgtcaatttttatgcttcaagtaaaaacgtttccctgaatggaagtgtccaa 1002

                                                                        
Query: 661  aatgctgcagttcctatgaagtctggaatgaagcgtgatattggaggaaattgtttggtt 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1003 aatgctgcagttcctatgaagtctggaatgaagcgtgatattggaggaaattgtttggtt 1062

                                                                        
Query: 721  agtcctgaaaattgtcaggtaaaacggcgaaagtttgagatacgtttgaacaggtctagt 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1063 agtcctgaaaattgtcaggtaaaacggcgaaagtttgagatacgtttgaacaggtctagt 1122

                                                                        
Query: 781  tttgatccaaaagaatttgctttgtatgtaagatatcagcgacaagtacataatgataaa 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1123 tttgatccaaaagaatttgctttgtatgtaagatatcagcgacaagtacataatgataaa 1182

                                                                        
Query: 841  ccacaaaatctcacagagacctcgtatcggaggtttctggttgatactccattattgtat 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1183 ccacaaaatctcacagagacctcgtatcggaggtttctggttgatactccattattgtat 1242

                                                                        
Query: 901  actcctcctactggcgatagcacaacgcctccttgtggctttggctctttccatcaacag 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1243 actcctcctactggcgatagcacaacgcctccttgtggctttggctctttccatcaacag 1302

                                                                        
Query: 961  tatctaatagacggtcagttagtggccgttggtgttatagatatccttcccaactgtttg 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1303 tatctaatagacggtcagttagtggccgttggtgttatagatatccttcccaactgtttg 1362

                                                                        
Query: 1021 tccagtaaatatttgttttgggatccagactttgcctttctatcactaggcaagtactca 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1363 tccagtaaatatttgttttgggatccagactttgcctttctatcactaggcaagtactca 1422

                                                                        
Query: 1081 gcacttcaagaaataggttgggtgaaagataaccaggagtattgtcctagtctccagtac 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1423 gcacttcaagaaataggttgggtgaaagataaccaggagtattgtcctagtctccagtac 1482

                                                                        
Query: 1141 tattatctgggctactatattcactcttgcaacaagatgagatacaaagctgcatatcgc 1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1483 tattatctgggctactatattcactcttgcaacaagatgagatacaaagctgcatatcgc 1542

                                                                        
Query: 1201 ccatcagaacttttatgtcctcttcgatatcagtggattccatttgacattgcaaggcct 1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1543 ccatcagaacttttatgtcctcttcgatatcagtggattccatttgacattgcaaggcct 1602

                                                                        
Query: 1261 ttgcttgaccgaatgccttatgctgtcttgtcagattattccgttttacaaaatggagac 1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1603 ttgcttgaccgaatgccttatgctgtcttgtcagattattccgttttacaaaatggagac 1662

                                                                        
Query: 1321 ttgtccctacctcaagttactgaagatgtcatgggaaggcagcttgatgatgttggtcaa 1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1663 ttgtccctacctcaagttactgaagatgtcatgggaaggcagcttgatgatgttggtcaa 1722

                                                                        
Query: 1381 gaagatgcaaatgatgttccaatgtatgaagatgaagagatggatgaatctgaagtggaa 1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1723 gaagatgcaaatgatgttccaatgtatgaagatgaagagatggatgaatctgaagtggaa 1782

                                                                        
Query: 1441 agctctgatgatgaacctgacctagaaaatacatcatctgttgaaccggaaaatgttgat 1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1783 agctctgatgatgaacctgacctagaaaatacatcatctgttgaaccggaaaatgttgat 1842

                                                                        
Query: 1501 gtcagcaaagtcttgctagggataaagggatctcgtgcgagatacaaggatctgcgcagt 1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1843 gtcagcaaagtcttgctagggataaagggatctcgtgcgagatacaaggatctgcgcagt 1902

                                                                        
Query: 1561 gtcttcggtgctgagcagcagagatacttggaatcccagttgcagaaatataggagggtt 1620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1903 gtcttcggtgctgagcagcagagatacttggaatcccagttgcagaaatataggagggtt 1962

                                                            
Query: 1621 gtgggaacagtgttatctgagcgaatggtgtattctcttggttaattt 1668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1963 gtgggaacagtgttatctgagcgaatggtgtattctcttggttaattt 2010