Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0130969.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0130969.1 tr|G7J081|G7J081_MEDTR D-3-phosphoglycerate
dehydrogenase OS=Medicago truncatula GN=MTR_3g005970
PE=,79.15,0,NAD(P)-binding Rossmann-fold domains,NULL;
Formate/glycerate dehydrogenase catalytic domain-like,NUL,CUFF.7950.1
(1161 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC63670 similar to UniRef100_A7PQ72 Cluster: Chromosome... 2262 0.0
gnl|LJGI|TC70559 similar to UniRef100_A7PQ72 Cluster: Chromosome... 854 0.0
>gnl|LJGI|TC63670 similar to UniRef100_A7PQ72 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_24,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_24, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (82%)
Length = 1389
Score = 2262 bits (1141), Expect = 0.0
Identities = 1156/1161 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgttgaggagaggccttttcgattggacgaaatatttcgatcttttcggcagaacgatc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 59 atgttgaggagaggccttttcgattggacgaaatatttcgatcttttcggcagaacgatc 118
Query: 61 actgccttctccacaaccaaagtagcagcaacgttttcgataagagcagcagctacagca 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 119 actgccttctccacaaccaaagtagcagcaacattttcgataagagcagcagctacagca 178
Query: 121 actagtagtagaagtagcagggctgatctcatggagagacacaatcggaatgttgataaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 179 actagtagtagaagtagcagggctgatctcatggagagacacaatcggaatgttgataaa 238
Query: 181 caaatcactcgtgtcttattttgtggaccactattcccagcttcgcatgaatgtacaata 240
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct: 239 caaatcactcgtgtcttgttttgtggaccactattcccagcttcccatgaatatacaata 298
Query: 241 gagtatctggagaaacattcatttatcaaggtggatgttctccctttggaagatgtgcca 300
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 gagtatctgcagaaacattcatttatcaaggtggatgttctccctttggaagatgtgcca 358
Query: 301 aaggaaattgcaaactatcatgtttgcatagtaaaaagcatgaagctagattcaaacata 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 aaggaaattgcaaactatcatgtttgcatagtaaaaagcatgaagctagattcaaacata 418
Query: 361 atttctcgtgcagttcagatgcagcttataatgcagtatggtgttggactggaaggtgtt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 419 atttctcgtgcagttcagatgcagcttataatgcagtatggtgttggactggaaggtgtt 478
Query: 421 gatattgatgctgcaacaaagcatggaatcaaagttggtaggatcccaagtggtgttact 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 479 gatattgatgctgcaacaaagcatggaatcaaagttggtaggatcccaagtggtgttact 538
Query: 481 ggaaattcagcttcatgtgctgagatggccatatatctaatgttgggtctacttcgtagg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539 ggaaattcagcttcatgtgctgagatggccatatatctaatgttgggtctacttcgtagg 598
Query: 541 caaaatgaactgcagatttccatacagcagaagaaggttggagagccaattactgatact 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 caaaatgaactgcagatttccatacagcagaagaaggttggagagccaattactgatact 658
Query: 601 ttattggggaaaactatattcattttgggttttgggaacattgggatggatttagcaaag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 ttattggggaaaactatattcattttgggttttgggaacattgggatggatttagcaaag 718
Query: 661 agattacaaccatttggcgtaaaagtgatagctacaaagcggagctggacttcatatgca 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719 agattacaaccatttggcgtaaaagtgatagctacaaagcggagctggacttcatatgca 778
Query: 721 cagaactctaatgatgtagacgatcttgttgatgtgaagggtagtcatgaagatatatac 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 cagaactctaatgatgtagacgatcttgttgatgtgaagggtagtcatgaagatatatac 838
Query: 781 gactttgccaggaaagctgacattgttgtttgctgcctaacattaaacaaacaaacggct 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 gactttgccaggaaagctgacattgttgtttgctgcctaacattaaacaaacaaacggct 898
Query: 841 ggtattatagatgacaagttcatatcttcaatgaaaaagggtgcccttctggtgaatgtt 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 899 ggtattatagatgacaagttcatatcttcaatgaaaaagggtgcccttctggtgaatgtt 958
Query: 901 gctagaggcggtcttgtggactatggggcagtcgtcaaccacctcaaatcaggccactta 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 gctagaggcggtcttgtggactatggggcagtcgtcaaccacctcaaatcaggccactta 1018
Query: 961 ggagggttaggcactgatgtagcatggactgagccatttgaccctgatgatcagatattg 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 ggagggttaggcactgatgtagcatggactgagccatttgaccctgatgatcagatattg 1078
Query: 1021 aaatttaagaatgttatcctgacccctcatgttgcaggcgttacggaacattcttacaga 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 aaatttaagaatgttatcctgacccctcatgttgcaggcgttacggaacattcttacaga 1138
Query: 1081 tccatggctaaggttgttggggatgtcgttcttcaacttcatgccgggcttcctttgaca 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 tccatggctaaggttgttggggatgtcgttcttcaacttcatgccgggcttcctttgaca 1198
Query: 1141 ggaatcgagttagttaattaa 1161
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 1199 ggaatcgagttagttaattaa 1219
>gnl|LJGI|TC70559 similar to UniRef100_A7PQ72 Cluster: Chromosome chr18 scaffold_24,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr18 scaffold_24, whole genome shotgun
sequence - Vitis vinifera (Grape), partial (36%)
Length = 734
Score = 854 bits (431), Expect = 0.0
Identities = 431/431 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 731 atgatgtagacgatcttgttgatgtgaagggtagtcatgaagatatatacgactttgcca 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 104 atgatgtagacgatcttgttgatgtgaagggtagtcatgaagatatatacgactttgcca 163
Query: 791 ggaaagctgacattgttgtttgctgcctaacattaaacaaacaaacggctggtattatag 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 164 ggaaagctgacattgttgtttgctgcctaacattaaacaaacaaacggctggtattatag 223
Query: 851 atgacaagttcatatcttcaatgaaaaagggtgcccttctggtgaatgttgctagaggcg 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 224 atgacaagttcatatcttcaatgaaaaagggtgcccttctggtgaatgttgctagaggcg 283
Query: 911 gtcttgtggactatggggcagtcgtcaaccacctcaaatcaggccacttaggagggttag 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 284 gtcttgtggactatggggcagtcgtcaaccacctcaaatcaggccacttaggagggttag 343
Query: 971 gcactgatgtagcatggactgagccatttgaccctgatgatcagatattgaaatttaaga 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 344 gcactgatgtagcatggactgagccatttgaccctgatgatcagatattgaaatttaaga 403
Query: 1031 atgttatcctgacccctcatgttgcaggcgttacggaacattcttacagatccatggcta 1090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 404 atgttatcctgacccctcatgttgcaggcgttacggaacattcttacagatccatggcta 463
Query: 1091 aggttgttggggatgtcgttcttcaacttcatgccgggcttcctttgacaggaatcgagt 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 464 aggttgttggggatgtcgttcttcaacttcatgccgggcttcctttgacaggaatcgagt 523
Query: 1151 tagttaattaa 1161
|||||||||||
Sbjct: 524 tagttaattaa 534