Miyakogusa Predicted Gene

Lj0g3v0106439.2
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj0g3v0106439.2 Non Chatacterized Hit- tr|I1MML9|I1MML9_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.37394 PE,84.9,0,L
domain-like,NULL; seg,NULL; LRRNT_2,Leucine-rich repeat-containing
N-terminal, type 2; SUBFAMILY N,CUFF.6060.2
         (1503 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC77596 similar to UniRef100_Q9MA13 Cluster: F20B17.5; ...  2185   0.0  

>gnl|LJGI|TC77596 similar to UniRef100_Q9MA13 Cluster: F20B17.5; n=1; Arabidopsis
            thaliana|Rep: F20B17.5 - Arabidopsis thaliana (Mouse-ear
            cress), partial (33%)
          Length = 1172

 Score = 2185 bits (1102), Expect = 0.0
 Identities = 1116/1118 (99%), Gaps = 2/1118 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 1    atgacaataatccgtgtgttgctctttctgggacttttgggggctcaaattcatggcata 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54   atgacaataatccgtgtgttgctctttctgggacttt-gggggctcaaattcatggcata 112

                                                                        
Query: 61   tcctcatttactgatcctcaagatgttgttgcacttagatctttaaaagatatatggcaa 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 113  tcctcatttactgatcctcaagatgttgttgcacttagatctttaaaagatatatggcaa 172

                                                                        
Query: 121  aatacaccacctagttgggacaaatcagctgacccttgtggagaacgctgggaaggagtg 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 173  aatacaccacctagttgggacaaatcagctgacccttgtggagaacgctgggaaggagtg 232

                                                                        
Query: 181  acctgcaacaaatccagggttacttcattgggactctcaaccatgggcctgaagggtaaa 240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 233  acctgcaacaaatccagggttacttcattgggactctcaaccatgggcctgaagggtaaa 292

                                                                        
Query: 241  ttgagtggagatattgccggactcactgaattgagatccttggacttatcatttaataag 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 293  ttgagtggagatattgccggactcactgaattgagatccttggacttatcatttaataag 352

                                                                        
Query: 301  gatttgatggggcctctctctcaagaattaggagagctgagcaagctaaatatattgatt 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 353  gatttgatggggcctctctctcaagaattaggagagctgagcaagctaaatatattgatt 412

                                                                        
Query: 361  ttggctggttgcagcttcagtggcagtattccagatgcattggggaaactttcagagcta 420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 413  ttggctggttgcagcttcagtggcagtattccagatgcattggggaaactttcagagcta 472

                                                                        
Query: 421  tctttcctggctttaaattcaaacaacttcactggaaaaatacctccttcattgggtaat 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 473  tctttcctggctttaaattcaaacaacttcactggaaaaatacctccttcattgggtaat 532

                                                                        
Query: 481  ctctccaaactctattggctggacttggctgacaatcagctcacagggtctctaccagtt 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 533  ctctccaaactctattggctggacttggctgacaatcagctcacagggtctctaccagtt 592

                                                                        
Query: 541  tcaacctccaccacccctggattagacctgcttttaaaggctaagcacttccatttcaat 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 593  tcaacctccaccacccctggattagacctgcttttaaaggctaagcacttccatttcaat 652

                                                                        
Query: 601  aagaaccagctttcaggtaccattccccccaaacttttcagctcagagatggtactcata 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 653  aagaaccagctttcaggtaccattccccccaaacttttcagctcagagatggtactcata 712

                                                                        
Query: 661  cacatattatttgatggaaacaatttacaagggagcataccttcgacaataggactagtt 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 713  cacatattatttgatggaaacaatttacaagggagcataccttcgacaataggactagtt 772

                                                                        
Query: 721  cagacagttgaggtcctccggcttgatagaaatttcatgactggagaggtcccttcaaat 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 773  cagacagttgaggtcctccggcttgatagaaatttcatgactggagaggtcccttcaaat 832

                                                                        
Query: 781  ctcaataaccttacaaacatcaatgaactgaatttagcacacaataaattgacaggtccg 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 833  ctcaataaccttacaaacatcaatgaactgaatttagcacacaataaattgacaggtccg 892

                                                                        
Query: 841  ttgccagacttaactacaatggatacactcaactatgtggatcttagtaacaactctttt 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 893  ttgccagacttaactacaatggatacactcaactatgtggatcttagtaacaactctttt 952

                                                                        
Query: 901  gatccatctgaagctccaatttggctctcaactctaccatcactcaccacgcttattatg 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 953  gatccatctgaagctccaatttggctctcaactctaccatcactcaccacgcttattatg 1012

                                                                        
Query: 961  gagtttggatctcttcaaggtcctcttcccacgaaactcttcagccttcctcagatacaa 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1013 gagtttggatctcttcaaggtcctcttcccacgaaactcttcagccttcctcagatacaa 1072

                                                                        
Query: 1021 caagtgaaactgcgaaacaatgcattgaacaacacattggacatgggtgacagcatttgt 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1073 caagtgaaactgcgaaacaatgcattgaacaacacattggacatgggtgacagcatttgt 1132

                                                  
Query: 1081 cctcagttgcagcttgtagatttgcaggctaaccagat 1118
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1133 cctcagttgcagcttgtaga-ttgcaggctaaccagat 1169