Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0101139.2
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0101139.2 tr|G7JIC6|G7JIC6_MEDTR Replication factor A
protein OS=Medicago truncatula GN=MTR_4g028320 PE=4
SV=1,28.19,0.000000000009,Nucleic acid-binding proteins,Nucleic
acid-binding, OB-fold-like; no description,Nucleic
acid-bindin,CUFF.5671.2
(912 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC77623 1792 0.0
>gnl|LJGI|TC77623
Length = 1247
Score = 1792 bits (904), Expect = 0.0
Identities = 907/908 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgaagttccgccctattagagatcatcatcaggagggtaaaatccaagcctctttgggg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 100 atgaagttccgccctattagagatcatcatcaggagggtaaaatccaagcctctttgggg 159
Query: 61 aaagcaatgttccgtaaatgggctgacaaatttgttgagggaaatgtttatgagatattc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 160 aaagcaatgttccgtaaatgggctgacaaatttgttgagggaaatgtttatgagatattc 219
Query: 121 tttttcaatgtaatgcctgcgaagggatcttaccgtgcagctaatcatgcctataggatt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 220 tttttcaatgtaatgcctgcgaagggatcttaccgtgcagctaatcatgcctataggatt 279
Query: 181 ttatttagtggtaagacaaaggttgttccattagagtgtgagagtataccaaggttgggg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 280 ttatttagtggtaagacaaaggttgttccattagagtgtgagagtataccaaggttgggg 339
Query: 241 ttatcgttggtaaccccgttacagctggaaaccattgcagacccttctgatcatttagtt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 340 ttatcgttggtaaccccgttacagctggaaaccattgcagacccttctgatcatttagtt 399
Query: 301 gatgttgttggatttttaactgcggtgtcccctgttagaattgatgtaaaaggatccagc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 400 gatgttgttggatttttaactgcggtgtcccctgttagaattgatgtaaaaggatccagc 459
Query: 361 catgtgaagattatgatgatggagttatatgatgagaatggttcgatgtcatttgttgtt 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 460 catgtgaagattatgatgatggagttatatgatgagaatggctcgatgtcatttgttgtt 519
Query: 421 cttggtgattgtgtaagtgttgtaagtgattatctatcttcacattcaaaggagaaacct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 520 cttggtgattgtgtaagtgttgtaagtgattatctatcttcacattcaaaggagaaacct 579
Query: 481 cttgtggttgtgcagtatgccaagataaagaaatttgaagggaagaatttgttgcatacc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 580 cttgtggttgtgcagtatgccaagataaagaaatttgaagggaagaatttgttgcatacc 639
Query: 541 ttaattcctgtgtctactatacatcttaatcaagaatttgaggaagctaaagcctttagg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 640 ttaattcctgtgtctactatacatcttaatcaagaatttgaggaagctaaagcctttagg 699
Query: 601 aagaggatgaatggacacagtagggaaattgaaggtcatgttggtgatattgatttcttc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 700 aagaggatgaatggacacagtagggaaattgaaggtcatgttggtgatattgatttcttc 759
Query: 661 gattttgcttatccaatgattgatgatgttaaaattgtatatccttctgtggatttgaag 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 760 gattttgcttatccaatgattgatgatgttaaaattgtatatccttctgtggatttgaag 819
Query: 721 tatgtagattttgaagttagtgtgtaccaacgatttaggggagaacctgttattgattat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 820 tatgtagattttgaagttagtgtgtaccaacgatttaggggagaacctgttattgattat 879
Query: 781 gctgatgatggatgttttgcggatatgatgagtgcatgtgatgttgagatgttatatgaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 880 gctgatgatggatgttttgcggatatgatgagtgcatgtgatgttgagatgttatatgaa 939
Query: 841 gaaagcgatatgatggagctatatgaatcctcctcattttttcagagttatatgatgtcc 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 940 gaaagcgatatgatggagctatatgaatcctcctcattttttcagagttatatgatgtcc 999
Query: 901 aagtattt 908
||||||||
Sbjct: 1000 aagtattt 1007