Miyakogusa Predicted Gene

Lj0g3v0101139.1

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj0g3v0101139.1 tr|G7JIC6|G7JIC6_MEDTR Replication factor A
protein OS=Medicago truncatula GN=MTR_4g028320 PE=4
SV=1,29.68,5e-18,Nucleic acid-binding proteins,Nucleic acid-binding,
OB-fold-like; seg,NULL; no description,Nucleic a,CUFF.5671.1
         (1035 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC77623                                                     1727   0.0  

>gnl|LJGI|TC77623 
          Length = 1247

 Score = 1727 bits (871), Expect = 0.0
 Identities = 874/875 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 157  gagggtaaaatccaagcctctttggggaaagcaatgttccgtaaatgggctgacaaattt 216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133  gagggtaaaatccaagcctctttggggaaagcaatgttccgtaaatgggctgacaaattt 192

                                                                        
Query: 217  gttgagggaaatgtttatgagatattctttttcaatgtaatgcctgcgaagggatcttac 276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193  gttgagggaaatgtttatgagatattctttttcaatgtaatgcctgcgaagggatcttac 252

                                                                        
Query: 277  cgtgcagctaatcatgcctataggattttatttagtggtaagacaaaggttgttccatta 336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253  cgtgcagctaatcatgcctataggattttatttagtggtaagacaaaggttgttccatta 312

                                                                        
Query: 337  gagtgtgagagtataccaaggttggggttatcgttggtaaccccgttacagctggaaacc 396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 313  gagtgtgagagtataccaaggttggggttatcgttggtaaccccgttacagctggaaacc 372

                                                                        
Query: 397  attgcagacccttctgatcatttagttgatgttgttggatttttaactgcggtgtcccct 456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373  attgcagacccttctgatcatttagttgatgttgttggatttttaactgcggtgtcccct 432

                                                                        
Query: 457  gttagaattgatgtaaaaggatccagccatgtgaagattatgatgatggagttatatgat 516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 433  gttagaattgatgtaaaaggatccagccatgtgaagattatgatgatggagttatatgat 492

                                                                        
Query: 517  gagaatggttcgatgtcatttgttgttcttggtgattgtgtaagtgttgtaagtgattat 576
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 493  gagaatggctcgatgtcatttgttgttcttggtgattgtgtaagtgttgtaagtgattat 552

                                                                        
Query: 577  ctatcttcacattcaaaggagaaacctcttgtggttgtgcagtatgccaagataaagaaa 636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 553  ctatcttcacattcaaaggagaaacctcttgtggttgtgcagtatgccaagataaagaaa 612

                                                                        
Query: 637  tttgaagggaagaatttgttgcataccttaattcctgtgtctactatacatcttaatcaa 696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 613  tttgaagggaagaatttgttgcataccttaattcctgtgtctactatacatcttaatcaa 672

                                                                        
Query: 697  gaatttgaggaagctaaagcctttaggaagaggatgaatggacacagtagggaaattgaa 756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 673  gaatttgaggaagctaaagcctttaggaagaggatgaatggacacagtagggaaattgaa 732

                                                                        
Query: 757  ggtcatgttggtgatattgatttcttcgattttgcttatccaatgattgatgatgttaaa 816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 733  ggtcatgttggtgatattgatttcttcgattttgcttatccaatgattgatgatgttaaa 792

                                                                        
Query: 817  attgtatatccttctgtggatttgaagtatgtagattttgaagttagtgtgtaccaacga 876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 793  attgtatatccttctgtggatttgaagtatgtagattttgaagttagtgtgtaccaacga 852

                                                                        
Query: 877  tttaggggagaacctgttattgattatgctgatgatggatgttttgcggatatgatgagt 936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 853  tttaggggagaacctgttattgattatgctgatgatggatgttttgcggatatgatgagt 912

                                                                        
Query: 937  gcatgtgatgttgagatgttatatgaagaaagcgatatgatggagctatatgaatcctcc 996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 913  gcatgtgatgttgagatgttatatgaagaaagcgatatgatggagctatatgaatcctcc 972

                                               
Query: 997  tcattttttcagagttatatgatgtccaagtattt 1031
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 973  tcattttttcagagttatatgatgtccaagtattt 1007



 Score = 69.9 bits (35), Expect = 3e-11
 Identities = 35/35 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                              
Query: 1   atgaagttccgccctattagagatcatcatcagga 35
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 100 atgaagttccgccctattagagatcatcatcagga 134