Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0097339.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0097339.1 Non Chatacterized Hit- tr|I1JMD5|I1JMD5_SOYBN
Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=Gma.5932
PE=,85.14,0,seg,NULL; FAMILY NOT NAMED,NULL; coiled-coil,NULL;
Frigida,Frigida-like,CUFF.5427.1
(1656 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC72562 3233 0.0
gnl|LJGI|BW594763 similar to UniRef100_Q2UAZ4 Cluster: Acyl-CoA ... 163 4e-39
gnl|LJGI|BP072125 92 1e-17
>gnl|LJGI|TC72562
Length = 2061
Score = 3233 bits (1631), Expect = 0.0
Identities = 1648/1656 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaagacaaagattcagttgctacgctgatggactctacaacttctaagatacaacag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 152 atggaagacaaagattcagttgctacgctgatggactctacaacttctaagatacaacag 211
Query: 61 ctgcaaaaggcatttgctgagcttgaaagctatcgagctgttactcttaacttgaaatgg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 212 ctgcaaaaggcatttgctgagcttgaaagctatcgagctgttactcttaacttgaaatgg 271
Query: 121 aaagaactagaggaacattttcatgggcttgagaaatccttgaagaggcgctttcatgaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 272 aaagaactagaggaacattttcatgggcttgagaaatccttgaagaggcgctttcatgaa 331
Query: 181 ttggaagaccaagaaaaagaattcgaaagcaaaacaaggaaatctcgtgaactgttggag 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 332 ttggaagaccaagaaaaagaattcgaaagcaaaacaaggaaatctcgtgaactgttggag 391
Query: 241 aagcgggaagcagctgtgttttctaaggagcaggtctcgttgcagaggcttcaagagaaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 392 aagcgggaagcagctgtgttttctaaggagcaggtctcgttgcagaggcttcaagagaaa 451
Query: 301 agggatgctgctgcatttgctattgtaaatgctcgagaaaagcaccggaaggtttcatca 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 452 agggatgctgctgcatttgctattgtaaatgctcgagaaaagcaccggaaggtttcatca 511
Query: 361 aaggatttggcttttgtctccagtggtggtcaagggagacagggtttagaggagacacca 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 512 aaggatttggcttttgtctccagtggtggtcaagggagacagggtttagaggagacacca 571
Query: 421 gtggatgctggggcccttttggctgaaggtaacttggaagatgtgaaactttctcctgaa 480
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 572 gtggatgctgggtcccttttggctgaaggtaacttggaagatgtgaaactttctcctgaa 631
Query: 481 aatggaagtgttgagttggtgtcttatccagagttggtaaaactatgtaaagaaatgaat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 632 aatggaagtgttgagttggtgtcttatccagagttggtaaaactatgtaaagaaatgaat 691
Query: 541 gctgctggacttcacaaattcatatctgataaccgtaagaaccttgctgctgtaagggat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 692 gctgctggacttcacaaattcatatctgataaccgtaagaaccttgctgctgtaagggat 751
Query: 601 gaaattccacatgcattgcgagctgctcctaatgctgcccgtctagttttagattcattg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 752 gaaattccacatgcattgcgagctgctcctaatgctgcccgtctagttttagattcattg 811
Query: 661 gaaggattttactgtatggaagtgtcaagtcaggatattaaaaaggatgctaatttattg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 812 gaaggattttactgtatggaagtgtcaagtcaggatattaaaaaggatgctaatttattg 871
Query: 721 ggtcttcgccgaacctgcattatgctgatggaatgtctaagtgatttcctgaacaattca 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 872 ggtcttcgccgaacctgcattatgctgatggaatgtctaagtgatttcctgaacaattca 931
Query: 781 gactgtgcttctaatgtaatttcagaagatatcaaagacagggcaaagtcagttgctgaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 932 gactgtgcttctaatgtaatttcagaagatatcaaagacagggcaaagtcagttgctgaa 991
Query: 841 gagtggaaacctagattggatgctcttgacatggatgctagccatgggaactcattggag 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 992 gagtggaaacctagattggatgctcttgacatggatgctagccatgggaactcattggag 1051
Query: 901 gctcatgcatttttgcaacttctggccagttttggtattgcctctggttttgatgaacaa 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1052 gctcatgcatttttgcaacttctggccagttttggtattgcctctggttttgatgaacaa 1111
Query: 961 gagttgtccaagctgattccagtggtgtctcggcgtcgccaaactgctgatttatgccgt 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1112 gagttgtccaagctgattccagtggtgtctcggcgtcgccaaactgctgatttatgccgt 1171
Query: 1021 tgccttggtttgacagagaagatgcctggtgtaatagaggttttggtaaacagtgggcgg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1172 tgccttggtttgacagagaagatgcctggtgtaatagaggttttggtaaacagtgggcgg 1231
Query: 1081 caacttgatgctgttaacttggccttttcatttgatcttacagaacagttttgtcctgtt 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1232 caacttgatgctgttaacttggccttttcatttgatcttacagaacagttttgtcctgtt 1291
Query: 1141 tccttactgaagtcttatttgaaggacgccagaaaagcttcctctcctgtcaaaagtgtt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1292 tccttactgaagtcttatttgaaggacgccagaaaagcttcctctcctgtcaaaagtgtt 1351
Query: 1201 aactcatcccccactgcacagattgaggtcaatgaacgagagctgattgctctgaagggt 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1352 aactcatcccccactgcacagattgaggtcaatgaacgagagctgattgctctgaagggt 1411
Query: 1261 gtaatcaagtgcattgaagaacataagcttgaggagcagtatcctgtggatcatctcgtg 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1412 gtaatcaagtgcattgaagaacataagcttgaggagcagtatcctgtggatcatctcgtg 1471
Query: 1321 aagcgagtggctcaactagagaaggccaaagctgnnnnnnngagggaaactgaagcaaca 1380
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 1472 aagcgagtggctcaactagagaaggccaaagctgaaaaaaagagggaaactgaagcaaca 1531
Query: 1381 aagcctcagcccaagagaccccgagctaatggcattgtgggatatgctcctcgtttctct 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1532 aagcctcagcccaagagaccccgagctaatggcattgtgggatatgctcctcgtttctct 1591
Query: 1441 aacattccttctgataacaaaagttcatatgctagagttgctgacaggtacccgccacaa 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1592 aacattccttctgataacaaaagttcatatgctagagttgctgacaggtacccgccacaa 1651
Query: 1501 tatgtgtatgaccgaccatacatgtacccagcacccgccgacaatcattgccctcctcct 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1652 tatgtgtatgaccgaccatacatgtacccagcacccgccgacaatcattgccctcctcct 1711
Query: 1561 ctctttggcacggctacctataacatctctcctactcatcatggaaactactttggaaat 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1712 ctctttggcacggctacctataacatctctcctactcatcatggaaactactttggaaat 1771
Query: 1621 ggctatcagtaccaagctacatatcttcactagtta 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1772 ggctatcagtaccaagctacatatcttcactagtta 1807
>gnl|LJGI|BW594763 similar to UniRef100_Q2UAZ4 Cluster: Acyl-CoA dehydrogenases; n=1;
Aspergillus oryzae|Rep: Acyl-CoA dehydrogenases -
Aspergillus oryzae, partial (3%)
Length = 489
Score = 163 bits (82), Expect = 4e-39
Identities = 115/122 (94%), Gaps = 3/122 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1535 ccgccgacaatcattgccctcctcctctctttggcacggctacctataacatctctccta 1594
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 8 ccgccgacaatcattgccctcctcctctcattggcacggctacctataacatctctccaa 67
Query: 1595 ctcatca-tggaaactac-tttggaaatggctatcagtaccaag-ctacatatcttcact 1651
||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct: 68 ctcgtcactggaaactacatttggaaatggctatcagtaccaagcctacatatcatcact 127
Query: 1652 ag 1653
||
Sbjct: 128 ag 129
>gnl|LJGI|BP072125
Length = 191
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-17
Identities = 112/122 (91%), Gaps = 9/122 (7%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1511 accgaccatacatgt-acccagcacccgccgacaatcattgccct-cctcct-ctctttg 1567
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||
Sbjct: 191 accgaccatacatgtgacccagcacccgccgaccatc-ttgccctgcctcctgctctttg 133
Query: 1568 g-cacggctacctataacat-ctctcctact-cat-catggaaact-actttggaaatgg 1622
| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 132 ggcacggctacctataacatgctctcctactgcatgcatggaaactgactttggaaatgg 73
Query: 1623 ct 1624
||
Sbjct: 72 ct 71