Miyakogusa Predicted Gene
- Lj0g3v0012389.1
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Lj0g3v0012389.1 CUFF.648.1
(1608 letters)
Database: LJGI
47,486 sequences; 32,788,469 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gnl|LJGI|TC76179 similar to UniRef100_A7NXC0 Cluster: Chromosome... 1782 0.0
gnl|LJGI|TC67323 similar to UniRef100_A7NXC0 Cluster: Chromosome... 1283 0.0
gnl|LJGI|GO010765 homologue to UniRef100_Q9SHY8 Cluster: Pre-mRN... 478 e-134
>gnl|LJGI|TC76179 similar to UniRef100_A7NXC0 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_2,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_2, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (51%)
Length = 907
Score = 1782 bits (899), Expect = 0.0
Identities = 905/907 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 529 aagaaattggagaagagtgaccaaaatggtgagggttctgctagtgatgaggatgaagac 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 aagaaattggagaagagtgaccaaaatggtgagggttctgctagtgatgaggatgaagac 60
Query: 589 gaagatgatctaagggtagatgaggcaaaggttgatgagagcaaacaaatggattttgca 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gaagatgatctaagggtagatgaggcaaaggttgatgagagcaaacaaatggattttgca 120
Query: 649 aaggttgagaagcgagtacgtacaactggtggtgggagtacaggaactgtgaggaaccta 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaggttgagaagcgagtacgtacaactggtggtgggagtacaggaactgtgaggaaccta 180
Query: 709 cgtattcgagaggatactgcaaaatatcttcttaatcttgaggtcaattctgctcattat 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 cgtattcgagaggatactgcaaaatatcttcttaatcttgaggtcaattctgctcattat 240
Query: 769 gatcccaagaccaggtcaatgcgtgaagatcctcttccagatgcagatccaaatgagaag 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gatcccaagaccaggtcaatgcgtgaagatcctcttccagatgcagatccaaatgagaag 300
Query: 829 ttttatctgggtgataaccaatatagaaatagtggtcaagctttggaattcaaggaatta 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 301 ttttatctgggtgataaccaatatagaaatagtggtcaagctttggaattcaaggaagga 360
Query: 889 aacatccatgcttgggaagcatttgacaaggggcaagatgttcatatgcaagcagctcca 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aacatccatgcttgggaagcatttgacaaggggcaagatgttcatatgcaagcagctcca 420
Query: 949 tcccaagctgaattgctctataagaatttcaaggtcatgaaggagaaattgaagtctcaa 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tcccaagctgaattgctctataagaatttcaaggtcatgaaggagaaattgaagtctcaa 480
Query: 1009 acaaaggatactatcctcgagaagtatggcaatgcagctgatgaggacaaacttccaaga 1068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 acaaaggatactatcctcgagaagtatggcaatgcagctgatgaggacaaacttccaaga 540
Query: 1069 gaacttctgcttggtcagagtgagggccaagttgagtatgatcgtgctggtagaattatt 1128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaacttctgcttggtcagagtgagggccaagttgagtatgatcgtgctggtagaattatt 600
Query: 1129 aagggacaggaagcagcagtccccaggagcaagtatgaagaagatgtttacattaacaac 1188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aagggacaggaagcagcagtccccaggagcaagtatgaagaagatgtttacattaacaac 660
Query: 1189 cacacaactgtttggggctcttggtggaaggatcaccaatggggcttcaagtgttgcaag 1248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 cacacaactgtttggggctcttggtggaaggatcaccaatggggcttcaagtgttgcaag 720
Query: 1249 cagacaatacgtaatagctattgtaccggtgctgctggtattgcggctgctgaggctgca 1308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cagacaatacgtaatagctattgtaccggtgctgctggtattgcggctgctgaggctgca 780
Query: 1309 aatgaccttatgagggctaatattgcccgtaaggaggctgctgcagaggatgctaaacca 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 aatgaccttatgagggctaatattgcccgtaaggaggctgctgcagaggatgctaaacca 840
Query: 1369 atggaggagaaaaggctggctacatggggaactgatgtccctgatgacctagttctggat 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 atggaggagaaaaggctggctacatggggaactgatgtccctgatgacctagttctggat 900
Query: 1429 gaaaaat 1435
|||||||
Sbjct: 901 gaaaaat 907
>gnl|LJGI|TC67323 similar to UniRef100_A7NXC0 Cluster: Chromosome chr5 scaffold_2,
whole genome shotgun sequence; n=1; Vitis vinifera|Rep:
Chromosome chr5 scaffold_2, whole genome shotgun sequence
- Vitis vinifera (Grape), partial (39%)
Length = 961
Score = 1283 bits (647), Expect = 0.0
Identities = 650/651 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 958 gaattgctctataagaatttcaaggtcatgaaggagaaattgaagtctcaaacaaaggat 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gaattgctctataagaatttcaaggtcatgaaggagaaattgaagtctcaaacaaaggat 61
Query: 1018 actatcctcgagaagtatggcaatgcagctgatgaggacaaacttccaagagaacttctg 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 actatcctcgagaagtatggcaatgcagctgatgaggacaaacttccaagagaacttctg 121
Query: 1078 cttggtcagagtgagggccaagttgagtatgatcgtgctggtagaattattaagggacag 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 cttggtcagagtgagggccaagttgagtatgatcgtgctggtagaattattaagggacag 181
Query: 1138 gaagcagcagtccccaggagcaagtatgaagaagatgtttacattaacaaccacacaact 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 gaagcagcagtccccaggagcaagtatgaagaagatgtttacattaacaaccacacaact 241
Query: 1198 gtttggggctcttggtggaaggatcaccaatggggcttcaagtgttgcaagcagacaata 1257
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 gtttggggctcttggtggaaggaccaccaatggggcttcaagtgttgcaagcagacaata 301
Query: 1258 cgtaatagctattgtaccggtgctgctggtattgcggctgctgaggctgcaaatgacctt 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 cgtaatagctattgtaccggtgctgctggtattgcggctgctgaggctgcaaatgacctt 361
Query: 1318 atgagggctaatattgcccgtaaggaggctgctgcagaggatgctaaaccaatggaggag 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 atgagggctaatattgcccgtaaggaggctgctgcagaggatgctaaaccaatggaggag 421
Query: 1378 aaaaggctggctacatggggaactgatgtccctgatgacctagttctggatgaaaaattg 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 aaaaggctggctacatggggaactgatgtccctgatgacctagttctggatgaaaaattg 481
Query: 1438 cttgcagatgcactcaaaaaggaggatcaaagaaagagagaagagaaagatgacaggaag 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 cttgcagatgcactcaaaaaggaggatcaaagaaagagagaagagaaagatgacaggaag 541
Query: 1498 cgtaaatataatgttagatggaacgatgaggttactgcagaggatatggaggcatacagg 1557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 cgtaaatataatgttagatggaacgatgaggttactgcagaggatatggaggcatacagg 601
Query: 1558 atgaagaaagtacattctgatgatccaatgaaggatttcttgaactgaagt 1608
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 atgaagaaagtacattctgatgatccaatgaaggatttcttgaactgaagt 652
>gnl|LJGI|GO010765 homologue to UniRef100_Q9SHY8 Cluster: Pre-mRNA-splicing factor
SLU7-A; n=1; Arabidopsis thaliana|Rep: Pre-mRNA-splicing
factor SLU7-A - Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress),
partial (16%)
Length = 436
Score = 478 bits (241), Expect = e-134
Identities = 247/249 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcaaccgcatcagtggcatttaagtcgagggaggatcatcgcaaacagattgagttg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 44 atggcaaccgcatcagtggcatttaagtcgagggaggatcatcgcaaacagattgagttg 103
Query: 61 gaggaagcccgtaaagctgggcttgctccagctgaggtggacgaagatggaaaggaaatc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 104 gaggaagcccgtaaagctgggcttgctccagctgaggtggacgaagatggaaaggaaatc 163
Query: 121 aatccccatattccgcagtatatgtcttctgcgccttggtatcttaatgctgagagacct 180
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 164 aatccccatattccgcagtatatgtcttccgcgccttggtatcttaatgctgagagacct 223
Query: 181 agtttgaaacatcaaaggaaatggaaatctgatcccaactacactaaatcatggtatgat 240
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 224 agtttgaaacatcaaaggaaatggagatctgatcccaactacactaaatcatggtatgat 283
Query: 241 agaggtgct 249
|||||||||
Sbjct: 284 agaggtgct 292