Miyakogusa Predicted Gene

Lj0g3v0005049.1
Show Alignment: 

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj0g3v0005049.1 NODE_13184_length_3065_cov_288.972931.path2.1
         (1905 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC79995 homologue to UniRef100_Q93YA9 Cluster: Lipoxyge...  2000   0.0  

>gnl|LJGI|TC79995 homologue to UniRef100_Q93YA9 Cluster: Lipoxygenase; n=1; Sesbania
            rostrata|Rep: Lipoxygenase - Sesbania rostrata, partial
            (37%)
          Length = 1140

 Score = 2000 bits (1009), Expect = 0.0
 Identities = 1015/1017 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 889  cacgcctgcacggaaccatttatattggcggctcatcggcatttgagtgctatgcatcct 948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2    cacgcctgcacggaaccatttatattggcggctcatcggcatttgagtgctatgcatcct 61

                                                                        
Query: 949  attttcaagttattggatccacacatgaggtacacattggagatcaacgccttggctcgc 1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62   attttcaagttattggatccacacatgaggtacacattggagatcaacgccttggctcgc 121

                                                                        
Query: 1009 cagagcttgatcaatgcggatggtatcattgagtcttgcttcactcccggtcgctactgc 1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122  cagagcttgatcaatgcggatggtatcattgagtcttgcttcactcccggtcgctactgc 181

                                                                        
Query: 1069 atggaggttagttctgccgcttacaaaaacttgtggcgctttgacatggatagcctccct 1128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182  atggaggttagttctgccgcttacaaaaacttgtggcgctttgacatggatagcctccct 241

                                                                        
Query: 1129 gcagatctcatccgcaggggaatggcagtgcctgacccaacagaaccacatggtctaaag 1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242  gcagatctcatccgcaggggaatggcagtgcctgacccaacagaaccacatggtctaaag 301

                                                                        
Query: 1189 ctcacaatgaaagactacccttatgcagaagatgggatactaatctggtctgcaatagaa 1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302  ctcacaatgaaagactacccttatgcagaagatgggatactaatctggtctgcaatagaa 361

                                                                        
Query: 1249 aattggattcgtacctatgtgaactattactacccacattcaagcatgataagcaatgat 1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362  aattggattcgtacctatgtgaactattactacccacattcaagcatgataagcaatgat 421

                                                                        
Query: 1309 agggagctacaagcttggtactctgagtcagtgaatgtgggacatgctgataagaggcat 1368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422  agggagctacaagcttggtactctgagtcagtgaatgtgggacatgctgataagaggcat 481

                                                                        
Query: 1369 gagagctggtggcccacattgaacaacagtgagaatcttgtctctgtcctctccattttg 1428
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482  gagagctggtggcccacatcgaacaacagtgagaatcttgtctctgtcctctccattttg 541

                                                                        
Query: 1429 atctggaatgcatctgcacagcatgctgctcttaactttggacagtatccttatggtggt 1488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542  atctggaatgcatctgcacagcatgctgctcttaactttggacagtatccttatggtggt 601

                                                                        
Query: 1489 tatgtgcctaatcgtcccccgatgatgcgaagattaattccagaagaaggtgaccctgaa 1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602  tatgtgcctaatcgtcccccgatgatgcgaagattaattccagaagaaggtgaccctgaa 661

                                                                        
Query: 1549 tatgcaagtttcctagctgaccctcagaagtattttctgaatgcactgcctagtgtgttg 1608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662  tatgcaagtttcctagctgaccctcagaagtattttctgaatgcactgcctagtgtgttg 721

                                                                        
Query: 1609 caggcttcaaaatacatggctataattgacactctctctactcactcacctgatgaggag 1668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722  caggcttcaaaatacatggctataattgacactctctctactcactcacctgatgaggag 781

                                                                        
Query: 1669 tacttgggagagcggcagcagccatcagtttggtccggtgatgctgatatcgttgaggca 1728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782  tacttgggagagcggcagcagccatcagtttggtccggtgatgctgatatcgttgaggca 841

                                                                        
Query: 1729 ttctacgacttctctgcacagatccagcagatagagaaggtgattgatagtaggaactcc 1788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842  ttctacgacttctctgcacagatccagcagatagagaaggtgattgatagtaggaactcc 901

                                                                        
Query: 1789 gaccggaatctaaggaaccgttgtggtgcaggggtgttgccttatgagttacttgcacct 1848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902  gaccggaatctaaggaaccgttgtggtgcaggggtgttgccttatgagttacttgcacct 961

                                                                     
Query: 1849 agctctggacctggtgttacatgcagaggggttcctaacagtgtgtccacataaaaa 1905
            |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962  agctctggacctggtgttacattcagaggggttcctaacagtgtgtccacataaaaa 1018