Miyakogusa Predicted Gene

Lj0g3v0000069.1

BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Lj0g3v0000069.1 tr|A4PIZ3|A4PIZ3_LOTJA Cysteine proteinase
OS=Lotus japonicus GN=LjCyp3 PE=2
SV=1,90.91,0,THIOL_PROTEASE_HIS,Cysteine peptidase, histidine active
site; THIOL_PROTEASE_ASN,Cysteine peptidase,,gene.g5.t1.1
         (813 letters)

Database: LJGI 
           47,486 sequences; 32,788,469 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gnl|LJGI|TC79159 UniRef100_A4PIZ3 Cluster: Cysteine proteinase; ...   977   0.0  

>gnl|LJGI|TC79159 UniRef100_A4PIZ3 Cluster: Cysteine proteinase; n=1; Lotus
            japonicus|Rep: Cysteine proteinase - Lotus japonicus,
            complete
          Length = 1243

 Score =  977 bits (493), Expect = 0.0
 Identities = 503/505 (99%), Gaps = 1/505 (0%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                        
Query: 310  gaacaagagctagtggattgtgacagaaaaggtacagaccaaggctgtgaaggaggatac 369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 563  gaacaagagctagtggattgtgacagaaaaggtacagaccaaggctgtgaaggaggatac 622

                                                                        
Query: 370  atggaagatggctttgagttcattataaaaaatggtggaattaccactgaggctaattac 429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 623  atggaagatggctttgagttcattataaaaaatggtggaattaccactgaggctaattac 682

                                                                        
Query: 430  ccctataaggcagttgatgggagttgtaaaaatgcaactgcacctgcagctcaaattaaa 489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 683  ccctataaggcagttgatgggagttgtaaaaatgcaactgcacctgcagctcaaattaaa 742

                                                                        
Query: 490  gggtatgagaaagtcccagttaatagcgagaaggcactcttgaaagcggttgctaaccaa 549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 743  gggtatgagaaagtcccagttaatagcgagaaggcactcttgaaagcggttgctaaccaa 802

                                                                        
Query: 550  cctgtgtcagtttcaattgatgcagctgatggaagtttcatgttttactcaagtgggata 609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 803  cctgtgtcagtttcaattgatgcagctgatggaagtttcatgttttactcaagtgggata 862

                                                                        
Query: 610  tttacaggagaatgtggaactgagctagaccatggtgttacagcagttggttatggaaga 669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 863  tttacaggagaatgtggaactgagctagaccatggtgttacagcagttggttatggaaga 922

                                                                        
Query: 670  gctaatggtactgattattggatagtgaagaattcatggggtacagtgtggggtgagcaa 729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 923  gctaatggtactgattattggatagtgaagaattcatggggtacagtgtggggtgagcaa 982

                                                                        
Query: 730  ggatacataaggatgcagcgaggcatagctgcaaagga-aggtttatgtggaattgctat 788
            |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 983  ggatacataaggatgcagagaggcatagctgcaaaggacaggtttatgtggaattgctat 1042

                                     
Query: 789  ggattcctcttatccaactgcttaa 813
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1043 ggattcctcttatccaactgcttaa 1067



 Score =  615 bits (310), Expect = e-175
 Identities = 310/310 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   atggcaaaatatgacaaagtgtataaggatgcggctgagaaggaaaaacgtttcttgata 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 173 atggcaaaatatgacaaagtgtataaggatgcggctgagaaggaaaaacgtttcttgata 232

                                                                       
Query: 61  ttcaaggacaatgtggagttcattgaatcattcaatgctgctggaaacaaaccttacaag 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 233 ttcaaggacaatgtggagttcattgaatcattcaatgctgctggaaacaaaccttacaag 292

                                                                       
Query: 121 ctcggcgttaatcaccttgctgatttaacaattgaggagttcaaggcttcgcgtaacgga 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 293 ctcggcgttaatcaccttgctgatttaacaattgaggagttcaaggcttcgcgtaacgga 352

                                                                       
Query: 181 ttgaagaggtcctatgactatgaggttgggacaacatcatttaagtatgaaaatgtgact 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 353 ttgaagaggtcctatgactatgaggttgggacaacatcatttaagtatgaaaatgtgact 412

                                                                       
Query: 241 gctattcctgcaagtgtagactggaggaaaaaaggagctgttactccaatcaaggaccaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 413 gctattcctgcaagtgtagactggaggaaaaaaggagctgttactccaatcaaggaccaa 472

                     
Query: 301 ggtcaatgtg 310
           ||||||||||
Sbjct: 473 ggtcaatgtg 482