Result of FASTA (ccds) for pF1KB8518
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8518, 869 aa
  1>>>pF1KB8518 869 - 869 aa - 869 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1006+/-0.00151; mu= -23.4542+/- 0.086
 mean_var=664.7971+/-154.980, 0's: 0 Z-trim(107.4): 330  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.049743
 statistics sampled from 9262 (9576) to 9262 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.294), width:  16
 Scan time:  4.090

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9           ( 869) 5836 435.8 1.6e-121
CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9           ( 783) 3336 256.3 1.5e-67
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1             ( 937)  930 83.7 1.6e-15
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9            ( 943)  876 79.9 2.4e-14
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 817)  814 75.3 4.8e-13
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 825)  814 75.4 4.8e-13
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 762)  798 74.2   1e-12
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 802)  798 74.2 1.1e-12
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5          ( 734)  776 72.6   3e-12
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6             ( 876)  776 72.7 3.3e-12
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 894)  776 72.7 3.4e-12
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 913)  776 72.7 3.4e-12
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10           (1072)  773 72.5 4.5e-12
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10            (1114)  773 72.5 4.6e-12
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 812)  758 71.3 7.8e-12
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  758 71.3 7.8e-12
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 593)  749 70.5 9.7e-12
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 680)  749 70.6 1.1e-11
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 731)  750 70.7 1.1e-11
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 733)  750 70.7 1.1e-11
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 704)  749 70.6 1.1e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 705)  749 70.6 1.1e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 707)  749 70.6 1.1e-11
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 709)  749 70.6 1.1e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 732)  749 70.6 1.1e-11
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 694)  748 70.5 1.1e-11
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  750 70.8 1.2e-11
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8           ( 822)  750 70.8 1.2e-11
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 769)  749 70.7 1.2e-11
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 853)  750 70.8 1.2e-11
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 819)  749 70.7 1.2e-11
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 821)  749 70.7 1.2e-11
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10          ( 822)  749 70.7 1.2e-11
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 806)  748 70.6 1.3e-11
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4          ( 808)  748 70.6 1.3e-11
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 767)  741 70.1 1.7e-11
CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 919)  719 68.6 5.9e-11


>>CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9                (869 aa)
 initn: 5836 init1: 5836 opt: 5836  Z-score: 2295.1  bits: 435.8 E(32554): 1.6e-121
Smith-Waterman score: 5836; 100.0% identity (100.0% similar) in 869 aa overlap (1-869:1-869)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEIS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 WTRNKILIKLFDTRYSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WTRNKILIKLFDTRYSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 PKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 QKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 PTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAAT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 ISIAEWSKPQKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPEEAQELLVHTAWNELK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ISIAEWSKPQKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPEEAQELLVHTAWNELK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 VVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSPGVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSPGVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHRG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 LYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLPHLDYNKENLKTFPPMTSSKPSVDIPNLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLPHLDYNKENLKTFPPMTSSKPSVDIPNLPS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 SSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTTLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTTLP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 SELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQARAPGLLPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQARAPGLLPY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 EPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFEYMAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFEYMAY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 GDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 FVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 TESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWS
              790       800       810       820       830       840

              850       860         
pF1KB8 KLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
              850       860         

>>CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9                (783 aa)
 initn: 4094 init1: 2749 opt: 3336  Z-score: 1326.0  bits: 256.3 E(32554): 1.5e-67
Smith-Waterman score: 4921; 87.8% identity (87.9% similar) in 879 aa overlap (1-869:1-783)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEIS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 WTRNKILIKLFDTRYSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WTRNKILIKLFDTRYSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 PKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNV
              130       140       150       160       170       180

              190       200                 210       220       230
pF1KB8 QKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVE----------VFARILRAPESHNVTFGSFVT
       :::::::::::::::::::::::::::::          :::::::::::::::::::::
CCDS75 QKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEEESEPEQDTKVFARILRAPESHNVTFGSFVT
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KB8 LHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGE
              250       260       270       280       290       300

              300       310       320       330       340       350
pF1KB8 KFSTAKAAATISIAEWSKPQKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPEEAQEL
       ::::::::::::::::                                            
CCDS75 KFSTAKAAATISIAEW--------------------------------------------
              310                                                  

              360       370       380       390       400       410
pF1KB8 LVHTAWNELKVVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSPGVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEW
                                                   ::::::::::::::::
CCDS75 --------------------------------------------REYCLAVKELFCAKEW
                                                    320       330  

              420       430       440       450       460       470
pF1KB8 LVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLPHLDYNKENLKTFPPMTSSK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        .::::::::
CCDS75 LVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLPHL--------AFPPMTSSK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVE
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
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CCDS62 SVSAELVPTSSWNISSELNKDSYLTLDEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKN
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CCDS62 DAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRLRIRNLDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPP
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pF1KB8 WSKP----QKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPE-EAQELLVHTAWNELK
        ..:    . .. :.:  ::: .: : .  .  :.... . . : : :   . :  .  .
CCDS62 TASPGYSDEYEEDGFCQPYRGIAC-ARFIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSS
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        .:  :   :   ::.. :  :.  . :: :  .::. :  .....:  :. .. ...  
CCDS62 HLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCDETSSVPKPRDLCRDECEILENVLCQTEY-IFARSNPM
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pF1KB8 GLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTA--CARL--PHLDYNKENLKTF------------
        :.:     :..:.:  ::. . .: :  : :.  :  :  ..: : .            
CCDS62 ILMR-----LKLPNCEDLPQPE-SPEAANCIRIGIPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVS
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pF1KB8 --------PPMTSSKP------SVDIPNL---------PSSSSSS---FSVSPTYS----
                : .:. :      .. .:.:         :.... .   :... ...    
CCDS62 VTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELNGGHSYCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLC
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pF1KB8 ---------------MTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTT
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CCDS62 DIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIPLAIALLFFFICVCRN---NQKSSSAPV--QR
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        :.       :   .  .: .:   .::  . : : . .......:: :::......   
CCDS62 QPK-------HVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELGECAFGKIYKGHLYL
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       ::.   .   .::.: ::.  . .. ..::.::.::::. .:::: :::. .  .:.:.:
CCDS62 PGM---DHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLGAVTQEQPVCML
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       :::.  :::.:::   :::.   :: :  : .....        :. .. : :: :.:::
CCDS62 FEYINQGDLHEFLIMRSPHSDVGCS-SDEDGTVKSS--------LDHGDFLHIAIQIAAG
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pF1KB8 MAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPE
       : ::: . :::.:::.:: :.::.. :::.:.::::.:::::::... .. .::::::::
CCDS62 MEYLSSHFFVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPIRWMPPE
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pF1KB8 SIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELY
       .:.:......::.:..:::::::::.:::::::....::: .::  ..: : :.:: ..:
CCDS62 AIMYGKFSSDSDIWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCSEDCPPRMY
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pF1KB8 NLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV                       
       .::  ::...:. :: : .::                                       
CCDS62 SLMTECWNEIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSASPVSNLS
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>>CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9                 (943 aa)
 initn: 910 init1: 608 opt: 876  Z-score: 370.9  bits: 79.9 E(32554): 2.4e-14
Smith-Waterman score: 1072; 31.6% identity (57.5% similar) in 722 aa overlap (221-868:69-753)

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pF1KB8 VAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHNVTF--GSFVTLHCTATGIPVPTITWIEN
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CCDS66 DPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGYFLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKN
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pF1KB8 GNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQ---LFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATISIAE
          : .   .  ..     :::.   :  :  : : :.:::  : :  :: ..  . .. 
CCDS66 DAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRLRIQDLDTTDTGYYQCVATN--GMKTITATGVLFVRLGP
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pF1KB8 WSKP----QKD--NKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPE-EAQELLVHTAWNE
         .:    : :  . :.:  ::: .: : .  .  .....   . : : .   . :  . 
CCDS66 THSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGIAC-ARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGT
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pF1KB8 LKVVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSP-GVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKT
          .:  :   :   .:. .:  :.  . .: :  .::. : ...  .: .:. . . ..
CCDS66 STHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCDARSRTPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIAR-SN
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pF1KB8 HRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTA--CARL--P-------HLDYN----------
          :.:     :..:.:  :: :  .: :  : :.  :       :  ::          
CCDS66 PLILMR-----LQLPKCEALP-MPESPDAANCMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTA
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pF1KB8 ---KENLKTFP-----PMTSSKPSVDIPNL---------PSSSSSS---F----------
          : . .  :     : .    :.:.:.:         :...  .   :          
CCDS66 STTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGGGHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMEL
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pF1KB8 ----SVSPTYS--MTVIISIMSSFAI-FVLLTITTLYC-CRRRKQWKNKKRESAAVTLTT
           : ::  :  : ..  .. :.:: .:.  .  : : ::      ::.. ::..    
CCDS66 CDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIACLFFLVCMCR------NKQKASAST----
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pF1KB8 LPSELLLDRLHPNPMYQ-RMPLLLNPKLLSL-EYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQARAPG
        :..    .:  .:  . .:::. . :  .: :   . .......::  ::.:....  :
CCDS66 -PQR---RQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGKVYKGHLFG
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pF1KB8 LLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFE
         : :    ::.: ::..: . .. .:..:: : :....::.: :::: .  .:. ..: 
CCDS66 PAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKDQPLSMIFS
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pF1KB8 YMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYL
       : ..:::.:::   :::.  . . .: .... .    :: .     . .. :.:::: ::
CCDS66 YCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALE---PPDF-----VHLVAQIAAGMEYL
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pF1KB8 SERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFY
       : .. ::.:::::: :: ... :::.:.:: :..:.:::::   :. .::::: ::.:.:
CCDS66 SSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMY
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pF1KB8 NRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMR
       .... .::.:.:::::::.:::::::: :.....:. ..:. ..: ::..::. .: :: 
CCDS66 GKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMI
        670       680       690       700       710       720      

        840       850       860                                    
pF1KB8 LCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV                           
        ::...:. :: : .::  :     :: :..:                            
CCDS66 ECWNEFPSRRPRFKDIHSRL-----RAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNV
        730       740            750       760       770       780 

CCDS66 SNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYVPVNGYQPVPAYGAYLPNFYPVQ
             790       800       810       820       830       840 

>>CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15              (817 aa)
 initn: 1056 init1: 636 opt: 814  Z-score: 347.7  bits: 75.3 E(32554): 4.8e-13
Smith-Waterman score: 922; 44.5% identity (73.5% similar) in 310 aa overlap (551-859:505-805)

              530       540       550       560        570         
pF1KB8 RKQWKNKKRESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLN-PKLLSLEYPRNNIEYVR
                                     ::.: :.    . :     .  : .:   :
CCDS58 HINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKR
          480       490       500       510       520       530    

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pF1KB8 DIGEGAFGRVFQARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIV
       ..::::::.:: :.  .: : .   .:::: ::. . :  . :::::: :...... .::
CCDS58 ELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLA-ARKDFQREAELLTNLQHEHIV
          540       550       560       570        580       590   

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pF1KB8 KLLGVCAVGKPMCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSC
       :. :::. : :. ..:::: .::::.:::. .: ..  .. .  . ...        :. 
CCDS58 KFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGE--------LGL
           600       610       620       630       640             

     700       710       720       730       740       750         
pF1KB8 AEQLCIARQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKAN
       ...: :: :.:.::.::. ..:::::::::::::: :..:::.:::.::..::.:::...
CCDS58 SQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVG
         650       660       670       680       690       700     

     760       770       780       790       800       810         
pF1KB8 ENDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGN
        .  .::::::::::.: ..:::::::..::.:::::.:: ::.. ... :::  . .: 
CCDS58 GHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGR
         710       720       730       740       750       760     

     820       830       840       850       860           
pF1KB8 ILSCPENCPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV  
       .:  :. :: :.:..:  ::.. : .: ..  :..::. .            
CCDS58 VLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
         770       780       790       800       810       

>>CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15              (825 aa)
 initn: 1056 init1: 636 opt: 814  Z-score: 347.6  bits: 75.4 E(32554): 4.8e-13
Smith-Waterman score: 922; 44.5% identity (73.5% similar) in 310 aa overlap (551-859:513-813)

              530       540       550       560        570         
pF1KB8 RKQWKNKKRESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLN-PKLLSLEYPRNNIEYVR
                                     ::.: :.    . :     .  : .:   :
CCDS10 HINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKR
            490       500       510       520       530       540  

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pF1KB8 DIGEGAFGRVFQARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIV
       ..::::::.:: :.  .: : .   .:::: ::. . :  . :::::: :...... .::
CCDS10 ELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLA-ARKDFQREAELLTNLQHEHIV
            550       560       570       580        590       600 

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pF1KB8 KLLGVCAVGKPMCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSC
       :. :::. : :. ..:::: .::::.:::. .: ..  .. .  . ...        :. 
CCDS10 KFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGE--------LGL
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pF1KB8 AEQLCIARQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKAN
       ...: :: :.:.::.::. ..:::::::::::::: :..:::.:::.::..::.:::...
CCDS10 SQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVG
           660       670       680       690       700       710   

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pF1KB8 ENDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGN
        .  .::::::::::.: ..:::::::..::.:::::.:: ::.. ... :::  . .: 
CCDS10 GHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGR
           720       730       740       750       760       770   

     820       830       840       850       860           
pF1KB8 ILSCPENCPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV  
       .:  :. :: :.:..:  ::.. : .: ..  :..::. .            
CCDS10 VLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
           780       790       800       810       820     

>>CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5                (762 aa)
 initn: 874 init1: 566 opt: 798  Z-score: 341.8  bits: 74.2 E(32554): 1e-12
Smith-Waterman score: 812; 28.7% identity (52.1% similar) in 781 aa overlap (115-859:30-706)

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB8 TILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTT
                                     :.  . :.. .   .. .  :  . : :  
CCDS44  MRLLLALLGVLLSVPGPPVLSLEASEEVELEPCLAPSLEQQEQELTVALGQPVRLCC--
                10        20        30        40        50         

          150       160       170       180       190              
pF1KB8 MGNPKPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSL--------
        :  . .  : :  : :   .:.   . : :.: .   ::::.: :.:..:.        
CCDS44 -GRAERGGHWYKEGSRLAPAGRVRGWR-GRLEIASFLPEDAGRYLCLARGSMIVLQNLTL
         60        70        80         90       100       110     

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pF1KB8 --GTAYS--------KVVKLEVEVFARILRAP----------ESHNVTFGSFVTLHCTAT
         : . .        :  .   .  .   .::          . : :  :. : ..: :.
CCDS44 ITGDSLTSSNDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQAPYWTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKFRCPAA
         120       130       140       150       160       170     

        240       250       260       270          280       290   
pF1KB8 GIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKP---GLYTCIATNKHGEKFS
       : :.::: :...:.:  . .   ... :     : .  . :   : :::.. :  :    
CCDS44 GNPTPTIRWLKDGQAFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAVG----
         180       190       200       210       220       230     

           300       310         320       330       340       350 
pF1KB8 TAKAAATISIAEWSKPQKD--NKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPEEAQELL
       . .    ... : : :..   . :  :.      .::...: . .:   :.:   ::   
CCDS44 SIRYNYLLDVLERS-PHRPILQAGLPAN-----TTAVVGSD-VELLCKVYSD---AQP--
             240        250            260        270              

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB8 VHTAWNELKVVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSPGVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWL
        :  : .  :..     .:...   ....  .  .  . . .     .....   : :. 
CCDS44 -HIQWLKHIVING-SSFGADGFPYVQVLK--TADINSSEVEVLYLRNVSAED---AGEYT
      280       290        300         310       320          330  

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pF1KB8 VMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLPHLDYNKENLKTFPPMTSSKP
        .  ..    :.:    :.:     ::.        .:.:::  ..      :   ...:
CCDS44 CLAGNSIGLSYQSAW--LTV-----LPGT-------GRIPHLTCDS----LTPAGRTKSP
            340         350                   360           370    

             480       490       500       510       520       530 
pF1KB8 SVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRES
       .... .: :.::.. : : . ..      .:: .  .:  ...:                
CCDS44 TLQF-SLESGSSGKSSSSLVRGVR-----LSSSGPALLAGLVSL----------------
           380       390            400       410                  

             540       550       560       570       580       590 
pF1KB8 AAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQ
              ::    ::     :..              :.::. .   . .::: ::.: .
CCDS44 ------DLP----LD-----PLW--------------EFPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVR
                           420                     430       440   

             600         610       620       630        640        
pF1KB8 ARAPGLLPYEP--FTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFD-NPNIVKLLGVCAVG
       :.: :. : .:   . :::::::..::    ::.  :  .:  .  . ::..:::::.  
CCDS44 AEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLGVCTQE
           450       460       470       480       490       500   

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pF1KB8 KPMCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQ
        :. .. :  : :.: ::::.  :         :::  .  :: :  :::    .  : :
CCDS44 GPLYVIVECAAKGNLREFLRARRP------PGPDLSPDGPRSSEG--PLSFPVLVSCAYQ
           510       520             530       540         550     

      710       720       730       740       750       760        
pF1KB8 VAAGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRW
       :: :: ::  :: .:::::.:: :: :. :.:::::::.:...  :::: . :  .:..:
CCDS44 VARGMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKTSNGRLPVKW
         560       570       580       590       600       610     

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pF1KB8 MPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCP
       : ::..:   :: .::::..:..:::::. : .:: :.  ::..  .:.:. .. : .::
CCDS44 MAPEALFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSLLREGHRMDRPPHCP
         620       630       640       650       660       670     

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pF1KB8 VELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV                   
        :::.::: ::   :..::.: .. . :...                             
CCDS44 PELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVLLAVSEEYLDLRLTFGPYSPSGGDASSTC
         680       690       700       710       720       730     

CCDS44 SSSDSVFSHDPLPLGSSSFPFGSGVQT
         740       750       760  

>>CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5                (802 aa)
 initn: 868 init1: 566 opt: 798  Z-score: 341.6  bits: 74.2 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 835; 28.3% identity (52.2% similar) in 781 aa overlap (115-859:30-746)

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB8 TILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTT
                                     :.  . :.. .   .. .  :  . : :  
CCDS44  MRLLLALLGVLLSVPGPPVLSLEASEEVELEPCLAPSLEQQEQELTVALGQPVRLCC--
                10        20        30        40        50         

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pF1KB8 MGNPKPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSL--------
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CCDS44 -GRAERGGHWYKEGSRLAPAGRVRGWR-GRLEIASFLPEDAGRYLCLARGSMIVLQNLTL
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CCDS44 ITGDSLTSSNDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQAPYWTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKFRCPAA
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       : :.::: :...:.:  . .   ... :     : .  . :   : :::.. :  :    
CCDS44 GNPTPTIRWLKDGQAFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAVG----
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pF1KB8 TAKAAATISIAEWSKPQKD--NKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPEEAQELL
       . .    ... : : :..   . :  :.      .::...: . .:   :.:   ::   
CCDS44 SIRYNYLLDVLERS-PHRPILQAGLPAN-----TTAVVGSD-VELLCKVYSD---AQP--
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pF1KB8 VHTAWNELKVVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSPGVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWL
        :  : .  :..     .:...   ....  .  .  . . .     .....   : :. 
CCDS44 -HIQWLKHIVING-SSFGADGFPYVQVLK--TADINSSEVEVLYLRNVSAED---AGEYT
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        .  ..  ::  .   :  .::         :::  :  :.  :.  ..  .   . .  
CCDS44 CLAGNSI-GLSYQSAWLTVLPEE--------DPTWTAAAPEARYT--DIILYASGSLALA
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pF1KB8 SVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRES
        . .      ...  .  :    ::  . .: : .   ... .       .. :...   
CCDS44 VLLLLAGLYRGQALHGRHPRPPATV--QKLSRFPLARQFSLES------GSSGKSSSSLV
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        .: :..    ::   .        . : :.:     :.::. .   . .::: ::.: .
CCDS44 RGVRLSSSGPALLAGLV-------SLDLPLDPL---WEFPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVR
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       :.: :. : .:   . :::::::..::    ::.  :  .:  .  . ::..:::::.  
CCDS44 AEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLGVCTQE
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CCDS44 GPLYVIVECAAKGNLREFLRARRP------PGPDLSPDGPRSSEG--PLSFPVLVSCAYQ
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       :: :: ::  :: .:::::.:: :: :. :.:::::::.:...  :::: . :  .:..:
CCDS44 VARGMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKTSNGRLPVKW
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       : ::..:   :: .::::..:..:::::. : .:: :.  ::..  .:.:. .. : .::
CCDS44 MAPEALFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSLLREGHRMDRPPHCP
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CCDS44 PELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVLLAVSEEYLDLRLTFGPYSPSGGDASSTC
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CCDS44 SSSDSVFSHDPLPLGSSSFPFGSGVQT
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       ::::::..::    ::.  :  .:  .  . ::..:::::.   :. .. :  : :.: :
CCDS78 AVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLGVCTQEGPLYVIVECAAKGNLRE
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CCDS78 FLRARRP------PGPDLSPDGPRSSEG--PLSFPVLVSCAYQVARGMQYLESRKCIHRD
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CCDS78 RPTFKQLVEALDKVLLAVSEEYLDLRLTFGPYSPSGGDASSTCSSSDSVFSHDPLPLGSS
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>>CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6                  (876 aa)
 initn: 760 init1: 386 opt: 776  Z-score: 332.5  bits: 72.7 E(32554): 3.3e-12
Smith-Waterman score: 776; 40.9% identity (67.2% similar) in 308 aa overlap (568-856:566-868)

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CCDS46 DIVTLQGVTGGNTYAVPALPPGAVGDGPPRVDFPRSRLRFKEKLGEGQFGEVHLCEVDSP
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         :    : .         ::::.:. .:. . . :: .:. .:... .:::..:::::.
CCDS46 QDLVSLDFPLNVRKGHPLLVAVKILRPDATKNARNDFLKEVKIMSRLKDPNIIRLLGVCV
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CCDS46 QDDPLCMITDYMENGDLNQFL---SAHQLEDKAAEGAPGDGQ-AAQGPT-ISYPMLLHVA
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CCDS46 AQIASGMRYLATLNFVHRDLATRNCLVGENFTIKIADFGMSRNLYAGDYYRVQGRAVLPI
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CCDS46 VYLSRPPACPQGLYELMLRCWSRESEQRPPFSQLHRFLAEDALNTV     
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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