Result of FASTA (ccds) for pF1KE3300
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3300, 2555 aa
  1>>>pF1KE3300 2555 - 2555 aa - 2555 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8361+/-0.00166; mu= -2.1274+/- 0.100
 mean_var=571.3297+/-113.296, 0's: 0 Z-trim(111.9): 261  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.053658
 statistics sampled from 12497 (12745) to 12497 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.392), width:  16
 Scan time:  7.150

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9         (2555) 18971 1486.4       0
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1           (2471) 6853 548.3 1.8e-154
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19        (2321) 5428 437.9 2.8e-121
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6         (2003) 2659 223.5 8.7e-57
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          (3144) 1663 146.6 1.9e-33
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          (3165) 1663 146.6 1.9e-33
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20           (1218) 1509 134.2   4e-30
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5           (2912) 1494 133.5 1.5e-29
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1200) 1259 114.9 2.6e-24
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1238) 1247 114.0 5.1e-24
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          ( 870) 1091 101.7 1.8e-20
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1           (1406) 1091 101.9 2.4e-20
CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2          ( 737) 1013 95.6   1e-18
CCDS58053.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          (1382) 1014 96.0 1.5e-18
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6           ( 723) 1001 94.6   2e-18
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15         ( 685)  945 90.3 3.8e-17
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9         (3571)  959 92.2 5.2e-17
CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15          (2871)  896 87.2 1.3e-15
CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9          (1285)  885 85.9 1.4e-15
CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1557)  857 83.9 7.3e-15
CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1587)  857 83.9 7.4e-15
CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1624)  857 83.9 7.5e-15
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10          (1534)  776 77.6 5.6e-13
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15       (1044)  760 76.2   1e-12
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5          (1530)  740 74.8 3.8e-12
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2         (1413)  739 74.7 3.8e-12
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1521)  731 74.1 6.2e-12
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1525)  731 74.1 6.2e-12
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4           (1529)  731 74.1 6.2e-12
CCDS53454.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          (1294)  728 73.8 6.6e-12
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5           (1523)  723 73.5 9.5e-12
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19         ( 587)  678 69.5 5.8e-11
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19         ( 618)  678 69.5   6e-11
CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19         (2809)  693 71.5   7e-11


>>CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9              (2555 aa)
 initn: 18971 init1: 18971 opt: 18971  Z-score: 7956.2  bits: 1486.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 18971; 100.0% identity (100.0% similar) in 2555 aa overlap (1-2555:1-2555)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCSQPGETCLNGGKCEAANGTEACVCGGAFVGPRCQDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCSQPGETCLNGGKCEAANGTEACVCGGAFVGPRCQDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 NPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPLDNACLTNPCRNGGTCDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPLDNACLTNPCRNGGTCDLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 TLTEYKCRCPPGWSGKSCQQADPCASNPCANGGQCLPFEASYICHCPPSFHGPTCRQDVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLTEYKCRCPPGWSGKSCQQADPCASNPCANGGQCLPFEASYICHCPPSFHGPTCRQDVN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 ECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCRPTGDVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCRPTGDVT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 HECACLPGFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HECACLPGFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 LMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 CPHGRTGLLCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVDECSLGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CPHGRTGLLCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVDECSLGA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 NPCEHAGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NPCEHAGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 GYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECASTPCKNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECASTPCKNG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 AKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHC
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 ETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSGTCLDKID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSGTCLDKID
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 GYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNEC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 NSNPCVHGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTSGYVCTCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NSNPCVHGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTSGYVCTCR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 EGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSPCRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSPCRN
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 GGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRCHCQAGYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRCHCQAGYS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 GRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGANC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGANC
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 TDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGFTGSYCQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGFTGSYCQH
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 DVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 YRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 YCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQNGGTCLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQNGGTCLD
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 LPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSCTCPPGFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSCTCPPGFV
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 GERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECRAGHTGRRCESVINGCKGKPCKNGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECRAGHTGRRCESVINGCKGKPCKNGG
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 TCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCLCLGPFTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCLCLGPFTG
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 PECQFPASSPCLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFGGGAGRDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PECQFPASSPCLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFGGGAGRDI
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE3 PPPLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQSLQCWKYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPPLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQSLQCWKYF
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 SDGHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRAEGQCNPLYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAECEWDGLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDGHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRAEGQCNPLYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAECEWDGLD
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 CAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSFHFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQQMIFPYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSFHFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQQMIFPYY
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 GREEELRKHPIKRAAEGWAAPDALLGQVKASLLPGGSEGGRRRRELDPMDVRGSIVYLEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GREEELRKHPIKRAAEGWAAPDALLGQVKASLLPGGSEGGRRRRELDPMDVRGSIVYLEI
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE3 DNRQCVQASSQCFQSATDVAAFLGALASLGSLNIPYKIEAVQSETVEPPPPAQLHFMYVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DNRQCVQASSQCFQSATDVAAFLGALASLGSLNIPYKIEAVQSETVEPPPPAQLHFMYVA
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE3 AAAFVLLFFVGCGVLLSRKRRRQHGQLWFPEGFKVSEASKKKRREPLGEDSVGLKPLKNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AAAFVLLFFVGCGVLLSRKRRRQHGQLWFPEGFKVSEASKKKRREPLGEDSVGLKPLKNA
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE3 SDGALMDDNQNEWGDEDLETKKFRFEEPVVLPDLDDQTDHRQWTQQHLDAADLRMSAMAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDGALMDDNQNEWGDEDLETKKFRFEEPVVLPDLDDQTDHRQWTQQHLDAADLRMSAMAP
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE3 TPPQGEVDADCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEEEDAPAVISDFIYQGASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TPPQGEVDADCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEEEDAPAVISDFIYQGASL
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KE3 HNQTDRTGETALHLAARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVSADAQGVFQIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HNQTDRTGETALHLAARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVSADAQGVFQIL
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KE3 IRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVDDLGKSALHWAAAVNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVDDLGKSALHWAAAVNN
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KE3 VDAAVVLLKNGANKDMQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANRDITDHMDRLPRDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VDAAVVLLKNGANKDMQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANRDITDHMDRLPRDI
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

             2110      2120      2130      2140      2150      2160
pF1KE3 AQERMHHDIVRLLDEYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGYLGSLKPGVQGKKVRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AQERMHHDIVRLLDEYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGYLGSLKPGVQGKKVRK
             2110      2120      2130      2140      2150      2160

             2170      2180      2190      2200      2210      2220
pF1KE3 PSSKGLACGSKEAKDLKARRKKSQDGKGCLLDSSGMLSPVDSLESPHGYLSDVASPPLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSSKGLACGSKEAKDLKARRKKSQDGKGCLLDSSGMLSPVDSLESPHGYLSDVASPPLLP
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

             2230      2240      2250      2260      2270      2280
pF1KE3 SPFQQSPSVPLNHLPGMPDTHLGIGHLNVAAKPEMAALGGGGRLAFETGPPRLSHLPVAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPFQQSPSVPLNHLPGMPDTHLGIGHLNVAAKPEMAALGGGGRLAFETGPPRLSHLPVAS
             2230      2240      2250      2260      2270      2280

             2290      2300      2310      2320      2330      2340
pF1KE3 GTSTVLGSSSGGALNFTVGGSTSLNGQCEWLSRLQSGMVPNQYNPLRGSVAPGPLSTQAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GTSTVLGSSSGGALNFTVGGSTSLNGQCEWLSRLQSGMVPNQYNPLRGSVAPGPLSTQAP
             2290      2300      2310      2320      2330      2340

             2350      2360      2370      2380      2390      2400
pF1KE3 SLQHGMVGPLHSSLAASALSQMMSYQGLPSTRLATQPHLVQTQQVQPQNLQMQQQNLQPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLQHGMVGPLHSSLAASALSQMMSYQGLPSTRLATQPHLVQTQQVQPQNLQMQQQNLQPA
             2350      2360      2370      2380      2390      2400

             2410      2420      2430      2440      2450      2460
pF1KE3 NIQQQQSLQPPPPPPQPHLGVSSAASGHLGRSFLSGEPSQADVQPLGPSSLAVHTILPQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NIQQQQSLQPPPPPPQPHLGVSSAASGHLGRSFLSGEPSQADVQPLGPSSLAVHTILPQE
             2410      2420      2430      2440      2450      2460

             2470      2480      2490      2500      2510      2520
pF1KE3 SPALPTSLPSSLVPPVTAAQFLTPPSQHSYSSPVDNTPSHQLQVPEHPFLTPSPESPDQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPALPTSLPSSLVPPVTAAQFLTPPSQHSYSSPVDNTPSHQLQVPEHPFLTPSPESPDQW
             2470      2480      2490      2500      2510      2520

             2530      2540      2550     
pF1KE3 SSSSPHSNVSDWSEGVSSPPTSMQSQIARIPEAFK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSSSPHSNVSDWSEGVSSPPTSMQSQIARIPEAFK
             2530      2540      2550     

>>CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1                (2471 aa)
 initn: 7358 init1: 4384 opt: 6853  Z-score: 2886.6  bits: 548.3 E(32554): 1.8e-154
Smith-Waterman score: 10140; 54.0% identity (74.7% similar) in 2564 aa overlap (2-2539:6-2443)

                   10        20        30        40         50     
pF1KE3     MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCSQPGETCLNGGKCEAA-NGTEACVCGGAFVGP
            : ::  :: : :  :  :.. .: .  : :.: : : .  :::  : :  .:.: 
CCDS90 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGE
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100        110    
pF1KE3 RCQDPNPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPLDNACLTN-PCRNG
        ::  .:: .. :.:.:::  : .  ..  .: :: ::.:  :    .. :... :: ::
CCDS90 YCQHRDPCEKNRCQNGGTC--VAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNG
               70          80        90       100       110        

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE3 GTCDLLTLTEYKCRCPPGWSGKSCQQADPCASNPCANGGQCLPFEASYICHCPPSFHGPT
       ::: .:.   :.: :  :..:: :: .: : :.:::::. :     .. :.:  .: :  
CCDS90 GTCHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQK
      120       130       140       150       160       170        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KE3 CRQDVNECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCR
       :. ::::: . :: :.::::: :  :::.: :    ::  :.  ::::.:::: ::::::
CCDS90 CETDVNEC-DIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCR
      180        190       200       210       220       230       

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE3 PTGDVTHECACLPGFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTE
        ::: : :: ::::: :..::.::::::.. :.:::.::::::::::::::.::::.:::
CCDS90 QTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTE
       240       250       260       270       280       290       

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE3 DVDECQLMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRV
       ::::: :.:::::::::: : .:::.:::::::.:.:::::::::: :.:  :.:: :::
CCDS90 DVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRV
       300       310       320       330       340       350       

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE3 ASFYCECPHGRTGLLCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVD
       ::: : ::.:..::::::.::::::::..:. :::::.::. :::::.:: :  :..:::
CCDS90 ASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVD
       360       370       380       390       400       410       

           420       430       440       450       460       470   
pF1KE3 ECSLG-ANPCEHAGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGE
       ::... .:::::::::.:: :.:.:.::.::.:::::.:.::: :.::::::::::.:: 
CCDS90 ECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGG
       420       430       440       450       460       470       

           480       490       500       510       520       530   
pF1KE3 FQCICMPGYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECA
       : :.::::..:::::.. .:: :.::..::.:.::.:.::: :: :::: .:: :.:.:.
CCDS90 FTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCS
       480       490       500       510       520       530       

           540       550       560       570       580       590   
pF1KE3 STPCKNGAKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGVATFTCLCRP
       :::: :::::.: :: : : :. :.::. :: .::.:::::::.:.:.::. ..::.: :
CCDS90 STPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNP
       540       550       560       570       580       590       

           600       610       620       630       640       650   
pF1KE3 GYTGHHCETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSG
       :: :  :  .:.:: :.:: . : : :  :.: : :  ::.: :::::.:::::.::  :
CCDS90 GYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHG
       600       610       620       630       640       650       

           660       670       680       690       700       710   
pF1KE3 TCLDKIDGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTC
        :.: :. : :.: ::.::. :::.:::::.:::..:.:: .:.::: : :::: : :.:
CCDS90 ICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSC
       660       670       680       690       700       710       

           720       730       740       750       760       770   
pF1KE3 LSEVNECNSNPCVHGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTS
        :.:::: ::::.:: :  .:.:::: :: :: : ::....::: :::: ::::: ....
CCDS90 YSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVN
       720       730       740       750       760       770       

           780       790       800       810       820       830   
pF1KE3 GYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPC
       :: :::..::.: :::.::.:::::::::::::.::..:: :.:.::::: .:..:::::
CCDS90 GYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCFDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPC
       780       790       800       810       820       830       

           840       850       860       870       880       890   
pF1KE3 APSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRC
       .:.::.:.. :..: ..::..:.:  ::::: : .::.::. .:: . . :.::.:.: :
CCDS90 SPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMC
       840       850       860       870       880       890       

           900       910       920       930       940       950   
pF1KE3 HCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDP
       .:  :.:: .:: :::::  :::.::::: ::.::  : ::::: :  :. :.::: :.:
CCDS90 ECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEP
       900       910       920       930       940       950       

           960       970       980       990      1000      1010   
pF1KE3 CRNGANCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGF
       :.::..:.: :.:::: : :::.:.:::::  .:::::::::::::::::::.:::: ::
CCDS90 CKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGF
       960       970       980       990      1000      1010       

          1020      1030      1040      1050      1060      1070   
pF1KE3 TGSYCQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGK
       :::.: :..:::.:.:::. ::: :: :.:::.:: :::: :::.::. :. ::::: : 
CCDS90 TGSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGT
      1020      1030      1040      1050      1060      1070       

          1080      1090      1100      1110      1120      1130   
pF1KE3 CWQTHTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRC
       : : ... .: :::::.: :::::.:::..::.:.:: : .::::.:.:..:::::.:.:
CCDS90 CVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQC
      1080      1090      1100      1110      1120      1130       

          1140      1150      1160      1170      1180      1190   
pF1KE3 QAGYTGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQ
         ::::::::. .:::. .:::.::::.:..::: :.:: ::.::::  :.::: ..:::
CCDS90 PLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQ
      1140      1150      1160      1170      1180      1190       

          1200      1210      1220      1230      1240      1250   
pF1KE3 NGGTCLDLPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSC
       :::::.:: : .::::: ::.:. :: :.:::       .:.:.:.:.: :.:..:::::
CCDS90 NGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDC-------ARGPHCLNGGQCMDRIGGYSC
      1200      1210      1220             1230      1240      1250

          1260      1270      1280      1290      1300      1310   
pF1KE3 TCPPGFVGERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECRAGHTGRRCESVINGCKG
        : :::.:::::::.::::::::...:. .:.: .::. : ::.. :::.::. .. :  
CCDS90 RCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQ
             1260      1270      1280      1290      1300      1310

          1320      1330      1340      1350      1360      1370   
pF1KE3 KPCKNGGTCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCL
        :: ::::::::::   ::::.:: :: :: :..   .::...: .:  :.    .: :.
CCDS90 MPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQS---SCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCF
             1320      1330      1340         1350      1360       

          1380      1390      1400      1410      1420      1430   
pF1KE3 CLGPFTGPECQFPASSPCLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFG
       : .:    .:.    : : ...:: . :.:.:  . :.: : :   :.:  :..  :.  
CCDS90 CPSPR---DCE----SGC-ASSPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCEL--YT--
      1370              1380      1390      1400      1410         

          1440      1450      1460      1470      1480      1490   
pF1KE3 GGAGRDIPPPLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQS
              ::     .:    : . : . ::.  ::.::: ::::::::....:: ::.. 
CCDS90 ------APPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSP
              1420      1430      1440      1450      1460         

          1500      1510      1520      1530      1540      1550   
pF1KE3 LQCWKYFSDGHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRAEGQCNPLYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAE
       : :: :... .::  ::.. ::::.:.::     :.  ::.:: :::.:.:::::::: :
CCDS90 LPCWDYINN-QCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCK--YDKYCADHFKDNHCDQGCNSEE
    1470       1480      1490      1500        1510      1520      

          1560      1570      1580      1590      1600      1610   
pF1KE3 CEWDGLDCAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSFHFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQ
       : :::::::   :: :: ::::.::::::::: ...  ::: :. .::::. .:::..:.
CCDS90 CGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGE
       1530      1540      1550      1560      1570      1580      

          1620       1630      1640      1650      1660      1670  
pF1KE3 QMIFPYYG-REEELRKHPIKRAAEGWAAPDALLGQVKASLLPGGSEGGRRRRELDPMDVR
        :..:::: .   ..:. . : .                 ::: .:          ..: 
CCDS90 LMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRS-----------------LPGEQE----------QEVA
       1590      1600                       1610                   

           1680      1690      1700      1710      1720      1730  
pF1KE3 GSIVYLEIDNRQCVQASSQCFQSATDVAAFLGALASLGSLNIPYKIEAVQSETVEPPPPA
       :: :.:::::::::: :..::...  .::.:.. :  :.:. :  . .: ::.. :   .
CCDS90 GSKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYP--LVSVVSESLTPER-T
    1620      1630      1640      1650      1660        1670       

           1740      1750      1760      1770       1780      1790 
pF1KE3 QLHFMYVAAAAFVLLFFVGCGVLLSRKRRRQHGQLWFPEGFKVS-EASKKKRREPLGEDS
       :: .. .:.:. ..::..  ::... ::.:.::.::.:::: .  .::..:::::.:.:.
CCDS90 QLLYL-LAVAVVIILFIILLGVIMA-KRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDA
       1680       1690      1700       1710      1720      1730    

             1800      1810        1820      1830      1840        
pF1KE3 VGLKPLK-NASDGALMDDNQNE-W-GDEDLETKKFRFEEPVVLPDLDDQTDHRQWTQQHL
       :::: :. ..:.. :.  . .: :  ::  . :: . :. ..: . ::  :.: ::::::
CCDS90 VGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHL
         1740      1750      1760      1770      1780      1790    

     1850       1860      1870      1880      1890      1900       
pF1KE3 DAADLRMS-AMAPTPPQGEVDADCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEE-EDA
       .:::.: . ..: ::::.: ..: .::::::::: ::::.::  ::. . .. .:. ::.
CCDS90 EAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDS
         1800      1810      1820      1830      1840      1850    

        1910      1920      1930      1940      1950      1960     
pF1KE3 PA-VISDFIYQGASLHNQTDRTGETALHLAARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPL
        : .:.:..::::::. ::::::: ::::::::::.:::::::.:.:::: :::::: ::
CCDS90 SANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPL
         1860      1870      1880      1890      1900      1910    

        1970      1980      1990      2000      2010      2020     
pF1KE3 HAAVSADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVD
       ::::.::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::. .::: .:::::::
CCDS90 HAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVD
         1920      1930      1940      1950      1960      1970    

        2030      2040      2050      2060      2070      2080     
pF1KE3 DLGKSALHWAAAVNNVDAAVVLLKNGANKDMQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFA
       : ::::::::::::::.:...:::::::.:::.:.:::::::::::::::.::.::::::
CCDS90 DHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFA
         1980      1990      2000      2010      2020      2030    

        2090      2100      2110      2120      2130      2140     
pF1KE3 NRDITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLLDEYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGY
       ::::::::::::::.:..::::::::::::::.. ::   :. :  : .::: .:.::  
CCDS90 NRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPP--GTVL--TSALSPVICGPNRS
         2040      2050      2060      2070          2080      2090

        2150      2160           2170       2180      2190         
pF1KE3 LGSLKPGVQGKKVRKPSSKG-----LACGSKEAKDLK-ARRKKSQDGKGCLLDSSGMLSP
       . :::   .::: :.::.:.     :   .::::: : .::::: . :  : .::  :::
CCDS90 FLSLKHTPMGKKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSP
             2100      2110      2120      2130      2140      2150

    2200      2210      2220        2230      2240       2250      
pF1KE3 VDSLESPHGYLSDVASPPLLPSP--FQQSPSVPLNHLPGMPDTHLGIGH-LNVAAKPEMA
       :::::::: :.::..: :.. ::  .: ::. :.    . : . .   : :. .   :: 
CCDS90 VDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPN-PM-LATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQ
             2160      2170      2180        2190      2200        

       2260      2270      2280      2290      2300      2310      
pF1KE3 ALGGGGRLAFETGPPRLSHLPVASGTSTVLGSSSGGALNFTVGGSTSLNGQCEWLSRLQS
        :. :.  .. .    :::  ..:      ::.:.:.:.        .    .:..:.. 
CCDS90 PLAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSP-----GSGSAGSLSRL----HPVPVPADWMNRMEV
     2210      2220      2230           2240          2250         

       2320      2330      2340      2350      2360      2370      
pF1KE3 GMVPNQYNPLRGSVAPGPLSTQAPSLQHGMVGPLHSSLAASALSQMMSYQGLPSTRLATQ
       .   .::: . : :        ::.  .:     : ..:             :..:    
CCDS90 N--ETQYNEMFGMVL-------APA--EG----THPGIA-------------PQSRPPEG
    2260        2270                   2280                   2290 

       2380      2390      2400      2410      2420      2430      
pF1KE3 PHLVQTQQVQPQNLQMQQQNLQPANIQQQQSLQPPPPPPQPHLGVSSAASGHLGRSFLSG
        :..  ..  :  . .:   : :     . :.  :   :::.     :..: :       
CCDS90 KHITTPREPLPPIVTFQ---LIP-----KGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPL-------
            2300         2310           2320      2330             

       2440        2450      2460       2470      2480      2490   
pF1KE3 EPSQADVQPLG--PSSLAVHTILPQESPALP-TSLPSSLVPPVTAAQFLTPPSQHSYSSP
        :.. ..  ..  ::     ...::..  .  : ::.    :...... ::::::::.: 
CCDS90 -PTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASS
        2340      2350      2360      2370      2380      2390     

            2500       2510      2520      2530      2540      2550
pF1KE3 --VDNTPSHQLQVP-EHPFLTPSPESPDQWSSSSPHSNVSDWSEGVSSPPTSMQSQIARI
         .. ::::. ..  :::.:::::::::::::::::: .::::. ..::           
CCDS90 NAAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHS-ASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRG
        2400      2410      2420      2430       2440      2450    

                        
pF1KE3 PEAFK            
                        
CCDS90 PGTHMSEPPHNNMQVYA
         2460      2470 

>>CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19             (2321 aa)
 initn: 5566 init1: 3565 opt: 5428  Z-score: 2290.7  bits: 437.9 E(32554): 2.8e-121
Smith-Waterman score: 8821; 50.9% identity (72.0% similar) in 2400 aa overlap (52-2385:33-2319)

              30        40        50        60         70        80
pF1KE3 PRCSQPGETCLNGGKCEAANGTEACVCGGAFVGPRCQDPNPCLS-TPCKNAGTCHVVDRR
                                     ..::    : :::. .:: :.: :  .  :
CCDS12 PGARGRRRRRRPMSPPPPPPPVRALPLLLLLAGPGAAAP-PCLDGSPCANGGRCTQLPSR
             10        20        30        40         50        60 

               90       100       110          120       130       
pF1KE3 GVADYACSCALGFSGPLCLTPLDNACLTNPCRNGGTCD---LLTLTEYKCRCPPGWSGKS
          . :: :  :. :  :   :.. : ..:: . :.:.   .   ....:::: :. : .
CCDS12 ---EAACLCPPGWVGERC--QLEDPCHSGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRCPRGFRGPD
                 70          80        90       100       110      

       140       150        160       170       180        190     
pF1KE3 CQQADPCASNPCANGGQC-LPFEASYICHCPPSFHGPTCRQDVNECG-QKPGLCRHGGTC
       :.  ::: :.:::.:..: .  .. ..: :::...: .::.::.::   .:  :::::::
CCDS12 CSLPDPCLSSPCAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEP--CRHGGTC
        120       130       140       150       160         170    

         200       210       220       230       240       250     
pF1KE3 HNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCRPTGDVTHECACLPGFTGQNCE
        :  ::.:: : : .::: :: : :::.::::.:::::: .::.:..::::::: :::::
CCDS12 LNTPGSFRCQCPAGYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCRQSGDLTYDCACLPGFEGQNCE
          180       190       200       210       220       230    

         260       270       280       290       300       310     
pF1KE3 ENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCHNT
        :.:::::. : :::.::::::::::.::::::::.::::::::::.::::.::::: ::
CCDS12 VNVDDCPGHRCLNGGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNT
          240       250       260       270       280       290    

         320       330       340       350       360       370     
pF1KE3 HGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCECPHGRTGLLCHLNDA
        ::..::::::::::.::.::::::.:.:::::::::::::::: :: :.:::::::.::
CCDS12 LGGHSCVCVNGWTGESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDA
          300       310       320       330       340       350    

         380       390       400       410       420       430     
pF1KE3 CISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVDECSLGANPCEHAGKCINTLGS
       :.::::.: . ::::::::.:::::: :.:: ::.:::::::.::::::: :.:.:: ::
CCDS12 CVSNPCHEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDVDECSIGANPCEHLGRCVNTQGS
          360       370       380       390       400       410    

         440       450       460       470       480       490     
pF1KE3 FECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGVHCEVNTDECA
       : ::: .:::::::: :::::.:.::.:.:::::.::.: :::: :. :..:::. ::: 
CCDS12 FLCQCGRGYTGPRCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDECQ
          420       430       440       450       460       470    

         500       510       520       530       540       550     
pF1KE3 SSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECASTPCKNGAKCLDGPNTYTCVCT
       ::::...: : :..: :.: ::.::.:  :: ::::::::::.:::::.: :. : : :.
CCDS12 SSPCVNGGVCKDRVNGFSCTCPSGFSGSTCQLDVDECASTPCRNGAKCVDQPDGYECRCA
          480       490       500       510       520       530    

         560       570       580       590       600       610     
pF1KE3 EGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHCETNINECSSQPCRHG
       ::. :: :. ..:.:.:::::.: : ::.:.:.: : ::::: .::....:: :::::::
CCDS12 EGFEGTLCDRNVDDCSPDPCHHGRCVDGIASFSCACAPGYTGTRCESQVDECRSQPCRHG
          540       550       560       570       580       590    

         620       630       640       650       660       670     
pF1KE3 GTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSGTCLDKIDGYECACEPGYTGSMC
       : : :  . ::: : .:::: :::.:.:::::.::  :.: : :. :.:.:.::.:: .:
CCDS12 GKCLDLVDKYLCRCPSGTTGVNCEVNIDDCASNPCTFGVCRDGINRYDCVCQPGFTGPLC
          600       610       620       630       640       650    

         680       690       700       710       720       730     
pF1KE3 NINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNECNSNPCVHGACRDSLN
       :..:.:::..:: .::.: :: ::: : :: :   : ::   . :  .:: :: : :. .
CCDS12 NVEINECASSPCGEGGSCVDGENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHEPCSHGICYDAPG
          660       670       680       690       700       710    

         740       750         760       770       780       790   
pF1KE3 GYKCDCDPGWSGTNCD--INNNECESNPCVNGGTCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNIN
       :..: :.:::::  :.  .  . :::.::  ::::..   :. :::  : .: .:.    
CCDS12 GFRCVCEPGWSGPRCSQSLARDACESQPCRAGGTCSSDGMGFHCTCPPGVQGRQCE----
          720       730       740       750       760       770    

           800       810       820       830       840       850   
pF1KE3 ECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESF
                                          .:.::.:.::..::.: .:   .  
CCDS12 -----------------------------------LLSPCTPNPCEHGGRC-ESAPGQLP
                                                 780        790    

           860       870        880       890       900       910  
pF1KE3 SCVCPTGWQGQTCEVDINECVL-SPCRHGASCQNTHGGYRCHCQAGYSGRNCETDIDDCR
        : :: ::::  :. :..::.  .::   . : :  :.. : :..::.: .:. ::.:: 
CCDS12 VCSCPQGWQGPRCQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDCD
          800       810       820       830       840       850    

            920       930       940       950       960       970  
pF1KE3 PNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGANCTDCVDSYTCTCP
       :::: ::::: ::...  :.::::: :  : .:..:: :.::  :. ::: : :.:::::
CCDS12 PNPCLNGGSCQDGVGSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPCGPGT-CTDHVASFTCTCP
          860       870       880       890       900        910   

            980       990      1000      1010      1020      1030  
pF1KE3 AGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGFTGSYCQHDVNECDSQPCLH
        :..:.:::.. :::. ::::::::::::.:::.::: ::.::..:::... : :.::::
CCDS12 PGYGGFHCEQDLPDCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQHEADPCLSRPCLH
           920       930       940       950       960       970   

           1040      1050      1060      1070      1080      1090  
pF1KE3 GGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQYRCECPSGWTGL
       ::.:. .  ..:::: ...:::.::.:: ::. .::.:::.: :: .   : :: ::.: 
CCDS12 GGVCSAAHPGFRCTCLESFTGPQCQTLVDWCSRQPCQNGGRCVQTGA--YCLCPPGWSGR
           980       990      1000      1010      1020        1030 

           1100      1110      1120      1130      1140      1150  
pF1KE3 YCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGSYCEDLVDECSPS
        ::. :. :. :: . :: . .::: :: :::  ..:.: :  : :::.::. :: :  .
CCDS12 LCDIRSLPCREAAAQIGVRLEQLCQAGGQCVDEDSSHYCVCPEGRTGSHCEQEVDPCLAQ
            1040      1050      1060      1070      1080      1090 

           1160      1170      1180      1190      1200      1210  
pF1KE3 PCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQNGGTCLDLPNTYKCSCPRG
       :::.:.::  :.::: :.:. ::.: :: ...::: :.:::.::.:.::   : :::: :
CCDS12 PCQHGGTCRGYMGGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECASQPCQHGGSCIDLVARYLCSCPPG
            1100      1110      1120      1130      1140      1150 

           1220      1230      1240      1250      1260      1270  
pF1KE3 TQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSCTCPPGFVGERCEGDVNECL
       : :: :::: :::.:   :.. .:.:..:::::: :::. ::::::..: :::.:.::: 
CCDS12 TLGVLCEINEDDCGPG-PPLDSGPRCLHNGTCVDLVGGFRCTCPPGYTGLRCEADINECR
            1160       1170      1180      1190      1200      1210

           1280      1290       1300      1310      1320      1330 
pF1KE3 SNPCDARGTQNCVQRVND-FHCECRAGHTGRRCESVINGCKGKPCKNGGTCAVASNTARG
       :. : :  :..:.:  .  :.: :.:: .: ::..:.. :...::..:: :  . . . :
CCDS12 SGACHAAHTRDCLQDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTVLSPCESQPCQHGGQCRPSPGPGGG
             1220      1230      1240      1250      1260      1270

              1340      1350      1360      1370      1380         
pF1KE3 --FICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCLCLGPFTGPECQ-FPAS
         : :.:   : :  ::  ::.:  :.:  :  : . ::.: : :   ..:: :. ::.:
CCDS12 LTFTCHCAQPFWGPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQTPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGS
             1280      1290      1300      1310      1320      1330

     1390            1400      1410      1420      1430      1440  
pF1KE3 SP------CLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFGGGAGRDIPP
        :      : .. :: . :.:.:.  .::.:: :   ..:  :.         :    : 
CCDS12 PPGASNASC-AAAPCLHGGSCRPAPLAPFFRCACAQGWTGPRCE---------APAAAPE
              1340      1350      1360      1370               1380

           1450      1460      1470      1480      1490      1500  
pF1KE3 PLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQSLQCWKYFSD
          :  :    ::   :.. :. .::. .::::::::::. .:::..: ..::::. :..
CCDS12 VSEEPRCPRAACQAKRGDQRCDRECNSPGCGWDGGDCSLSVGDPWRQC-EALQCWRLFNN
             1390      1400      1410      1420       1430         

           1510      1520        1530      1540      1550      1560
pF1KE3 GHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRA--EGQCNPLYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAECEWDGLD
       ..::  :.: .::.:.:::. .  :  :::.:..:: :::.::.::::::. :: :::::
CCDS12 SRCDPACSSPACLYDNFDCHAGGRERTCNPVYEKYCADHFADGRCDQGCNTEECGWDGLD
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 CAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSFHFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQQMIFPYY
       :: .::  :: :.::..::.:::.:  ::  ::..:: .:.:.. :. ::::: :.:::.
CCDS12 CASEVPALLARGVLVLTVLLPPEELLRSSADFLQRLSAILRTSLRFRLDAHGQAMVFPYH
    1500      1510      1520      1530      1540      1550         

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 GREEELRKHPIKRAAEGWAAPDALLGQVKASLLPGGSEGGRRRRELDPMDVRGSIVYLEI
             :  :                         :::  : :::: : .: ::.:.:::
CCDS12 ------RPSP-------------------------GSEP-RARRELAP-EVIGSVVMLEI
          1560                                1570       1580      

               1690      1700      1710      1720      1730        
pF1KE3 DNRQCVQA--SSQCFQSATDVAAFLGALASLGSLNIPYKIEAVQSETVEPPPPAQLHFMY
       ::: :.:.  ...:: .: ..: .::::...  :..:: .. :..: .::: :.   .  
CCDS12 DNRLCLQSPENDHCFPDAQSAADYLGALSAVERLDFPYPLRDVRGEPLEPPEPSVPLLPL
       1590      1600      1610      1620      1630      1640      

     1740      1750      1760      1770         1780      1790     
pF1KE3 VAAAAFVLLFFVGCGVLLSRKRRRQHGQLWFPEGFKVSE---ASKKKRREPLGEDSVGLK
       ..:.: .:: ..  ::...: :.:.:. :::::::.. .   ...: ::::.:.:..:.:
CCDS12 LVAGAVLLLVILVLGVMVAR-RKREHSTLWFPEGFSLHKDVASGHKGRREPVGQDALGMK
       1650      1660       1670      1680      1690      1700     

        1800      1810       1820      1830      1840      1850    
pF1KE3 PLKNASDGALMDDNQNEWGDEDL-ETKKFRFEEPVVLPDLDDQTDHRQWTQQHLDAADLR
        .  :.  .:: .  ..: : .  :.:... ::: .    .. .: :::::.:: :::.:
CCDS12 NM--AKGESLMGEVATDWMDTECPEAKRLKVEEPGM--GAEEAVDCRQWTQHHLVAADIR
          1710      1720      1730        1740      1750      1760 

          1860      1870      1880      1890      1900         1910
pF1KE3 MS-AMAPTPPQGEVDADCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEEE--DAPA-VI
       .. ::: :::::..::: :::::::::::::::.::  ::.::   .::.:  :. : .:
CCDS12 VAPAMALTPPQGDADADGMDVNVRGPDGFTPLMLASFCGGALEPMPTEEDEADDTSASII
            1770      1780      1790      1800      1810      1820 

             1920      1930      1940      1950      1960      1970
pF1KE3 SDFIYQGASLHNQTDRTGETALHLAARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVS
       ::.: :::.:  .:::::::::::::::.:.:::::::.:.::.: ::. ::::::.::.
CCDS12 SDLICQGAQLGARTDRTGETALHLAARYARADAAKRLLDAGADTNAQDHSGRTPLHTAVT
            1830      1840      1850      1860      1870      1880 

             1980      1990      2000      2010      2020      2030
pF1KE3 ADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVDDLGKS
       ::::::::::::::.::::::: ::.: ::::::::::::.:.:: :::::::::.::::
CCDS12 ADAQGVFQILIRNRSTDLDARMADGSTALILAARLAVEGMVEELIASHADVNAVDELGKS
            1890      1900      1910      1920      1930      1940 

             2040      2050      2060      2070      2080      2090
pF1KE3 ALHWAAAVNNVDAAVVLLKNGANKDMQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANRDIT
       :::::::::::.:...:::::::::::...:::::::::::::::.::.::::::::.::
CCDS12 ALHWAAAVNNVEATLALLKNGANKDMQDSKEETPLFLAAREGSYEAAKLLLDHFANREIT
            1950      1960      1970      1980      1990      2000 

             2100      2110      2120      2130      2140      2150
pF1KE3 DHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLLDEYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGYLGSLK
       ::.::::::.::::.:.:::::::. .  :::    .: :    :.: :: :...: .::
CCDS12 DHLDRLPRDVAQERLHQDIVRLLDQPSGPRSPP---GPHG----LGPLLCPPGAFLPGLK
            2010      2020      2030             2040      2050    

              2160       2170      2180      2190      2200        
pF1KE3 PGVQG-KKVRKPSSK-GLACGSKEAKDLKARRKKSQDGKGCLLDSSGMLSPVDSLESPHG
        . .: :: :.: .: ::.  . ...     .: .    : : :::  :::::::.::. 
CCDS12 AAQSGSKKSRRPPGKAGLGPQGPRGRG----KKLTLACPGPLADSSVTLSPVDSLDSPRP
         2060      2070      2080          2090      2100      2110

     2210      2220          2230      2240                2250    
pF1KE3 YLSDVASPPLLP--SPFQQSPS--VPLNHLPGMPDTHLG----------IGHLNVAAKP-
       . .  :::  .:  .:.  . .  : : .: :   . ::          .: :: .: : 
CCDS12 FGGPPASPGGFPLEGPYAAATATAVSLAQLGGPGRAGLGRQPPGGCVLSLGLLNPVAVPL
             2120      2130      2140      2150      2160      2170

                2260      2270       2280       2290      2300     
pF1KE3 EMAAL------GGGGRLAFETGPPRLSH-LPVASGTSTV-LGSSSGGALNFTVGGSTSLN
       . : :      : .  : .  ::  :.   ::.         .  : . .. ..:. :  
CCDS12 DWARLPPPAPPGPSFLLPLAPGPQLLNPGTPVSPQERPPPYLAVPGHGEEYPAAGAHSSP
             2180      2190      2200      2210      2220      2230

        2310         2320       2330           2340      2350      
pF1KE3 GQCEWLSRLQSG---MVPNQYNPLR-GSVAPGPLS-----TQAPSLQHGMVGPLHSSLAA
        . ..: :. :    ..:.  .: . .: .:  ::     : .:.   : ..   ..: :
CCDS12 PKARFL-RVPSEHPYLTPSPESPEHWASPSPPSLSDWSESTPSPATATGAMATTTGALPA
              2240      2250      2260      2270      2280         

       2360       2370      2380      2390      2400      2410     
pF1KE3 SALS-QMMSYQGLPSTRLATQPHLVQTQQVQPQNLQMQQQNLQPANIQQQQSLQPPPPPP
       . :  .. :  .  .:.:. ::...  .::                              
CCDS12 QPLPLSVPSSLAQAQTQLGPQPEVTPKRQVLA                            
    2290      2300      2310      2320                             

>>CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6              (2003 aa)
 initn: 2706 init1: 819 opt: 2659  Z-score: 1133.0  bits: 223.5 E(32554): 8.7e-57
Smith-Waterman score: 5389; 37.1% identity (57.4% similar) in 2345 aa overlap (2-2281:3-1998)

                10        20           30        40         50     
pF1KE3  MPPLLAPLLCLALLPALAARGPR---CSQPGETCLNGGKCEAAN-GTEACVCGGAFVGP
         :: :  :: : ::  ...  ::   :..  : : ::: : . . :  .: :. .:.: 
CCDS34 MQPPSLLLLLLLLLLLCVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFLGE
               10        20        30        40        50        60

          60         70        80                  90       100    
pF1KE3 RCQDPNPCLSTP-CKNAGTCHVVDRRGVA----------DYACSCALGFSGPLCLTPLDN
        :: :.:: ..  :.:.:.:...    ..          .. :.:  ::.:  : . :..
CCDS34 TCQFPDPCQNAQLCQNGGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKLED
               70        80        90       100       110       120

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE3 ACLTNPCRNGGTCDLLTLTEYKCRCPPGWSGKSCQQADPCASNPCANGGQCLPFEASYIC
        :  . : . : : . .  . .: : :::.:..::  : :..:::.::: ::    .  :
CCDS34 PCPPSFCSKRGRCHIQASGRPQCSCMPGWTGEQCQLRDFCSANPCVNGGVCLATYPQIQC
              130       140       150       160       170       180

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE3 HCPPSFHGPTCRQDVNECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSP
       ::::.:.: .:..::::: : :: : .: .::: .::..:.: . . :: ::    :: :
CCDS34 HCPPGFEGHACERDVNECFQDPGPCPKGTSCHNTLGSFQCLCPVGQEGPRCELRAGPCPP
              190       200       210       220       230       240

          230         240        250       260       270       280 
pF1KE3 SPCQNGGTCR--PTGDVT-HECACLPGFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNC
         :.:::::.  :  : : : : : ::: : .:: : :.: ...:.:::.: ::..::.:
CCDS34 RGCSNGGTCQLMPEKDSTFHLCLCPPGFIGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTCQDGLDTYTC
              250       260       270       280       290       300

             290       300        310       320       330       340
pF1KE3 RCPPEWTGQYCTEDVDECQLM-PNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCA
        ::  :::  :.::::::. . :  :.:::::.:. :...::::.:: : .: ::.::: 
CCDS34 LCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAGSFHCVCVSGWGGTSCEENLDDCI
              310       320       330       340       350       360

              350       360       370       380       390       400
pF1KE3 SAACFHGATCHDRVASFYCECPHGRTGLLCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTC
       .:.:  :.:: :::.:: : :: :::::::::.: :.:.::.  ..:.:::..:...: :
CCDS34 AATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLCHLEDMCLSQPCHGDAQCSTNPLTGSTLCLC
              370       380       390       400       410       420

              410          420       430       440       450       
pF1KE3 PSGYTGPACSQDVDECSL---GANPCEHAGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECV
         ::.::.: ::.::: .   : .::::.:.:.:: :::.: :  :::: ::: : :::.
CCDS34 QPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCEADHNECL
              430       440       450       460       470       480

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE3 SNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECP
       :.::.  .:::: .. :.:.: :: ::  :::.:.::::.:::... : : .: ::: : 
CCDS34 SQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADCHDLLNGFQCICL
              490       500       510       520       530       540

       520       530       540       550       560       570       
pF1KE3 TGFTGHLCQYDVDECASTPCKNGAKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHY
        ::.:  :. :.::: :.:: ::..: : :...           ::.             
CCDS34 PGFSGTRCEEDIDECRSSPCANGGQCQDQPGAF-----------HCK-------------
              550       560       570                              

       580       590       600       610       620       630       
pF1KE3 GSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHCETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPN
                    : ::. : .:.:...:: :.::  :..: :  .:..:.: .: ::  
CCDS34 -------------CLPGFEGPRCQTEVDECLSDPCPVGASCLDLPGAFFCLCPSGFTGQL
                     580       590       600       610       620   

       640       650       660       670       680       690       
pF1KE3 CEINLDDCASSPCDSGTCLDKIDGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGI
       ::. :                                       :: : :.    :.:  
CCDS34 CEVPL---------------------------------------CAPNLCQPKQICKDQK
                                                  630       640    

       700       710       720       730       740       750       
pF1KE3 NGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNECNSNPCVHGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNEC
       .  .: ::.:  .: :    ..:.   : :: :. :    .: :: ::.: .:. . . :
CCDS34 DKANCLCPDG--SPGCAPPEDNCT---CHHGHCQRS----SCVCDVGWTGPECEAELGGC
          650         660          670           680       690     

       760       770       780       790       800       810       
pF1KE3 ESNPCVNGGTCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNC
        : ::..::::  . ::: :::  :..::.:. ... : :.:::: :.:           
CCDS34 ISAPCAHGGTCYPQPSGYNCTCPTGYTGPTCSEEMTACHSGPCLNGGSC-----------
         700       710       720       730       740               

       820       830       840       850       860       870       
pF1KE3 LLPYTGATCEVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSP
                        :::                                        
CCDS34 ----------------NPSP----------------------------------------
                                                                   

       880       890       900       910       920       930       
pF1KE3 CRHGASCQNTHGGYRCHCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGF
                  ::: : :  ...: .:.:. : :   :: :::.:   .:       :: 
CCDS34 -----------GGYYCTCPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPCFNGGTC---VNR------PG-
                 750       760       770       780                 

       940       950       960       970       980        990      
pF1KE3 RGTFCEEDINECASDPCRNGANCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNT-PDCTESSCFNGG
                                   ...: :  ::.: .::..  :.:..: : : .
CCDS34 ----------------------------TFSCLCAMGFQGPRCEGKLRPSCADSPCRNRA
                                   790       800       810         

       1000      1010      1020      1030      1040      1050      
pF1KE3 TCVDGINSFTCLCPPGFTGSYCQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNC
       :: :.        : :                :              :: :: :::: .:
CCDS34 TCQDS--------PQG----------------P--------------RCLCPTGYTGGSC
     820                                             830       840 

       1060      1070      1080      1090      1100      1110      
pF1KE3 QNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLC
       :.:.  : ..::  ...: ::  ...: : .::::  :..:  ::. ::  ::.::. ::
CCDS34 QTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLSSCQKAALSQGIDVSSLC
             850       860       870       880       890       900 

       1120      1130      1140      1150      1160      1170      
pF1KE3 QHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYH
       ..::::::.: .. :.:  :. :: :.: :. :   ::::::::    .:: :.:. :: 
CCDS34 HNGGLCVDSGPSYFCHCPPGFQGSLCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAPGYD
             910       920       930       940       950       960 

       1180      1190      1200      1210      1220      1230      
pF1KE3 GVNCSEEIDECLSHPCQNGGTCLDLPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSP
       : :::.:.: : :.::.: :::   :                                  
CCDS34 GQNCSKELDACQSQPCHNHGTCTPKP----------------------------------
             970       980                                         

       1240      1250      1260      1270      1280      1290      
pF1KE3 KCFNNGTCVDQVGGYSCTCPPGFVGERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECR
                   ::. :.::::::: ::::::.:::..::   ::  : . .: :.:.: 
CCDS34 ------------GGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGTAACHSLANAFYCQCL
                   990      1000      1010      1020      1030     

       1300      1310      1320      1330      1340      1350      
pF1KE3 AGHTGRRCESVINGCKGKPCKNGGTCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLR
        ::::. ::  :. :...:: .:::: .....  ::::.:: :::: :: . : .::  .
CCDS34 PGHTGQWCEVEIDPCHSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAPSCGFHH
        1040      1050      1060      1070      1080      1090     

       1360         1370      1380       1390      1400        1410
pF1KE3 CLNGGTCISGPRS---PTCLCLGPFTGPECQFP-ASSPCLGGNPCYNQGTCEPTSE--SP
       : .:: :. .:.    : : ::. . ::.:  : : . :   .::  .:.:  :.   .:
CCDS34 CHHGGLCLPSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPCLYNGSCSETTGLGGP
        1100      1110      1120      1130      1140      1150     

             1420      1430      1440      1450      1460      1470
pF1KE3 FYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFGGGAGRDIPPPLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNH
        .:: :: .  :  :.       :. :                :.  .:. .:.  :.. 
CCDS34 GFRCSCPHSSPGPRCQK-----PGAKG----------------CEGRSGDGACDAGCSGP
        1160      1170                           1180      1190    

             1480      1490      1500      1510      1520      1530
pF1KE3 ACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQSLQCWKYFSDGHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRAEGQCNP
       . .::::::::.  ::::.: .  .::  : ::.:  ::.:  :::::.::.   . :.:
CCDS34 GGNWDGGDCSLGVPDPWKGCPSHSRCWLLFRDGQCHPQCDSEECLFDGYDCETPPA-CTP
         1200      1210      1220      1230      1240      1250    

             1540      1550      1560      1570      1580      1590
pF1KE3 LYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAECEWDGLDCAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSF
        :::::.::: .:::..:::.::: ::: ::  .  .   . .:...:.. :  : .. :
CCDS34 AYDQYCHDHFHNGHCEKGCNTAECGWDGGDCRPEDGDPEWGPSLALLVVLSPPALDQQLF
          1260      1270      1280      1290      1300      1310   

             1600      1610      1620      1630      1640      1650
pF1KE3 HFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQQMIFPYYGREEELRKHPIKRAAEGWAAPDALLGQVKA
        . : :: .:....  ..:  :..:..::          :  :: :  ..      : .:
CCDS34 ALARVLSLTLRVGLWVRKDRDGRDMVYPY----------PGARAEEKLGGTRDPTYQERA
          1320      1330      1340                1350      1360   

             1660      1670      1680        1690      1700        
pF1KE3 SLLPGGSEGGRRRRELDPMDVRGSIVYLEIDNRQCV--QASSQCFQSATDVAAFLGALAS
       .  :  .  :.   : : ... : .: . .:  .:   . .:.:  .   .  ::.:.:.
CCDS34 A--PQTQPLGK---ETDSLSA-GFVVVMGVDLSRCGPDHPASRCPWDPGLLLRFLAAMAA
            1370          1380      1390      1400      1410       

     1710        1720      1730       1740      1750        1760   
pF1KE3 LGSLN--IPYKIEAVQSETVEPPPPAQLHF-MYVAAAAFVLLFFVGCGVLLS--RKRRRQ
       .:.:.  .:  . ::. ..   ::  :: . .  . .: :.:. .:  ..:.  :.:::.
CCDS34 VGALEPLLPGPLLAVHPHAGTAPPANQLPWPVLCSPVAGVILLALGALLVLQLIRRRRRE
      1420      1430      1440      1450      1460      1470       

          1770         1780      1790      1800          1810      
pF1KE3 HGQLWFPEGFKV---SEASKKKRREPLGEDSVGLKPLKNAS----DGALMDDNQNEWGDE
       :: ::.: ::     .... ..:: ::::::.::: ::  .    ::..: .. .: :.:
CCDS34 HGALWLPPGFTRRPRTQSAPHRRRPPLGEDSIGLKALKPKAEVDEDGVVMCSGPEE-GEE
      1480      1490      1500      1510      1520      1530       

       1820      1830      1840      1850      1860      1870      
pF1KE3 DLETKKFRFEEPVVLPDLDDQTDHRQWTQQHLDAADLRMSAMAPTPPQGEVDADCMDVNV
         ...           .    .  . :. .   .: : ..::  :::: : . .  :...
CCDS34 VGQAE-----------ETGPPSTCQLWSLSGGCGA-LPQAAML-TPPQ-ESEMEAPDLDT
       1540                 1550      1560        1570       1580  

       1880      1890      1900       1910      1920      1930     
pF1KE3 RGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEEE-DAPAVISDFIYQGASLHNQTDRTGETALHLA
       ::::: :::: : : :  ...:. .      :     ..  ::  . .:  :::: ::::
CCDS34 RGPDGVTPLMSAVCCGE-VQSGTFQGAWLGCPEPWEPLLDGGACPQAHTVGTGETPLHLA
           1590       1600      1610      1620      1630      1640 

        1940      1950      1960      1970      1980      1990     
pF1KE3 ARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVSADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDG
       ::.::  ::.:::::.:. :  :  :::::::::.:::. : :.:.:.: : .::: .::
CCDS34 ARFSRPTAARRLLEAGANPNQPDRAGRTPLHAAVAADAREVCQLLLRSRQTAVDARTEDG
            1650      1660      1670      1680      1690      1700 

        2000      2010      2020      2030      2040      2050     
pF1KE3 TTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVDDLGKSALHWAAAVNNVDAAVVLLKNGANKD
       ::::.:::::::: ..:.:: ..:::.: :  ::.::::::::::. ::  ::. ::.::
CCDS34 TTPLMLAARLAVEDLVEELIAAQADVGARDKWGKTALHWAAAVNNARAARSLLQAGADKD
            1710      1720      1730      1740      1750      1760 

        2060      2070      2080      2090      2100      2110     
pF1KE3 MQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANRDITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLLD-
        :.:::.::::::::::. :.:..::   : :.. :.    : :.:..: : :.. ::. 
CCDS34 AQDNREQTPLFLAAREGAVEVAQLLLGLGAARELRDQAGLAPADVAHQRNHWDLLTLLEG
            1770      1780      1790      1800      1810      1820 

             2120      2130      2140      2150      2160      2170
pF1KE3 ----EYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGYLGSLKPGVQGKKVRKPSSKGLACGS
           :     .:  ...:.  . :.:  .  :.:  :.  :  .  ..      : :: .
CCDS34 AGPPEARHKATPGREAGPFPRARTVSVSV-PPHG--GGALPRCRTLSAGAGPRGGGACLQ
            1830      1840      1850         1860      1870        

               2180      2190      2200          2210      2220    
pF1KE3 KE--AKDLKARRKKSQDGKGCLLDSSGMLSPVDSL--ESPHG--YLSDVASPPLLPSPFQ
        .  . :: ::      : :      . :: : .    .:.:  . . . .:   :. ..
CCDS34 ARTWSVDLAAR------GGGAYSHCRS-LSGVGAGGGPTPRGRRFSAGMRGPRPNPAIMR
     1880            1890       1900      1910      1920      1930 

         2230           2240      2250           2260      2270    
pF1KE3 QSPSVPLNH-----LPGMPDTHLGIGHLNVAAK-----PEMAALGGGGRLAFETGPPRLS
          .:  ..         :   ...:  . :..     : ..     :   .. ::: :.
CCDS34 GRYGVAAGRGGRVSTDDWPCDWVALGACGSASNIPIPPPCLTPSPERGSPQLDCGPPALQ
            1940      1950      1960      1970      1980      1990 

         2280      2290      2300      2310      2320      2330    
pF1KE3 HLPVASGTSTVLGSSSGGALNFTVGGSTSLNGQCEWLSRLQSGMVPNQYNPLRGSVAPGP
       ..:. .:                                                     
CCDS34 EMPINQGGEGKK                                                
            2000                                                   

>>CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6               (3144 aa)
 initn: 998 init1: 998 opt: 1663  Z-score: 714.1  bits: 146.6 E(32554): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 2016; 34.9% identity (56.2% similar) in 875 aa overlap (231-1060:467-1270)

              210       220       230       240       250          
pF1KE3 SYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCRPTGDVTHECACLPGFTG---QNCEEN
                                     : :.  : .  : .   ::.:   ..:.  
CCDS47 IPGCTKNPCWFLKNVYLIHQHLCYCGVTFHGICQDKGPAQFEYVWQLGFAGSEGEKCQGV
        440       450       460       470       480       490      

       260         270       280       290       300       310     
pF1KE3 IDD--CPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCHNT
       ::     . :: . .. :.  .  :  :   :  .  :...         : :: .: . 
CCDS47 IDAYFFLAANCTEDATYVNDPEDNNSSC---WFPHEGTKEI---------CANGCSCLSE
        500       510       520          530                540    

           320       330       340       350       360       370   
pF1KE3 HGG--YNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCECPHGRTGLLCHLN
       . .  :  .:   :.:.   ::  :     : : :.:.:..    : :  .  : :: .:
CCDS47 EDSQEYRYLCFLRWAGNMYLENTTDDQENECQHEAVCKDEINRPRCSCSLSYIGRLCVVN
          550       560       570       580       590       600    

            380        390       400          410       420        
pF1KE3 -DACISNPC-NEGSNCDTNPVNGKAICTCPSG---YTGPACSQDVDECSLGANPCEHAGK
        : :..:   .  . : .   :    :.: ::   :    :  :...:.  .  :...  
CCDS47 VDYCLGNHSISVHGLCLALSHN----CNC-SGLQRYERNICEIDTEDCK--SASCKNGTT
          610       620            630       640         650       

      430       440       450       460       470                  
pF1KE3 CINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGE--------------F
         .  : :  .:. :. : .::::..::.:.::.: :::.:: :.              :
CCDS47 STHLRGYFFRKCVPGFKGTQCEIDIDECASHPCKNGATCIDQPGNYFCQCVPPFKVVDGF
       660       670       680       690       700       710       

          480       490       500       510       520       530    
pF1KE3 QCICMPGYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECAS
       .:.: ::: :..:: . :.:  . : ::. : :    .:: : . . :..:. . .::  
CCDS47 SCLCNPGYVGIRCEQDIDDCILNACEHNSTCKDLHLSYQCVCLSDWEGNFCEQESNECKM
       720       730       740       750       760       770       

          540       550       560       570        580         590 
pF1KE3 TPCKNGAKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGS-CKDGV--ATFTCLC
       .::::.. : :  ..: : :: :.:: .:  .:.::: :::  :. :....  . :.:::
CCDS47 NPCKNNSTCTDLYKSYRCECTSGWTGQNCSEEINECDSDPCMNGGLCHESTIPGQFVCLC
       780       790       800       810       820       830       

             600         610       620        630       640        
pF1KE3 RPGYTGHHCETNINECS--SQPCRHGGTCQDR-DNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASS
        : :::. :.   : :.   .:::...::    :    :.: .   : ::::.. ::   
CCDS47 PPLYTGQFCHQRYNLCDLLHNPCRNNSTCLALVDANQHCICREEFEGKNCEIDVKDCLFL
       840       850       860       870       880       890       

      650        660       670       680       690       700       
pF1KE3 PC-DSGTCLDKIDGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEG
        : : : : : .....: :.::..::.:.:.:.::...::.:.::: :  : : : :   
CCDS47 SCQDYGDCEDMVNNFRCICRPGFSGSLCEIEINECSSEPCKNNGTCVDLTNRFFCNCEPE
       900       910       920       930       940       950       

       710       720        730       740       750       760      
pF1KE3 YHDPTCLSEVNECNSNPCV-HGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGG
       :: : :  .::.:. .::. .  :    .::.: : ::..: ::.:: .:: :.::.. :
CCDS47 YHGPFCELDVNKCKISPCLDEENCVYRTDGYNCLCAPGYTGINCEINLDECLSEPCLHDG
       960       970       980       990      1000      1010       

        770       780       790       800       810       820      
pF1KE3 TCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATC
       .: :  . :.: :. :: : .:.:: :.: :::::. : : . .  : :.:    :.. :
CCDS47 VCIDGINHYTCDCKSGFFGTHCETNANDCLSNPCLH-GRCTELINEYPCSCDADGTSTQC
      1020      1030      1040      1050       1060      1070      

        830       840       850       860       870       880      
pF1KE3 EVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQN
       .. .  :.  :: : : :..:   ..:.:.:: :. :  :: .:..:.            
CCDS47 KIKINDCTSIPCMNEGFCQKSA--HGFTCICPRGYTGAYCEKSIDNCA------------
       1080      1090        1100      1110      1120              

        890       900       910       920       930        940     
pF1KE3 THGGYRCHCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAF-CDCLPGFRGTFCEED
                         : ....     : ::: :.:: . .: : ::::: : ::: .
CCDS47 ------------------EPELNSV---ICLNGGICVDGPGHTFDCRCLPGFSGQFCEIN
                                1130      1140      1150      1160 

         950       960       970       980       990      1000     
pF1KE3 INECASDPCRNGANCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSF
       ::::.:.:: .::.: : ...:.: :  :.:: ::::.  .:  .:: .   :...  . 
CCDS47 INECSSSPCLHGADCEDHINGYVCKCQPGWSGHHCENEL-ECIPNSCVHE-LCMENEPGS
            1170      1180      1190      1200       1210          

        1010      1020      1030      1040                1050     
pF1KE3 TCLCPPGFTGSYCQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCP----------QGYTGPN
       :::: :::              . :  :  : :      :  :          : :: : 
CCDS47 TCLCTPGF--------------MTCSIGLLCGDEIRRITCLTPIFQRTDPISTQTYTIPP
    1220                    1230      1240      1250      1260     

        1060      1070      1080      1090      1100      1110     
pF1KE3 CQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARL
        ..::                                                       
CCDS47 SETLVSSFPSIKATRIPAIMDTYPVDQGPKQTGIVKHDILPTTGLATLRISTPLESYLLQ
        1270      1280      1290      1300      1310      1320     

>>CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6               (3165 aa)
 initn: 998 init1: 998 opt: 1663  Z-score: 714.0  bits: 146.6 E(32554): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 2016; 34.9% identity (56.2% similar) in 875 aa overlap (231-1060:467-1270)

              210       220       230       240       250          
pF1KE3 SYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCRPTGDVTHECACLPGFTG---QNCEEN
                                     : :.  : .  : .   ::.:   ..:.  
CCDS78 IPGCTKNPCWFLKNVYLIHQHLCYCGVTFHGICQDKGPAQFEYVWQLGFAGSEGEKCQGV
        440       450       460       470       480       490      

       260         270       280       290       300       310     
pF1KE3 IDD--CPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCHNT
       ::     . :: . .. :.  .  :  :   :  .  :...         : :: .: . 
CCDS78 IDAYFFLAANCTEDATYVNDPEDNNSSC---WFPHEGTKEI---------CANGCSCLSE
        500       510       520          530                540    

           320       330       340       350       360       370   
pF1KE3 HGG--YNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCECPHGRTGLLCHLN
       . .  :  .:   :.:.   ::  :     : : :.:.:..    : :  .  : :: .:
CCDS78 EDSQEYRYLCFLRWAGNMYLENTTDDQENECQHEAVCKDEINRPRCSCSLSYIGRLCVVN
          550       560       570       580       590       600    

            380        390       400          410       420        
pF1KE3 -DACISNPC-NEGSNCDTNPVNGKAICTCPSG---YTGPACSQDVDECSLGANPCEHAGK
        : :..:   .  . : .   :    :.: ::   :    :  :...:.  .  :...  
CCDS78 VDYCLGNHSISVHGLCLALSHN----CNC-SGLQRYERNICEIDTEDCK--SASCKNGTT
          610       620            630       640         650       

      430       440       450       460       470                  
pF1KE3 CINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGE--------------F
         .  : :  .:. :. : .::::..::.:.::.: :::.:: :.              :
CCDS78 STHLRGYFFRKCVPGFKGTQCEIDIDECASHPCKNGATCIDQPGNYFCQCVPPFKVVDGF
       660       670       680       690       700       710       

          480       490       500       510       520       530    
pF1KE3 QCICMPGYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECAS
       .:.: ::: :..:: . :.:  . : ::. : :    .:: : . . :..:. . .::  
CCDS78 SCLCNPGYVGIRCEQDIDDCILNACEHNSTCKDLHLSYQCVCLSDWEGNFCEQESNECKM
       720       730       740       750       760       770       

          540       550       560       570        580         590 
pF1KE3 TPCKNGAKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGS-CKDGV--ATFTCLC
       .::::.. : :  ..: : :: :.:: .:  .:.::: :::  :. :....  . :.:::
CCDS78 NPCKNNSTCTDLYKSYRCECTSGWTGQNCSEEINECDSDPCMNGGLCHESTIPGQFVCLC
       780       790       800       810       820       830       

             600         610       620        630       640        
pF1KE3 RPGYTGHHCETNINECS--SQPCRHGGTCQDR-DNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASS
        : :::. :.   : :.   .:::...::    :    :.: .   : ::::.. ::   
CCDS78 PPLYTGQFCHQRYNLCDLLHNPCRNNSTCLALVDANQHCICREEFEGKNCEIDVKDCLFL
       840       850       860       870       880       890       

      650        660       670       680       690       700       
pF1KE3 PC-DSGTCLDKIDGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEG
        : : : : : .....: :.::..::.:.:.:.::...::.:.::: :  : : : :   
CCDS78 SCQDYGDCEDMVNNFRCICRPGFSGSLCEIEINECSSEPCKNNGTCVDLTNRFFCNCEPE
       900       910       920       930       940       950       

       710       720        730       740       750       760      
pF1KE3 YHDPTCLSEVNECNSNPCV-HGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGG
       :: : :  .::.:. .::. .  :    .::.: : ::..: ::.:: .:: :.::.. :
CCDS78 YHGPFCELDVNKCKISPCLDEENCVYRTDGYNCLCAPGYTGINCEINLDECLSEPCLHDG
       960       970       980       990      1000      1010       

        770       780       790       800       810       820      
pF1KE3 TCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATC
       .: :  . :.: :. :: : .:.:: :.: :::::. : : . .  : :.:    :.. :
CCDS78 VCIDGINHYTCDCKSGFFGTHCETNANDCLSNPCLH-GRCTELINEYPCSCDADGTSTQC
      1020      1030      1040      1050       1060      1070      

        830       840       850       860       870       880      
pF1KE3 EVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQN
       .. .  :.  :: : : :..:   ..:.:.:: :. :  :: .:..:.            
CCDS78 KIKINDCTSIPCMNEGFCQKSA--HGFTCICPRGYTGAYCEKSIDNCA------------
       1080      1090        1100      1110      1120              

        890       900       910       920       930        940     
pF1KE3 THGGYRCHCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAF-CDCLPGFRGTFCEED
                         : ....     : ::: :.:: . .: : ::::: : ::: .
CCDS78 ------------------EPELNSV---ICLNGGICVDGPGHTFDCRCLPGFSGQFCEIN
                                1130      1140      1150      1160 

         950       960       970       980       990      1000     
pF1KE3 INECASDPCRNGANCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSF
       ::::.:.:: .::.: : ...:.: :  :.:: ::::.  .:  .:: .   :...  . 
CCDS78 INECSSSPCLHGADCEDHINGYVCKCQPGWSGHHCENEL-ECIPNSCVHE-LCMENEPGS
            1170      1180      1190      1200       1210          

        1010      1020      1030      1040                1050     
pF1KE3 TCLCPPGFTGSYCQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCP----------QGYTGPN
       :::: :::              . :  :  : :      :  :          : :: : 
CCDS78 TCLCTPGF--------------MTCSIGLLCGDEIRRITCLTPIFQRTDPISTQTYTIPP
    1220                    1230      1240      1250      1260     

        1060      1070      1080      1090      1100      1110     
pF1KE3 CQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARL
        ..::                                                       
CCDS78 SETLVSSFPSIKATRIPAIMDTYPVDQGPKQTGIVKHDILPTTGLATLRISTPLESYLLQ
        1270      1280      1290      1300      1310      1320     

>>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20                (1218 aa)
 initn: 2254 init1: 765 opt: 1509  Z-score: 654.3  bits: 134.2 E(32554): 4e-30
Smith-Waterman score: 2103; 35.6% identity (59.1% similar) in 824 aa overlap (399-1208:186-949)

      370       380       390       400       410          420     
pF1KE3 LCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQ---DVDECSLGANPCEH
                                     :: . : : .:..     :.  .:   :..
CCDS13 SHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDF-FGHYACDQ
         160       170       180       190       200        210    

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE3 AGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGV
        :.           :..:. ::.:.  .  : ..   . ..:    :.  : :. :..:.
CCDS13 NGNKT---------CMEGWMGPECNRAI--CRQGCSPKHGSC-KLPGD--CRCQYGWQGL
                   220       230         240        250         260

         490        500       510        520       530        540  
pF1KE3 HCEVNTDECASSP-CLHNGRCLDKINE-FQCECPTGFTGHLCQYDVDECAS-TPCKNGAK
       .:    :.:   : :.: : :    :: .:: : :.. :.::. :.. :..  :: ::. 
CCDS13 YC----DKCIPHPGCVH-GIC----NEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYCGTHQPCLNGGT
                  270            280       290       300       310 

             550       560       570        580       590       600
pF1KE3 CLD-GPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCH-YGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHC
       : . ::. : : : :::.: .::.    :  ::::  ::::.    : : : ::.::  :
CCDS13 CSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTC
             320       330       340       350       360       370 

              610       620       630       640       650          
pF1KE3 ETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPC-DSGTCLDKI
        :::..:: . : :::::::  :.. : :    :: .:... ..: ..:: .. .: . :
CCDS13 STNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLI
             380       390       400       410       420       430 

     660       670       680       690       700       710         
pF1KE3 DGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNE
        .: : : ::. :. :.:::..: :. :.: ..:.: .::. : :: ::    :  ...:
CCDS13 ASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDE
             440       450        460       470       480       490

     720        730       740       750       760       770        
pF1KE3 CNSNPCVHGA-CRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTSGYVCT
       : ::::..:. :.. .: ..: :  :.::. :... . :: ::: ::. : . .: : : 
CCDS13 CASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCK
              500       510       520       530       540       550

      780       790       800       810       820       830        
pF1KE3 CREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSPC
       : : . : ::.   ..: ..::    .:   .:.      . : ...       :.:   
CCDS13 CPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNV------CGPH--
              560       570       580       590             600    

      840       850       860       870       880       890        
pF1KE3 RNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRCHCQAG
          :.:. :..  .:.: :  :. :  :. .::.:  .:::.:..: .  ..:.: :. :
CCDS13 ---GKCK-SQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDG
                610       620       630       640       650        

      900       910       920       930       940       950        
pF1KE3 YSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGA
       . :  :::.:.::  :::::::.: : .:  .:::  :..:  :.   ..:    : ::.
CCDS13 WEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGG
      660       670       680       690       700       710        

      960       970       980        990      1000      1010       
pF1KE3 NCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCE-NNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGFTGSY
       .: :  :.. : ::.:. :  :.   . .:  . : :::::: . .::::.:  :. :  
CCDS13 TCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPI
      720       730       740       750       760       770        

      1020      1030      1040      1050      1060      1070       
pF1KE3 CQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQT
       : ...:.:. .:: ..::: :: . ::: :  :..::.:.  .. :.::::  :. : . 
CCDS13 CAQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDE
      780       790       800       810       820       830        

      1080      1090      1100      1110      1120      1130       
pF1KE3 HTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGY
        . ::: :: : .:  :.      ::.. :  . .. .   :.   :  ::  :.:  : 
CCDS13 INGYRCVCPPGHSGAKCQ------EVSG-RPCITMGSVIPDGAKWDDDCNT--CQCLNGR
      840       850             860        870       880           

      1140      1150      1160      1170      1180      1190       
pF1KE3 TGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQNGGT
        .  :  .   :.: ::      ..  .: ::  .            :.:. ::: . : 
CCDS13 IA--CSKV--WCGPRPCLLHKGHSECPSGQSCIPILD----------DQCFVHPCTGVGE
     890           900       910       920                 930     

      1200         1210      1220      1230      1240      1250    
pF1KE3 CLD---LPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSCT
       : .    :   ::.                                              
CCDS13 CRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAE
         940       950       960       970       980       990     

>>CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5                (2912 aa)
 initn: 442 init1: 164 opt: 1494  Z-score: 643.7  bits: 133.5 E(32554): 1.5e-29
Smith-Waterman score: 2333; 30.8% identity (52.4% similar) in 1619 aa overlap (24-1417:1204-2722)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE3        MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCSQPGETCLNGGKCEAANGTEACVCGGAF-
                                     ::   . : :: ::    ::  : :. .. 
CCDS34 CVNTEGSFQCDCPLGHELSPSREDCVDINECSLSDNLCRNG-KCVNMIGTYQCSCNPGYQ
          1180      1190      1200      1210       1220      1230  

                60        70        80        90           100     
pF1KE3 VGPR---CQDPNPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFS----GPLCLTPLDNA
       . :    : : . :.       : : .    . ..: :::. :..    :  : . .:. 
CCDS34 ATPDRQGCTDIDECMIM----NGGCDTQCTNSEGSYECSCSEGYALMPDGRSC-ADIDE-
           1240          1250      1260      1270      1280        

         110         120       130           140         150       
pF1KE3 CLTNP--CRNGGTCDLLTLTEYKCRCPPGWSG----KSCQQADPC--ASNPCANGGQCLP
       : .::  : .:: :  .   ::.: :  :. .    :.: ... :   :: :  : .:  
CCDS34 CENNPDIC-DGGQCTNIP-GEYRCLCYDGFMASMDMKTCIDVNECDLNSNICMFG-ECEN
       1290       1300       1310      1320      1330       1340   

       160       170          180       190       200         210  
pF1KE3 FEASYICHCPPSF---HGPTCRQDVNECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRA--THTG
        ..:.::::  ..   .: :   ::.::      :   ..: :  ::..: ::     .:
CCDS34 TKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDMHASCLNIPGSFKCSCREGWIGNG
          1350      1360      1370      1380      1390      1400   

            220         230       240       250         260        
pF1KE3 PNCERPYVPCSPSP--CQNGGTCRPTGDVTHECACLPGFTGQN--CEENIDDCPGNN--C
        .:      :: .   :. .. :  :   ...:::  ::::..  : . .:.:  :   :
CCDS34 IKCI-DLDECSNGTHQCSINAQCVNTPG-SYRCACSEGFTGDGFTCSD-VDECAENINLC
           1410      1420      1430       1440       1450      1460

        270       280           290       300       310       320  
pF1KE3 KNGGACVDGVNTYNCRCP----PEWTGQYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCHNTHGGYNCV
       .::  :..  ..: :.:     :   .. : .:.:::... : :  : ::.:  : ..:.
CCDS34 ENG-QCLNVPGAYRCECEMGFTPASDSRSC-QDIDECSFQ-NICVFG-TCNNLPGMFHCI
              1470      1480       1490       1500       1510      

                330       340        350       360           370   
pF1KE3 CVNGW----TGEDCSENIDDCASAA-CFHGATCHDRVASFYCECPH----GRTGLLCHLN
       : .:.    :: .:.. ::.::.   : .:  : .  . . :.::     . ::. :  :
CCDS34 CDDGYELDRTGGNCTD-IDECADPINCVNG-LCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCVDN
       1520      1530       1540       1550      1560      1570    

                      380                          390         400 
pF1KE3 DA--CI---------SNPCNE-------------------GSNCDTNP-VNGKAICT-CP
        .  :          :  ::                    :. :.: : ::.    : ::
CCDS34 RVGNCYLKFGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVNSTEYYTLCP
         1580      1590      1600      1610      1620      1630    

                410         420       430       440           450  
pF1KE3 SG---YTGPACS--QDVDECSLGANPCEHAGKCINTLGSFECQCLQGY---TGPR-CEID
       .:     .:     .:.:::.   . :. .:.::::.:::.:.: :::      : :: :
CCDS34 GGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQ-GGNCINTFGSFQCECPQGYYLSEDTRICE-D
         1640      1650      1660       1670      1680      1690   

            460         470       480       490       500       510
pF1KE3 VNECVSNP--CQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKIN
       ..:: ..:  : . .:: . .:.. ::: : :  :.   :   : .   .... :  . :
CCDS34 IDECFAHPGVC-GPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHN---CMD---MRKSFCYRSYN
           1700       1710      1720      1730            1740     

                520         530       540        550            560
pF1KE3 EFQCEC--PTGFTGHLC--QYDVDECASTPCKNGAKC-LDGPNTYTCVCTE--GYT---G
          ::   : . : ..:   :.: .  . ::.    :   :   .  .: .  :.:    
CCDS34 GTTCENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCE---PCPTPGTADFKTICGNIPGFTFDIH
        1750      1760      1770         1780      1790      1800  

              570         580       590           600       610    
pF1KE3 THCEVDIDECD--PDPCHYGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHH----CETNINECSSQP--C
       :   ::::::   :  :  : : . ...: : :  :.. .     :: .:.:::.    :
CCDS34 TGKAVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCE-DIDECSNGDNLC
           1810      1820      1830      1840       1850      1860 

            620       630          640         650       660       
pF1KE3 RHGGTCQDRDNAYLCFCLKG-TTGPN--CEINLDDCASSP--CDSGTCLDKIDGYECACE
       .... : .  ..: : :  :   .::  : .. ..:   :  :. : :.:   .:.: :.
CCDS34 QRNADCINSPGSYRCECAAGFKLSPNGAC-VDRNECLEIPNVCSHGLCVDLQGSYQCICH
            1870      1880      1890       1900      1910      1920

       670           680       690       700          710       720
pF1KE3 PGYTGS----MCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGY---HDPTCLSEVNEC
        :. .:    :: ...:::  .:: :: ::.. .....: :  :.   :.  :: ...::
CCDS34 NGFKASQDQTMC-MDVDECERHPCGNG-TCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCL-DIDEC
             1930       1940       1950      1960      1970        

                 730       740           750       760         770 
pF1KE3 NS---NPCVHGACRDSLNGYKCDCDPGW----SGTNCDINNNECESNP--CVNGGTCKDM
       .:   . : .: : . ....:: :. :.    .: :: :..::: . :  : . :::...
CCDS34 SSFFGQVCRNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTPDGKNC-IDTNECVALPGSC-SPGTCQNL
      1980      1990      2000      2010       2020       2030     

             780         790         800       810           820   
pF1KE3 TSGYVCTCREGF--SGPNCQTNINECASNP--CLNQGTCIDDVAGYKCNC----LLPYTG
        ... : :  :.  .. ::  .::::  .:  ::  :.: .  .:..: :    .:  .:
CCDS34 EGSFRCICPPGYEVKSENC-IDINECDEDPNICLF-GSCTNTPGGFQCLCPPGFVLSDNG
        2040      2050       2060       2070      2080      2090   

            830       840       850             860                
pF1KE3 ATC-EVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESFS--CVC---P-TGWQGQTCEV--------
         : ..  . :  .   ..:.:   . ... .  : :   :  :: :. ::.        
CCDS34 RRCFDTRQSFCFTN--FENGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGW-GDPCELCPKDDEVA
          2100        2110      2120      2130       2140      2150

                          870         880       890           900  
pF1KE3 --------------------DINECVLSP--CRHGASCQNTHGGYRCHCQAGY----SGR
                           :.:::. ::  : .: .: :: :..::.:  ::    .: 
CCDS34 FQDLCPYGHGTVPSLHDTREDVNECLESPGICSNG-QCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGV
             2160      2170      2180       2190      2200         

            910        920       930        940         950        
pF1KE3 NCETDIDDCR-PNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFR-GTF--CEEDINECASDPCRNGA
        : .: :.:   ::: :: .::. :..  :.:  ::. : .  :: ::::::..:   . 
CCDS34 RC-VDTDECSIGNPCGNG-TCTNVIGSFECNCNEGFEPGPMMNCE-DINECAQNPLLCAF
    2210       2220       2230      2240      2250       2260      

      960       970           980       990         1000      1010 
pF1KE3 NCTDCVDSYTCTCPAGFS----GIHCENNTPDCTES--SCFNGGT-CVDGINSFTCLCPP
        : .   :: :::: :..       :..   .:.:.  .: . :  : . :..: :.:::
CCDS34 RCMNTFGSYECTCPIGYALREDQKMCKD-LDECAEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPP
       2270      2280      2290       2300      2310      2320     

                1020        1030      1040      1050           1060
pF1KE3 GFT----GSYCQHDVNECDSQP--CLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGY----TGPNC-QNLV
       :..    :  :  : ::: ..:  : ..: : .  ::::: : .:.    .: .: .:  
CCDS34 GMARRPDGEGCV-DENECRTKPGIC-ENGRCVNIIGSYRCECNEGFQSSSSGTECLDNRQ
        2330       2340       2350      2360      2370      2380   

                 1070      1080        1090      1100      1110    
pF1KE3 HWCDS----SPCKNGGKCWQTHTQYRCECPSG--WTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVAR
         : .    . :. ...  .  :. .: : .:  : :  :..    : . .  :     .
CCDS34 GLCFAEVLQTICQMASSSRNLVTKSECCCDGGRGW-GHQCEL----CPLPGTAQ---YKK
          2390      2400      2410       2420          2430        

         1120      1130      1140      1150        1160      1170  
pF1KE3 LCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGSYCEDLVDECS--PSPCQNGATCTDYLGGYSCKCV
       .: ::                ::: .  .: .:::.  :. : ::  : . .:.. : : 
CCDS34 ICPHG---------------PGYT-TDGRD-IDECKVMPNLCTNGQ-CINTMGSFRCFCK
        2440                       2450      2460       2470       

               1180      1190      1200      1210          1220    
pF1KE3 AGY----HGVNCSEEIDECLSHPCQNGGTCLDLPNTYKCSCPRG----TQGVHCEINVDD
       .::     :..: . .::: . :   .  : .  ..:.::::::     .:  :. ..:.
CCDS34 VGYTTDISGTSCID-LDECSQSPKPCNYICKNTEGSYQCSCPRGYVLQEDGKTCK-DLDE
      2480      2490       2500      2510      2520      2530      

         1230      1240      1250      1260        1270        1280
pF1KE3 CNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSCTCPPGFVGER--CEGDVNECLSNP--CDARG
       :.      ... .:  .  ::. .::..: :::::. ..  :  : ::: :.:  : :.:
CCDS34 CQ------TKQHNC--QFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACI-DNNECGSQPSLCGAKG
              2540        2550      2560      2570       2580      

             1290          1300      1310       1320      1330     
pF1KE3 TQNCVQRVNDFHCECRAGH----TGRRCESVINGCKGKP-CKNGGTCAVASNTARGFICK
          : .  ..: :::. :     ::  ::.: . : :.  :..:  :   .:   :. : 
CCDS34 I--CQNTPGSFSCECQRGFSLDATGLNCEDV-DECDGNHRCQHG--C---QNILGGYRCG
         2590      2600      2610       2620           2630        

        1340          1350      1360      1370      1380      1390 
pF1KE3 CPAGF----EGATCENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCLCLGPFTGPECQFPASSPC
       :: :.    .   :  :   :..    ....: .   :  : : . :.    ::  :: :
CCDS34 CPQGYIQHYQWNQCV-DENECSNPNACGSASCYNTLGSYKCACPSGFSFD--QF--SSAC
     2640      2650       2660      2670      2680          2690   

             1400        1410      1420      1430      1440        
pF1KE3 LGGNPCYN-QGTCEP--TSESPFYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFGGGAGRDIPPPLIEEA
          : : . .. :.   ..    : : ::                               
CCDS34 HDVNECSSSKNPCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLSLDTEVDE
          2700      2710      2720      2730      2740      2750   

>--
 initn: 327 init1: 164 opt: 1446  Z-score: 623.7  bits: 129.8 E(32554): 2e-28
Smith-Waterman score: 1539; 29.4% identity (50.6% similar) in 1174 aa overlap (61-1088:108-1188)

               40        50        60        70        80        90
pF1KE3 CLNGGKCEAANGTEACVCGGAFVGPRCQDPNPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCA
                                     : :.   :.:  .:   :        :.:.
CCDS34 GQQDVLRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRN--SCG--DGFCSRPNMCTCS
        80        90       100       110         120         130   

              100       110       120       130       140       150
pF1KE3 LGFSGPLCLTPLDNACLTNPCRNGGTCDLLTLTEYKCRCPPGWSGKSCQQADPCASNPCA
        :  .  : .   . : .  : :::::     .. .:.:  :. :  : :  :   : : 
CCDS34 SGQISSTCGSKSIQQC-SVRCMNGGTC-----ADDHCQCQKGYIGTYCGQ--PVCENGCQ
           140        150            160       170         180     

              160       170       180       190          200       
pF1KE3 NGGQCLPFEASYICHCPPSFHGPTCRQDVNECGQKPGLCR---HGGTCHNEVGSYRC---
       :::.:.   .   : :  .: :: :..:      . : :    ..  :.... .  :   
CCDS34 NGGRCI---GPNRCACVYGFTGPQCERDY-----RTGPCFTQVNNQMCQGQLTGIVCTKT
         190          200       210            220       230       

             210       220       230       240       250       260 
pF1KE3 VCRAT---HTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCRPTGDVTHECACLPGFTGQNCEENIDDC
       .: ::     :  ::  . : .:.::. :               .:..    :.. .:.:
CCDS34 LCCATIGRAWGHPCE--MCPAQPQPCRRG--------------FIPNIRTGACQD-VDEC
       240       250         260                     270        280

                270       280           290       300       310    
pF1KE3 ---PGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPP----EWTGQYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCHN
          ::  :. :: :.. :....::::       : : : ::.:::...:. :..:  : :
CCDS34 QAIPGI-CQ-GGNCINTVGSFECRCPAGHKQSETTQKC-EDIDECSIIPGICETG-ECSN
                290       300       310        320       330       

          320        330       340          350           360      
pF1KE3 THGGYNCVCVNGW-TGEDCSENIDDCASAACFHG---ATCHD----RVASFYCECPHGRT
       : :.: :::  :. :. : :. ::.  .. :: :   . : .    :.... : :  :: 
CCDS34 TVGSYFCVCPRGYVTSTDGSRCIDQ-RTGMCFSGLVNGRCAQELPGRMTKMQCCCEPGRC
        340       350       360        370       380       390     

        370                                380       390       400 
pF1KE3 GLLCHLNDACI-------------------------SNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCP
         .  . .::                          : : . :.:  .   ::..     
CCDS34 WGIGTIPEACPVRGSEEYRRLCMDGLPMGGIPGSAGSRPGGTGGNGFAPSGNGNGYGPGG
         400       410       420       430       440       450     

                                   410             420       430   
pF1KE3 SGYT----------------------GPACS------QDVDECSLGANPCEHAGKCINTL
       .:.                       ::  .      : .: :.  :: : . :.:: :.
CCDS34 TGFIPIPGGNGFSPGVGGAGVGAGGQGPIITGLTILNQTIDICKHHANLCLN-GRCIPTV
         460       470       480       490       500        510    

           440          450       460       470       480          
pF1KE3 GSFECQCLQGY---TGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGVHCE--
       .:..:.: .::   ..  : :::.::.:::: : . :..  : . : :  :.. .  .  
CCDS34 SSYRCECNMGYKQDANGDC-IDVDECTSNPCTN-GDCVNTPGSYYCKCHAGFQRTPTKQA
          520       530        540        550       560       570  

       490       500        510       520           530        540 
pF1KE3 -VNTDECASSPCL-HNGRCLDKINEFQCECPTGFT----GHLCQYDVDECASTP-CKNGA
        .. ::: ..  : .::::..  . ::: : .::     :. :  : :::..:  : :: 
CCDS34 CIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTDGSFQCICNAGFELTTDGKNC-VDHDECTTTNMCLNGM
            580       590       600       610        620       630 

             550           560       570        580       590      
pF1KE3 KCLDGPNTYTCVCTEGYT----GTHCEVDIDECD-PDPCHYGSCKDGVATFTCLCRPGYT
        :..  ... :.:  :..    : .: .:.:::. :  :  : : .. ..: : : :: .
CCDS34 -CINEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYC-TDVDECQTPGICMNGHCINSEGSFRCDCPPGLA
              640       650        660       670       680         

         600       610          620       630       640       650  
pF1KE3 -GHHCETNINECSSQPCRHG---GTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDS
        :   .. ..    . :  :   :.:  :      :    : .  :  : :   . ::. 
CCDS34 VGMDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGVCV-RP-----FPGAVTKSECCCANPDYGFGEPCQP
     690       700       710             720       730       740   

            660        670       680         690       700         
pF1KE3 GTCLDKIDG-YECACEPGYTGSMCNINIDECAGNP--CHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYH
         :  : .. ..  :  :   .. . .:.::: .:  : ::  ::.  ... : :  ::.
CCDS34 --CPAKNSAEFHGLCSSGVGITVDGRDINECALDPDICANG-ICENLRGSYRCNCNSGYE
             750       760       770       780        790       800

      710          720         730       740           750         
pF1KE3 -DPT---CLSEVNECNSNP--CVHGACRDSLNGYKCDCDPGW----SGTNCDINNNECES
        : .   :. ...::  :   : .: ::.. ..:.: : ::.       .:. . :::::
CCDS34 PDASGRNCI-DIDECLVNRLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPPGYVFRTETETCE-DINECES
               810       820       830       840       850         

     760       770       780       790       800       810         
pF1KE3 NPCVNGGTCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLL
       ::::::. :..  ... : :  :  .   .:..  : ..    .:::  ..   .:.  .
CCDS34 NPCVNGA-CRNNLGSFNCECSPG--SKLSSTGLI-CIDSL---KGTCWLNIQDSRCE--V
      860        870       880          890          900           

     820       830       840       850       860          870      
pF1KE3 PYTGATCEVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGW---QGQTCEVDINECVLS
         .::: .     ::      :. :.. :    .. .:: :    .: ::: :.::: . 
CCDS34 NINGATLKS--ECCATLGAAWGSPCERCE----LDTACPRGLARIKGVTCE-DVNECEVF
     910         920       930           940       950        960  

          880       890       900           910       920       930
pF1KE3 P--CRHGASCQNTHGGYRCHCQAGYS----GRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAF
       :  : .:  : :..:...:.:  : .    :: :     : : . :.   .  . :.   
CCDS34 PGVCPNG-RCVNSKGSFHCECPEGLTLDGTGRVCL----DIRMEQCYLKWDEDECIHP--
             970       980       990          1000      1010       

               940       950       960           970          980  
pF1KE3 CDCLPG-FRGTFCEEDINECASDPCRNGANCTDC----VDSYTCTCP--AGFSGI-HCEN
          .:: ::   :      : .     :..: .:    .  :   ::  :::..     .
CCDS34 ---VPGKFRMDAC------CCAVGAAWGTECEECPKPGTKEYETLCPRGAGFANRGDVLT
           1020            1030      1040      1050      1060      

               990          1000      1010      1020         1030  
pF1KE3 NTP---DCTESSCFNG----GTCVDGINSFTCLCPPGFTGSYCQH---DVNECDSQPCLH
       . :   : .: . : :    : : . :.:: : :  ::. .. ..   :..::  .: : 
CCDS34 GRPFYKDINECKAFPGMCTYGKCRNTIGSFKCRCNSGFALDMEERNCTDIDECRISPDLC
       1070      1080      1090      1100      1110      1120      

            1040      1050           1060        1070      1080    
pF1KE3 G-GTCQDGCGSYRCTCPQGY-TG----PNCQNLVHWCDSSP--CKNGGKCWQTHTQYRCE
       : : : .  ::..: : .:: .:     ::.. .  :. .:  :. :: : .:. ...:.
CCDS34 GSGICVNTPGSFECECFEGYESGFMMMKNCMD-IDECERNPLLCR-GGTCVNTEGSFQCD
       1130      1140      1150       1160      1170       1180    

         1090      1100      1110      1120      1130      1140    
pF1KE3 CPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGSYCED
       :: :                                                        
CCDS34 CPLGHELSPSREDCVDINECSLSDNLCRNGKCVNMIGTYQCSCNPGYQATPDRQGCTDID
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

>>CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14                (1200 aa)
 initn: 1095 init1: 658 opt: 1259  Z-score: 549.8  bits: 114.9 E(32554): 2.6e-24
Smith-Waterman score: 1921; 33.0% identity (55.5% similar) in 904 aa overlap (179-1064:172-977)

      150       160       170       180       190       200        
pF1KE3 CANGGQCLPFEASYICHCPPSFHGPTCRQDVNECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRA
                                     .:   .  .:   : . : :. . :  :  
CCDS99 FTLIVEAWDWDNDTTPNEELLIERVSHAGMINPEDRWKSLHFSGHVAHLEL-QIRVRCDE
             150       160       170       180       190        200

      210       220       230        240       250       260       
pF1KE3 THTGPNCERPYVPCSPSPCQNGG-TCRPTGDVTHECACLPGFTGQNCEENIDDCP-GNNC
       .. . .:..    : :     :  ::   :.     ::. :. :..:.: .  :  : : 
CCDS99 NYYSATCNKF---CRPRNDFFGHYTCDQYGNK----ACMDGWMGKECKEAV--CKQGCNL
              210          220           230       240         250 

        270       280       290       300       310       320      
pF1KE3 KNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNG
        .::  : :    .:::   : :..:    :::  .:. : .: .: .    ..: : ..
CCDS99 LHGGCTVPG----ECRCSYGWQGRFC----DECVPYPG-CVHG-SCVEP---WQCNCETN
             260           270           280         290           

        330       340        350        360       370        380   
pF1KE3 WTGEDCSENIDDCASA-ACFHGATC-HDRVASFYCECPHGRTGLLCHLND-ACISNPCNE
       : :  :..... :.:   : .:.:: . .  .. : :: : .:  :.  . :: :::: .
CCDS99 WGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCAN
      300       310       320       330       340       350        

           390       400       410       420       430       440   
pF1KE3 GSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVDECSLGANPCEHAGKCINTLGSFECQCLQG
       :..:   : . .  : ::::..::.:. :.:::.  .:::  .: :.. . .::: : . 
CCDS99 GGSCHEVPSGFE--CHCPSGWSGPTCALDIDECA--SNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQ
      360       370         380       390         400       410    

           450       460       470       480       490       500   
pF1KE3 YTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGVHCEVNTDECASSPCLHNG
       ..:  :..:::.:  . ::. .:: : .. .::.:  :. : :::.. ::::::::  .:
CCDS99 WVGATCQLDVNDC-RGQCQHGGTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGG
          420        430       440       450       460       470   

           510       520       530       540       550       560   
pF1KE3 RCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECASTPCKNGAKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHC
        : :  . :.:.:: ::.: ::. ::: :  .::.:::.: .  . : :.: . . : .:
CCDS99 LCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEVDVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNC
           480       490       500       510       520       530   

           570        580         590       600       610       620
pF1KE3 EVDIDECDP-DPCHYGSCK--DGVATFTCLCRPGYTGHHCETNINECSSQPCRHGGTCQD
        :      : .::  :.:.  :: .. .    :: ..       ..: :::   ::.   
CCDS99 SV------PREPCPGGACRVIDGCGSDAGPGMPGTAASGVCGPHGRCVSQP---GGN---
                 540       550       560       570          580    

              630       640       650        660       670         
pF1KE3 RDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPC-DSGTCLDKIDGYECACEPGYTGSMCNINI
           . :.: .: ::  :. :.::: ..:: ..:::.:..:...: :  :. : .:. : 
CCDS99 ----FSCICDSGFTGTYCHENIDDCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNP
                 590       600       610       620       630       

     680       690       700       710       720        730        
pF1KE3 DECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNECNSNPCVHGA-CRDSLNGYK
       ..:  .:::. : : : .: : : : .:..  :: :.  .:..  : .:. : :: . ..
CCDS99 NDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFR
       640       650       660       670       680       690       

      740       750        760       770       780       790       
pF1KE3 CDCDPGWSGTNCDI-NNNECESNPCVNGGTCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNINECAS
       : : :::.:..: . .:. :  :::::::::    ... : ::.:. : .:  : :.:  
CCDS99 CACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNP
       700       710       720       730       740       750       

       800       810       820       830       840       850       
pF1KE3 NPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESFSCVC
        :: : : :.: :  ..:.:                ::                      
CCDS99 LPCYNGGICVDGVNWFRCEC----------------AP----------------------
       760       770                                               

       860       870       880       890       900          910    
pF1KE3 PTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRCHCQAGYSGRNCETDID---DC--R
         :. :  :...:.::  ::: .::.: .  .:::: :  : .:  :.  :    .:  :
CCDS99 --GFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSR
       780       790       800       810       820       830       

            920       930       940       950       960       970  
pF1KE3 PNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGANCTDCVDSYTCTCP
        .:  .:.: ..  :.  : :: : :   : .    :.  ::  ...     .. .  ::
CCDS99 GTPFPHGSSWVEDCNS--CRCLDGRRD--CSK--VWCGWKPCLLAGQ----PEALSAQCP
       840       850         860           870           880       

            980        990       1000      1010      1020      1030
pF1KE3 AGFSGIHCENNTP-DCTESSCFNGGTC-VDGINSFTCLCPPGFTGSYCQHDVNECDSQPC
        :    .: ...: .: .  :   : : ..   :  ::   :   . : . . . . .  
CCDS99 LG---QRCLEKAPGQCLRPPCEAWGECGAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDHV
          890       900       910       920       930       940    

             1040      1050      1060      1070      1080      1090
pF1KE3 LHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQYRCECPSGWT
        .: :    :.. : . :   .    . ::  ::                          
CCDS99 PQGTTVGAICSGIR-SLPATRAVARDRLLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDSSL
          950        960       970       980       990      1000   

             1100      1110      1120      1130      1140      1150
pF1KE3 GLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGSYCEDLVDECS
                                                                   
CCDS99 IQGAAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVTGGSSTGLLVPVLCGAFSVLWLACVVL
          1010      1020      1030      1040      1050      1060   

>>CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14                (1238 aa)
 initn: 1435 init1: 768 opt: 1247  Z-score: 544.6  bits: 114.0 E(32554): 5.1e-24
Smith-Waterman score: 2047; 35.4% identity (57.6% similar) in 891 aa overlap (510-1366:208-1044)

     480       490       500       510       520             530   
pF1KE3 PGYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHL-C-QYD----VD---
                                     :.: :.  . : ::  : ::     .:   
CCDS99 WKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKF-CRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGWM
       180       190       200       210        220       230      

                540       550         560       570        580     
pF1KE3 --ECASTPCKNGAKCLDGPNTYT--CVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDP-CHYGSCKDGVA
         ::  . ::.: . : :  :    : :. :. :  :    ::: : : : .:::   : 
CCDS99 GKECKEAVCKQGCNLLHGGCTVPGECRCSYGWQGRFC----DECVPYPGCVHGSC---VE
        240       250       260       270           280            

         590       600       610        620        630       640   
pF1KE3 TFTCLCRPGYTGHHCETNINECSSQ-PCRHGGTCQDRD-NAYLCFCLKGTTGPNCEINLD
        . : :. .. :  :. ..: :.:. :: .:::: . . . : : :  : .: :::    
CCDS99 PWQCNCETNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEH
     290       300       310       320       330       340         

           650        660       670       680       690       700  
pF1KE3 DCASSPC-DSGTCLDKIDGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTC
        :.:.:: ..:.: .  .:.:: :  :..:  : ..:::::.:::  :::: : ..:: :
CCDS99 ACTSNPCANGGSCHEVPSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECASNPCAAGGTCVDQVDGFEC
     350       360       370       380       390       400         

            710       720        730       740       750       760 
pF1KE3 RCPEGYHDPTCLSEVNECNSNPCVHG-ACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNP
        ::: .   ::  ..:::...::... .:.. ..:: ::: :::.: :: :: :.:... 
CCDS99 ICPEQWVGATCQLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKGINCHINVNDCRGQ-
     410       420       430       440       450       460         

             770       780       790       800       810       820 
pF1KE3 CVNGGTCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPY
       : .::::::...:: :.: .::.: .:. . .::::.:: . : : : . :..:.:   .
CCDS99 CQHGGTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGF
      470       480       490       500       510       520        

             830       840       850       860       870       880 
pF1KE3 TGATCEVVLAPCAPSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHG
       .:  ::: .  : :::::::..: . :   .. :.::  . :..: :  .     ::  :
CCDS99 SGPLCEVDVDLCEPSPCRNGARCYNLEG--DYYCACPDDFGGKNCSVPRE-----PCPGG
      530       540       550         560       570            580 

             890       900       910       920       930        940
pF1KE3 ASCQNTHGGYRCHCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAF-CDCLPGFRGT
       : :.   :   :  .::  :    .    : :.     : :..  .  : : :  :: ::
CCDS99 A-CRVIDG---CGSDAG-PGMPGTAASGVCGPH-----GRCVSQPGGNFSCICDSGFTGT
                 590        600            610       620       630 

              950       960       970       980       990      1000
pF1KE3 FCEEDINECASDPCRNGANCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVD
       .:.:.:..: ..:::::..: : ::.. : ::.:. :  :..:  ::  . : . : : :
CCDS99 YCHENIDDCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYD
             640       650       660       670       680       690 

             1010      1020      1030      1040      1050      1060
pF1KE3 GINSFTCLCPPGFTGSYCQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLV
        .:.: : :  :. :. :.    .::.  : .:::: :.  ..::.:: :. : .:    
CCDS99 LVNDFYCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAK
             700       710       720       730       740       750 

              1070      1080      1090      1100      1110         
pF1KE3 HW-CDSSPCKNGGKCWQTHTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHG
       .  :  .:: ::: :  . ... : : .:: :  :   . .:.             : .:
CCDS99 NSSCLPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLP----------CYNG
             760       770       780       790                 800 

    1120      1130      1140      1150      1160      1170         
pF1KE3 GLCVDAGNTHHCRCQAGYTGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVN
       :.:::. :  .:.:  :..:  :.  .:::. :::  ::::.: ..:: :.:  :  :  
CCDS99 GICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPR
             810       820       830       840       850       860 

    1180      1190      1200      1210      1220      1230         
pF1KE3 CSEEIDECLSHPCQNGGTCLDLPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCF
       :.: :   ... : . :: .   ...  .:    .. .:  .  ::.      . .: :.
CCDS99 CQEVIG--FGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDC----NSCRCLDGRRDCSKVW--CGWKP-CL
               870       880           890       900         910   

    1240      1250      1260       1270      1280       1290       
pF1KE3 NNGTCVDQVGGYSCTCPPGFVGERC-EGDVNECLSNPCDARGTQNC-VQRVNDFHCECRA
         :    :  . :  ::   .:.:: :   ..::  ::.: :  .: ...  .  :  :.
CCDS99 LAG----QPEALSAQCP---LGQRCLEKAPGQCLRPPCEAWG--ECGAEEPPSTPCLPRS
                920          930       940         950       960   

      1300               1310       1320      1330        1340     
pF1KE3 GHTGRRC---------ESVINGCK-GKPCKNGGTCAVASNTARG--FICKCPAGFEGATC
       ::    :         . : .:   :  :..  .  ..  .::   ..  :  .  ::. 
CCDS99 GHLDNNCARLTLHFNRDHVPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDRLLVLLCDRASSGASA
           970       980       990      1000      1010      1020   

        1350      1360      1370      1380      1390      1400     
pF1KE3 ENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCLCLGPFTGPECQFPASSPCLGGNPCYNQGTCEP
        . : . .  : :  .. :.:                                       
CCDS99 VEVAVSFSPARDLPDSSLIQGAAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVTGGSSTGLL
          1030      1040      1050      1060      1070      1080   




2555 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 17:23:26 2016 done: Tue Nov  8 17:23:28 2016
 Total Scan time:  7.150 Total Display time:  1.610

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com