Result of FASTA (ccds) for pF1KE4281
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4281, 1502 aa
  1>>>pF1KE4281 1502 - 1502 aa - 1502 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4070+/-0.00119; mu= 14.9427+/- 0.073
 mean_var=156.1940+/-29.751, 0's: 0 Z-trim(107.8): 117  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.102622
 statistics sampled from 9677 (9797) to 9677 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.301), width:  16
 Scan time:  5.920

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32062.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14        (1502) 10038 1499.6       0
CCDS45095.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14        (1501) 10019 1496.8       0
CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs108|chr19      (1499) 4021 608.8 4.1e-173
CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2           ( 334)  444 78.7 3.4e-14
CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2           ( 433)  444 78.7 4.2e-14
CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2           ( 459)  444 78.8 4.4e-14
CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7           ( 332)  422 75.4 3.3e-13
CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7            ( 468)  422 75.5 4.2e-13
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17    ( 548)  414 74.4 1.1e-12
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17    ( 889)  414 74.5 1.6e-12
CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs108|chr2       ( 475)  387 70.3 1.6e-11
CCDS78219.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7           ( 274)  382 69.4 1.7e-11


>>CCDS32062.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14             (1502 aa)
 initn: 10038 init1: 10038 opt: 10038  Z-score: 8035.9  bits: 1499.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10038; 100.0% identity (100.0% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1502)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

         
pF1KE4 II
       ::
CCDS32 II
         

>>CCDS45095.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14             (1501 aa)
 initn: 8263 init1: 8263 opt: 10019  Z-score: 8020.7  bits: 1496.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10019; 99.9% identity (99.9% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1501)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
              190       200       210       220       230       240

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pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
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pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
              310       320       330       340       350       360

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pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
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pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
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pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
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pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
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pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
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pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
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pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
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pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
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pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
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pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
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pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
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pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
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pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS45 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKK-KKKTKNFNPPTRRNWESNYF
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pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
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pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
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pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
    1380      1390      1400      1410      1420      1430         

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pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

         
pF1KE4 II
       ::
CCDS45 II
    1500 

>>CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs108|chr19           (1499 aa)
 initn: 3300 init1: 1368 opt: 4021  Z-score: 3221.4  bits: 608.8 E(32554): 4.1e-173
Smith-Waterman score: 4975; 50.8% identity (78.3% similar) in 1515 aa overlap (1-1496:2-1491)

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pF1KE4  MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLST
        :::.... : :.:.::.::::::::.::.::.::::::::::: .:::.. .:::::::
CCDS46 MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE4 IDFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRA
        ::::::::::::::::.. .. :: ::::.:..::::::::::: ::::: ::::::::
CCDS46 SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE4 AASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKF
       ::.:: :::::::.:::::::::::::::::.::: :::::: ::::.: ::.:::::::
CCDS46 AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE4 VNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCF
       :.::. ::.:.:::.... ::::: :..:.:....:: .:::: ::::::: :::..  :
CCDS46 VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280        290        
pF1KE4 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
       ..:::..::.:.: :::::..: : : : ..:: ::.: :: . :.... .: .:: :..
CCDS46 STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
              250       260       270       280       290       300

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pF1KE4 NHPDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEH
         :.:..:. ::::.::.. : .::..::.:::..::. :. .:: ::..:.:::.::.:
CCDS46 ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
              310       320       330       340       350       360

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE4 LNWSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHV
       :.  .: ::.: . .:   :::::.:::: :.:::.....::::::..:. ::..:. :.
CCDS46 LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
              370       380       390       400       410       420

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE4 QHLISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRH
       ..: .:..::::.. ::..::   ::.::.::::.  :.:... :... :.   ..::.:
CCDS46 EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
              430       440       450       460       470       480

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pF1KE4 QREIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDR
       :..:..::::::::.:.:.:::::.:.:.: ::..::. :. ::.:: :.::::::  .:
CCDS46 QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
              490       500       510       520       530       540

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pF1KE4 ESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNL
       ..:.:::: :::::::::: :   :.: :.:.:..: ... .    .   .. :::..::
CCDS46 DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
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pF1KE4 FILGKDGLAQELANEIRTQST-DDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHG
        ::::::::.:::::::.  : ::.:..:::.:::.:::....    .... : .:.:::
CCDS46 VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
              610       620       630       640       650       660

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pF1KE4 CFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQR-DSISKNLPILRH
       :.:..:: ::::.. : : : : :..  :.:.....::.::::.:.: :. ...:  : .
CCDS46 CLCLYNSKESLSYVVESIEKSR-ESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQ
              670       680        690       700       710         

        720       730          740       750       760       770   
pF1KE4 QGQQLANKLQCPFVDVPAGT---YPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDL
       ::::.:.:::: :.: ::..   : :..:: ::.:.:.:.:.: :.::..::   . :::
CCDS46 QGQQIASKLQCVFLD-PASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDS-KRNLNLVSSTASIKDL
     720       730        740       750       760        770       

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pF1KE4 SEADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITI
       ...::::::: :::::::.: :: : :.:..:.... :.:::..:.  :: ...::....
CCDS46 ADVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSV
       780       790       800       810       820       830       

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pF1KE4 LSYHSSIGVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFE
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CCDS46 LSYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLD
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pF1KE4 NEAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDN
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CCDS46 NDLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSI-PCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDN
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pF1KE4 TRESTHQSEDVFLPSPRDCFPY--NNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYR
       . :.   .:.::  :::   :   .:  ::..: :  : :: . .:..:    .:.:.  
CCDS46 AAEACSTTEEVF-NSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIE--PSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLS
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pF1KE4 LDLEGNEYPIHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPR
       ..::::.  .    .  . . :.:::::.:::: : . .. : :   :. .. :   . :
CCDS46 MELEGND-GLSFIMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPV-HFEITKGD---LSYLDQGHRDGQR
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pF1KE4 KQTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDS-QNRI-KIRNSFVNNT
       :..:  :    . .:::: ::::.:.. : ..  ..:: :: :: :..:  :::  .:..
CCDS46 KSVSSSPWLPQDGFDPSD-YAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRN--INKA
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pF1KE4 QGDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRK
       :..  .. ::    . . .:  : .  :: .. ...    :    ::   .:....  . 
CCDS46 QSNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRC--TRLGRFASYRTSFSVGSDDEL
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pF1KE4 GRHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNP
       :  : .:::   .  . .::  :: .:  . . : .. ..  ...... : : : :    
CCDS46 GPIRKKEED---QASQGYKG--DNAVIPYETDEDPRR-RNILRSLRRNTK-KPKPKPRPS
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pF1KE4 PTRRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQ
        :. .:::::::.::  .:: :::::.:.:.:.:.:: ::: :::.:::::::......:
CCDS46 ITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQ
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pF1KE4 KQFDQDHNINLVSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHA
       .:::::::..:.  . :::.::::.:.::..:::::.::... .:.:: :: :. ..:::
CCDS46 RQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHA
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pF1KE4 LKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLS
       :::..:::   :..::.:::.:::.::...:.::::..::::::::::::::: . . :.
CCDS46 LKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALT
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pF1KE4 TTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVE-----PMV----PLQ
       .:. .:...: ::::: :::::  :.:  . . :  ::  .. :      :..    : :
CCDS46 ATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG-ARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQ
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pF1KE4 LPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII  
        :::   . .:: : .        
CCDS46 SPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
        1480      1490         

>>CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2                (334 aa)
 initn: 378 init1: 297 opt: 444  Z-score: 368.2  bits: 78.7 E(32554): 3.4e-14
Smith-Waterman score: 444; 37.0% identity (69.4% similar) in 216 aa overlap (1238-1449:120-334)

      1210      1220      1230      1240      1250      1260       
pF1KE4 KGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYFGMPLQDL
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CCDS56 GPHWCEYCANFMWGLIAQGVKCADCGLNVHKQCSKMVPNDCKPDLKHVKKVY-SCDLTTL
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pF1KE4 VTAEKPI-PLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEV-
       : :.    :. :. :.. ::. :: .:::::::: .   ....  ::.: .   .:... 
CCDS56 VKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIEDVKMAFDRDGEKADISVNMY
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pF1KE4 -TVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDV
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pF1KE4 FRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMR-PDFENREFLSTTKIHQSVVETFIQ
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CCDS56 NEDILF                                                     
      330                                                         

>>CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2                (433 aa)
 initn: 378 init1: 297 opt: 444  Z-score: 366.7  bits: 78.7 E(32554): 4.2e-14
Smith-Waterman score: 444; 37.0% identity (69.4% similar) in 216 aa overlap (1238-1449:219-433)

      1210      1220      1230      1240      1250      1260       
pF1KE4 KGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYFGMPLQDL
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CCDS46 GPHWCEYCANFMWGLIAQGVKCADCGLNVHKQCSKMVPNDCKPDLKHVKKVY-SCDLTTL
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pF1KE4 VTAEKPI-PLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEV-
       : :.    :. :. :.. ::. :: .:::::::: .   ....  ::.: .   .:... 
CCDS46 VKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIEDVKMAFDRDGEKADISVNMY
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pF1KE4 -TVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDV
         .: ..:::: .: ::: ::: :. .:...:.::: :  :.:..:.: .: . :.. ..
CCDS46 EDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYPKFIESAKIMDPDEQLETLHEALKLLPPAHCET
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pF1KE4 FRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMR-PDFENREFLSTTKIHQSVVETFIQ
       .::...::.::. ..: :::.:.::.: : ::::: :...    :.  . .. ::: .:.
CCDS46 LRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPELDAMAALNDIRYQRLVVELLIK
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pF1KE4 QCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
       . ...:                                                     
CCDS46 NEDILF                                                     
       430                                                        

>>CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2                (459 aa)
 initn: 378 init1: 297 opt: 444  Z-score: 366.3  bits: 78.8 E(32554): 4.4e-14
Smith-Waterman score: 444; 37.0% identity (69.4% similar) in 216 aa overlap (1238-1449:245-459)

      1210      1220      1230      1240      1250      1260       
pF1KE4 KGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYFGMPLQDL
                                     :. .: . :   :  .. .. : .  :  :
CCDS46 GPHWCEYCANFMWGLIAQGVKCADCGLNVHKQCSKMVPNDCKPDLKHVKKVY-SCDLTTL
          220       230       240       250       260        270   

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pF1KE4 VTAEKPI-PLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEV-
       : :.    :. :. :.. ::. :: .:::::::: .   ....  ::.: .   .:... 
CCDS46 VKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIEDVKMAFDRDGEKADISVNMY
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pF1KE4 -TVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDV
         .: ..:::: .: ::: ::: :. .:...:.::: :  :.:..:.: .: . :.. ..
CCDS46 EDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYPKFIESAKIMDPDEQLETLHEALKLLPPAHCET
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pF1KE4 FRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMR-PDFENREFLSTTKIHQSVVETFIQ
       .::...::.::. ..: :::.:.::.: : ::::: :...    :.  . .. ::: .:.
CCDS46 LRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPELDAMAALNDIRYQRLVVELLIK
           400       410       420       430       440       450   

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pF1KE4 QCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
       . ...:                                                     
CCDS46 NEDILF                                                     
                                                                  

>>CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7                (332 aa)
 initn: 376 init1: 296 opt: 422  Z-score: 350.7  bits: 75.4 E(32554): 3.3e-13
Smith-Waterman score: 422; 34.7% identity (66.7% similar) in 216 aa overlap (1238-1449:118-332)

      1210      1220      1230      1240      1250      1260       
pF1KE4 KGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYFGMPLQDL
                                     :. .:.. :   :  .  .. :    :  :
CCDS47 GPHWCEYCANFMWGLIAQGVRCSDCGLNVHKQCSKHVPNDCQPDLKRIKKVYC-CDLTTL
        90       100       110       120       130       140       

      1270       1280      1290      1300      1310      1320      
pF1KE4 VTAEKPI-PLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEV-
       : :..   :. :. :.. ::  :: .::::::::     ....  ::.: .   .: .: 
CCDS47 VKAHNTQRPMVVDICIREIEARGLKSEGLYRVSGFTEHIEDVKMAFDRDGEKADISANVY
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pF1KE4 -TVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDV
         .: ..:::: .: ::: :.: :. . ....:::: .  :::.:..:..  . :..:..
CCDS47 PDINIITGALKLYFRDLPIPVITYDTYSKFIDAAKISNADERLEAVHEVLMLLPPAHYET
        210       220       230       240       250       260      

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pF1KE4 FRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENR-EFLSTTKIHQSVVETFIQ
       .::.. ::..:....: :.:.:.::.: : ::::::  ..    :   . .. .:. .:.
CCDS47 LRYLMIHLKKVTMNEKDNFMNAENLGIVFGPTLMRPPEDSTLTTLHDMRYQKLIVQILIE
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pF1KE4 QCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
       . . .:                                                     
CCDS47 NEDVLF                                                     
        330                                                       

>>CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7                 (468 aa)
 initn: 376 init1: 296 opt: 422  Z-score: 348.6  bits: 75.5 E(32554): 4.2e-13
Smith-Waterman score: 447; 31.1% identity (60.7% similar) in 318 aa overlap (1138-1449:167-468)

      1110      1120      1130      1140      1150      1160       
pF1KE4 IYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSY
                                     : : :.:..: : ..  .. .:   : .: 
CCDS54 ETKAAEYISKMTTNPIYEHIGYATLLREKVSRRLSRSKNEPRKTNVTHEEHTAVEKISSL
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pF1KE4 YRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRH--RGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDK
        ::. . . .:. :.  ::.    :  :: .     .    : : : . .  ::  :.  
CCDS54 VRRA-ALTHNDNHFNYEKTHNFKVHTFRGPHWCEYCANF-MW-GLIAQGVRCSDCGLN--
        200        210       220       230         240       250   

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pF1KE4 KMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPI-PLFVEKCVEF
            .::    . .:.  .. .:  .:   .. .   :  :: :..   :. :. :.. 
CCDS54 -----VHK----QCSKHVPNDCQPDLKRI--KKVYCCDLTTLVKAHNTQRPMVVDICIRE
                      260       270         280       290       300

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pF1KE4 IEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEV--TVNAVAGALKAFFADLP
       ::  :: .::::::::     ....  ::.: .   .: .:   .: ..:::: .: :::
CCDS54 IEARGLKSEGLYRVSGFTEHIEDVKMAFDRDGEKADISANVYPDINIITGALKLYFRDLP
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pF1KE4 DPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKIN
        :.: :. . ....:::: .  :::.:..:..  . :..:...::.. ::..:....: :
CCDS54 IPVITYDTYSKFIDAAKISNADERLEAVHEVLMLLPPAHYETLRYLMIHLKKVTMNEKDN
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pF1KE4 LMTADNLSICFWPTLMRPDFENR-EFLSTTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIV
       .:.:.::.: : ::::::  ..    :   . .. .:. .:.. . .:            
CCDS54 FMNAENLGIVFGPTLMRPPEDSTLTTLHDMRYQKLIVQILIENEDVLF            
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pF1KE4 APPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII

>>CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17         (548 aa)
 initn: 404 init1: 287 opt: 414  Z-score: 341.3  bits: 74.4 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 438; 25.9% identity (54.3% similar) in 540 aa overlap (969-1449:13-545)

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pF1KE4 LEKKNMIENSYLSDNTRESTHQSEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPP-YSPIGD-
                                     ::   : ..::.:   :  :   :::.:. 
CCDS11                   MQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPES--LTSYPEEDYSPVGSF
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pF1KE4 ----DVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYPIHSTPNCHDH-ERNHKVPPPIKPKPVVPKTNV
            .. : ::   : .  . .   :  : : .   . :  :  :   .:.    . ..
CCDS11 GEPGPTSPLTTPPGWSCHVSQDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYNPEDSSVRWEL
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pF1KE4 KKLDPNLLKTIEAGI--GKNPRKQTSRVPLAHPEDMDPSDNYAE--PIDTIFKQKGYSDE
        ..     ..:. .   : .:  :.:      : ..:   .. :  :  .  . :   :.
CCDS11 PQVPVPAPRSIHKSSQDGDTP-AQASPPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAAVRTKTL-DK
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pF1KE4 IYVV----PDDSQNRIKIRNSFVNNT--QGDEENGFSD-RTSKSHGERRPSKY-------
         :.      :. .:.. ..  .. :  .:   . :.: .:: . : :.:::.       
CCDS11 AGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTV
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pF1KE4 KYKSKTLF------SKAKSYYRRTHSDAS------DDEAFTTS--KTKRKGRHRGSEEDP
       . .. ::       :. :.  .    :.:      :.::. ..  :.  .: .. : : :
CCDS11 ELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRDGSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAELP
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pF1KE4 LLSPVETWKGGID---NPAITSDQELDDKKMKKKTHK------VKED-KKQKKKTKNF--
          : :. .. .:   .  . : :: ..    . .        .. : .: ..: ..:  
CCDS11 ---PEESESSRVDFGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQ
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pF1KE4 -NPPTRRNWESNY-----FGMPLQDLVTAEKP-IPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSG
         :  .   :..:     ::  :  :   :.  .: ::..:.. .:  ::  .::::.::
CCDS11 RRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISG
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pF1KE4 NKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEVT-VNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAK
       : .  .... . :.:. ..: . .   :....:::: :: .::.::.:.:   ... : :
CCDS11 NLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIK
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pF1KE4 IPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMR
       . :...: . ....:...   :.:..:... :: :: .. . : :......: : :::.:
CCDS11 LQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLR
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pF1KE4 PDFENREFLSTTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPL
       :. :.  .  :  ....::: ..:::  .:                              
CCDS11 PEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQCADIFPPH                           
         520       530       540                                   

>>CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17         (889 aa)
 initn: 404 init1: 287 opt: 414  Z-score: 338.4  bits: 74.5 E(32554): 1.6e-12
Smith-Waterman score: 438; 25.9% identity (54.3% similar) in 540 aa overlap (969-1449:354-886)

      940       950       960       970       980       990        
pF1KE4 LEKKNMIENSYLSDNTRESTHQSEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPP-YSPIGD-
                                     ::   : ..::.:   :  :   :::.:. 
CCDS74 GETAWEDEAENEPEEELEMQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPES--LTSYPEEDYSPVGSF
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pF1KE4 ----DVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYPIHSTPNCHDH-ERNHKVPPPIKPKPVVPKTNV
            .. : ::   : .  . .   :  : : .   . :  :  :   .:.    . ..
CCDS74 GEPGPTSPLTTPPGWSCHVSQDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYNPEDSSVRWEL
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pF1KE4 KKLDPNLLKTIEAGI--GKNPRKQTSRVPLAHPEDMDPSDNYAE--PIDTIFKQKGYSDE
        ..     ..:. .   : .:  :.:      : ..:   .. :  :  .  . :   :.
CCDS74 PQVPVPAPRSIHKSSQDGDTP-AQASPPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAAVRTKTL-DK
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pF1KE4 IYVV----PDDSQNRIKIRNSFVNNT--QGDEENGFSD-RTSKSHGERRPSKY-------
         :.      :. .:.. ..  .. :  .:   . :.: .:: . : :.:::.       
CCDS74 AGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTV
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pF1KE4 KYKSKTLF------SKAKSYYRRTHSDAS------DDEAFTTS--KTKRKGRHRGSEEDP
       . .. ::       :. :.  .    :.:      :.::. ..  :.  .: .. : : :
CCDS74 ELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRDGSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAELP
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pF1KE4 LLSPVETWKGGID---NPAITSDQELDDKKMKKKTHK------VKED-KKQKKKTKNF--
          : :. .. .:   .  . : :: ..    . .        .. : .: ..: ..:  
CCDS74 ---PEESESSRVDFGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQ
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pF1KE4 -NPPTRRNWESNY-----FGMPLQDLVTAEKP-IPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSG
         :  .   :..:     ::  :  :   :.  .: ::..:.. .:  ::  .::::.::
CCDS74 RRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISG
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pF1KE4 NKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEVT-VNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAK
       : .  .... . :.:. ..: . .   :....:::: :: .::.::.:.:   ... : :
CCDS74 NLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIK
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pF1KE4 IPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMR
       . :...: . ....:...   :.:..:... :: :: .. . : :......: : :::.:
CCDS74 LQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLR
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