Result of FASTA (omim) for
pF1KE2344
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2344, 1336 aa
1>>>pF1KE2344 1336 - 1336 aa - 1336 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.7133+/-0.000467; mu= -8.6105+/- 0.029
mean_var=586.3303+/-121.444, 0's: 0 Z-trim(123.7): 173 B-trim: 0 in 0/59
Lambda= 0.052967
statistics sampled from 43705 (43908) to 43705 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.775), E-opt: 0.2 (0.515), width: 16
Scan time: 21.830
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000827 (OMIM: 602717,617162) glutamate receptor (1336) 9401 734.6 1.1e-210
XP_011525174 (OMIM: 602717,617162) PREDICTED: glut (1336) 9401 734.6 1.1e-210
XP_006721908 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1308) 3544 287.0 5.9e-76
NP_000826 (OMIM: 138254) glutamate receptor ionotr (1233) 3538 286.5 7.8e-76
XP_011522990 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1316) 3522 285.3 1.9e-75
NP_001265482 (OMIM: 138254) glutamate receptor ion ( 873) 3471 281.3 2.1e-74
XP_006721909 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1307) 3039 248.4 2.4e-64
NP_001127880 (OMIM: 138253,245570) glutamate recep (1281) 2694 222.1 2.1e-56
XP_011520763 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1281) 2694 222.1 2.1e-56
XP_011520760 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1307) 2694 222.1 2.1e-56
XP_016878662 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1333) 2694 222.1 2.1e-56
NP_000824 (OMIM: 138253,245570) glutamate receptor (1464) 2694 222.1 2.3e-56
NP_001127879 (OMIM: 138253,245570) glutamate recep (1464) 2694 222.1 2.3e-56
XP_016878661 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1516) 2694 222.1 2.3e-56
XP_016874708 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484) 2627 217.0 7.9e-55
NP_000825 (OMIM: 138252,613970,616139) glutamate r (1484) 2627 217.0 7.9e-55
XP_011518930 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484) 2627 217.0 7.9e-55
XP_011518931 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484) 2627 217.0 7.9e-55
XP_011522994 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r ( 879) 2414 200.5 4.4e-50
XP_011522989 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1329) 2414 200.7 5.9e-50
XP_016880033 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1337) 2414 200.7 5.9e-50
XP_011522991 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1262) 2408 200.2 7.8e-50
XP_011522988 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1336) 1909 162.1 2.4e-38
NP_619635 (OMIM: 606651) glutamate receptor ionotr (1043) 993 92.0 2.4e-17
NP_597702 (OMIM: 606650) glutamate receptor ionotr (1115) 919 86.4 1.3e-15
NP_000823 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 885) 851 81.1 4e-14
NP_067544 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 901) 851 81.1 4.1e-14
XP_005266128 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 922) 851 81.1 4.1e-14
NP_015566 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 938) 851 81.1 4.2e-14
XP_011516513 (OMIM: 606650) PREDICTED: glutamate r ( 925) 843 80.5 6.3e-14
XP_011516885 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 892) 799 77.1 6.3e-13
NP_001172020 (OMIM: 138249,614254) glutamate recep ( 906) 799 77.1 6.4e-13
XP_005266129 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 922) 799 77.1 6.5e-13
NP_001172019 (OMIM: 138249,614254) glutamate recep ( 943) 799 77.1 6.6e-13
XP_005266130 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 959) 799 77.1 6.6e-13
XP_011541089 (OMIM: 600282) PREDICTED: glutamate r ( 702) 675 67.5 3.8e-10
XP_011541088 (OMIM: 600282) PREDICTED: glutamate r ( 714) 675 67.5 3.9e-10
XP_011541086 (OMIM: 600282) PREDICTED: glutamate r ( 902) 675 67.6 4.5e-10
NP_001269399 (OMIM: 600282) glutamate receptor ion ( 956) 675 67.6 4.7e-10
NP_055434 (OMIM: 600282) glutamate receptor ionotr ( 956) 675 67.6 4.7e-10
NP_000822 (OMIM: 138243) glutamate receptor ionotr ( 919) 661 66.6 9.6e-10
NP_002079 (OMIM: 600283) glutamate receptor ionotr ( 980) 657 66.3 1.2e-09
XP_005258878 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 980) 657 66.3 1.2e-09
XP_011525164 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 981) 652 65.9 1.6e-09
XP_016881732 (OMIM: 606651) PREDICTED: glutamate r ( 582) 642 64.9 1.9e-09
XP_011525169 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 913) 645 65.3 2.2e-09
NP_001307550 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 763) 642 65.0 2.3e-09
NP_001287959 (OMIM: 600283) glutamate receptor ion ( 981) 645 65.4 2.4e-09
XP_011525165 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 981) 645 65.4 2.4e-09
NP_783300 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotr ( 905) 642 65.1 2.6e-09
>>NP_000827 (OMIM: 602717,617162) glutamate receptor ion (1336 aa)
initn: 9401 init1: 9401 opt: 9401 Z-score: 3903.4 bits: 734.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 9401; 100.0% identity (100.0% similar) in 1336 aa overlap (1-1336:1-1336)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAGGPGGGLGGARPLNVALVFSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MRGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAGGPGGGLGGARPLNVALVFSGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAVLSAQLRSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAVLSAQLRSVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNRTHRGESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNRTHRGESL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 GKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 DIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 AAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 FHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGRPLSPPAAQPPQKPPPSYFAIVRDKEPAEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGRPLSPPAAQPPQKPPPSYFAIVRDKEPAEPP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 AGAFPGFPSPPAPPAAAATAVGPPLCRLAFEDESPPAPARWPRSDPESQPLLGPGAGGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AGAFPGFPSPPAPPAAAATAVGPPLCRLAFEDESPPAPARWPRSDPESQPLLGPGAGGAG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 GTGGAGGGAPAAPPPCRAAPPPCPYLDLEPSPSDSEDSESLGGASLGGLEPWWFADFPYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GTGGAGGGAPAAPPPCRAAPPPCPYLDLEPSPSDSEDSESLGGASLGGLEPWWFADFPYP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 YAERLGPPPGRYWSVDKLGGWRAGSWDYLPPRSGPAAWHCRHCASLELLPPPRHLSCSHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YAERLGPPPGRYWSVDKLGGWRAGSWDYLPPRSGPAAWHCRHCASLELLPPPRHLSCSHD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 GLDGGWWAPPPPPWAAGPLPRRRARCGCPRSHPHRPRASHRTPAAAAPHHHRHRRAAGGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GLDGGWWAPPPPPWAAGPLPRRRARCGCPRSHPHRPRASHRTPAAAAPHHHRHRRAAGGW
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 DLPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPARRLTGPSRHARRCPHAAHWGPPLPTASHRRHRGGDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DLPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPARRLTGPSRHARRCPHAAHWGPPLPTASHRRHRGGDL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330
pF1KE2 GTRRGSAHFSSLESEV
::::::::::::::::
NP_000 GTRRGSAHFSSLESEV
1330
>>XP_011525174 (OMIM: 602717,617162) PREDICTED: glutamat (1336 aa)
initn: 9401 init1: 9401 opt: 9401 Z-score: 3903.4 bits: 734.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 9401; 100.0% identity (100.0% similar) in 1336 aa overlap (1-1336:1-1336)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAGGPGGGLGGARPLNVALVFSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAGGPGGGLGGARPLNVALVFSGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAVLSAQLRSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAVLSAQLRSVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNRTHRGESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNRTHRGESL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 GKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 DIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADG
910 920 930 940 950 960
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGRPLSPPAAQPPQKPPPSYFAIVRDKEPAEPP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGAFPGFPSPPAPPAAAATAVGPPLCRLAFEDESPPAPARWPRSDPESQPLLGPGAGGAG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GTGGAGGGAPAAPPPCRAAPPPCPYLDLEPSPSDSEDSESLGGASLGGLEPWWFADFPYP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KE2 YAERLGPPPGRYWSVDKLGGWRAGSWDYLPPRSGPAAWHCRHCASLELLPPPRHLSCSHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YAERLGPPPGRYWSVDKLGGWRAGSWDYLPPRSGPAAWHCRHCASLELLPPPRHLSCSHD
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pF1KE2 GLDGGWWAPPPPPWAAGPLPRRRARCGCPRSHPHRPRASHRTPAAAAPHHHRHRRAAGGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLDGGWWAPPPPPWAAGPLPRRRARCGCPRSHPHRPRASHRTPAAAAPHHHRHRRAAGGW
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pF1KE2 DLPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPARRLTGPSRHARRCPHAAHWGPPLPTASHRRHRGGDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPARRLTGPSRHARRCPHAAHWGPPLPTASHRRHRGGDL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330
pF1KE2 GTRRGSAHFSSLESEV
::::::::::::::::
XP_011 GTRRGSAHFSSLESEV
1330
>>XP_006721908 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate recep (1308 aa)
initn: 3099 init1: 2393 opt: 3544 Z-score: 1484.7 bits: 287.0 E(85289): 5.9e-76
Smith-Waterman score: 3804; 50.6% identity (68.6% similar) in 1317 aa overlap (29-1288:69-1302)
10 20 30 40
pF1KE2 MRGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAP-GPGGAGGPG----------GGLG-
:.. : ::: ::. .:::
XP_006 LPYVCPSVPPVCPSASLQTSVSLPVLVLVSPQDPPVDMGGALGPALLLTSLFGAWAGLGP
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50 60 70 80 90 100
pF1KE2 --GARPLNVALVFS--GPAYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQ
: . ..::.::: :: : ::: : . . : :...:... .: ..: ::. :
XP_006 GQGEQGMTVAVVFSSSGPPQAQFRARLTP--QSFLDLP-LEIQPLTVGVNTTNPSSLLTQ
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110 120 130 140 150 160
pF1KE2 LCDLLSGLRVHGVVFEDDSRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFL
.: ::.. .:::.::::. . ::: ::::.:.:: .::... ::.:.:::::: ::.::
XP_006 ICGLLGAAHVHGIVFEDNVDTEAVAQILDFISSQTHVPILSISGGSAVVLTPKEPGSAFL
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170 180 190 200 210 220
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::: : ::::::.:.:::::::..:...:. ::: :: .....:.: :.:. ..:
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230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LD--PGAGEAVLSAQLRSVSAQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLA
:. ::. .: . ::...: . . .:.::::: .: : .:::.: :.::.. :.::
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290 300 310 320 330 340
pF1KE2 GGGGSGAPGEPPLLPGGAPLPAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGF
:. :: : .:.::..: . .:: .: ..: :::..: ::.. :..:
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350 360 370 380 390
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:: . :::.. . :...:...:.::..::.::. :.::.:..:::.:.: : :
XP_006 LPAPAGDCRVHPGPVSPAREAFYRHLLNVTWEGRDFSFSPGGYLVQPTMVVIALNRHRLW
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400 410 420 430 440 450
pF1KE2 EVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYGRFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRD
:.:: ::. .: .:::.: ::. :::: :..:::::::::::::::: :: .: :. .
XP_006 EMVGRWEHGVLYMKYPVWPRYSASLQPVVDSRHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPN
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460 470 480 490 500 510
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.:::: : :.: : :: : :::::::::::.::... :::::::::::::::..
XP_006 TVPCRRQSNHTFSSGDVAPYT-KLCCKGFCIDILKKLARVVKFSYDLYLVTNGKHGKRVR
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::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GVWNGMIGEVYYKRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFL
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::::::::::::::::::::.:::.:::.:::.::..:. ::. :: .::::::.:::::
XP_006 EPYSPAVWVMMFVMCLTVVAITVFMFEYFSPVSYNQNLTRGKKSGGPAFTIGKSVWLLWA
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pF1KE2 LVFNNSVPVENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKF
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::
XP_006 LVFNNSVPIENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEQYIDTVSGLSDKKF
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pF1KE2 QRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIY
::::.::::..::::::::::.:::::: :::..::..:: ::.:::.:: ::::::::
XP_006 QRPQDQYPPFRFGTVPNGSTERNIRSNYRDMHTHMVKFNQRSVEDALTSLKMGKLDAFIY
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::::::::: ::::::::::::::::::::::::..: :.::: ::::::::::: : .
XP_006 DAAVLNYMAGKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIAMQKDSHWKRAIDLALLQFLGDGETQK
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pF1KE2 LERLWLSGICHNDKIEVMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLG
:: .::::::.:.: :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::: .
XP_006 LETVWLSGICQNEKNEVMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLALLVFAWEHLVYWKLRHSVP
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880 890 900 910 920 930
pF1KE2 PTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAEAAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERA
. ..:::::::::.::: :. : : :: :: : .: . .:
XP_006 NSSQLDFLLAFSRGIYSCFSGV------------QSLASP----PRQA-SPDLTASSAQA
930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 SVDRWRRTKGAGPPGGAGLADGFHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGRPLSP--PA
:: . .. . ::..... : :: : : : .: : :: :.
XP_006 SVLKMLQA-ARDMVTTAGVSSSLDRATRTIENWGGGRRAPPPSPCPTPRSG-P-SPCLPT
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 AQPPQKPPPSYFAIVRDKEPAEPPAGAFPGFPS-PPAPPAAAATAVGPPLCRLAFEDESP
.:: .: :. .. :: :. .. : ::. : :::: .. .. :
XP_006 PDPPPEPSPTGWG---------PPDGGRAALVRRAPQPPGRPPTP-GPPLSDVSRVSRRP
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1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 PAPARWP-RSDPESQPLLGPGAGGAGGTGGAGGGAPAAPPPCRAAPPPC------PYLDL
:::: :. : : ... : .: :. . : :.: :
XP_006 AWEARWPVRT-------------GHCGRHLSASERPLSPARCHYSSFPRADRSGRPFLPL
1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KE2 EPSPSDSEDSESLGGASLGGLEPWWFADFPYPYAERLGPPPGRYWSVDKLGGWRAGSWDY
: . :: :: .:. : : . : . :. :: . . : .:
XP_006 FP---ELEDLPLLGPEQLARREALLHAAWARGSRPRHASLPS---SVAEAFA-RPSS---
1130 1140 1150 1160 1170
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE2 LPPR-SGPAAWH------CRHCASLELLPPPRHLSCSHDGLDGGWWAPPPPPWAAGPLPR
:: .::: . ::. :. . . : . ..: ..: : : .
XP_006 LPAGCTGPACARPDGHSACRRLAQAQSMCLPIYREACQEGEQAG-----APAW-----QH
1180 1190 1200 1210 1220
1230 1240 1250 1260
pF1KE2 RRARCGCPRSH---------PHRPR-ASHRT--PAAAAPHHHRHR--------RAAGGWD
:. : ..: :: : ::: . .: .: :: : : .:: :
XP_006 RQHVCLHAHAHLPFCWGAVCPHLPPCASHGSWLSGAWGPLGHRGRTLGLGTGYRDSGGLD
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 LPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPARRLTGPSRHARRCPHAAHWGPPLPTASHRRHRGGDLG
:: . .. : ::..
XP_006 -----EISRVARGTQGFPGPCTWRRISSLESEV
1290 1300
>>NP_000826 (OMIM: 138254) glutamate receptor ionotropic (1233 aa)
initn: 3099 init1: 2393 opt: 3538 Z-score: 1482.5 bits: 286.5 E(85289): 7.8e-76
Smith-Waterman score: 3801; 51.1% identity (68.9% similar) in 1294 aa overlap (38-1288:19-1227)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 RGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAG-GPGGGLGGARPLNVALVFS--GPAYAA
:: ::: : : ..::.::: :: :
NP_000 MGGALGPALLLTSLFGAWAGLGPGQGEQG---MTVAVVFSSSGPPQAQ
10 20 30 40
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pF1KE2 EAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDDSRAP
::: : . . : :...:... .: ..: ::. :.: ::.. .:::.::::. .
NP_000 FRARLTP--QSFLDLP-LEIQPLTVGVNTTNPSSLLTQICGLLGAAHVHGIVFEDNVDTE
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pF1KE2 AVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLEEYDW
::: ::::.:.:: .::... ::.:.:::::: ::.::::: : ::::::.:.:::::::
NP_000 AVAQILDFISSQTHVPILSISGGSAVVLTPKEPGSAFLQLGVSLEQQLQVLFKVLEEYDW
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLD--PGAGEAVLSAQLRSVSAQ
..:...:. ::: :: .....:.: :.:. ..::. ::. .: . ::...:
NP_000 SAFAVITSLHPGHALFLEGVRAVADASHVSWRLLDVVTLELGPGGPRARTQRLLRQLDAP
170 180 190 200 210 220
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pF1KE2 IRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPLPA
. . .:.::::: .: : .:::.: :.::.. :.:: :. :: : .:.
NP_000 VFVAYCSREEAEVLFAEAAQAGLVGPGHVWLV--PNLA----LGSTDAPP-----ATFPV
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 GLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNR--THRGESL
::..: . .:: .: ..: :::..: ::.. :..: :: . :::.. . :..
NP_000 GLISVVTESWRLSLRQKVRDGVAILALGAHSYWRQHGTLPAPAGDCRVHPGPVSPAREAF
280 290 300 310 320 330
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pF1KE2 HRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYG
.:...:.::..::.::. :.::.:..:::.:.: : ::.:: ::. .: .:::.: ::.
NP_000 YRHLLNVTWEGRDFSFSPGGYLVQPTMVVIALNRHRLWEMVGRWEHGVLYMKYPVWPRYS
340 350 360 370 380 390
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pF1KE2 RFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPE
:::: :..:::::::::::::::: :: .: :. ..:::: : :.: : ::
NP_000 ASLQPVVDSRHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPNTVPCRRQSNHTFSSGDVAPYT-
400 410 420 430 440 450
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pF1KE2 KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSL
: :::::::::::.::... :::::::::::::::.. ::::::::::.:.:::::::::
NP_000 KLCCKGFCIDILKKLARVVKFSYDLYLVTNGKHGKRVRGVWNGMIGEVYYKRADMAIGSL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
NP_000 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAIT
520 530 540 550 560 570
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pF1KE2 VFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVL
::.:::.:::.::..:. ::. :: .::::::.:::::::::::::.:::::::::::::
NP_000 VFMFEYFSPVSYNQNLTRGKKSGGPAFTIGKSVWLLWALVFNNSVPIENPRGTTSKIMVL
580 590 600 610 620 630
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pF1KE2 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEK
::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::::::.::::..::::::::::.
NP_000 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEQYIDTVSGLSDKKFQRPQDQYPPFRFGTVPNGSTER
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGS
:::::: :::..::..:: ::.:::.:: ::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_000 NIRSNYRDMHTHMVKFNQRSVEDALTSLKMGKLDAFIYDAAVLNYMAGKDEGCKLVTIGS
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 GKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKL
::::::::::::..: :.::: ::::::::::: : . :: .::::::.:.: :::::::
NP_000 GKVFATTGYGIAMQKDSHWKRAIDLALLQFLGDGETQKLETVWLSGICQNEKNEVMSSKL
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 DIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
::::::::::::::::::.::::::::::::.::: . . ..:::::::::.::: :.
NP_000 DIDNMAGVFYMLLVAMGLALLVFAWEHLVYWKLRHSVPNSSQLDFLLAFSRGIYSCFSGV
820 830 840 850 860 870
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pF1KE2 AAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADG
: : :: :: : .: . .::: . .. . ::....
NP_000 ------------QSLASP----PRQA-SPDLTASSAQASVLKMLQA-ARDMVTTAGVSSS
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pF1KE2 FHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGRPLSP--PAAQPPQKPPPSYFAIVRDKEPAE
. : :: : : : .: : :: :. .:: .: :. ..
NP_000 LDRATRTIENWGGGRRAPPPSPCPTPRSG-P-SPCLPTPDPPPEPSPTGWG---------
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pF1KE2 PPAGAFPGFPS-PPAPPAAAATAVGPPLCRLAFEDESPPAPARWPRSDPESQPLLGPGAG
:: :. .. : ::. : :::: .. .. : ::::
NP_000 PPDGGRAALVRRAPQPPGRPPTP-GPPLSDVSRVSRRPAWEARWPVRT------------
970 980 990 1000
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pF1KE2 GAGGTGGAGGGAPAAPPPCRAAPPPC------PYLDLEPSPSDSEDSESLGGASLGGLEP
: : ... : .: :. . : :.: : : . :: :: .:. :
NP_000 GHCGRHLSASERPLSPARCHYSSFPRADRSGRPFLPLFP---ELEDLPLLGPEQLARREA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE2 WWFADFPYPYAERLGPPPGRYWSVDKLGGWRAGSWDYLPPR-SGPAAWH------CRHCA
: . : . :. :: . . : .: :: .::: . ::. :
NP_000 LLHAAWARGSRPRHASLPS---SVAEAFA-RPSS---LPAGCTGPACARPDGHSACRRLA
1070 1080 1090 1100 1110
1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 SLELLPPPRHLSCSHDGLDGGWWAPPPPPWAAGPLPRRRARCGCPRSH---------PHR
. . . : . ..: ..: : : .:. : ..: ::
NP_000 QAQSMCLPIYREACQEGEQAG-----APAW-----QHRQHVCLHAHAHLPFCWGAVCPHL
1120 1130 1140 1150 1160
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 PR-ASHRT--PAAAAPHHHRHR--------RAAGGWDLPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPA
: ::: . .: .: :: : : .:: : :: . .. :
NP_000 PPCASHGSWLSGAWGPLGHRGRTLGLGTGYRDSGGLD-----EISRVARGTQGFPGPCTW
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE2 RRLTGPSRHARRCPHAAHWGPPLPTASHRRHRGGDLGTRRGSAHFSSLESEV
::..
NP_000 RRISSLESEV
1230
>>XP_011522990 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate recep (1316 aa)
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Smith-Waterman score: 3778; 50.3% identity (68.2% similar) in 1325 aa overlap (29-1288:69-1310)
10 20 30 40
pF1KE2 MRGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAP-GPGGAGGPG----------GGLG-
:.. : ::: ::. .:::
XP_011 LPYVCPSVPPVCPSASLQTSVSLPVLVLVSPQDPPVDMGGALGPALLLTSLFGAWAGLGP
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 --GARPLNVALVFS--GPAYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQ
: . ..::.::: :: : ::: : . . : :...:... .: ..: ::. :
XP_011 GQGEQGMTVAVVFSSSGPPQAQFRARLTP--QSFLDLP-LEIQPLTVGVNTTNPSSLLTQ
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 LCDLLSGLRVHGVVFEDDSRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFL
.: ::.. .:::.::::. . ::: ::::.:.:: .::... ::.:.:::::: ::.::
XP_011 ICGLLGAAHVHGIVFEDNVDTEAVAQILDFISSQTHVPILSISGGSAVVLTPKEPGSAFL
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 QLGSSTEQQLQVIFEVLEEYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALT
::: : ::::::.:.:::::::..:...:. ::: :: .....:.: :.:. ..:
XP_011 QLGVSLEQQLQVLFKVLEEYDWSAFAVITSLHPGHALFLEGVRAVADASHVSWRLLDVVT
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LD--PGAGEAVLSAQLRSVSAQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLA
:. ::. .: . ::...: . . .:.::::: .: : .:::.: :.::.. :.::
XP_011 LELGPGGPRARTQRLLRQLDAPVFVAYCSREEAEVLFAEAAQAGLVGPGHVWLV--PNLA
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 GGGGSGAPGEPPLLPGGAPLPAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGF
:. :: : .:.::..: . .:: .: ..: :::..: ::.. :..:
XP_011 ----LGSTDAPP-----ATFPVGLISVVTESWRLSLRQKVRDGVAILALGAHSYWRQHGT
340 350 360 370 380
350 360 370 380 390
pF1KE2 LPELGHDCRAQNR--THRGESLHRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTW
:: . :::.. . :...:...:.::..::.::. :.::.:..:::.:.: : :
XP_011 LPAPAGDCRVHPGPVSPAREAFYRHLLNVTWEGRDFSFSPGGYLVQPTMVVIALNRHRLW
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 EVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYGRFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRD
:.:: ::. .: .:::.: ::. :::: :..:::::::::::::::: :: .: :. .
XP_011 EMVGRWEHGVLYMKYPVWPRYSASLQPVVDSRHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPN
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 SVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKID
.:::: : :.: : :: : :::::::::::.::... :::::::::::::::..
XP_011 TVPCRRQSNHTFSSGDVAPYT-KLCCKGFCIDILKKLARVVKFSYDLYLVTNGKHGKRVR
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 GVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFL
::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVWNGMIGEVYYKRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFL
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 EPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVTVFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWA
::::::::::::::::::::.:::.:::.:::.::..:. ::. :: .::::::.:::::
XP_011 EPYSPAVWVMMFVMCLTVVAITVFMFEYFSPVSYNQNLTRGKKSGGPAFTIGKSVWLLWA
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640 650 660 670 680 690
pF1KE2 LVFNNSVPVENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKF
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::
XP_011 LVFNNSVPIENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEQYIDTVSGLSDKKF
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 QRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAG-------
::::.::::..::::::::::.:::::: :::..::..:: ::.:::.:: :
XP_011 QRPQDQYPPFRFGTVPNGSTERNIRSNYRDMHTHMVKFNQRSVEDALTSLKMGSEAQPVP
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760 770 780 790 800 810
pF1KE2 -KLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQF
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::..: :.::: ::::::::
XP_011 RKLDAFIYDAAVLNYMAGKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIAMQKDSHWKRAIDLALLQF
810 820 830 840 850 860
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 LGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVY
::: : . :: .::::::.:.: :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
XP_011 LGDGETQKLETVWLSGICQNEKNEVMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLALLVFAWEHLVY
870 880 890 900 910 920
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 WRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAEAAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPA
:.::: . . ..:::::::::.::: :. : : :: :: : .:
XP_011 WKLRHSVPNSSQLDFLLAFSRGIYSCFSGV------------QSLASP----PRQA-SPD
930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 PFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADGFHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGR
. .::: . .. . ::..... : :: : : : .:
XP_011 LTASSAQASVLKMLQA-ARDMVTTAGVSSSLDRATRTIENWGGGRRAPPPSPCPTPRSG-
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 PLSP--PAAQPPQKPPPSYFAIVRDKEPAEPPAGAFPGFPS-PPAPPAAAATAVGPPLCR
: :: :. .:: .: :. .. :: :. .. : ::. : ::::
XP_011 P-SPCLPTPDPPPEPSPTGWG---------PPDGGRAALVRRAPQPPGRPPTP-GPPLSD
1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 LAFEDESPPAPARWP-RSDPESQPLLGPGAGGAGGTGGAGGGAPAAPPPCRAAPPPC---
.. .. : :::: :. : : ... : .: :. . :
XP_011 VSRVSRRPAWEARWPVRT-------------GHCGRHLSASERPLSPARCHYSSFPRADR
1080 1090 1100 1110 1120
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 ---PYLDLEPSPSDSEDSESLGGASLGGLEPWWFADFPYPYAERLGPPPGRYWSVDKLGG
:.: : : . :: :: .:. : : . : . :. :: . .
XP_011 SGRPFLPLFP---ELEDLPLLGPEQLARREALLHAAWARGSRPRHASLPS---SVAEAFA
1130 1140 1150 1160 1170
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE2 WRAGSWDYLPPR-SGPAAWH------CRHCASLELLPPPRHLSCSHDGLDGGWWAPPPPP
: .: :: .::: . ::. :. . . : . ..: ..: :
XP_011 -RPSS---LPAGCTGPACARPDGHSACRRLAQAQSMCLPIYREACQEGEQAG-----APA
1180 1190 1200 1210 1220
1220 1230 1240 1250
pF1KE2 WAAGPLPRRRARCGCPRSH---------PHRPR-ASHRT--PAAAAPHHHRHR-------
: .:. : ..: :: : ::: . .: .: :: :
XP_011 W-----QHRQHVCLHAHAHLPFCWGAVCPHLPPCASHGSWLSGAWGPLGHRGRTLGLGTG
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE2 -RAAGGWDLPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPARRLTGPSRHARRCPHAAHWGPPLPTASHR
: .:: : :: . .. : ::..
XP_011 YRDSGGLD-----EISRVARGTQGFPGPCTWRRISSLESEV
1290 1300 1310
1320 1330
pF1KE2 RHRGGDLGTRRGSAHFSSLESEV
>>NP_001265482 (OMIM: 138254) glutamate receptor ionotro (873 aa)
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Smith-Waterman score: 3651; 63.4% identity (82.1% similar) in 878 aa overlap (38-908:19-871)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 RGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAG-GPGGGLGGARPLNVALVFS--GPAYAA
:: ::: : : ..::.::: :: :
NP_001 MGGALGPALLLTSLFGAWAGLGPGQGEQG---MTVAVVFSSSGPPQAQ
10 20 30 40
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pF1KE2 EAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDDSRAP
::: : . . : :...:... .: ..: ::. :.: ::.. .:::.::::. .
NP_001 FRARLTP--QSFLDLP-LEIQPLTVGVNTTNPSSLLTQICGLLGAAHVHGIVFEDNVDTE
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pF1KE2 AVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLEEYDW
::: ::::.:.:: .::... ::.:.:::::: ::.::::: : ::::::.:.:::::::
NP_001 AVAQILDFISSQTHVPILSISGGSAVVLTPKEPGSAFLQLGVSLEQQLQVLFKVLEEYDW
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLD--PGAGEAVLSAQLRSVSAQ
..:...:. ::: :: .....:.: :.:. ..::. ::. .: . ::...:
NP_001 SAFAVITSLHPGHALFLEGVRAVADASHVSWRLLDVVTLELGPGGPRARTQRLLRQLDAP
170 180 190 200 210 220
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pF1KE2 IRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPLPA
. . .:.::::: .: : .:::.: :.::.. :.:: :. :: : .:.
NP_001 VFVAYCSREEAEVLFAEAAQAGLVGPGHVWLV--PNLA----LGSTDAPP-----ATFPV
230 240 250 260 270
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pF1KE2 GLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNR--THRGESL
::..: . .:: .: ..: :::..: ::.. :..: :: . :::.. . :..
NP_001 GLISVVTESWRLSLRQKVRDGVAILALGAHSYWRQHGTLPAPAGDCRVHPGPVSPAREAF
280 290 300 310 320 330
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pF1KE2 HRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYG
.:...:.::..::.::. :.::.:..:::.:.: : ::.:: ::. .: .:::.: ::.
NP_001 YRHLLNVTWEGRDFSFSPGGYLVQPTMVVIALNRHRLWEMVGRWEHGVLYMKYPVWPRYS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPE
:::: :..:::::::::::::::: :: .: :. ..:::: : :.: : ::
NP_001 ASLQPVVDSRHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPNTVPCRRQSNHTFSSGDVAPYT-
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSL
: :::::::::::.::... :::::::::::::::.. ::::::::::.:.:::::::::
NP_001 KLCCKGFCIDILKKLARVVKFSYDLYLVTNGKHGKRVRGVWNGMIGEVYYKRADMAIGSL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
NP_001 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAIT
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVL
::.:::.:::.::..:. ::. :: .::::::.:::::::::::::.:::::::::::::
NP_001 VFMFEYFSPVSYNQNLTRGKKSGGPAFTIGKSVWLLWALVFNNSVPIENPRGTTSKIMVL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEK
::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::::::.::::..::::::::::.
NP_001 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEQYIDTVSGLSDKKFQRPQDQYPPFRFGTVPNGSTER
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGS
:::::: :::..::..:: ::.:::.:: ::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_001 NIRSNYRDMHTHMVKFNQRSVEDALTSLKMGKLDAFIYDAAVLNYMAGKDEGCKLVTIGS
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 GKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKL
::::::::::::..: :.::: ::::::::::: : . :: .::::::.:.: :::::::
NP_001 GKVFATTGYGIAMQKDSHWKRAIDLALLQFLGDGETQKLETVWLSGICQNEKNEVMSSKL
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 DIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
::::::::::::::::::.::::::::::::.::: . . ..:::::::: .
NP_001 DIDNMAGVFYMLLVAMGLALLVFAWEHLVYWKLRHSVPNSSQLDFLLAFSR-------VG
820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 AAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADG
: : : .:
NP_001 AHPSPHRPKF
870
>>XP_006721909 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate recep (1307 aa)
initn: 2989 init1: 2416 opt: 3039 Z-score: 1276.1 bits: 248.4 E(85289): 2.4e-64
Smith-Waterman score: 3795; 50.5% identity (68.6% similar) in 1317 aa overlap (29-1288:69-1301)
10 20 30 40
pF1KE2 MRGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAP-GPGGAGGPG----------GGLG-
:.. : ::: ::. .:::
XP_006 LPYVCPSVPPVCPSASLQTSVSLPVLVLVSPQDPPVDMGGALGPALLLTSLFGAWAGLGP
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 --GARPLNVALVFS--GPAYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQ
: . ..::.::: :: : ::: : . . : :...:... .: ..: ::. :
XP_006 GQGEQGMTVAVVFSSSGPPQAQFRARLTP--QSFLDLP-LEIQPLTVGVNTTNPSSLLTQ
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 LCDLLSGLRVHGVVFEDDSRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFL
.: ::.. .:::.::::. . ::: ::::.:.:: .::... ::.:.:::::: ::.::
XP_006 ICGLLGAAHVHGIVFEDNVDTEAVAQILDFISSQTHVPILSISGGSAVVLTPKEPGSAFL
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 QLGSSTEQQLQVIFEVLEEYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALT
::: : ::::::.:.:::::::..:...:. ::: :: .....:.: :.:. ..:
XP_006 QLGVSLEQQLQVLFKVLEEYDWSAFAVITSLHPGHALFLEGVRAVADASHVSWRLLDVVT
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LD--PGAGEAVLSAQLRSVSAQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLA
:. ::. .: . ::...: . . .:.::::: .: : .:::.: :.::.. :.::
XP_006 LELGPGGPRARTQRLLRQLDAPVFVAYCSREEAEVLFAEAAQAGLVGPGHVWLV--PNLA
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 GGGGSGAPGEPPLLPGGAPLPAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGF
:. :: : .:.::..: . .:: .: ..: :::..: ::.. :..:
XP_006 ----LGSTDAPP-----ATFPVGLISVVTESWRLSLRQKVRDGVAILALGAHSYWRQHGT
340 350 360 370 380
350 360 370 380 390
pF1KE2 LPELGHDCRAQNR--THRGESLHRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTW
:: . :::.. . :...:...:.::..::.::. :.::.:..:::.:.: : :
XP_006 LPAPAGDCRVHPGPVSPAREAFYRHLLNVTWEGRDFSFSPGGYLVQPTMVVIALNRHRLW
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 EVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYGRFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRD
:.:: ::. .: .:::.: ::. :::: :..:::::::::::::::: :: .: :. .
XP_006 EMVGRWEHGVLYMKYPVWPRYSASLQPVVDSRHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPN
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 SVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKID
.:::: : :.: : :. : :::::::::::.::... :::::::::::::::..
XP_006 TVPCRRQSNHTFSG--DVAPYTKLCCKGFCIDILKKLARVVKFSYDLYLVTNGKHGKRVR
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 GVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFL
::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GVWNGMIGEVYYKRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFL
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 EPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVTVFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWA
::::::::::::::::::::.:::.:::.:::.::..:. ::. :: .::::::.:::::
XP_006 EPYSPAVWVMMFVMCLTVVAITVFMFEYFSPVSYNQNLTRGKKSGGPAFTIGKSVWLLWA
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 LVFNNSVPVENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKF
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::
XP_006 LVFNNSVPIENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEQYIDTVSGLSDKKF
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 QRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIY
::::.::::..::::::::::.:::::: :::..::..:: ::.:::.:: ::::::::
XP_006 QRPQDQYPPFRFGTVPNGSTERNIRSNYRDMHTHMVKFNQRSVEDALTSLKMGKLDAFIY
750 760 770 780 790 800
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 DAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEM
::::::::: ::::::::::::::::::::::::..: :.::: ::::::::::: : .
XP_006 DAAVLNYMAGKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIAMQKDSHWKRAIDLALLQFLGDGETQK
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:: .::::::.:.: :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::: .
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. ..:::::::::.::: :. : : :: :: : .: . .:
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:: . .. . ::..... : :: : : : .: : :: :.
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.:: .: :. .. :: :. .. : ::. : :::: .. .. :
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.... .:...:. ....:: .: .: .: : .:: ...:.:::..: ::.:.:
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