Result of FASTA (ccds) for pF1KE2344
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2344, 1336 aa
  1>>>pF1KE2344 1336 - 1336 aa - 1336 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4847+/-0.00112; mu= -1.1310+/- 0.068
 mean_var=504.9115+/-105.035, 0's: 0 Z-trim(116.2): 88  B-trim: 163 in 1/53
 Lambda= 0.057078
 statistics sampled from 16735 (16814) to 16735 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.777), E-opt: 0.2 (0.516), width:  16
 Scan time:  6.990

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19        (1336) 9401 790.0       0
CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17        (1233) 3538 307.1 1.9e-82
CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17        ( 873) 3471 301.5 6.8e-81
CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16        (1281) 2694 237.7 1.6e-61
CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16        (1464) 2694 237.7 1.7e-61
CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12         (1484) 2627 232.2 8.1e-60
CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19      (1043)  993 97.5   2e-19
CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9        (1115)  919 91.4 1.5e-17
CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9          ( 885)  851 85.7 6.1e-16
CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9           ( 901)  851 85.7 6.1e-16
CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9           ( 938)  851 85.7 6.3e-16
CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9          ( 906)  799 81.4 1.2e-14
CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9          ( 943)  799 81.5 1.2e-14
CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11          ( 956)  675 71.3 1.5e-11
CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1            ( 919)  661 70.1 3.2e-11
CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19         ( 980)  657 69.8 4.2e-11
CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19         ( 981)  645 68.8 8.3e-11
CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 905)  642 68.5 9.4e-11
CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 920)  642 68.5 9.5e-11


>>CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19             (1336 aa)
 initn: 9401 init1: 9401 opt: 9401  Z-score: 4202.6  bits: 790.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9401; 100.0% identity (100.0% similar) in 1336 aa overlap (1-1336:1-1336)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAGGPGGGLGGARPLNVALVFSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MRGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAGGPGGGLGGARPLNVALVFSGP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 AYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 SRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 EYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAVLSAQLRSVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAVLSAQLRSVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 AQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 PAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNRTHRGESL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNRTHRGESL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 HRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 RFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 VFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 NIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 GKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 DIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 AAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADG
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 FHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGRPLSPPAAQPPQKPPPSYFAIVRDKEPAEPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGRPLSPPAAQPPQKPPPSYFAIVRDKEPAEPP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 AGAFPGFPSPPAPPAAAATAVGPPLCRLAFEDESPPAPARWPRSDPESQPLLGPGAGGAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AGAFPGFPSPPAPPAAAATAVGPPLCRLAFEDESPPAPARWPRSDPESQPLLGPGAGGAG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 GTGGAGGGAPAAPPPCRAAPPPCPYLDLEPSPSDSEDSESLGGASLGGLEPWWFADFPYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GTGGAGGGAPAAPPPCRAAPPPCPYLDLEPSPSDSEDSESLGGASLGGLEPWWFADFPYP
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 YAERLGPPPGRYWSVDKLGGWRAGSWDYLPPRSGPAAWHCRHCASLELLPPPRHLSCSHD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YAERLGPPPGRYWSVDKLGGWRAGSWDYLPPRSGPAAWHCRHCASLELLPPPRHLSCSHD
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 GLDGGWWAPPPPPWAAGPLPRRRARCGCPRSHPHRPRASHRTPAAAAPHHHRHRRAAGGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GLDGGWWAPPPPPWAAGPLPRRRARCGCPRSHPHRPRASHRTPAAAAPHHHRHRRAAGGW
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 DLPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPARRLTGPSRHARRCPHAAHWGPPLPTASHRRHRGGDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DLPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPARRLTGPSRHARRCPHAAHWGPPLPTASHRRHRGGDL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      
pF1KE2 GTRRGSAHFSSLESEV
       ::::::::::::::::
CCDS12 GTRRGSAHFSSLESEV
             1330      

>>CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17             (1233 aa)
 initn: 3099 init1: 2393 opt: 3538  Z-score: 1593.8  bits: 307.1 E(32554): 1.9e-82
Smith-Waterman score: 3801; 51.1% identity (68.9% similar) in 1294 aa overlap (38-1288:19-1227)

        10        20        30         40        50          60    
pF1KE2 RGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAG-GPGGGLGGARPLNVALVFS--GPAYAA
                                     :: ::: :  :   ..::.:::  ::  : 
CCDS32             MGGALGPALLLTSLFGAWAGLGPGQGEQG---MTVAVVFSSSGPPQAQ
                           10        20           30        40     

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE2 EAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDDSRAP
         ::: :   . .  : :...:... .: ..: ::. :.: ::.. .:::.::::.  . 
CCDS32 FRARLTP--QSFLDLP-LEIQPLTVGVNTTNPSSLLTQICGLLGAAHVHGIVFEDNVDTE
          50           60        70        80        90       100  

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE2 AVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLEEYDW
       ::: ::::.:.:: .::... ::.:.:::::: ::.::::: : ::::::.:.:::::::
CCDS32 AVAQILDFISSQTHVPILSISGGSAVVLTPKEPGSAFLQLGVSLEQQLQVLFKVLEEYDW
            110       120       130       140       150       160  

          190       200       210       220         230       240  
pF1KE2 TSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLD--PGAGEAVLSAQLRSVSAQ
       ..:...:.  :::  ::  .....:.: :.:.   ..::.  ::. .:  .  ::...: 
CCDS32 SAFAVITSLHPGHALFLEGVRAVADASHVSWRLLDVVTLELGPGGPRARTQRLLRQLDAP
            170       180       190       200       210       220  

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE2 IRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPLPA
       . . .:.::::: .:  : .:::.: :.::..  :.::     :.   ::     : .:.
CCDS32 VFVAYCSREEAEVLFAEAAQAGLVGPGHVWLV--PNLA----LGSTDAPP-----ATFPV
            230       240       250             260            270 

            310       320       330       340       350         360
pF1KE2 GLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNR--THRGESL
       ::..: . .:: .: ..:  :::..: ::..  :..: ::  . :::..    .   :..
CCDS32 GLISVVTESWRLSLRQKVRDGVAILALGAHSYWRQHGTLPAPAGDCRVHPGPVSPAREAF
             280       290       300       310       320       330 

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pF1KE2 HRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYG
       .:...:.::..::.::.  :.::.:..:::.:.: : ::.:: ::. .: .:::.: ::.
CCDS32 YRHLLNVTWEGRDFSFSPGGYLVQPTMVVIALNRHRLWEMVGRWEHGVLYMKYPVWPRYS
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pF1KE2 RFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPE
         :::: :..::::::::::::::::  :: .: :. ..:::: : :.: :    ::   
CCDS32 ASLQPVVDSRHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPNTVPCRRQSNHTFSSGDVAPYT-
             400       410       420       430       440       450 

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pF1KE2 KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSL
       : :::::::::::.::... :::::::::::::::.. ::::::::::.:.:::::::::
CCDS32 KLCCKGFCIDILKKLARVVKFSYDLYLVTNGKHGKRVRGVWNGMIGEVYYKRADMAIGSL
              460       470       480       490       500       510

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pF1KE2 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS32 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAIT
              520       530       540       550       560       570

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pF1KE2 VFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVL
       ::.:::.:::.::..:. ::. :: .::::::.:::::::::::::.:::::::::::::
CCDS32 VFMFEYFSPVSYNQNLTRGKKSGGPAFTIGKSVWLLWALVFNNSVPIENPRGTTSKIMVL
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pF1KE2 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEK
       ::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::::::.::::..::::::::::.
CCDS32 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEQYIDTVSGLSDKKFQRPQDQYPPFRFGTVPNGSTER
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pF1KE2 NIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGS
       :::::: :::..::..::  ::.:::.:: ::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS32 NIRSNYRDMHTHMVKFNQRSVEDALTSLKMGKLDAFIYDAAVLNYMAGKDEGCKLVTIGS
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pF1KE2 GKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKL
       ::::::::::::..: :.::: ::::::::::: : . :: .::::::.:.: :::::::
CCDS32 GKVFATTGYGIAMQKDSHWKRAIDLALLQFLGDGETQKLETVWLSGICQNEKNEVMSSKL
              760       770       780       790       800       810

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pF1KE2 DIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
       ::::::::::::::::::.::::::::::::.::: .  . ..:::::::::.::: :. 
CCDS32 DIDNMAGVFYMLLVAMGLALLVFAWEHLVYWKLRHSVPNSSQLDFLLAFSRGIYSCFSGV
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pF1KE2 AAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADG
                   : : ::    :: : .:   .   .::: .  .. .      ::....
CCDS32 ------------QSLASP----PRQA-SPDLTASSAQASVLKMLQA-ARDMVTTAGVSSS
                              880        890        900       910  

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pF1KE2 FHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGRPLSP--PAAQPPQKPPPSYFAIVRDKEPAE
       . :    ::  : :         :   .: : ::  :. .:: .: :. ..         
CCDS32 LDRATRTIENWGGGRRAPPPSPCPTPRSG-P-SPCLPTPDPPPEPSPTGWG---------
            920       930       940         950       960          

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pF1KE2 PPAGAFPGFPS-PPAPPAAAATAVGPPLCRLAFEDESPPAPARWPRSDPESQPLLGPGAG
       :: :.  ..    : ::.   :  ::::  ..  .. :   ::::               
CCDS32 PPDGGRAALVRRAPQPPGRPPTP-GPPLSDVSRVSRRPAWEARWPVRT------------
             970       980        990      1000                    

      1080      1090      1100            1110      1120      1130 
pF1KE2 GAGGTGGAGGGAPAAPPPCRAAPPPC------PYLDLEPSPSDSEDSESLGGASLGGLEP
       :  :   ...  : .:  :. .  :       :.: : :   . ::   ::  .:.  : 
CCDS32 GHCGRHLSASERPLSPARCHYSSFPRADRSGRPFLPLFP---ELEDLPLLGPEQLARREA
     1010      1020      1030      1040         1050      1060     

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pF1KE2 WWFADFPYPYAERLGPPPGRYWSVDKLGGWRAGSWDYLPPR-SGPAAWH------CRHCA
          : .      : .  :.   :: .  . : .:   ::   .:::  .      ::. :
CCDS32 LLHAAWARGSRPRHASLPS---SVAEAFA-RPSS---LPAGCTGPACARPDGHSACRRLA
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pF1KE2 SLELLPPPRHLSCSHDGLDGGWWAPPPPPWAAGPLPRRRARCGCPRSH---------PHR
       . . .  : .    ..: ..:      : :      .:.  :   ..:         :: 
CCDS32 QAQSMCLPIYREACQEGEQAG-----APAW-----QHRQHVCLHAHAHLPFCWGAVCPHL
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pF1KE2 PR-ASHRT--PAAAAPHHHRHR--------RAAGGWDLPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPA
       :  ::: .   .: .:  :: :        : .:: :       ::  .  .. :     
CCDS32 PPCASHGSWLSGAWGPLGHRGRTLGLGTGYRDSGGLD-----EISRVARGTQGFPGPCTW
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pF1KE2 RRLTGPSRHARRCPHAAHWGPPLPTASHRRHRGGDLGTRRGSAHFSSLESEV
       ::..                                                
CCDS32 RRISSLESEV                                          
          1230                                             

>>CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17             (873 aa)
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                                     :: ::: :  :   ..::.:::  ::  : 
CCDS62             MGGALGPALLLTSLFGAWAGLGPGQGEQG---MTVAVVFSSSGPPQAQ
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pF1KE2 EAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDDSRAP
         ::: :   . .  : :...:... .: ..: ::. :.: ::.. .:::.::::.  . 
CCDS62 FRARLTP--QSFLDLP-LEIQPLTVGVNTTNPSSLLTQICGLLGAAHVHGIVFEDNVDTE
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pF1KE2 AVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLEEYDW
       ::: ::::.:.:: .::... ::.:.:::::: ::.::::: : ::::::.:.:::::::
CCDS62 AVAQILDFISSQTHVPILSISGGSAVVLTPKEPGSAFLQLGVSLEQQLQVLFKVLEEYDW
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pF1KE2 TSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLD--PGAGEAVLSAQLRSVSAQ
       ..:...:.  :::  ::  .....:.: :.:.   ..::.  ::. .:  .  ::...: 
CCDS62 SAFAVITSLHPGHALFLEGVRAVADASHVSWRLLDVVTLELGPGGPRARTQRLLRQLDAP
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pF1KE2 IRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPLPA
       . . .:.::::: .:  : .:::.: :.::..  :.::     :.   ::     : .:.
CCDS62 VFVAYCSREEAEVLFAEAAQAGLVGPGHVWLV--PNLA----LGSTDAPP-----ATFPV
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pF1KE2 GLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNR--THRGESL
       ::..: . .:: .: ..:  :::..: ::..  :..: ::  . :::..    .   :..
CCDS62 GLISVVTESWRLSLRQKVRDGVAILALGAHSYWRQHGTLPAPAGDCRVHPGPVSPAREAF
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pF1KE2 HRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYG
       .:...:.::..::.::.  :.::.:..:::.:.: : ::.:: ::. .: .:::.: ::.
CCDS62 YRHLLNVTWEGRDFSFSPGGYLVQPTMVVIALNRHRLWEMVGRWEHGVLYMKYPVWPRYS
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         :::: :..::::::::::::::::  :: .: :. ..:::: : :.: :    ::   
CCDS62 ASLQPVVDSRHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPNTVPCRRQSNHTFSSGDVAPYT-
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       : :::::::::::.::... :::::::::::::::.. ::::::::::.:.:::::::::
CCDS62 KLCCKGFCIDILKKLARVVKFSYDLYLVTNGKHGKRVRGVWNGMIGEVYYKRADMAIGSL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS62 TINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAIT
              520       530       540       550       560       570

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CCDS62 VFMFEYFSPVSYNQNLTRGKKSGGPAFTIGKSVWLLWALVFNNSVPIENPRGTTSKIMVL
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pF1KE2 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEK
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CCDS62 VWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEQYIDTVSGLSDKKFQRPQDQYPPFRFGTVPNGSTER
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       :::::: :::..::..::  ::.:::.:: ::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS62 NIRSNYRDMHTHMVKFNQRSVEDALTSLKMGKLDAFIYDAAVLNYMAGKDEGCKLVTIGS
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pF1KE2 GKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKL
       ::::::::::::..: :.::: ::::::::::: : . :: .::::::.:.: :::::::
CCDS62 GKVFATTGYGIAMQKDSHWKRAIDLALLQFLGDGETQKLETVWLSGICQNEKNEVMSSKL
              760       770       780       790       800       810

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pF1KE2 DIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
       ::::::::::::::::::.::::::::::::.::: .  . ..::::::::       . 
CCDS62 DIDNMAGVFYMLLVAMGLALLVFAWEHLVYWKLRHSVPNSSQLDFLLAFSR-------VG
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pF1KE2 AAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADG
       : : : .:                                                    
CCDS62 AHPSPHRPKF                                                  
           870                                                     

>>CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16             (1281 aa)
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             10        20        30        40        50        60  
pF1KE2 GAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAGGPGGGLGGARPLNVALVFSGPAY
                                     :.:..:.  :        ::.:... : ..
CCDS45           MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPP-----ALNIAVML-GHSH
                         10        20        30             40     

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pF1KE2 AAEAARL----GPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFE
        .   .:    ::  ::..  : :::  :::..: .::.::. ..:::.:: :.::.:: 
CCDS45 DVTERELRTLWGPEQAAGL--P-LDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFG
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pF1KE2 DDSRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEV
       ::.   ::: .:::.:..: .::...::::..... :.  :::.:.:.: .::  :....
CCDS45 DDTDQEAVAQMLDFISSHTFVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKI
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pF1KE2 LEEYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAVLSAQLRS
       ...:::  :  :::  ::.: :.:.... .:.:.:::. ....::: .  .:  ..::..
CCDS45 MQDYDWHVFSLVTTIFPGYREFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKK
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pF1KE2 VSAQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGA
       . ... ::.:...::  ..  :.  ::::  . :..  :.:..:.    : :        
CCDS45 IHSSVILLYCSKDEAVLILSEARSLGLTGYDFFWIV--PSLVSGNTELIPKE--------
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pF1KE2 PLPAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNRTHRGE
        .:.::..:    :  .:  ::  :..... .:...:. ....::   .: .:   .: :
CCDS45 -FPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILTTAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQ--MERPE
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pF1KE2 ----SLHRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYP
           .:: ...:.:::..: ::.:.:. :.: :::: :..:: :: ::.::..:: :.. 
CCDS45 VPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPRLVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHA
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pF1KE2 LWSRYGRFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPP
       .: ::  : .   : .::...:::: ::::::  ::.. ::.:..::::. .. ..:   
CCDS45 VWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNS--T
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pF1KE2 DAPRPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRAD
       .     :.:::::::::::.:..:. :.::::::::::::::...::::::::: :::: 
CCDS45 NEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAV
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pF1KE2 MAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCL
       ::.:::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::.: .:::::::: :
CCDS45 MAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLL
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pF1KE2 TVVAVTVFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTT
        : :..::.:::.:::::::.:: :: : : .:::::.:::::.:::::::::.::.:::
CCDS45 IVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTT
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       ::::: :::::::::::::::::::::::::.:: :.::::.:::::..  ::..:::::
CCDS45 SKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVDQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVP
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pF1KE2 NGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCK
       :::::.:::.::: ::.::...::  ::.::..::.::::::::::::::: : .:::::
CCDS45 NGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCK
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pF1KE2 LVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIE
       ::::::: .::::::::::.::: ::: ::::::::.:: :.: :: :::.:::::.: :
CCDS45 LVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNE
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pF1KE2 VMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGP--THRMDFLLAFSRG
       ::::.::::::::::::: .::.:::..: :::: ::.:: :.    . :  .:...:::
CCDS45 VMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHLFYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRG
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pF1KE2 MYSCCSAEAAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPP
       .:::  .       : :                                           
CCDS45 IYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRSAKNISSMSNMNSSRMDSPKRAADFIQ
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>>CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16             (1464 aa)
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pF1KE2 GAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAGGPGGGLGGARPLNVALVFSGPAY
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CCDS10           MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPP-----ALNIAVML-GHSH
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pF1KE2 AAEAARL----GPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFE
        .   .:    ::  ::..  : :::  :::..: .::.::. ..:::.:: :.::.:: 
CCDS10 DVTERELRTLWGPEQAAGL--P-LDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFG
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pF1KE2 DDSRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEV
       ::.   ::: .:::.:..: .::...::::..... :.  :::.:.:.: .::  :....
CCDS10 DDTDQEAVAQMLDFISSHTFVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKI
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pF1KE2 LEEYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAVLSAQLRS
       ...:::  :  :::  ::.: :.:.... .:.:.:::. ....::: .  .:  ..::..
CCDS10 MQDYDWHVFSLVTTIFPGYREFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKK
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pF1KE2 VSAQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGA
       . ... ::.:...::  ..  :.  ::::  . :..  :.:..:.    : :        
CCDS10 IHSSVILLYCSKDEAVLILSEARSLGLTGYDFFWIV--PSLVSGNTELIPKE--------
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pF1KE2 PLPAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRAQNRTHRGE
        .:.::..:    :  .:  ::  :..... .:...:. ....::   .: .:   .: :
CCDS10 -FPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILTTAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQ--MERPE
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pF1KE2 ----SLHRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTLRLKYP
           .:: ...:.:::..: ::.:.:. :.: :::: :..:: :: ::.::..:: :.. 
CCDS10 VPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPRLVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHA
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pF1KE2 LWSRYGRFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPP
       .: ::  : .   : .::...:::: ::::::  ::.. ::.:..::::. .. ..:   
CCDS10 VWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNS--T
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pF1KE2 DAPRPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRAD
       .     :.:::::::::::.:..:. :.::::::::::::::...::::::::: :::: 
CCDS10 NEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAV
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pF1KE2 MAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCL
       ::.:::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::.: .:::::::: :
CCDS10 MAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLL
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pF1KE2 TVVAVTVFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTT
        : :..::.:::.:::::::.:: :: : : .:::::.:::::.:::::::::.::.:::
CCDS10 IVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTT
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       ::::: :::::::::::::::::::::::::.:: :.::::.:::::..  ::..:::::
CCDS10 SKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVDQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVP
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       :::::.:::.::: ::.::...::  ::.::..::.::::::::::::::: : .:::::
CCDS10 NGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCK
        690       700       710       720       730       740      

          780       790       800       810       820       830    
pF1KE2 LVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIE
       ::::::: .::::::::::.::: ::: ::::::::.:: :.: :: :::.:::::.: :
CCDS10 LVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNE
        750       760       770       780       790       800      

          840       850       860       870         880       890  
pF1KE2 VMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGP--THRMDFLLAFSRG
       ::::.::::::::::::: .::.:::..: :::: ::.:: :.    . :  .:...:::
CCDS10 VMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHLFYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRG
        810       820       830       840       850       860      

            900       910       920       930       940       950  
pF1KE2 MYSCCSAEAAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPP
       .:::  .       : :                                           
CCDS10 IYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRSAKNISSMSNMNSSRMDSPKRAADFIQ
        870       880       890       900       910       920      

>>CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12              (1484 aa)
 initn: 2967 init1: 2106 opt: 2627  Z-score: 1187.4  bits: 232.2 E(32554): 8.1e-60
Smith-Waterman score: 3185; 57.1% identity (82.3% similar) in 823 aa overlap (82-896:62-871)

              60        70        80         90        100         
pF1KE2 NVALVFSGPAYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRP-VALV-LNGSDPRSLVLQLCDLLSG
                                     :.: : : :: .: .::.:.. ..:::.: 
CCDS86 PPSIGIAVILVGTSDEVAIKDAHEKDDFHHLSVVPRVELVAMNETDPKSIITRICDLMSD
              40        50        60        70        80        90 

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE2 LRVHGVVFEDDSRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTE
        ...:::: ::.   :.: ::::.::::  ::...:::...... :...: :.:.: : :
CCDS86 RKIQGVVFADDTDQEAIAQILDFISAQTLTPILGIHGGSSMIMADKDESSMFFQFGPSIE
             100       110       120       130       140       150 

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE2 QQLQVIFEVLEEYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGA--
       :: .:.....:::::  :  :::  ::.. :.. :.   ..:.:::: . .: :: .   
CCDS86 QQASVMLNIMEEYDWYIFSIVTTYFPGYQDFVNKIRSTIENSFVGWELEEVLLLDMSLDD
             160       170       180       190       200       210 

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE2 GEAVLSAQLRSVSAQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGA
       :.. .. ::..... : ::.:..:::  .:..:. .:::: ::.:..  :.:..:  . .
CCDS86 GDSKIQNQLKKLQSPIILLYCTKEEATYIFEVANSVGLTGYGYTWIV--PSLVAGDTDTV
             220       230       240       250         260         

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE2 PGEPPLLPGGAPLPAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHD
       :.:         .:.::..:    :   :  ::  :.:... .:. .: ...:.::   .
CCDS86 PAE---------FPTGLISVSYDEWDYGLPARVRDGIAIITTAASDMLSEHSFIPEPKSS
     270                280       290       300       310       320

       350         360       370       380       390       400     
pF1KE2 CRA--QNRTHRGESLHRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWE
       :    ..: .... :.::..:.:...:. ::.:::. ..:.::.: :...: :: ::.:.
CCDS86 CYNTHEKRIYQSNMLNRYLINVTFEGRNLSFSEDGYQMHPKLVIILLNKERKWERVGKWK
              330       340       350       360       370       380

         410       420       430       440       450       460     
pF1KE2 QQTLRLKYPLWSRYGRFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQ
       ...:..:: .: :.    .  .: .::...:::: :::::: .::.::::.:..:::...
CCDS86 DKSLQMKYYVWPRMCPETEEQED-DHLSIVTLEEAPFVIVESVDPLSGTCMRNTVPCQKR
              390       400        410       420       430         

         470       480       490       500       510       520     
pF1KE2 LNRTHSPPPDAPRPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMI
       .  :..   . :   :.:::::::::::...... :.:::::::::::::::.:.:::::
CCDS86 IV-TENKTDEEPGYIKKCCKGFCIDILKKISKSVKFTYDLYLVTNGKHGKKINGTWNGMI
     440        450       460       470       480       490        

         530       540       550       560       570       580     
pF1KE2 GEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAV
       ::: ..:: ::.:::::::::::.:::::::.::::::::.::::::::::::::.:  :
CCDS86 GEVVMKRAYMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFIETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSADV
      500       510       520       530       540       550        

         590       600       610       620       630       640     
pF1KE2 WVMMFVMCLTVVAVTVFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSV
       ::::::: : : ::.::.:::.::::::: :: :..::: .:::::.:::::.:::::::
CCDS86 WVMMFVMLLIVSAVAVFVFEYFSPVGYNRCLADGREPGGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSV
      560       570       580       590       600       610        

         650       660       670       680       690       700     
pF1KE2 PVENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQY
       ::.::.:::::::: :::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::..  
CCDS86 PVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDQVSGLSDKKFQRPNDFS
      620       630       640       650       660       670        

         710       720       730       740       750       760     
pF1KE2 PPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNY
       ::..::::::::::.:::.:: .::.:: ..::  :..:: .::.:::::::::::::::
CCDS86 PPFRFGTVPNGSTERNIRNNYAEMHAYMGKFNQRGVDDALLSLKTGKLDAFIYDAAVLNY
      680       690       700       710       720       730        

         770       780       790       800       810       820     
pF1KE2 MARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLS
       :: .::::::::::::::::.::::::..: : ::: .:::.::..:: :.: :: :::.
CCDS86 MAGRDEGCKLVTIGSGKVFASTGYGIAIQKDSGWKRQVDLAILQLFGDGEMEELEALWLT
      740       750       760       770       780       790        

         830       840       850       860       870         880   
pF1KE2 GICHNDKIEVMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHC-LGP-THRM
       :::::.: :::::.::::::::::::: .::.:::..:  ::: ::..::: .:  . . 
CCDS86 GICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLGAAMALSLITFICEHLFYWQFRHCFMGVCSGKP
      800       810       820       830       840       850        

           890       900       910       920       930       940   
pF1KE2 DFLLAFSRGMYSCCSAEAAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRW
        .....:::.:::                                               
CCDS86 GMVFSISRGIYSCIHGVAIEERQSVMNSPTATMNNTHSNILRLLRTAKNMANLSGVNGSP
      860       870       880       890       900       910        

>>CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19           (1043 aa)
 initn: 514 init1: 344 opt: 993  Z-score: 462.1  bits: 97.5 E(32554): 2e-19
Smith-Waterman score: 1108; 29.3% identity (55.4% similar) in 1037 aa overlap (32-1005:14-980)

              10        20        30        40              50     
pF1KE2 RGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAGG---PGG---GLGGARPLNVAL
                                     : :::.:::   : :    :::.  :. ::
CCDS32                  MEFVRALWLGLALALGPGSAGGHPQPCGVLARLGGSVRLG-AL
                                10        20        30        40   

          60        70        80         90       100       110    
pF1KE2 VFSGPAYAAEAARLGPAVAAAVRSP-GLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHG
       .  .:   :.:      .: : : : .:... :. .  . :: ::.  ::. :    : .
CCDS32 LPRAPLARARARAALARAALAPRLPHNLSLELVVAAPPARDPASLTRGLCQALVPPGVAA
             50        60        70        80        90       100  

          120       130       140       150       160          170 
pF1KE2 VVFEDDSRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTF-LQL--GSSTEQQ
       ..   ..: : .   : ::.: :  :....    :   .:    . : :::  .:  :  
CCDS32 LLAFPEAR-PELLQ-LHFLAAATETPVLSLLRREAR--APLGAPNPFHLQLHWASPLETL
            110         120       130         140       150        

             180         190       200       210       220         
pF1KE2 LQVIFEVLEEYDW--TSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGA----LTLDP
       :.:.  ::. . :  ....   :. ::             : .. :  :..    :.:: 
CCDS32 LDVLVAVLQAHAWEDVGLALCRTQDPG-------------GLVALWTSRAGRPPQLVLDL
      160       170       180                    190       200     

            230       240                250       260       270   
pF1KE2 G---AGEAVLSAQLRSVSAQIR---------LLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWF
       .   .:.: : :.:  ..: .          :: :   .:. :..:.        :  :.
CCDS32 SRRDTGDAGLRARLAPMAAPVGGEAPVPAAVLLGCDIARARRVLEAVPP------GPHWL
         210       220       230       240       250               

           280       290       300       310       320         330 
pF1KE2 MVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPLPAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVAR--GA
       .           :.:  :  ::  : :: ::.:.  .. :  :   .   : .:::  :.
CCDS32 L-----------GTPLPPKALPT-AGLPPGLLALGEVA-RPPLEAAIHDIVQLVARALGS
     260                  270        280        290       300      

              340         350       360       370       380        
pF1KE2 QALLRD-YGFLPELGH--DCRAQNRTHRGESLHRYFMNITWDNRDYSFNEDG---FLVNP
        : ..   ..::   .  : .  .    :. : :.. : ....:       :     .. 
CCDS32 AAQVQPKRALLPAPVNCGDLQPAGPESPGRFLARFLANTSFQGRTGPVWVTGSSQVHMSR
        310       320       330       340       350       360      

         390           400       410       420       430       440 
pF1KE2 SLVVISLTRDR----TWEVVGSWEQQTLRLKYPLWSRYGRFLQPVDDTQHLTVATLEERP
        . : :: ::     .: .::::..  : :.    :      : ..   .: :.:: :.:
CCDS32 HFKVWSLRRDPRGAPAWATVGSWRDGQLDLEPGGASARPPPPQGAQVWPKLRVVTLLEHP
        370       380       390       400       410       420      

                  450       460       470         480       490    
pF1KE2 FVIVEPAD-----PISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPD--APRPEKRCCKGFCIDILKR
       ::...  :     : .  :.  ..   . :.   .   .  :::  ..:: :.:::.:.:
CCDS32 FVFARDPDEDGQCPAGQLCLDPGTNDSATLDALFAALANGSAPRALRKCCYGYCIDLLER
        430       440       450       460       470       480      

          500       510       520       530       540       550    
pF1KE2 LAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSV
       ::.   :...:::: .::.:   :: :.:..:...  :: ::. :..::  ::..:::. 
CCDS32 LAEDTPFDFELYLVGDGKYGALRDGRWTGLVGDLLAGRAHMAVTSFSINSARSQVVDFTS
        490       500       510       520       530       540      

          560       570        580       590       600       610   
pF1KE2 PFVETGISVMVARSNGTVSP-SAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVTVFIFEYLSPVGYN
       ::  :....:: :.  :.:: .::. :   ..:. .:.  : ..:. . ..:. :: :  
CCDS32 PFFSTSLGIMV-RARDTASPIGAFMWPLHWSTWLGVFAA-LHLTALFLTVYEWRSPYG--
        550        560       570       580        590       600    

           620       630       640       650       660       670   
pF1KE2 RSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASY
         :.   :  ...:. .... : .:..:  .:  ..:.  :..... .::.: .. :.::
CCDS32 --LTPRGRNRSTVFSYSSALNLCYAILFRRTVSSKTPKCPTGRLLMNLWAIFCLLVLSSY
              610       620       630       640       650       660

           680       690       700       710       720       730   
pF1KE2 TANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYM
       :::::: :. ..  . .::. : :...: . .   .:::: ..:.:  :....::::..:
CCDS32 TANLAAVMVGDKTFEELSGIHDPKLHHPAQGF---RFGTVWESSAEAYIKKSFPDMHAHM
              670       680       690          700       710       

           740       750         760       770       780       790 
pF1KE2 VRYNQPRVEEALTQLKAG--KLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGI
        :.. : . .....: .   ::.:::.: ..:.: .  :  :::.:.:  : ::  ::::
CCDS32 RRHSAPTTPRGVAMLTSDPPKLNAFIMDKSLLDYEVSIDADCKLLTVG--KPFAIEGYGI
       720       730       740       750       760         770     

             800       810       820        830        840         
pF1KE2 ALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGI-CHNDKIEVMSS-KLDIDNMAGVF
       .: ..:     ..  . .. ..  :..:.  : . . : .  . :  . ...: ..::.:
CCDS32 GLPQNSPLTSNLSEFISRYKSSGFIDLLHDKWYKMVPCGKRVFAVTETLQMSIYHFAGLF
         780       790       800       810       820       830     

     850       860       870        880       890       900        
pF1KE2 YMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLR-HCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAEAAPPPAKP
        .: ...: .::    :: ...::    .    :... :  :. ..   ..:  :: .. 
CCDS32 VLLCLGLGSALLSSLGEH-AFFRLALPRIRKGSRLQYWLHTSQKIHRALNTE--PPEGSK
         840       850        860       870       880         890  

      910       920       930           940       950       960    
pF1KE2 PPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVP----RERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADGFHRY
           .  ::      .      : .:    : : .::. ::..    :. .         
CCDS32 EETAEAEPSGPEVEQQQQQQDQPTAPEGWKRARRAVDKERRVRFLLEPAVV---------
            900       910       920       930       940            

          970       980             990      1000      1010        
pF1KE2 YGPIEPQGLGLGLGEARAAPR-GAA-----GRPLSPPAAQPPQKPPPSYFAIVRDKEPAE
          . :.. .    ::.:::: : .     ::   ::::.:   : :             
CCDS32 ---VAPEADA----EAEAAPREGPVWLCSYGR---PPAARPTGAPQPGELQELERRIEVA
              950           960          970       980       990   

     1020      1030      1040      1050      1060      1070        
pF1KE2 PPAGAFPGFPSPPAPPAAAATAVGPPLCRLAFEDESPPAPARWPRSDPESQPLLGPGAGG
                                                                   
CCDS32 RERLRQALVRRGQLLAQLGDSARHRPRRLLQARAAPAEAPPHSGRPGSQE          
          1000      1010      1020      1030      1040             

>>CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9             (1115 aa)
 initn: 683 init1: 359 opt: 919  Z-score: 428.8  bits: 91.4 E(32554): 1.5e-17
Smith-Waterman score: 1035; 27.8% identity (58.3% similar) in 844 aa overlap (94-894:175-980)

            70        80        90       100       110       120   
pF1KE2 AEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFEDDSRA
                                     ::: :.. ..:  .    : ...   .:..
CCDS67 NLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQG
          150       160       170       180       190       200    

           130       140       150       160          170       180
pF1KE2 PAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTF-LQLG--SSTEQQLQVIFEVLE
         .   ::..:    .:....    .    :.:. . . :::.  .:  .. .:   .: 
CCDS67 EMME--LDLVSLVLHIPVISI----VRHEFPRESQNPLHLQLSLENSLSSDADVTVSILT
            210       220           230       240       250        

              190       200       210       220             230    
pF1KE2 EYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGAL---TLD-PGAGE--AVLSA
         .: .:  .  .   .   .. . .::...  .  : :..   : . :.. .  . :. 
CCDS67 MNNWYNFSLLLCQEDWN---ITDFLLLTQNN--SKFHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQI
      260       270          280         290       300       310   

            240        250       260       270       280       290 
pF1KE2 QLRSV--SAQIRLLF-CAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEP
       ::.:.  :.   ..: :  :  . .:. . . :.      : .        : :    : 
CCDS67 QLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVL--------GDSQNVEE-
           320       330       340       350               360     

             300       310       320       330          340        
pF1KE2 PLLPGGAPLPAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARG---AQALLRDYGFLPELGHDC
        :   :  :: ::.: ..   .. . . :  .. .:::.   :  .  . ...:    .:
CCDS67 -LRTEG--LPLGLIA-HGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPST-MNC
             370        380       390       400       410          

      350         360       370       380          390             
pF1KE2 RAQNRTH--RGESLHRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPS---LVVISLTRDRT----WE
          . :.   :. : :.. : :. . . :.   :  .  :   . . .: .:      : 
CCDS67 MEVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWT
     420       430       440       450       460       470         

     400       410       420            430       440              
pF1KE2 VVGSWEQQTLRLKYPLWSRYGR-----FLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPAD-----
        .:::.   . . : .: . ..     : .:  .  :: :.:: :.:::... .:     
CCDS67 RLGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHP--SKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLC
     480       490       500       510         520       530       

     450           460       470       480       490       500     
pF1KE2 PISGTCI----RDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDL
       : .  :.     ::    : ..  ::    .:   :.:: :.:::.:...:. ..:..::
CCDS67 PAGQLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDL
       540       550       560       570       580       590       

         510       520       530       540       550       560     
pF1KE2 YLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMV
       :.: .::.:   .: :.:..:...   : ::. :..::  ::...::. ::  :.....:
CCDS67 YIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILV
       600       610       620       630       640       650       

         570        580       590       600       610       620    
pF1KE2 ARSNGTVSP-SAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVTVFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGG
        :.  :..: .::. :   ..:. .::  : ..:: . ..:. :: :    :.   :  .
CCDS67 -RTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVA-LHITAVFLTLYEWKSPFG----LTPKGRNRS
        660       670       680        690       700           710 

          630       640       650       660       670       680    
pF1KE2 STFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQE
       ..:...... . .::.:. .: .. :.  :..... .::.: .. :..::::::: :. :
CCDS67 KVFSFSSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGE
             720       730       740       750       760       770 

          690       700       710       720       730       740    
pF1KE2 EYVDTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEA
       .  . .::. : :...:.. .   .:::: ..:.:  .:...:.:: :: ::: : . ..
CCDS67 KIYEELSGIHDPKLHHPSQGF---RFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDG
             780       790          800       810       820        

          750         760       770       780       790       800  
pF1KE2 LTQLKAG--KLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRP
       .  ::    ::::::.: :.:.: .  :  :::.:.  :: ::  ::::.:  .:     
CCDS67 VEYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTV--GKPFAIEGYGIGLPPNSPLTAN
      830       840       850       860         870       880      

            810       820        830        840       850       860
pF1KE2 IDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGI-CHNDKIEVMSS-KLDIDNMAGVFYMLLVAMGLSL
       :.  . :. .   ..::.  :   . : . .. :  . .. : ...:.: .: ...:::.
CCDS67 ISELISQYKSHGFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSI
        890       900       910       920       930       940      

              870       880       890       900       910       920
pF1KE2 LVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAEAAPPPAKPPPPPQPLPSPAY
       :.   ::.::  :   .    .... :  :. ..                          
CCDS67 LTTIGEHIVYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNV
        950       960       970       980       990      1000      

              930       940       950       960       970       980
pF1KE2 PAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADGFHRYYGPIEPQGLGLGLGEA
                                                                   
CCDS67 GPRQLTVWNTSNLSHDNRRKYIFSDEEGQNQLGIRIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKAD
       1010      1020      1030      1040      1050      1060      

>>CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9               (885 aa)
 initn: 642 init1: 202 opt: 851  Z-score: 399.7  bits: 85.7 E(32554): 6.1e-16
Smith-Waterman score: 1000; 26.4% identity (62.1% similar) in 821 aa overlap (99-890:74-853)

       70        80        90       100       110            120   
pF1KE2 LGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFE-----DDSRA
                                     ..:..:. : . .:....       .:  .
CCDS43 EAVNQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFT
            50        60        70        80        90       100   

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE2 PAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLEEYD
       :.  :. .. ..   .:....    . . . :    .::.      .: .: ::... :.
CCDS43 PT--PV-SYTAGFYRIPVLGLTTRMS-IYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYS
              110       120        130       140       150         

           190       200       210       220       230        240  
pF1KE2 WTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAV-LSAQLRSVSAQ
       :. .. ...     ::  . .:.: .      :.  .: .:::. ... :  . . . :.
CCDS43 WNHIILLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAEK--VLQFDPGTKNVTALLMEAKELEAR
     160       170       180       190         200       210       

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE2 IRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPLPA
       . .:  ....:  :.:::   ..:::::::..   ...:..   ::              
CCDS43 VIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPD-------------
       220       230       240       250       260                 

            310       320       330       340        350        360
pF1KE2 GLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFL-PELGHDCRAQ-NRTHRGESL
       :.....  . ... :. .. .:.:::.... ::.  ..  :  :  : .. :  . :  .
CCDS43 GILGLQLINGKNESAH-ISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRG--CVGNTNIWKTGPLF
          270       280        290       300         310       320 

              370          380       390       400         410     
pF1KE2 HRYFMNITWDNR---DYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTL--RLKYPL
       .: .:.  . .       :::::     .  ...: ..:    :: ..   .    .  .
CCDS43 KRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNL-QNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKII
             330       340       350        360       370       380

         420         430       440       450       460             
pF1KE2 WSRYGRFLQP--VDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSV----PCRSQLNR-
       :   :.  .:   . . .: ..:....::: :.:.   .::: .. .    : .. .   
CCDS43 WPG-GETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLS-DGTCKEEFTVNGDPVKKVICTG
               390       400       410        420       430        

      470       480        490       500       510         520     
pF1KE2 THSPPPDAPRPE-KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHG--KKIDGV----W
        ..  : .::    .:: :::::.: .::.:..:.:...::..:: :  .....     :
CCDS43 PNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEW
      440       450       460       470       480       490        

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       :::.::..  .::: .. ::::.::.. ..:: ::   :....: .     . ..:..:.
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       . ..:...  . . :::: ..... .:: :  :  .....   ...:.....:. :....
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       :...    ::. ...:. .::: ::.:..::::::::::.. ..  . ..:..: ... :
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       ....    ..:: ..:..  .: .     :. .: ..:   . ::.  .. .:: :::.:
CCDS43 SDKFI---YATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWD
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       .:::.. :  .. : :::  .:..:  .:.::...: : ::. ..:..:.   .  .: :
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       ..: .. :::.                                                 
CCDS43 ARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQQYHPTDITGPLNLSDPSVSTVV                 
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CCDS70 KRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNL-QNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKII
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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