Result of FASTA (ccds) for pF1KE2551
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2551, 630 aa
  1>>>pF1KE2551 630 - 630 aa - 630 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1653+/-0.0011; mu= 20.1502+/- 0.066
 mean_var=71.3618+/-14.845, 0's: 0 Z-trim(103.1): 38  B-trim: 3 in 1/47
 Lambda= 0.151824
 statistics sampled from 7230 (7265) to 7230 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.223), width:  16
 Scan time:  2.980

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17        ( 630) 4285 948.5       0
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16        ( 617) 2089 467.4 2.4e-131
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16        ( 628) 2089 467.5 2.5e-131
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5          ( 620) 2065 462.2 9.3e-130
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12        ( 614) 1756 394.5 2.2e-109
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12        ( 602) 1733 389.5 7.1e-108
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3         ( 632) 1733 389.5 7.4e-108
CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX         ( 635) 1727 388.2 1.8e-107
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3          ( 599) 1699 382.0 1.2e-105
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3         ( 620) 1656 372.6 8.7e-103
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3         ( 721) 1656 372.7 9.8e-103
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5          ( 636) 1655 372.4  1e-102
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16        ( 512) 1638 368.6 1.1e-101
CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX         ( 520) 1364 308.6 1.4e-83
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11         ( 797) 1222 277.6 4.4e-74
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12       ( 510) 1186 269.6 7.3e-72
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1         ( 633) 1128 257.0 5.8e-68
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1         ( 652) 1128 257.0 5.9e-68
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1         ( 706) 1128 257.0 6.3e-68
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3        ( 555)  750 174.1 4.4e-43
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3        ( 208)  620 145.3 7.5e-35
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3         ( 200)  609 142.9 3.9e-34
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX       ( 642)  548 129.9   1e-29
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12       ( 289)  511 121.6 1.5e-27
CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1      ( 727)  515 122.7 1.7e-27
CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12       ( 730)  511 121.9 3.1e-27
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5      ( 634)  509 121.4 3.8e-27
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5       ( 628)  507 120.9 5.1e-27
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3       ( 592)  500 119.4 1.4e-26
CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12      ( 623)  451 108.7 2.5e-23
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19      ( 736)  341 84.6   5e-16


>>CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17             (630 aa)
 initn: 4285 init1: 4285 opt: 4285  Z-score: 5070.9  bits: 948.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4285; 100.0% identity (100.0% similar) in 630 aa overlap (1-630:1-630)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 METTPLNSQKQLSACEDGEDCQENGVLQKVVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 METTPLNSQKQLSACEDGEDCQENGVLQKVVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 HSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 YTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 AWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFSEDNITWTLHSTSPAEEFYTRHVLQIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFSEDNITWTLHSTSPAEEFYTRHVLQIH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 RSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 TLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 ALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPAS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 TFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 LTFGGAYVVKLLEEYATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LTFGGAYVVKLLEEYATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRIC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 WVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIIT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630
pF1KE2 PGTFKERIIKSITPETPTEIPCGDIRLNAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGTFKERIIKSITPETPTEIPCGDIRLNAV
              610       620       630

>>CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16             (617 aa)
 initn: 1655 init1: 766 opt: 2089  Z-score: 2471.5  bits: 467.4 E(32554): 2.4e-131
Smith-Waterman score: 2089; 52.6% identity (81.4% similar) in 555 aa overlap (79-626:56-607)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE2 AVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYI
                                     :::::::.::::::.:.::::.:::::::.
CCDS10 RARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRDGDAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYL
          30        40        50        60        70        80     

      110       120       130       140       150       160        
pF1KE2 CYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICII
       ::.:::::::.:::.. :..:.::::::::::::.:.:  ..: ::::.:::.:::. .:
CCDS10 CYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYNREGAATVW-KICPFFKGVGYAVILI
          90       100       110       120        130       140    

      170       180       190       200       210             220  
pF1KE2 AFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTN------YFSEDNITWTL
       :.:.. :::.:.::.::::.:::: .::::.: ..::. :::.          ..  .. 
CCDS10 ALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK
          150       160       170       180       190       200    

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE2 HSTSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVW
       .. .:: ::: : ::..:.:.:..:.:  .::: ::.:..  :.:::.::::::::::::
CCDS10 YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVW
          210       220       230       240       250       260    

            290       300       310       320       330       340  
pF1KE2 VTATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFG
       .:::.::..: ::::.:.:::::  :.  ::. .. .: :. ::::::.::::::: :::
CCDS10 ITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFG
          270       280       290       300       310       320    

            350       360       370       380       390       400  
pF1KE2 VLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAG
       ::.::::::::.::::.:::.:: .::.:::::::.::..:::::. .. .. .:: . :
CCDS10 VLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATE-G
          330       340       350       360       370       380    

            410       420       430       440       450       460  
pF1KE2 PSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRR
        .:.:: : :::... .:::.:..::.::..:::::...:.:.:::.. :.: .:  ..:
CCDS10 AGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDF-QVLKRHR
           390       400       410       420       430        440  

            470       480       490       500       510       520  
pF1KE2 ERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFC
       . :...:... :. .:  .: :: ::. ::. .:.: ..: ..:.::..::::::. .: 
CCDS10 KLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFS
            450       460       470       480       490       500  

            530       540       550       560       570       580  
pF1KE2 RDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIG
        :...:.:: :: .::.::  .:: ::::..   ...   :   .: .: :.  .:. :.
CCDS10 NDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIA
            510       520       530       540       550       560  

            590       600       610        620       630      
pF1KE2 TSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPETPTE-IPCGDIRLNAV      
        ::.. .: :. :... : :.. ::.  .::::.  . .   :::          
CCDS10 LSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
            570       580       590       600       610       

>>CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16             (628 aa)
 initn: 1630 init1: 766 opt: 2089  Z-score: 2471.3  bits: 467.5 E(32554): 2.5e-131
Smith-Waterman score: 2089; 52.6% identity (81.4% similar) in 555 aa overlap (79-626:56-607)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE2 AVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYI
                                     :::::::.::::::.:.::::.:::::::.
CCDS54 RARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRDGDAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYL
          30        40        50        60        70        80     

      110       120       130       140       150       160        
pF1KE2 CYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICII
       ::.:::::::.:::.. :..:.::::::::::::.:.:  ..: ::::.:::.:::. .:
CCDS54 CYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPLFYMELALGQYNREGAATVW-KICPFFKGVGYAVILI
          90       100       110       120        130       140    

      170       180       190       200       210             220  
pF1KE2 AFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTN------YFSEDNITWTL
       :.:.. :::.:.::.::::.:::: .::::.: ..::. :::.          ..  .. 
CCDS54 ALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK
          150       160       170       180       190       200    

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE2 HSTSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVW
       .. .:: ::: : ::..:.:.:..:.:  .::: ::.:..  :.:::.::::::::::::
CCDS54 YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVW
          210       220       230       240       250       260    

            290       300       310       320       330       340  
pF1KE2 VTATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFG
       .:::.::..: ::::.:.:::::  :.  ::. .. .: :. ::::::.::::::: :::
CCDS54 ITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFG
          270       280       290       300       310       320    

            350       360       370       380       390       400  
pF1KE2 VLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAG
       ::.::::::::.::::.:::.:: .::.:::::::.::..:::::. .. .. .:: . :
CCDS54 VLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATE-G
          330       340       350       360       370       380    

            410       420       430       440       450       460  
pF1KE2 PSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRR
        .:.:: : :::... .:::.:..::.::..:::::...:.:.:::.. :.: .:  ..:
CCDS54 AGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDF-QVLKRHR
           390       400       410       420       430        440  

            470       480       490       500       510       520  
pF1KE2 ERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFC
       . :...:... :. .:  .: :: ::. ::. .:.: ..: ..:.::..::::::. .: 
CCDS54 KLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFS
            450       460       470       480       490       500  

            530       540       550       560       570       580  
pF1KE2 RDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIG
        :...:.:: :: .::.::  .:: ::::..   ...   :   .: .: :.  .:. :.
CCDS54 NDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIA
            510       520       530       540       550       560  

            590       600       610        620       630           
pF1KE2 TSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPETPTE-IPCGDIRLNAV           
        ::.. .: :. :... : :.. ::.  .::::.  . .   :::               
CCDS54 LSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQMKTRQGRRRATN
            570       580       590       600       610       620  

CCDS54 SCQISC
             

>>CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5               (620 aa)
 initn: 1902 init1: 750 opt: 2065  Z-score: 2443.0  bits: 462.2 E(32554): 9.3e-130
Smith-Waterman score: 2065; 49.9% identity (79.6% similar) in 579 aa overlap (60-626:37-610)

      30        40        50        60        70            80     
pF1KE2 VVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLV----AELHQGERETWGKK
                                     ....  :..::.    . ..  .:::::::
CCDS38 SVGLMSSVVAPAKEPNAVGPKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKK
         10        20        30        40        50        60      

          90       100       110       120       130       140     
pF1KE2 VDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRN
       .::::::::.::::.:::::::.::.:::::::.:: .. ...:.:::::::::::..:.
CCDS38 IDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNRE
         70        80        90       100       110       120      

         150       160       170       180       190       200     
pF1KE2 GCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWN
       :  ..: :::::.::.:... .:..:.. .::.:.::::.::.:::: .:::  :.::::
CCDS38 GAAGVW-KICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWN
        130        140       150       160       170       180     

         210       220            230       240       250       260
pF1KE2 TGNCTNYFSEDNITWT-----LHSTSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIM
       . ::..    :.   .       .:.:: :.. : ::..:.:.:..:::   :::. :..
CCDS38 SPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLV
         190       200       210       220       230       240     

              270       280       290       300       310       320
pF1KE2 LIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKL
       :.....:::.::::::::::::.:::.::..:..::.::.:::::  :.  ::. .. .:
CCDS38 LVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRL
         250       260       270       280       290       300     

              330       340       350       360       370       380
pF1KE2 LETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIF
        :..::::::.:. :::: :::::.::.:::::.::::.::.::. .: .::: ::::.:
CCDS38 CEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVF
         310       320       330       340       350       360     

              390       400       410       420       430       440
pF1KE2 TVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTF
       . :::::. ..  ...:::: ::.:.:: : ::::..: :. .:..::.::.:::.::..
CCDS38 SFLGYMAQKHSVPIGDVAKD-GPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAM
         370       380        390       400       410       420    

              450       460       470       480       490       500
pF1KE2 AGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYATGPA
       .:.:.:::...::: ..  ..:: :.: .:.. :. ::  .: :: ::  ::...:.: .
CCDS38 GGMESVITGLIDEF-QLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAAGTS
          430        440       450       460       470       480   

              510       520       530       540       550          
pF1KE2 VLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMS-
       .:  .::::..:.::::. ::  :...: :  :. .::.::  .:: ::::..   ... 
CCDS38 ILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTF
           490       500       510       520       530       540   

      560       570       580       590       600       610        
pF1KE2 -PPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPETPT
        ::.     : .: :.  ::. :.:::.  .: : ::..   ::.:.:..  .:.::   
CCDS38 RPPHYG--AYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKDR
             550       560       570       580       590       600 

       620       630      
pF1KE2 E-IPCGDIRLNAV      
       : .  :..:          
CCDS38 ELVDRGEVRQFTLRHWLKV
             610       620

>>CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12             (614 aa)
 initn: 777 init1: 612 opt: 1756  Z-score: 2077.3  bits: 394.5 E(32554): 2.2e-109
Smith-Waterman score: 1756; 44.4% identity (74.9% similar) in 561 aa overlap (78-624:35-589)

        50        60        70        80        90       100       
pF1KE2 SAVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPY
                                     .:  : .:..:.::: :  . :::::::::
CCDS85 VAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPY
           10        20        30        40        50        60    

       110       120       130       140       150       160       
pF1KE2 ICYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICI
       .::.::::::..:: :. .  :::.:..:.:::::  .: .. ::::::.:.::: :  .
CCDS85 LCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGLASVV
           70        80        90       100       110       120    

       170       180       190       200       210          220    
pF1KE2 IAFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFSEDN---ITWTLHS
       :  :.  ::  :.::::.::.::::..::::.:.: ::: .::.......   .:   . 
CCDS85 IESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTPFENF
          130       140       150       160       170       180    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE2 TSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVT
       :::. ::. :.:: :  ..:..:::.. :.::::..: ... :: ::::::..::::. :
CCDS85 TSPVMEFWERRVLGI--TSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFT
          190         200       210       220       230       240  

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE2 ATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVL
       :::::..: .::.::.:::::..:...::::.  .: .  ::.::..:::::..   : :
CCDS85 ATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAICQGCL
            250       260       270       280       290       300  

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE2 LAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPS
        :..::::..::::.: ..   .:  ::::.:::.:..::.:.. ..  .:::: ..::.
CCDS85 TALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVA-ESGPG
            310       320       330       340       350        360 

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE2 LLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAK--RR
       : ::.. .:.. :: : ... .::.::: ::::: :. .: ..:: .: ::.   :  ::
CCDS85 LAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRKSGRR
             370       380       390       400       410       420 

            470       480       490        500       510       520 
pF1KE2 ERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYAT-GPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQF
       : ..:.... :.. .:  .: :: :. .:.. ::. :  .: ..:.:.: .:: ::  .:
CCDS85 ELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYGADRF
             430       440       450       460       470       480 

             530       540       550       560           570       
pF1KE2 CRDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYN----YPYWSIIL
         ....:.:. :  . .: :. ..: . :    .::.:  .   ..::    :: :.  .
CCDS85 YDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCL---ATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYSI
             490       500       510          520       530        

       580       590       600       610           620       630   
pF1KE2 GYCIGTSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPET----PTEIPCGDIRLNAV   
       :. .. ::..:.: ...  :. : : :..:. . :::..    : . :: :         
CCDS85 GWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFGP
      540       550       560       570       580       590        

CCDS85 SPTREGLIAGEKETHL
      600       610    

>>CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12             (602 aa)
 initn: 1470 init1: 1138 opt: 1733  Z-score: 2050.2  bits: 389.5 E(32554): 7.1e-108
Smith-Waterman score: 1733; 45.4% identity (74.1% similar) in 555 aa overlap (78-623:31-581)

        50        60        70        80        90       100       
pF1KE2 SAVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPY
                                     ::  :..:..:.::: :  . :::::::::
CCDS85 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPY
               10        20        30        40        50        60

       110       120       130       140       150       160       
pF1KE2 ICYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICI
       .::.::::::..:: .. .  :::.: .: :::::  .: .. ::::::::.:::::  .
CCDS85 LCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGYASQM
               70        80        90       100       110       120

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE2 IAFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFSEDNITW---TLHS
       :.. .  ::  ..::::.::.:::: .::: .: . ::: .: . :.. : .    . ..
CCDS85 IVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCME-FQKTNGSLNGTSENA
              130       140       150       160        170         

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE2 TSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVT
       :::. ::. :.::.:  : :.: ::.. :.::::..: ... :: ::::::..::::. :
CCDS85 TSPVIEFWERRVLKI--SDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFT
     180       190         200       210       220       230       

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE2 ATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVL
       :::::..: :::.::.::::: .:. ::: ::  .: .  ::.::..:::::..  .: :
CCDS85 ATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLGCL
       240       250       260       270       280       290       

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pF1KE2 LAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPS
        :..::::..::::.: ..   .:  ::::.::.::..::.:.. ..  .:::: ..::.
CCDS85 TALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVA-ESGPG
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KE2 LLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAK--RR
       : ::.: .:.. .: : ..:  ::.:.. ::::: :. .:...::..: .:::. :  ::
CCDS85 LAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNRR
        360       370       380       390       400       410      

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pF1KE2 ERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYA-TGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQF
       : ..:.: .. :. .:. :: :: :: .:.. :: .:  .: ::..:.. :.: ::  .:
CCDS85 EVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKRF
        420       430       440       450       460       470      

             530       540        550       560       570       580
pF1KE2 CRDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISP-LFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYC
         ....:.:. :  . . ::. ..: .    .. :..   :     .:.::.:.  ::. 
CCDS85 YDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGWL
        480       490       500       510       520       530      

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pF1KE2 IGTSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITP--ETPTEIPCGDIRLNAV        
       .. ::..:::..  :::    : :.::: . . :  . : . : :               
CCDS85 LALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPATPRTSLLRLT
        540       550       560       570       580       590      

CCDS85 ELESHC
        600  

>>CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3              (632 aa)
 initn: 1525 init1: 600 opt: 1733  Z-score: 2049.9  bits: 389.5 E(32554): 7.4e-108
Smith-Waterman score: 1733; 43.2% identity (72.0% similar) in 590 aa overlap (40-620:11-596)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KE2 KQLSACEDGEDCQENGVLQKVVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTRHSIPATTTT
                                     .:. ..      .::.: ..  . ::    
CCDS26                     MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPR
                                   10        20        30        40

      70        80        90       100       110       120         
pF1KE2 LVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLPYTIMAIFGG
       .  .    ::  :..::.:.::: :  . :::::::::.::.:::::::.::... :  :
CCDS26 VKRDKAVHERGHWNNKVEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCG
               50        60        70        80        90       100

     130       140       150       160       170       180         
pF1KE2 IPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIMAWALYYLIS
       ::.:..: ::::.  .: :. :::.::.:.:::::  .:  ..  ::  :.:::..:: .
CCDS26 IPVFFLETALGQFTSEGGITCWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSN
              110       120       130       140       150       160

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pF1KE2 SFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFSEDNITWTLH-----STSPAEEFYTRHVLQIHRSKG
        :: .:::..: . ::: ::.. :.. :..   :     .:::. ::. ..:: :  : :
CCDS26 CFTTELPWATCGHEWNTENCVE-FQKLNVSNYSHVSLQNATSPVMEFWEHRVLAI--SDG
              170       180        190       200       210         

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE2 LQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGATLPG
       .. .:.. :.::::..  .:. :: ::::.:..::::.::::::::.: .::.::.::::
CCDS26 IEHIGNLRWELALCLLAAWTICYFCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPG
       220       230       240       250       260       270       

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pF1KE2 AWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQDALVT
       : .:. ::: :. ..: .  ::.::..::::: .  .: : :..:::..:::::.: .. 
CCDS26 ASEGIKFYLYPDLSRLSDPQVWVDAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIML
       280       290       300       310       320       330       

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pF1KE2 SVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPASTFFA
         .:  ::::.::.::.:::.::  ..  ..::: ..::.: ::.: .:.. :: : ..:
CCDS26 CCLNSGTSFVAGFAIFSVLGFMAYEQGVPIAEVA-ESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWA
       340       350       360       370        380       390      

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pF1KE2 IIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAK--RRERFVLAVVITCFFGSLVTLT
        .::.::: ::::: :. .:...:::.: .:.:. .  ::: ..::. .  .: .:: ::
CCDS26 TLFFMMLIFLGLDSQFVCVESLVTAVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLT
        400       410       420       430       440       450      

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pF1KE2 FGGAYVVKLLEEYA-TGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRICW
        :: :. .:.. :: .:  .: ::..: . ..: :: ..:  ....:.:. :  . . ::
CCDS26 EGGMYIFQLFDSYAASGMCLLFVAIFECICIGWVYGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCW
        460       470       480       490       500       510      

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pF1KE2 VAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQ-YNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIIT
       . ..: .   :.  ::..   :.  . :.:: :.  .:. .. ::..::: .:   .  :
CCDS26 MIMTPGICAGIFIFFLIKYKPLKYNNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKT
        520       530       540       550       560       570      

              610       620       630                          
pF1KE2 PGTFKERIIKSITPETPTEIPCGDIRLNAV                          
        ::. :.. :  :: :  ..                                    
CCDS26 EGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRGKLGVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
        580       590       600       610       620       630  

>>CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX              (635 aa)
 initn: 1465 init1: 625 opt: 1727  Z-score: 2042.8  bits: 388.2 E(32554): 1.8e-107
Smith-Waterman score: 1727; 42.2% identity (71.8% similar) in 599 aa overlap (23-607:7-590)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 METTPLNSQKQLSACEDGEDCQENGVLQKVVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTR
                             :::. .    . ::. ..  :. : ...:. : :    
CCDS14                 MAKKSAENGIYS----VSGDEKKGPLIAPGPDGAPAKGDG----
                               10            20        30          

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 HSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLP
          :.   :  ..:    :::: ...::..: .:.:: :::::::::.::.::::.::.:
CCDS14 ---PVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMDFIMSCVGFAVGLGNVWRFPYLCYKNGGGVFLIP
            40        50        60        70        80        90   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 YTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIM
       :...:. ::::.:..:..:::. . : :..: .:::.:::.:::  .:.::  .::  ..
CCDS14 YVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGSINVW-NICPLFKGLGYASMVIVFYCNTYYIMVL
           100       110       120        130       140       150  

              190       200       210        220                230
pF1KE2 AWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFS-EDNITWTLHST---------SPAEE
       ::..:::..:::  :::..: ..::: .:.. :  ::  . .: .          ::. :
CCDS14 AWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANASLANLTCDQLADRRSPVIE
            160       170       180       190       200       210  

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pF1KE2 FYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYI
       :.  .::..  : ::.  :...:...::..  ....:: .:::::..::.:. ::::::.
CCDS14 FWENKVLRL--SGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTATFPYV
            220         230       240       250       260       270

              300       310       320       330       340       350
pF1KE2 ILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASY
       .: ::::::. ::::  :...::::.:.::    :::::..::::: . :.:.: :..::
CCDS14 VLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTALGSY
              280       290       300       310       320       330

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pF1KE2 NKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITY
       :.::::::.::.. ...:  ::: .:::.:..::.::  ..  .:.:: ..::.: ::.:
CCDS14 NRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVA-ESGPGLAFIAY
              340       350       360       370        380         

              420       430       440       450       460       470
pF1KE2 AEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVV
        .:.. ::.. ..: .::.::. ::::: :.:.:: ::..:: .:  .  : .: . ...
CCDS14 PRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISVAL
     390       400       410       420       430       440         

                480       490        500       510       520       
pF1KE2 --ITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEY-ATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKE
           ::  .:  .: :: :: .:.. : :.: ..:  :. : :.:.: ::  .:  :.  
CCDS14 CCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMDDIAC
     450       460       470       480       490       500         

       530       540       550        560       570       580      
pF1KE2 MLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFI-ICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSF
       :.:. :  . . ::  ..::  . : : . ..  : .    : ::.:.  .:. .. ::.
CCDS14 MIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFALSSM
     510       520       530       540       550       560         

        590       600       610       620       630                
pF1KE2 ICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPETPTEIPCGDIRLNAV                
       .:.: ..   :. . ::. ::                                       
CCDS14 LCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIWGLHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSESSKVV
     570       580       590       600       610       620         

>>CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3               (599 aa)
 initn: 1122 init1: 761 opt: 1699  Z-score: 2010.0  bits: 382.0 E(32554): 1.2e-105
Smith-Waterman score: 1736; 43.1% identity (73.7% similar) in 585 aa overlap (33-614:3-573)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE2 TTPLNSQKQLSACEDGEDCQENGVLQKVVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTRHS
                                     : :.:: .::::.  : .:   ...:  ..
CCDS26                             MATNGSKVADGQISTEVSEAP---VANDKPKT
                                           10        20            

             70        80        90       100       110       120  
pF1KE2 IPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLPYT
       . . .   .:.:   .:.::  . :::.: .:::. :::::::::.: .:::::::.:: 
CCDS26 LVVKVQKKAADLP--DRDTWKGRFDFLMSCVGYAIGLGNVWRFPYLCGKNGGGAFLIPYF
      30        40          50        60        70        80       

            130       140       150       160       170       180  
pF1KE2 IMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIMAW
       .  ::.:.::: .: .::::   : ...: :. :.:::.: :  ...:..  :: .:..:
CCDS26 LTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVW-KLAPMFKGVGLAAAVLSFWLNIYYIVIISW
        90       100       110        120       130       140      

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pF1KE2 ALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFSEDNITWTLHSTSPAEEFYTRHVLQIHRS
       :.::: .:::  ::: .: : :::  :   ::. ... : . :: . ::. :.. :.  .
CCDS26 AIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRC---FSNYSMVNTTNMTSAVVEFWERNMHQM--T
        150       160       170          180       190       200   

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pF1KE2 KGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGATL
        ::.  : : : ::. . . . ..:: :::::  .::::. .::.:::.: .:. ::.::
CCDS26 DGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGVGWTGKVVYFSATYPYIMLIILFFRGVTL
             210       220       230       240       250       260 

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pF1KE2 PGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQDAL
       ::: .:.:::. ::..:: .. ::.:::.::::: : :.: :.:..:::.:.:: :.:..
CCDS26 PGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIFFSYGLGLGSLIALGSYNSFHNNVYRDSI
             270       280       290       300       310       320 

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pF1KE2 VTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPASTF
       ..  .:  ::. .:::::...:.::.. ......::  .::.: :..: ::....: : .
CCDS26 IVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSIADVAA-SGPGLAFLAYPEAVTQLPISPL
             330       340       350        360       370       380

            430       440       450       460       470       480  
pF1KE2 FAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVTLT
       .::.:: ::. ::.:: :  .:: :::..::.:..  .::: :. :: :  .. .: ..:
CCDS26 WAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYPRLLRNRRELFIAAVCIISYLIGLSNIT
              390       400       410       420       430       440

            490        500       510       520       530       540 
pF1KE2 FGGAYVVKLLEEY-ATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRICW
        :: :: ::.. : :.: ..: ....: :..:::::...:  ...::.:  :  .:..::
CCDS26 QGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSISWFYGVNRFYDNIQEMVGSRPCIWWKLCW
              450       460       470       480       490       500

               550       560       570       580       590         
pF1KE2 VAISPLFL--LFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLII
         ..:...  .::. .  :.:  : . .: .: :.  .:. .. ::.. :: :.:: .. 
CCDS26 SFFTPIIVAGVFIFSAVQMTP--LTMGNYVFPKWGQGVGWLMALSSMVLIPGYMAYMFLT
              510       520         530       540       550        

     600       610       620       630          
pF1KE2 TPGTFKERIIKSITPETPTEIPCGDIRLNAV          
         :..:.::   . :                          
CCDS26 LKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAGSSTSKEAYI
      560       570       580       590         

>>CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3              (620 aa)
 initn: 1361 init1: 578 opt: 1656  Z-score: 1958.8  bits: 372.6 E(32554): 8.7e-103
Smith-Waterman score: 1656; 44.2% identity (71.6% similar) in 577 aa overlap (51-617:20-585)

               30        40        50        60        70        80
pF1KE2 CQENGVLQKVVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLVAELHQGERE
                                     :::: .  ::   :       :: .  .::
CCDS33            MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTR---PEDE----AEGKPPQRE
                          10        20           30            40  

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pF1KE2 TWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLPYTIMAIFG-GIPLFYMELAL
        :..:.::.::: :  : :::::::::.::.:::::::.:: :. .:: :.:.:..:. .
CCDS33 KWSSKIDFVLSVAGGFVGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIF-LFGSGLPVFFLEIII
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pF1KE2 GQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTS
       :::  .: :. :.::::.:.:::::  .:.  .  :: .:.::: :::..::  .:::. 
CCDS33 GQYTSEGGITCWEKICPLFSGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAH
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pF1KE2 CKNSWNTGNCT-NYFSEDNITW-TLHST---SPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQ
       :..:::: .:  . . ... .: :. ::   ::. ::. :.::..  : :..  :...:.
CCDS33 CNHSWNTPHCMEDTMRKNKSVWITISSTNFTSPVIEFWERNVLSL--SPGIDHPGSLKWD
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pF1KE2 LALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLK
       ::::..:.. : .: :::::...::::. :::::. .: :::::: :::::  :. ::: 
CCDS33 LALCLLLVWLVCFFCIWKGVRSTGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLY
     220       230       240       250       260       270         

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pF1KE2 PNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFV
       :.  .: .  :::::..::::: .  .:.. ...::::.. : :.: .. . .:  ::::
CCDS33 PDITRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFV
     280       290       300       310       320       330         

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pF1KE2 SGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITL
       :::.::..::.::. .. :...:: ..::.: ::.: .:.. ::  ::..:.::.::. :
CCDS33 SGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVA-ESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLL
     340       350       360        370       380       390        

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pF1KE2 GLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAK--RRERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLL
       :::: :. .:: ::...: .:    :  ::: :.  :    .. .:. .: :: :: .:.
CCDS33 GLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLF
      400       410       420       430       440       450        

             500       510       520       530       540       550 
pF1KE2 EEYA-TGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLL-
       . :: .:  .: ::..:  ...:.::  ..   ...:.:. :: . .  :..:.:.. . 
CCDS33 DYYAASGVCLLWVAFFECFVIAWIYGGDNLYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVG
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pF1KE2 FIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIK
        .: :..   :      : :: :.: ::. .. ::..:.:  :. ::  : : :  :.  
CCDS33 CFIFSLVKYVPLTYNKTYVYPNWAIGLGWSLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKY
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pF1KE2 SITPETPTEIPCGDIRLNAV                      
        .::. :                                   
CCDS33 LLTPREPNRWAVEREGATPYNSRTVMNGALVKPTHIIVETMM
      580       590       600       610       620




630 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Tue Nov  8 04:00:37 2016 done: Tue Nov  8 04:00:37 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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