FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2438, 1941 aa 1>>>pF1KE2438 1941 - 1941 aa - 1941 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.6077+/-0.00101; mu= -27.2078+/- 0.062 mean_var=913.4756+/-189.491, 0's: 0 Z-trim(113.5): 779 B-trim: 0 in 0/56 Lambda= 0.042435 statistics sampled from 22092 (22810) to 22092 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16 Scan time: 18.970 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001093582 (OMIM: 160740,605637) myosin-2 [Homo (1941) 12257 768.9 0 NP_060004 (OMIM: 160740,605637) myosin-2 [Homo sap (1941) 12257 768.9 0 XP_016880164 (OMIM: 160730) PREDICTED: myosin-1 is (1939) 11738 737.2 4e-211 NP_005954 (OMIM: 160730) myosin-1 [Homo sapiens] (1939) 11738 737.2 4e-211 NP_002463 (OMIM: 158300,160741,608837) myosin-8 [H (1937) 11492 722.1 1.4e-206 NP_060003 (OMIM: 160742) myosin-4 [Homo sapiens] (1939) 11448 719.4 8.8e-206 XP_016880165 (OMIM: 160742) PREDICTED: myosin-4 is (1939) 11448 719.4 8.8e-206 NP_002461 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) myos (1940) 10583 666.5 7.7e-190 XP_011522173 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 10583 666.5 7.7e-190 XP_011522172 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 10583 666.5 7.7e-190 NP_003793 (OMIM: 603487) myosin-13 [Homo sapiens] (1938) 10347 652.0 1.7e-185 NP_000248 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25516 (1935) 10289 648.5 2e-184 XP_016876829 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25 (1935) 10289 648.5 2e-184 NP_002462 (OMIM: 160710,192600,613251,613252,61408 (1939) 10200 643.0 8.8e-183 NP_065935 (OMIM: 609928) myosin-7B [Homo sapiens] (1983) 8629 546.8 8e-154 XP_006723903 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (1989) 8629 546.8 8e-154 NP_055796 (OMIM: 609929) myosin-15 precursor [Homo (1946) 6892 440.5 8.1e-122 XP_011510861 (OMIM: 609929) PREDICTED: myosin-15 i (1946) 6892 440.5 8.1e-122 XP_016861411 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myosin-2 [Homo sapiens (1941 aa) initn: 12257 init1: 12257 opt: 12257 Z-score: 4083.1 bits: 768.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 12257; 100.0% identity (100.0% similar) in 1941 aa overlap (1-1941:1-1941) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSSDSELAVFGEAAPFLRKSERERIEAQNRPFDAKTSVFVAEPKESFVKGTIQSREGGKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 MSSDSELAVFGEAAPFLRKSERERIEAQNRPFDAKTSVFVAEPKESFVKGTIQSREGGKV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TVKTEGGATLTVKDDQVFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 TVKTEGGATLTVKDDQVFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LFCVTVNPYKWLPVYKPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 LFCVTVNPYKWLPVYKPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 LRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEARVRELEGEVESEQKRNAEAVKGLRKHERRVKELTYQT 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KE2 EEDRKNILRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAEEAEEQSNTNLAKFRKLQHELEEAEERADIAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 EEDRKNILRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAEEAEEQSNTNLAKFRKLQHELEEAEERADIAE 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KE2 SQVNKLRVKSREVHTKVISEE ::::::::::::::::::::: NP_060 SQVNKLRVKSREVHTKVISEE 1930 1940 >>XP_016880164 (OMIM: 160730) PREDICTED: myosin-1 isofor (1939 aa) initn: 7870 init1: 7870 opt: 11738 Z-score: 3911.4 bits: 737.2 E(85289): 4e-211 Smith-Waterman score: 11738; 94.8% identity (99.0% similar) in 1941 aa overlap (1-1941:1-1939) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSSDSELAVFGEAAPFLRKSERERIEAQNRPFDAKTSVFVAEPKESFVKGTIQSREGGKV ::::::.:.::::::::::::::::::::.::::::::::..:::::::.:.:::::::: XP_016 MSSDSEMAIFGEAAPFLRKSERERIEAQNKPFDAKTSVFVVDPKESFVKATVQSREGGKV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 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110 pF1KE2 KVTVKTEGGATLTVKDDQVFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTY ::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: NP_002 KVTVKTEGGATLTVREDQVFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPGVLYNLKERYAAWMIYTY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 SGLFCVTVNPYKWLPVYKPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILIT ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 SGLFCVTVNPYKWLPVYKPEVVAAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILIT 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GESGAGKTVNTKRVIQYFATIAVTGEKKKEEITSGKIQGTLEDQIISANPLLEAFGNAKT :::::::::::::::::::::::::::::.: :::.::::::::::::::::::::::: NP_002 GESGAGKTVNTKRVIQYFATIAVTGEKKKDE--SGKMQGTLEDQIISANPLLEAFGNAKT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 VRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADIETYLLEKSRVVFQLKAERSYHIFYQITSNKKP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: NP_002 VRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADIETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQITSNKKP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ELIEMLLITTNPYDYPFVSQGEISVASIDDQEELMATDSAIDILGFTNEEKVSIYKLTGA .:::::::::::::: :::::::.: ::::::::::::::::::::: :::::::::::: NP_002 DLIEMLLITTNPYDYAFVSQGEITVPSIDDQEELMATDSAIDILGFTPEEKVSIYKLTGA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 VMHYGNLKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLQSLNSADLLKALCYPRVKVGNEYVTKGQ ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 VMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLQSLNSADLLKALCYPRVKVGNEYVTKGQ 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 TVEQVSNAVGALAKAVYEKMFLWMVARINQQLDTKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQ ::.:: :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 TVQQVYNAVGALAKAVYEKMFLWMVTRINQQLDTKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQ 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 LCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLAACIELIEKPMGIFSILE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: NP_002 LCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLAACIELIEKPLGIFSILE 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 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NP_002 EEDKVNILTKAKTKLEQQVDDLEGSLEQEKKLRMDLERAKRKLEGDLKLAQESTMDMEND 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE2 KQQLDEKLKKKEFEISNLQSKIEDEQALGIQLQKKIKELQARIEELEEEIEAERASRAKA ::::::::.::::::::: ::::::::. ::::::::::::::::: ::::::::::::: NP_002 KQQLDEKLEKKEFEISNLISKIEDEQAVEIQLQKKIKELQARIEELGEEIEAERASRAKA 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE2 EKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMNKKREAEFQKMRRDLEEATLQHEATAATL ::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::: .:.: NP_002 EKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQVELNKKREAEFQKLRRDLEEATLQHEAMVAAL 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 RKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEMKMEIDDLASNVETVSKAKGNLEKMCRTL :::::::.:::::::::::::::::::::::.::: :::.::.:..::::::::::::.: NP_002 RKKHADSMAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMETDDLSSNAEAISKAKGNLEKMCRSL 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 EDQLSELKSKEEEQQRLINDLTAQRGRLQTESGEFSRQLDEKEALVSQLSRGKQAFTQQI :::.::::.::::::::::::::::.:::::.::.:::::::.::::::::.::: :::: NP_002 EDQVSELKTKEEEQQRLINDLTAQRARLQTEAGEYSRQLDEKDALVSQLSRSKQASTQQI 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 EELKRQLEEEIKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQESKAELQRALSKANTEVAQWR ::::.::::: :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::: NP_002 EELKHQLEEETKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEGKAELQRALSKANSEVAQWR 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 TKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQAAEEHVEAVNAKCASLEKTKQRLQNEVEDLMLDV :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 TKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEEHVEAVNAKCASLEKTKQRLQNEVEDLMLDV 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE2 ERTNAACAALDKKQRNFDKILAEWKQKCEETHAELEASQKEARSLGTELFKIKNAYEESL ::.::::::::::::::::.:.::::: :::.:::::::::.:::.:::::.::.::::: NP_002 ERSNAACAALDKKQRNFDKVLSEWKQKYEETQAELEASQKESRSLSTELFKVKNVYEESL 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE2 DQLETLKRENKNLQQEISDLTEQIAEGGKRIHELEKIKKQVEQEKCELQAALEEAEASLE ::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::: NP_002 DQLETLRRENKNLQQEISDLTEQIAEGGKQIHELEKIKKQVEQEKCEIQAALEEAEASLE 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KE2 HEEGKILRIQLELNQVKSEVDRKIAEKDEEIDQLKRNHIRIVESMQSTLDAEIRSRNDAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::.:::::::::::::::. NP_002 HEEGKILRIQLELNQVKSEVDRKIAEKDEEIDQLKRNHTRVVETMQSTLDAEIRSRNDAL 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KE2 RLKKKMEGDLNEMEIQLNHANRMAAEALRNYRNTQGILKDTQIHLDDALRSQEDLKEQLA :.::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.::.:::::::.::::::::: NP_002 RVKKKMEGDLNEMEIQLNHANRLAAESLRNYRNTQGILKETQLHLDDALRGQEDLKEQLA 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KE2 MVERRANLLQAEIEELRATLEQTERSRKIAEQELLDASERVQLLHTQNTSLINTKKKLET .::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. NP_002 IVERRANLLQAEIEELWATLEQTERSRKIAEQELLDASERVQLLHTQNTSLINTKKKLEN 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KE2 DISQMQGEMEDILQEARNAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTVKD :.::.:.:.:...::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: NP_002 DVSQLQSEVEEVIQESRNAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKD 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KE2 LQLRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEARVRELEGEVESEQKRNAEAVKGLRKHERRVKELTY :: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::: NP_002 LQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEARVRELEGEVENEQKRNAEAVKGLRKHERRVKELTY 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KE2 QTEEDRKNILRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAEEAEEQSNTNLAKFRKLQHELEEAEERADI ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::: NP_002 QTEEDRKNVLRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAEEAEEQSNANLSKFRKLQHELEEAEERADI 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KE2 AESQVNKLRVKSREVHTKVISEE ::::::::::::::::::. .: NP_002 AESQVNKLRVKSREVHTKISAE 1920 1930 >>NP_060003 (OMIM: 160742) myosin-4 [Homo sapiens] (1939 aa) initn: 7614 init1: 7614 opt: 11448 Z-score: 3815.4 bits: 719.4 E(85289): 8.8e-206 Smith-Waterman score: 11448; 91.9% identity (98.4% similar) in 1941 aa overlap (1-1941:1-1939) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSSDSELAVFGEAAPFLRKSERERIEAQNRPFDAKTSVFVAEPKESFVKGTIQSREGGKV ::::::.:.::::::::::::.:::::::.::::::::::..::::.::. .:::::::: NP_060 MSSDSEMAIFGEAAPFLRKSEKERIEAQNKPFDAKTSVFVVDPKESYVKAIVQSREGGKV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TVKTEGGATLTVKDDQVFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSG :.:::.:::.:::.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 TAKTEAGATVTVKEDQVFSMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LFCVTVNPYKWLPVYKPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGE :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 LFCVTVNPYKWLPVYNPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 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