Result of SIM4 for pF1KB4192

seq1 = pF1KB4192.tfa, 1479 bp
seq2 = pF1KB4192/gi568815581r_4798739.tfa (gi568815581r:4798739_5003063), 204325 bp

>pF1KB4192 1479
>gi568815581r:4798739_5003063 (Chr17)

(complement)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-189  (100301-100443)   100% ->
190-234  (100570-100614)   100% ->
235-344  (100738-100847)   100% ->
345-500  (100977-101132)   100% ->
501-601  (101439-101539)   100% ->
602-802  (101874-102074)   100% ->
803-917  (102157-102271)   100% ->
918-1032  (103482-103596)   100% ->
1033-1219  (103680-103866)   100% ->
1220-1326  (103957-104063)   99% ->
1327-1479  (104173-104325)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAGGGCTCCGCTTGGGGTCCTGCTCCTCTTGGGGCTTCTCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGGCAAGGGCTCCGCTTGGGGTCCTGCTCCTCTTGGGGCTTCTCGGTA.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      GCAGGGGTGTGGGGAAGAACGAGGAACTGCGTCTTTATCACCATC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..CAGGCAGGGGTGTGGGGAAGAACGAGGAACTGCGTCTTTATCACCATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCTTCAACAACTATGACCCAGGAAGCCGGCCAGTGCGGGAGCCTGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100346 TCTTCAACAACTATGACCCAGGAAGCCGGCCAGTGCGGGAGCCTGAGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTGTCACCATCAGCCTCAAGGTCACCCTGACGAATCTCATCTCACTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100396 ACTGTCACCATCAGCCTCAAGGTCACCCTGACGAATCTCATCTCACTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190        AATGAAAAAGAGGAGACTCTCACCACTAGCGTCTGGATTGGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100446 A...CAGAATGAAAAAGAGGAGACTCTCACCACTAGCGTCTGGATTGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TC         GATTGGCAGGATTACCGACTCAACTACAGCAAGGACGAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100613 TCGTG...TAGGATTGGCAGGATTACCGACTCAACTACAGCAAGGACGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTGGGGGTATAGAAACCCTGCGAGTCCCTTCAGAACTCGTGTGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100777 TTTGGGGGTATAGAAACCCTGCGAGTCCCTTCAGAACTCGTGTGGCTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGAGATTGTGCTGGAAAACAA         TATTGATGGCCAGTTCGGAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100827 AGAGATTGTGCTGGAAAACAAGTG...CAGTATTGATGGCCAGTTCGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGGCCTACGACGCCAACGTGCTCGTCTACGAGGGCGGCTCCGTGACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100997 TGGCCTACGACGCCAACGTGCTCGTCTACGAGGGCGGCTCCGTGACGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGCCTCCGGCCATCTACCGCAGCGTCTGCGCAGTGGAGGTCACCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101047 CTGCCTCCGGCCATCTACCGCAGCGTCTGCGCAGTGGAGGTCACCTACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCCCTTCGATTGGCAGAACTGTTCGCTTATTTTCCG         CTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101097 CCCCTTCGATTGGCAGAACTGTTCGCTTATTTTCCGGTG...CAGCTCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGACGTACAATGCCGAAGAGGTGGAGTTCACTTTTGCCGTAGACAACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101444 AGACGTACAATGCCGAAGAGGTGGAGTTCACTTTTGCCGTAGACAACGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGCAAGACCATCAACAAGATCGACATCGACACAGAGGCCTATACTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101494 GGCAAGACCATCAACAAGATCGACATCGACACAGAGGCCTATACTGGTG.

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    602      AGAACGGCGAGTGGGCCATCGACTTCTGCCCGGGGGTGATCCGCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101544 ..CAGAGAACGGCGAGTGGGCCATCGACTTCTGCCCGGGGGTGATCCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCCACCACGGTGGCGCCACCGACGGCCCAGGGGAGACTGACGTCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101919 GCCACCACGGTGGCGCCACCGACGGCCCAGGGGAGACTGACGTCATCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCGCTCATCATCCGCCGGAAGCCGCTCTTCTACGTCATTAACATCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101969 TCGCTCATCATCCGCCGGAAGCCGCTCTTCTACGTCATTAACATCATCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCCCTGTGTGCTCATCTCGGGCCTGGTGCTGCTCGCCTACTTCCTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102019 GCCCTGTGTGCTCATCTCGGGCCTGGTGCTGCTCGCCTACTTCCTGCCGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CGCAGG         CCGGCGGCCAGAAATGCACGGTCTCCATCAACGTC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102069 CGCAGGGTA...CAGCCGGCGGCCAGAAATGCACGGTCTCCATCAACGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTGCTCGCCCAGACCGTCTTCTTGTTCCTCATTGCCCAGAAAATCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102192 CTGCTCGCCCAGACCGTCTTCTTGTTCCTCATTGCCCAGAAAATCCCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GACTTCTCTGAGCGTGCCGCTCCTGGGCAG         GTTCCTTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102242 GACTTCTCTGAGCGTGCCGCTCCTGGGCAGGTG...CAGGTTCCTTATTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TCGTCATGGTGGTCGCCACGCTCATTGTCATGAATTGCGTCATCGTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103493 TCGTCATGGTGGTCGCCACGCTCATTGTCATGAATTGCGTCATCGTGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AACGTGTCCCAGCGGACGCCCACCACCCACGCCATGTCCCCGCGGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103543 AACGTGTCCCAGCGGACGCCCACCACCCACGCCATGTCCCCGCGGCTGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCAC         GTTCTCCTGGAGCTGCTGCCGCGCCTCCTGGGCTCCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103593 CCACGTA...CAGGTTCTCCTGGAGCTGCTGCCGCGCCTCCTGGGCTCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CGCCGCCGCCCGAGGCCCCCCGGGCCGCCTCGCCCCCAAGGCGGGCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103717 CGCCGCCGCCCGAGGCCCCCCGGGCCGCCTCGCCCCCAAGGCGGGCGTCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TCGGTGGGCTTATTGCTCCGCGCGGAGGAGCTGATACTGAAAAAGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103767 TCGGTGGGCTTATTGCTCCGCGCGGAGGAGCTGATACTGAAAAAGCCACG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GAGCGAGCTCGTGTTTGAGGGGCAGAGGCACCGGCAGGGGACCTGGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103817 GAGCGAGCTCGTGTTTGAGGGGCAGAGGCACCGGCAGGGGACCTGGACGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220          CTGCCTTCTGCCAGAGCCTGGGCGCCGCCGCCCCCGAGGTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103867 GTG...CAGCTGCCTTCTGCCAGAGCCTGGGCGCCGCCGCCCCCGAGGTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CGCTGCTGTGTGGATGCCGTGAACTTCGTGGCTGAGAGCACGAGAGATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 103998 CGCTGCTGTGTGGATGCCGTGAACTTCGTGGCCGAGAGCACGAGAGATCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGAGGCCACCGGCGAG         GAAGTGTCCGACTGGGTGCGCATGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 104048 GGAGGCCACCGGCGAGGTG...CAGGAAGTGTCCGACTGGGTGCGCATGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GGAATGCCCTTGACAACATCTGCTTCTGGGCCGCTCTGGTGCTCTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104198 GGAATGCCCTTGACAACATCTGCTTCTGGGCCGCTCTGGTGCTCTTCAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GTGGGCTCCAGCCTCATCTTCCTCGGGGCCTACTTCAACCGAGTGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104248 GTGGGCTCCAGCCTCATCTTCCTCGGGGCCTACTTCAACCGAGTGCCTGA

   1550     .    :    .    :    .
   1452 TCTCCCCTACGCGCCGTGTATCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 104298 TCTCCCCTACGCGCCGTGTATCCAGCCT

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