Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9400
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9400, 841 aa
1>>>pF1KB9400 841 - 841 aa - 841 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8666+/-0.00107; mu= 18.4226+/- 0.064
mean_var=90.8167+/-18.873, 0's: 0 Z-trim(105.2): 39 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.134583
statistics sampled from 8289 (8324) to 8289 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16
Scan time: 3.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 ( 841) 5767 1130.7 0
CCDS82.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 ( 587) 2929 579.6 5.4e-165
CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs108|chr1 ( 839) 1841 368.4 2.8e-101
CCDS30556.1 TAS1R3 gene_id:83756|Hs108|chr1 ( 852) 1552 312.3 2.2e-84
CCDS2834.1 GRM2 gene_id:2912|Hs108|chr3 ( 872) 867 179.3 2.5e-44
CCDS3010.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3 (1078) 705 147.9 8.6e-35
CCDS54632.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3 (1088) 705 147.9 8.7e-35
CCDS69184.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 855) 643 135.8 3e-31
CCDS5112.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 926) 643 135.9 3.2e-31
CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs108|chr7 ( 879) 606 128.7 4.5e-29
CCDS69185.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 751) 507 109.4 2.4e-23
CCDS75432.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 865) 432 94.9 6.5e-19
CCDS4787.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 912) 432 94.9 6.8e-19
CCDS5794.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7 ( 908) 430 94.5 8.9e-19
CCDS47696.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7 ( 908) 430 94.5 8.9e-19
CCDS43042.1 GRM7 gene_id:2917|Hs108|chr3 ( 915) 393 87.3 1.3e-16
CCDS8283.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11 (1180) 364 81.8 7.9e-15
CCDS44694.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11 (1212) 364 81.8 8e-15
CCDS4442.1 GRM6 gene_id:2916|Hs108|chr5 ( 877) 347 78.4 6.1e-14
CCDS47497.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 ( 906) 337 76.4 2.4e-13
CCDS64548.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 ( 908) 337 76.4 2.4e-13
CCDS5209.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 (1194) 337 76.5 3e-13
>>CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 (841 aa)
initn: 5767 init1: 5767 opt: 5767 Z-score: 6051.4 bits: 1130.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5767; 99.9% identity (100.0% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-841)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRPEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRPEVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRVLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAASSETLSVKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 QYPSFLRTIPNDKYQVETMVLLLQKFGWTWISLVGSSDDYGQLGVQALENQATGQGICIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QYPSFLRTIPNDKYQVETMVLLLQKFGWTWISLVGSSDDYGQLGVQALENQATGQGICIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FKDIMPFSAQVGDERMQCLMRHLAQAGATVVVVFSSRQLARVFFESVVLTNLTGKVWVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FKDIMPFSAQVGDERMQCLMRHLAQAGATVVVVFSSRQLARVFFESVVLTNLTGKVWVAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 EAWALSRHITGVPGIQRIGMVLGVAIQKRAVPGLKAFEEAYARADKEAPRPCHKGSWCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS81 EAWALSRHITGVPGIQRIGMVLGVAIQKRAVPGLKAFEEAYARADKKAPRPCHKGSWCSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 NQLCRECQAFMAHTMPKLKAFSMSSAYNAYRAVYAVAHGLHQLLGCASGACSRGRVYPWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NQLCRECQAFMAHTMPKLKAFSMSSAYNAYRAVYAVAHGLHQLLGCASGACSRGRVYPWQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTWSPVQLNINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTWSPVQLNINE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 TKIQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNKSDLYRCQPCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TKIQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNKSDLYRCQPCG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 KEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFAWHLDTPVVRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFAWHLDTPVVRSA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 GGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCLTVRSFQLIIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCLTVRSFQLIIIF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 KFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPAREYQRFPHLVMLEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPAREYQRFPHLVMLEC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 TETNSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSLLFNFVSWIAFFTTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TETNSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSLLFNFVSWIAFFTTA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 SVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEHFQASIQDYTRRCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEHFQASIQDYTRRCGS
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 T
:
CCDS81 T
>>CCDS82.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 (587 aa)
initn: 4048 init1: 2929 opt: 2929 Z-score: 3075.6 bits: 579.6 E(32554): 5.4e-165
Smith-Waterman score: 3542; 69.8% identity (69.8% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRPEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRPEVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRVLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAASSETLSVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPM--------------
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 QYPSFLRTIPNDKYQVETMVLLLQKFGWTWISLVGSSDDYGQLGVQALENQATGQGICIA
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250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FKDIMPFSAQVGDERMQCLMRHLAQAGATVVVVFSSRQLARVFFESVVLTNLTGKVWVAS
CCDS82 ------------------------------------------------------------
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 EAWALSRHITGVPGIQRIGMVLGVAIQKRAVPGLKAFEEAYARADKEAPRPCHKGSWCSS
CCDS82 ------------------------------------------------------------
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 NQLCRECQAFMAHTMPKLKAFSMSSAYNAYRAVYAVAHGLHQLLGCASGACSRGRVYPWQ
CCDS82 ------------------------------------------------------------
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTWSPVQLNINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTWSPVQLNINE
170 180 190 200 210 220
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 TKIQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNKSDLYRCQPCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TKIQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNKSDLYRCQPCG
230 240 250 260 270 280
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 KEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFAWHLDTPVVRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFAWHLDTPVVRSA
290 300 310 320 330 340
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 GGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCLTVRSFQLIIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCLTVRSFQLIIIF
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670 680 690 700 710 720
pF1KB9 KFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPAREYQRFPHLVMLEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPAREYQRFPHLVMLEC
410 420 430 440 450 460
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 TETNSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSLLFNFVSWIAFFTTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TETNSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSLLFNFVSWIAFFTTA
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pF1KB9 SVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEHFQASIQDYTRRCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEHFQASIQDYTRRCGS
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 T
:
CCDS82 T
>>CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs108|chr1 (839 aa)
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Smith-Waterman score: 1841; 37.3% identity (65.8% similar) in 833 aa overlap (19-837:16-837)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRP--E
:..: . .:.: :: :::::::.::: ::.. . : .
CCDS18 MGPRAKTISSLFFLLWVLA-EPAENS-DFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VTLCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRV
: .: . . ::.:.::::..::::::...:::.. :::.. ::: : :: .:
CCDS18 VPMC-KEYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LSLPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAASSETLSV
:. .. . .: : .: :.::::::... . :.: .:: ::.:.:.:.: :. :
CCDS18 LAHE-DNLLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KRQYPSFLRTIPNDKYQVETMVLLLQKFGWTWISLVGSSDDYGQLGVQALENQATGQGIC
: ..:..::: :. ...:.:: :. .: :.:: .. ::: ::. . : : .... . ::
CCDS18 KVRFPALLRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDIC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 IAFKDIMPF----SAQVGDERMQ--CLMRHLAQAGATVVVVFSSRQLARVFFESVVLTNL
:::.. .: . ....::.. .. .: :. : :::::: ::. :. :.
CCDS18 IAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TGKVWVASEAWALSRHITGVPGIQRIGMVLGVAIQKRAVPGLKAFEEAYARADKEAPRPC
:: ::.:::.::.. . .. ....: ::..::. .::.. :.: .: .: :
CCDS18 TGAVWIASESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQA---GPPPL
300 310 320 330 340 350
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pF1KB9 HKGSWC-SSNQLCRECQAFMAHTMPKLKAFSMSSAYNAYRAVYAVAHGLHQLLGCASGAC
. : . :: : .: :. . .:..: :::::::.::.:::: ...:
CCDS18 SRTSQSYTCNQECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 SRGRVYPWQLLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTW
.. ::::::::.: ::.: : . :. . : .:. :.:. . : ..: .
CCDS18 TKRVVYPWQLLEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVAS--Y
420 430 440 450 460
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pF1KB9 SPVQLNINETK-IQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNK
:.: .... . :.:: .: .: :.::. : :... .:.: :::::. : :::::.
CCDS18 YPLQRQLKNIQDISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNH
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KB9 S-DLYRCQPCGKEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFA
. : :.:: : ..::. .. .:: : .::: .: . .. .: .: :. .:
CCDS18 TEDEYECQACPNNEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFW
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 WHLDTPVVRSAGGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCL
:..::.:::::: .::::: : .. . . : : .:: ::::: : ::: .::.
CCDS18 RHFQTPIVRSAGGPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCI
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 TVRSFQLIIIFKFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPA-RE
.:::::.. ::.... : : ::. .: . . . .. ...: . ... :. :
CCDS18 AVRSFQIVCAFKMASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRT
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KB9 YQRFPHLVMLECTET--NSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSL
:..... :. . ::: : .. . :::. .:. .:.::.:: :::::: .:.:.
CCDS18 DPDDPKITIVSCNPNYRNSLLFNTSL--DLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSM
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KB9 LFNFVSWIAFFTTASVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEH
: :.: ... : :.:.: . ..... . .: . ::: ::::.:: :. :. .
CCDS18 TFYFTSSVSLCTFMSAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAY
770 780 790 800 810 820
830 840
pF1KB9 FQASIQDYTRRCGST
:.. :: :: :
CCDS18 FNSMIQGYTMRRD
830
>>CCDS30556.1 TAS1R3 gene_id:83756|Hs108|chr1 (852 aa)
initn: 1492 init1: 686 opt: 1552 Z-score: 1628.3 bits: 312.3 E(32554): 2.2e-84
Smith-Waterman score: 1557; 32.8% identity (62.7% similar) in 848 aa overlap (8-827:1-829)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSP-----DFTLPGDYLLAGLFPL---HSGCLQ
..: .: ::. : ..: .. . :::.:.::::: . . :.
CCDS30 MLGPAVLGLSLWALL-HPGTGAPLCLSQQLRMKGDYVLGGLFPLGEAEEAGLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VRHRPEVTLCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSA-N
: :: .: : :. .: ::...::::::.. :::.. :::.:.:.::. .
CCDS30 SRTRPSSPVCTR---FSSNGLLWALAMKMAVEEINNKSDLLPGLRLGYDLFDTCSEPVVA
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VYATLRVLSLPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAA
. .: :. :.. : . .:.: ::::::: :.. : .:. ..: ::.:..::.:
CCDS30 MKPSLMFLAKAGSRDIAAYCNYTQYQPRVLAVIGPHSSELAMVTGKFFSFFLMPQVSYGA
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CCDS54 QVSYASSSRLLSNKNQFKSFLRTIPNDEHQATAMADIIEYFRWNWVGTIAADDDYGRPGI
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CCDS54 EKFREEAEERDICIDFSELI--SQYSDEEEIQHVVEVIQNSTAKVIVVFSSGPDLEPLIK
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CCDS54 SVHNGFAKEFWEETFNCHLQEGAKGPLPVDTFLRGHEESGDRFSNSSTAFRPLCTGDENI
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:.: .::.:.... .: .:.: :: :.::. :.::: .: ::: :...:.
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. .::. :.. .....:. .:.:: .: : . :.:.. . :..::. :: .
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770 780 790 800 810
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CCDS51 GYIAILAFICFIFAFKGKYENYNEAKFITFGMLIYFIAWITFIPIYATTFGKYVPAVEII
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CCDS51 VILISNYGILYCTFIPKCYVIICKQEINTKSAFLKMIYSYSSHSVSSIALSPASLDSMSG
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CCDS51 NVTMTNPSSSGKSATWQKSKDLQAQAFAHICRENATSVSKTLPRKRMSSI
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CCDS56 -CGR---INEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEF
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CCDS56 VRASLTKVDEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYA
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CCDS56 STSAKLSDKSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQ
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CCDS56 EARLRNICIATAEKVGRSNI--RKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASR
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CCDS56 ANASF-TWVASDGWGAQESI--IKGSEHVAY--GAITLELASQPVRQFDRYFQSLN---P
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CCDS56 YNNHRNPWFRDFWEQKFQCSLQNKRNHRRVCDKHLA--IDSSNYEQESKIMFVVNAVYAM
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CCDS56 AHALHKMQRTLCPNTTKLCDAMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFG
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CCDS56 DGMGRYNVFNFQNVGGKYSYLKVGH--WAET-LSLDVNSIHW--SRNSVPTSQCSDPCAP
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CCDS56 NEMKNMQPGDVCCWICIPCEPYEYL--ADEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYI---
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CCDS56 -RWEDAWAIGPVTIACLGFMCTCMVVTVFIKHNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMT
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pF1KB9 YGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCLTVRSFQLIIIF---KFSTKVPTFYHAWVQN
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CCDS56 FFFIAKPSPVICALRRLGLGSSFAICYSALLTKTNCIARIFDGVKNGAQRPKFISPSSQV
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CCDS56 FICLGLILV----QIVMVSVWLILEAP-GTRRYTLAEKRETVILKCNVKDS-SMLISLTY
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CCDS56 DVILVILCTVYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTMYTTCIIWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTM
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CCDS56 CISVSLS-GFVVLGCLFAPKVHIILFQPQKNVVTHRLHLNRFSVSGTGTTYSQSSASTYV
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CCDS56 PTVCNGREVLDSTTSSL
870
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]